RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000584229.1

GPS1-223, Transcript of G protein pathway suppressor 1, human

TSL 3

Gene GPS1, Length 535 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GPS1-223	ENST00000584229	EXOSC10	Q01780	885 aa	Known RBP	29.13	■■■□□ 2.25
GPS1-223	ENST00000584229	ASPRV1	Q53RT3	343 aa		29.13	■■■□□ 2.25
GPS1-223	ENST00000584229	GPATCH4	Q5T3I0	446 aa	Known RBP	29.13	■■■□□ 2.25
GPS1-223	ENST00000584229	ZNF654	Q8IZM8	581 aa		29.13	■■■□□ 2.25
GPS1-223	ENST00000584229	TMTC2	Q8N394	836 aa		29.13	■■■□□ 2.25
GPS1-223	ENST00000584229	MYL10	Q9BUA6	226 aa		29.13	■■■□□ 2.25
GPS1-223	ENST00000584229	CYP46A1	Q9Y6A2	500 aa		29.13	■■■□□ 2.25
GPS1-223	ENST00000584229	VWA5A	O00534	786 aa		29.12	■■■□□ 2.25
GPS1-223	ENST00000584229	DHX16	O60231	1041 aa	Known RBP	29.12	■■■□□ 2.25
GPS1-223	ENST00000584229	CNMD	O75829	334 aa		29.12	■■■□□ 2.25
GPS1-223	ENST00000584229	SNHG28	P0DPA3	235 aa		29.12	■■■□□ 2.25
GPS1-223	ENST00000584229	PSMC4	P43686	418 aa		29.12	■■■□□ 2.25
GPS1-223	ENST00000584229	FCGRT	P55899	365 aa		29.12	■■■□□ 2.25
GPS1-223	ENST00000584229	CCNA1	P78396	465 aa		29.12	■■■□□ 2.25
GPS1-223	ENST00000584229		Q6ZUG5	572 aa		29.12	■■■□□ 2.25
GPS1-223	ENST00000584229	UPF3B	Q9BZI7	483 aa	Known RBP	29.12	■■■□□ 2.25
GPS1-223	ENST00000584229	LIFR	P42702	1097 aa		29.11	■■■□□ 2.25
GPS1-223	ENST00000584229	ARHGEF6	Q15052	776 aa		29.11	■■■□□ 2.25
GPS1-223	ENST00000584229	POTEE	Q6S8J3	1075 aa		29.11	■■■□□ 2.25
GPS1-223	ENST00000584229	SYNE3	Q6ZMZ3	975 aa		29.11	■■■□□ 2.25
GPS1-223	ENST00000584229	RUFY3	Q7L099	469 aa		29.11	■■■□□ 2.25
GPS1-223	ENST00000584229	RAB11FIP4	Q86YS3	637 aa		29.11	■■■□□ 2.25
GPS1-223	ENST00000584229	TRIM17	Q9Y577	477 aa		29.11	■■■□□ 2.25
GPS1-223	ENST00000584229	SLC12A7	Q9Y666	1083 aa		29.11	■■■□□ 2.25
GPS1-223	ENST00000584229	DOCK3	Q8IZD9	2030 aa		29.11	■■■□□ 2.25
GPS1-223	ENST00000584229	TNPO2	O14787	897 aa	Known RBP	29.1	■■■□□ 2.25
GPS1-223	ENST00000584229	ANAPC15	P60006	121 aa		29.1	■■■□□ 2.25
GPS1-223	ENST00000584229	SNAP25	P60880	206 aa		29.1	■■■□□ 2.25
GPS1-223	ENST00000584229		Q3C1V9	767 aa		29.1	■■■□□ 2.25
GPS1-223	ENST00000584229	SYDE2	Q5VT97	1194 aa		29.1	■■■□□ 2.25
GPS1-223	ENST00000584229	CPXCR1	Q8N123	301 aa		29.1	■■■□□ 2.25
GPS1-223	ENST00000584229	EFCC1	Q9HA90	598 aa		29.1	■■■□□ 2.25
