RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591545.5

SMARCA4-216, Transcript of SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily a, member 4, humanhuman

TSL 2

Gene SMARCA4, Length 5,193 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA4-216ENST00000591545 ERCC5P28715 1186 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
SMARCA4-216ENST00000591545 PAK2Q13177 524 aa14.74□□□□□ -0.05
SMARCA4-216ENST00000591545 MTMR3Q13615 1198 aa14.74□□□□□ -0.05
SMARCA4-216ENST00000591545 ZBTB8OSQ8IWT0 167 aa14.74□□□□□ -0.05
SMARCA4-216ENST00000591545 SLC10A4Q96EP9 437 aa14.74□□□□□ -0.05
SMARCA4-216ENST00000591545 ASIC2Q16515 512 aa14.74□□□□□ -0.05
SMARCA4-216ENST00000591545 CFAP157Q5JU67 520 aa14.74□□□□□ -0.05
SMARCA4-216ENST00000591545 KRT26Q7Z3Y9 468 aa14.74□□□□□ -0.05
SMARCA4-216ENST00000591545 RRAGDQ9NQL2 400 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
SMARCA4-216ENST00000591545 PPFIA1Q13136 1202 aa14.73□□□□□ -0.05
SMARCA4-216ENST00000591545 GPATCH4Q5T3I0 446 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
SMARCA4-216ENST00000591545 RNF34Q969K3 372 aa14.73□□□□□ -0.05
SMARCA4-216ENST00000591545 SPON1Q9HCB6 807 aa14.73□□□□□ -0.05
SMARCA4-216ENST00000591545 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
SMARCA4-216ENST00000591545 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
SMARCA4-216ENST00000591545 SMIM23A6NLE4 172 aa14.73□□□□□ -0.05
SMARCA4-216ENST00000591545 TXNRD1Q16881 649 aa14.73□□□□□ -0.05
SMARCA4-216ENST00000591545 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa14.73□□□□□ -0.05
SMARCA4-216ENST00000591545 CACNA2D3Q8IZS8 1091 aa14.73□□□□□ -0.05
SMARCA4-216ENST00000591545 METTL13Q8N6R0 699 aa14.73□□□□□ -0.05
SMARCA4-216ENST00000591545 C2orf69Q8N8R5 385 aa14.73□□□□□ -0.05
SMARCA4-216ENST00000591545 NACA2Q9H009 215 aa14.73□□□□□ -0.05
SMARCA4-216ENST00000591545 TNKSO95271 1327 aa14.73□□□□□ -0.05
SMARCA4-216ENST00000591545 CSGALNACT2Q8N6G5 542 aa14.73□□□□□ -0.05
SMARCA4-216ENST00000591545 CARD6Q9BX69 1037 aa14.73□□□□□ -0.05
SMARCA4-216ENST00000591545 AP5M1Q9H0R1 490 aa14.73□□□□□ -0.05
SMARCA4-216ENST00000591545 ADD3Q9UEY8 706 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
SMARCA4-216ENST00000591545 SERPINA10Q9UK55 444 aa14.73□□□□□ -0.05
SMARCA4-216ENST00000591545 FOSP01100 380 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
SMARCA4-216ENST00000591545 TMOD1P28289 359 aa14.73□□□□□ -0.05
SMARCA4-216ENST00000591545 INPP5BP32019 993 aa14.73□□□□□ -0.05
SMARCA4-216ENST00000591545 TAOK1Q7L7X3 1001 aa14.73□□□□□ -0.05
SMARCA4-216ENST00000591545 KANSL2Q9H9L4 492 aa14.73□□□□□ -0.05
SMARCA4-216ENST00000591545 PRKAG2Q9UGJ0 569 aa14.73□□□□□ -0.05
SMARCA4-216ENST00000591545 SPOPO43791 374 aa14.72□□□□□ -0.05
SMARCA4-216ENST00000591545 TPH2Q8IWU9 490 aa14.72□□□□□ -0.05
SMARCA4-216ENST00000591545 LMNTD2Q8IXW0 634 aa14.72□□□□□ -0.05
SMARCA4-216ENST00000591545 VPS54Q9P1Q0 977 aa14.72□□□□□ -0.05
SMARCA4-216ENST00000591545 KDM3AQ9Y4C1 1321 aa14.72□□□□□ -0.05
SMARCA4-216ENST00000591545 DDAH1O94760 285 aa14.72□□□□□ -0.05
SMARCA4-216ENST00000591545 VIMP08670 466 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
SMARCA4-216ENST00000591545 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
SMARCA4-216ENST00000591545 CYP27B1O15528 508 aa14.72□□□□□ -0.05
SMARCA4-216ENST00000591545 ERCC6LQ2NKX8 1250 aa14.72□□□□□ -0.05
SMARCA4-216ENST00000591545 LIN9Q5TKA1 542 aa14.72□□□□□ -0.05
SMARCA4-216ENST00000591545 GALNT17Q6IS24 598 aa14.72□□□□□ -0.05
SMARCA4-216ENST00000591545 SYCE1Q8N0S2 351 aa14.72□□□□□ -0.05
SMARCA4-216ENST00000591545 VPS16Q9H269 839 aa14.72□□□□□ -0.05
