RNA–Protein interactions for RNA: YFL036W

RPO41, Transcript of Mitochondrial RNA polymerase, yeast

Gene RPO41, Length 4,056 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RPO41	YFL036W	HBT1	Q07653	1046 aa	Known RBP	2.62	□□□□□ -1.99
RPO41	YFL036W	EMP46	Q12396	444 aa		2.62	□□□□□ -1.99
RPO41	YFL036W	HSH49	Q99181	213 aa	Predicted RBP	2.62	□□□□□ -1.99
RPO41	YFL036W	RPL4A	P10664	362 aa	Known RBP	2.62	□□□□□ -1.99
RPO41	YFL036W	SCH9	P11792	824 aa	Known RBP	2.62	□□□□□ -1.99
RPO41	YFL036W	NPR1	P22211	790 aa		2.62	□□□□□ -1.99
RPO41	YFL036W	RPS1A	P33442	255 aa	Known RBP	2.62	□□□□□ -1.99
RPO41	YFL036W	YKL107W	P34251	309 aa		2.62	□□□□□ -1.99
RPO41	YFL036W	STL1	P39932	569 aa		2.62	□□□□□ -1.99
RPO41	YFL036W	DIM1	P41819	318 aa	Known RBP	2.62	□□□□□ -1.99
RPO41	YFL036W	RRT5	P43607	289 aa		2.62	□□□□□ -1.99
RPO41	YFL036W	RPS10B	P46784	105 aa	Known RBP	2.62	□□□□□ -1.99
RPO41	YFL036W	YJR124C	P47159	448 aa		2.62	□□□□□ -1.99
RPO41	YFL036W	RPL4B	P49626	362 aa	Known RBP	2.62	□□□□□ -1.99
RPO41	YFL036W	SHY1	P53266	389 aa		2.62	□□□□□ -1.99
RPO41	YFL036W	NOP19	P53317	196 aa	Predicted RBP	2.62	□□□□□ -1.99
RPO41	YFL036W	DSL1	P53847	754 aa		2.62	□□□□□ -1.99
RPO41	YFL036W	ADE13	Q05911	482 aa	Known RBP	2.62	□□□□□ -1.99
RPO41	YFL036W	SEC10	Q06245	871 aa		2.62	□□□□□ -1.99
RPO41	YFL036W	RPS10A	Q08745	105 aa	Predicted RBP	2.62	□□□□□ -1.99
RPO41	YFL036W	YOR223W	Q12015	292 aa		2.62	□□□□□ -1.99
RPO41	YFL036W	SSC1	P0CS90	654 aa	Known RBP	2.61	□□□□□ -1.99
RPO41	YFL036W	CDC34	P14682	295 aa		2.61	□□□□□ -1.99
RPO41	YFL036W	CBS2	P14905	389 aa		2.61	□□□□□ -1.99
RPO41	YFL036W	MET16	P18408	261 aa	Predicted RBP	2.61	□□□□□ -1.99
RPO41	YFL036W	GAL11	P19659	1081 aa		2.61	□□□□□ -1.99
RPO41	YFL036W	PRP6	P19735	899 aa	Predicted RBP	2.61	□□□□□ -1.99
RPO41	YFL036W	PPH22	P23595	377 aa		2.61	□□□□□ -1.99
RPO41	YFL036W	MRS6	P32864	603 aa	Known RBP	2.61	□□□□□ -1.99
RPO41	YFL036W	IMP3	P32899	183 aa	Predicted RBP	2.61	□□□□□ -1.99
RPO41	YFL036W	YBP1	P38315	674 aa		2.61	□□□□□ -1.99
RPO41	YFL036W	ARN1	P38731	627 aa		2.61	□□□□□ -1.99
RPO41	YFL036W	PEX18	P38855	283 aa		2.61	□□□□□ -1.99
RPO41	YFL036W	MRX1	P40050	688 aa		2.61	□□□□□ -1.99
RPO41	YFL036W	YJL107C	P42947	387 aa		2.61	□□□□□ -1.99
RPO41	YFL036W	FAR3	P46671	204 aa		2.61	□□□□□ -1.99
RPO41	YFL036W	NMD5	P46970	1048 aa		2.61	□□□□□ -1.99
RPO41	YFL036W	AIM23	P47015	356 aa		2.61	□□□□□ -1.99
RPO41	YFL036W	IMA1	P53051	589 aa		2.61	□□□□□ -1.99
RPO41	YFL036W	CUZ1	P53899	274 aa		2.61	□□□□□ -1.99
RPO41	YFL036W	USA1	Q03714	838 aa		2.61	□□□□□ -1.99
RPO41	YFL036W	SNU56	Q03782	492 aa	Known RBP	2.61	□□□□□ -1.99
RPO41	YFL036W	SSL1	Q04673	461 aa	Predicted RBP	2.61	□□□□□ -1.99
RPO41	YFL036W	YPR114W	Q06107	315 aa		2.61	□□□□□ -1.99
RPO41	YFL036W	LCB5	Q06147	687 aa	Known RBP	2.61	□□□□□ -1.99
RPO41	YFL036W	CDD1	Q06549	142 aa		2.61	□□□□□ -1.99
RPO41	YFL036W	YOR059C	Q08448	450 aa	Known RBP	2.61	□□□□□ -1.99
RPO41	YFL036W	BUD7	Q08754	746 aa		2.61	□□□□□ -1.99