GPS1-223	ENST00000584229	PRR12	Q9ULL5	1215 aa		29.1	■■■□□ 2.25
GPS1-223	ENST00000584229	DDAH1	O94760	285 aa		29.09	■■■□□ 2.25
GPS1-223	ENST00000584229	RXRA	P19793	462 aa		29.09	■■■□□ 2.25
GPS1-223	ENST00000584229	TMEM132B	Q14DG7	1078 aa		29.09	■■■□□ 2.25
GPS1-223	ENST00000584229	CCDC174	Q6PII3	467 aa		29.09	■■■□□ 2.25
GPS1-223	ENST00000584229	CCDC144CP	Q8IYA2	1237 aa		29.09	■■■□□ 2.25
GPS1-223	ENST00000584229	CTCFL	Q8NI51	663 aa	Predicted RBP	29.09	■■■□□ 2.25
GPS1-223	ENST00000584229	UBA5	Q9GZZ9	404 aa		29.09	■■■□□ 2.25
GPS1-223	ENST00000584229	SPATC1L	Q9H0A9	340 aa		29.09	■■■□□ 2.25
GPS1-223	ENST00000584229	CPVL	Q9H3G5	476 aa		29.09	■■■□□ 2.25
GPS1-223	ENST00000584229	ZSWIM6	Q9HCJ5	1215 aa		29.09	■■■□□ 2.25
GPS1-223	ENST00000584229	GRM4	Q14833	912 aa		29.08	■■■□□ 2.25
GPS1-223	ENST00000584229	CTU1	Q7Z7A3	348 aa	Known RBP	29.08	■■■□□ 2.25
GPS1-223	ENST00000584229	MICU3	Q86XE3	530 aa		29.08	■■■□□ 2.25
GPS1-223	ENST00000584229	BRF1	Q92994	677 aa		29.08	■■■□□ 2.25
GPS1-223	ENST00000584229	C22orf23	Q9BZE7	217 aa		29.08	■■■□□ 2.25
GPS1-223	ENST00000584229	TM6SF1	Q9BZW5	370 aa		29.08	■■■□□ 2.25
GPS1-223	ENST00000584229	RAVER2	Q9HCJ3	691 aa	Known RBP	29.08	■■■□□ 2.25
GPS1-223	ENST00000584229	KLF18	A0A0U1RQI7	1052 aa		29.07	■■■□□ 2.24
GPS1-223	ENST00000584229	PLA2G6	O60733	806 aa		29.07	■■■□□ 2.24
GPS1-223	ENST00000584229	CTGF	P29279	349 aa		29.07	■■■□□ 2.24
GPS1-223	ENST00000584229	NCAPG2	Q86XI2	1143 aa		29.07	■■■□□ 2.24
GPS1-223	ENST00000584229	STAG2	Q8N3U4	1231 aa		29.07	■■■□□ 2.24
GPS1-223	ENST00000584229	TRIM47	Q96LD4	638 aa		29.07	■■■□□ 2.24
GPS1-223	ENST00000584229	PORCN	Q9H237	461 aa		29.07	■■■□□ 2.24
GPS1-223	ENST00000584229	ADAMTS5	Q9UNA0	930 aa		29.07	■■■□□ 2.24
GPS1-223	ENST00000584229	CALM1	P0DP23	149 aa		29.06	■■■□□ 2.24
GPS1-223	ENST00000584229	CALM2	P0DP24	149 aa		29.06	■■■□□ 2.24
GPS1-223	ENST00000584229	CALM3	P0DP25	149 aa		29.06	■■■□□ 2.24
GPS1-223	ENST00000584229	CAP1	Q01518	475 aa		29.06	■■■□□ 2.24
GPS1-223	ENST00000584229	APOBR	Q0VD83	1088 aa		29.06	■■■□□ 2.24
GPS1-223	ENST00000584229	TROAP	Q12815	778 aa		29.06	■■■□□ 2.24
GPS1-223	ENST00000584229	SNRNP48	Q6IEG0	339 aa	Known RBP	29.06	■■■□□ 2.24
GPS1-223	ENST00000584229	OTOP1	Q7RTM1	612 aa		29.06	■■■□□ 2.24
GPS1-223	ENST00000584229	COA7	Q96BR5	231 aa		29.06	■■■□□ 2.24