SMARCA4-216ENST00000591545 SERPINB13Q9UIV8 391 aa14.72□□□□□ -0.05
SMARCA4-216ENST00000591545 ZBTB24O43167 697 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
SMARCA4-216ENST00000591545 SUSD4Q5VX71 490 aa14.72□□□□□ -0.05
SMARCA4-216ENST00000591545 CABP7Q86V35 215 aa14.72□□□□□ -0.05
SMARCA4-216ENST00000591545 LMBRD1Q9NUN5 540 aa14.72□□□□□ -0.05
SMARCA4-216ENST00000591545 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
SMARCA4-216ENST00000591545 MYO3BQ8WXR4 1341 aa14.72□□□□□ -0.05
SMARCA4-216ENST00000591545 EXOC3O60645 756 aa14.71□□□□□ -0.05
SMARCA4-216ENST00000591545 ZNF202O95125 648 aa14.71□□□□□ -0.05
SMARCA4-216ENST00000591545 USP17L8P0C7I0 530 aa14.71□□□□□ -0.05
SMARCA4-216ENST00000591545 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
SMARCA4-216ENST00000591545 ADPGKQ9BRR6 497 aa14.71□□□□□ -0.05
SMARCA4-216ENST00000591545 AMNQ9BXJ7 453 aa14.71□□□□□ -0.05
SMARCA4-216ENST00000591545 NRBP2Q9NSY0 501 aa14.71□□□□□ -0.05
SMARCA4-216ENST00000591545 H0YCG3 227 aa14.71□□□□□ -0.05
SMARCA4-216ENST00000591545 HSPA1LP34931 641 aa14.71□□□□□ -0.05
SMARCA4-216ENST00000591545 FAM160B1Q5W0V3 765 aa14.71□□□□□ -0.05
SMARCA4-216ENST00000591545 MAK16Q9BXY0 300 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
SMARCA4-216ENST00000591545 PLCB1Q9NQ66 1216 aa14.71□□□□□ -0.05
SMARCA4-216ENST00000591545 FAM184BQ9ULE4 1060 aa14.71□□□□□ -0.05
SMARCA4-216ENST00000591545 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
SMARCA4-216ENST00000591545 ADORA1P30542 326 aa14.71□□□□□ -0.05
SMARCA4-216ENST00000591545 FANCBQ8NB91 859 aa14.71□□□□□ -0.05
SMARCA4-216ENST00000591545 KCNJ14Q9UNX9 436 aa14.71□□□□□ -0.05
SMARCA4-216ENST00000591545 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa14.71□□□□□ -0.06
SMARCA4-216ENST00000591545 GOLGA6BA6NDN3 693 aa14.71□□□□□ -0.06
SMARCA4-216ENST00000591545 PI4KBQ9UBF8 816 aa14.71□□□□□ -0.06
SMARCA4-216ENST00000591545 NCAPD2Q15021 1401 aa14.71□□□□□ -0.06
SMARCA4-216ENST00000591545 ABCA6Q8N139 1617 aa14.71□□□□□ -0.06
SMARCA4-216ENST00000591545 P4HA1P13674 534 aa14.7□□□□□ -0.06
SMARCA4-216ENST00000591545 ARL1P40616 181 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
SMARCA4-216ENST00000591545 PSMC4P43686 418 aa14.7□□□□□ -0.06
SMARCA4-216ENST00000591545 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
SMARCA4-216ENST00000591545 BRD3Q15059 726 aa14.7□□□□□ -0.06
SMARCA4-216ENST00000591545 ZNF365Q70YC5 407 aa14.7□□□□□ -0.06
SMARCA4-216ENST00000591545 SLFN12Q8IYM2 578 aa14.7□□□□□ -0.06
SMARCA4-216ENST00000591545 BLIDQ8IZY5 108 aa14.7□□□□□ -0.06
SMARCA4-216ENST00000591545 ARHGAP24Q8N264 748 aa14.7□□□□□ -0.06
SMARCA4-216ENST00000591545 RNF169Q8NCN4 708 aa14.7□□□□□ -0.06
SMARCA4-216ENST00000591545 TEKT3Q9BXF9 490 aa14.7□□□□□ -0.06
SMARCA4-216ENST00000591545 WDR70Q9NW82 654 aa14.7□□□□□ -0.06
SMARCA4-216ENST00000591545 PNMA3Q9UL41 463 aa14.7□□□□□ -0.06
SMARCA4-216ENST00000591545 BRD1O95696 1058 aa14.7□□□□□ -0.06
SMARCA4-216ENST00000591545 ELF2Q15723 593 aa14.7□□□□□ -0.06
SMARCA4-216ENST00000591545 RSPH3Q86UC2 560 aa14.7□□□□□ -0.06
SMARCA4-216ENST00000591545 FAM193BQ96PV7 902 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
SMARCA4-216ENST00000591545 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
SMARCA4-216ENST00000591545 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa14.7□□□□□ -0.06
SMARCA4-216ENST00000591545 PPFIA4O75335 1185 aa14.7□□□□□ -0.06
SMARCA4-216ENST00000591545 TTLL1O95922 423 aa14.7□□□□□ -0.06
SMARCA4-216ENST00000591545 GBP1P32455 592 aa14.7□□□□□ -0.06
SMARCA4-216ENST00000591545 SEPT6Q14141 434 aa14.7□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.1 ms