RPO41	YFL036W	YLR053C	Q12026	108 aa		2.61	□□□□□ -1.99
RPO41	YFL036W	RRP42	Q12277	265 aa	Predicted RBP	2.61	□□□□□ -1.99
RPO41	YFL036W	NDJ1	Q12366	352 aa		2.61	□□□□□ -1.99
RPO41	YFL036W	RRD2	Q12461	358 aa		2.61	□□□□□ -1.99
RPO41	YFL036W	ARG4	P04076	463 aa	Predicted RBP	2.61	□□□□□ -1.99
RPO41	YFL036W	SPS1	P08458	490 aa		2.61	□□□□□ -1.99
RPO41	YFL036W	SST2	P11972	698 aa	Known RBP	2.61	□□□□□ -1.99
RPO41	YFL036W	PMR1	P13586	950 aa		2.61	□□□□□ -1.99
RPO41	YFL036W	DAL81	P21657	970 aa		2.61	□□□□□ -1.99
RPO41	YFL036W	TRX2	P22803	104 aa	Known RBP	2.61	□□□□□ -1.99
RPO41	YFL036W	YCR090C	P25654	182 aa	Known RBP	2.61	□□□□□ -1.99
RPO41	YFL036W	PUP2	P32379	260 aa		2.61	□□□□□ -1.99
RPO41	YFL036W	KAR9	P32526	644 aa		2.61	□□□□□ -1.99
RPO41	YFL036W	STE5	P32917	917 aa		2.61	□□□□□ -1.99
RPO41	YFL036W	OSH7	P38755	437 aa		2.61	□□□□□ -1.99
RPO41	YFL036W	YHR045W	P38775	560 aa		2.61	□□□□□ -1.99
RPO41	YFL036W	UBA4	P38820	440 aa		2.61	□□□□□ -1.99
RPO41	YFL036W	UTP9	P38882	575 aa	Known RBP	2.61	□□□□□ -1.99
RPO41	YFL036W	AXL2	P38928	823 aa		2.61	□□□□□ -1.99
RPO41	YFL036W	RSP5	P39940	809 aa	Known RBP	2.61	□□□□□ -1.99
RPO41	YFL036W	AVT2	P39981	480 aa		2.61	□□□□□ -1.99
RPO41	YFL036W	RIC1	P40395	1056 aa		2.61	□□□□□ -1.99
RPO41	YFL036W	YIL161W	P40449	235 aa	Known RBP	2.61	□□□□□ -1.99
RPO41	YFL036W	AXL1	P40851	1208 aa		2.61	□□□□□ -1.99
RPO41	YFL036W	SAD1	P43589	448 aa		2.61	□□□□□ -1.99
RPO41	YFL036W	GPI8	P49018	411 aa		2.61	□□□□□ -1.99
RPO41	YFL036W	HSV2	P50079	448 aa	Predicted RBP	2.61	□□□□□ -1.99
RPO41	YFL036W	YMR102C	Q03177	834 aa		2.61	□□□□□ -1.99
RPO41	YFL036W	CIA1	Q05583	330 aa		2.61	□□□□□ -1.99
RPO41	YFL036W	SYT1	Q06836	1226 aa		2.61	□□□□□ -1.99
RPO41	YFL036W	COS7	Q07788	383 aa		2.61	□□□□□ -1.99
RPO41	YFL036W	MCH5	Q08777	521 aa		2.61	□□□□□ -1.99
RPO41	YFL036W	GET4	Q12125	312 aa		2.61	□□□□□ -1.99
RPO41	YFL036W	ADE4	P04046	510 aa	Known RBP	2.61	□□□□□ -1.99
RPO41	YFL036W	SEC15	P22224	910 aa		2.61	□□□□□ -1.99
RPO41	YFL036W	MRPL8	P22353	238 aa		2.61	□□□□□ -1.99
RPO41	YFL036W	RPC19	P28000	142 aa	Known RBP	2.61	□□□□□ -1.99
RPO41	YFL036W	FRE2	P36033	711 aa		2.61	□□□□□ -1.99
RPO41	YFL036W	GTR2	P53290	341 aa		2.61	□□□□□ -1.99
RPO41	YFL036W	ZRG17	P53735	605 aa		2.61	□□□□□ -1.99
RPO41	YFL036W	SLG1	P54867	378 aa		2.61	□□□□□ -1.99
RPO41	YFL036W	HFD1	Q04458	532 aa		2.61	□□□□□ -1.99
RPO41	YFL036W	YDR056C	Q12025	205 aa		2.61	□□□□□ -1.99
RPO41	YFL036W	SLP1	Q12232	587 aa		2.61	□□□□□ -1.99
RPO41	YFL036W	LCB4	Q12246	624 aa		2.61	□□□□□ -1.99
RPO41	YFL036W	LAT1	P12695	482 aa	Known RBP	2.6	□□□□□ -1.99
RPO41	YFL036W	FAR1	P21268	830 aa		2.6	□□□□□ -1.99
RPO41	YFL036W	YCR015C	P25616	317 aa		2.6	□□□□□ -1.99
RPO41	YFL036W	AEP1	P32493	518 aa		2.6	□□□□□ -1.99
RPO41	YFL036W	SKT5	P34226	696 aa		2.6	□□□□□ -1.99
RPO41	YFL036W	AGP2	P38090	596 aa		2.6	□□□□□ -1.99
RPO41	YFL036W	KTR4	P38131	464 aa		2.6	□□□□□ -1.99

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