GPS1-223	ENST00000584229	MOV10L1	Q9BXT6	1211 aa	Known RBP	29.06	■■■□□ 2.24
GPS1-223	ENST00000584229	SLC38A10	Q9HBR0	1119 aa		29.06	■■■□□ 2.24
GPS1-223	ENST00000584229	PDRG1	Q9NUG6	133 aa		29.06	■■■□□ 2.24
GPS1-223	ENST00000584229	MAD2L2	Q9UI95	211 aa		29.06	■■■□□ 2.24
GPS1-223	ENST00000584229	ZNFX1	Q9P2E3	1918 aa	Known RBP	29.06	■■■□□ 2.24
GPS1-223	ENST00000584229	KLRF2	D3W0D1	207 aa		29.05	■■■□□ 2.24
GPS1-223	ENST00000584229	FDX1	P10109	184 aa		29.05	■■■□□ 2.24
GPS1-223	ENST00000584229	MAPK4	P31152	587 aa		29.05	■■■□□ 2.24
GPS1-223	ENST00000584229	KIF5B	P33176	963 aa		29.05	■■■□□ 2.24
GPS1-223	ENST00000584229	STAT3	P40763	770 aa		29.05	■■■□□ 2.24
GPS1-223	ENST00000584229	BTNL9	Q6UXG8	535 aa		29.05	■■■□□ 2.24
GPS1-223	ENST00000584229	SGMS1	Q86VZ5	419 aa		29.05	■■■□□ 2.24
GPS1-223	ENST00000584229	REPS2	Q8NFH8	660 aa		29.05	■■■□□ 2.24
GPS1-223	ENST00000584229	VAT1L	Q9HCJ6	419 aa		29.05	■■■□□ 2.24
GPS1-223	ENST00000584229	BAZ2B	Q9UIF8	2168 aa	Known RBP	29.05	■■■□□ 2.24
GPS1-223	ENST00000584229	ZBTB43	O43298	467 aa		29.04	■■■□□ 2.24
GPS1-223	ENST00000584229	APOA5	Q6Q788	366 aa		29.04	■■■□□ 2.24
GPS1-223	ENST00000584229	TEX13B	Q9BXU2	312 aa		29.04	■■■□□ 2.24
GPS1-223	ENST00000584229	ZNF214	Q9UL59	606 aa	Predicted RBP	29.04	■■■□□ 2.24
GPS1-223	ENST00000584229	BRPF3	Q9ULD4	1205 aa		29.04	■■■□□ 2.24
GPS1-223	ENST00000584229	IVNS1ABP	Q9Y6Y0	642 aa		29.04	■■■□□ 2.24
GPS1-223	ENST00000584229	SMCHD1	A6NHR9	2005 aa		29.03	■■■□□ 2.24
GPS1-223	ENST00000584229	GOLGA8B	A8MQT2	603 aa		29.03	■■■□□ 2.24
GPS1-223	ENST00000584229	ERCC3	P19447	782 aa		29.03	■■■□□ 2.24
GPS1-223	ENST00000584229	HOXD10	P28358	340 aa		29.03	■■■□□ 2.24
GPS1-223	ENST00000584229	HOMER2	Q9NSB8	354 aa		29.03	■■■□□ 2.24
GPS1-223	ENST00000584229	PALM3	A6NDB9	673 aa	Predicted RBP	29.02	■■■□□ 2.24
GPS1-223	ENST00000584229	GOLGA8A	A7E2F4	631 aa		29.02	■■■□□ 2.24
GPS1-223	ENST00000584229	GPR142	Q7Z601	462 aa		29.02	■■■□□ 2.24
GPS1-223	ENST00000584229	PLEKHH3	Q7Z736	793 aa		29.02	■■■□□ 2.24
GPS1-223	ENST00000584229	ADGRF4	Q8IZF3	695 aa		29.02	■■■□□ 2.24
GPS1-223	ENST00000584229	RANBP17	Q9H2T7	1088 aa	Known RBP	29.02	■■■□□ 2.24
GPS1-223	ENST00000584229	RBBP6	Q7Z6E9	1792 aa	Known RBP	29.02	■■■□□ 2.24

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