RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580022.5

TSPOAP1-AS1-205, TSPOAP1, SUPT4H1 and RNF43 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene TSPOAP1-AS1, Length 2,337 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 CRKP46108 304 aa27.46■■□□□ 1.99
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TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 KANK3Q6NY19 840 aa27.46■■□□□ 1.99
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 MTMR4Q9NYA4 1195 aa27.46■■□□□ 1.99
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 PCDHA6Q9UN73 950 aa27.46■■□□□ 1.99
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa27.46■■□□□ 1.99
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa27.46■■□□□ 1.99
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa27.46■■□□□ 1.99
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TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 ECE2O60344 883 aa27.45■■□□□ 1.98
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 ATP1A3P13637 1013 aa27.45■■□□□ 1.98
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 AFMP43652 599 aa27.45■■□□□ 1.98
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 IL17AQ16552 155 aa27.45■■□□□ 1.98
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP27.45■■□□□ 1.98
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TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 NT5DC1Q5TFE4 455 aa27.44■■□□□ 1.98
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TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 SLURP2P0DP57 97 aa27.44■■□□□ 1.98
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 CACNB3P54284 484 aa27.44■■□□□ 1.98
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TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 SLFN14P0C7P3 912 aa27.42■■□□□ 1.98
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 INF2Q27J81 1249 aa27.42■■□□□ 1.98
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 ZFPM1Q8IX07 1006 aa27.42■■□□□ 1.98
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TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa27.42■■□□□ 1.98
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 CASP1P29466 404 aa27.42■■□□□ 1.98
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 SHMT1P34896 483 aa27.42■■□□□ 1.98
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP27.42■■□□□ 1.98
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TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 ZDHHC15Q96MV8 337 aa27.41■■□□□ 1.98
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TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 GPCPD1Q9NPB8 672 aa27.38■■□□□ 1.97
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 FAM196BA6NMK8 535 aa27.37■■□□□ 1.97
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 SERPINC1P01008 464 aa27.37■■□□□ 1.97
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP27.37■■□□□ 1.97
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 TMEM60Q9H2L4 133 aa27.37■■□□□ 1.97
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 RIOX1Q9H6W3 641 aa27.37■■□□□ 1.97
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 C6orf50Q9HD87 102 aa27.37■■□□□ 1.97
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 NOL12Q9UGY1 213 aaKnown RBP eCLIP27.37■■□□□ 1.97
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TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 V9GYY5 206 aaPredicted RBP27.37■■□□□ 1.97
TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 GSDMDP57764 484 aa27.36■■□□□ 1.97
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