RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000578208.1

GGA3-204, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, human

TSL 3

Gene GGA3, Length 478 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GGA3-204	ENST00000578208	TEX13B	Q9BXU2	312 aa		13.68	□□□□□ -0.22
GGA3-204	ENST00000578208	IL25	Q9H293	177 aa		13.68	□□□□□ -0.22
GGA3-204	ENST00000578208	RPTOR	Q8N122	1335 aa		13.67	□□□□□ -0.22
GGA3-204	ENST00000578208	PLXNB2	O15031	1838 aa		13.67	□□□□□ -0.22
GGA3-204	ENST00000578208	ZNF236	Q9UL36	1845 aa		13.67	□□□□□ -0.22
GGA3-204	ENST00000578208	HTT	P42858	3142 aa		13.67	□□□□□ -0.22
GGA3-204	ENST00000578208		B4E1Z4	1266 aa		13.67	□□□□□ -0.22
GGA3-204	ENST00000578208	CAPN2	P17655	700 aa		13.67	□□□□□ -0.22
GGA3-204	ENST00000578208	ADORA2A	P29274	412 aa		13.67	□□□□□ -0.22
GGA3-204	ENST00000578208	NOV	P48745	357 aa		13.67	□□□□□ -0.22
GGA3-204	ENST00000578208	SLC4A3	P48751	1232 aa		13.67	□□□□□ -0.22
GGA3-204	ENST00000578208	RCSD1	Q6JBY9	416 aa		13.67	□□□□□ -0.22
GGA3-204	ENST00000578208	KCTD1	Q719H9	257 aa		13.67	□□□□□ -0.22
GGA3-204	ENST00000578208	ABRA	Q8N0Z2	381 aa		13.67	□□□□□ -0.22
GGA3-204	ENST00000578208	CPXCR1	Q8N123	301 aa		13.67	□□□□□ -0.22
GGA3-204	ENST00000578208	U2AF1L4	Q8WU68	220 aa	Known RBP	13.67	□□□□□ -0.22
GGA3-204	ENST00000578208	CHMP4C	Q96CF2	233 aa		13.67	□□□□□ -0.22
GGA3-204	ENST00000578208	MMP19	Q99542	508 aa		13.67	□□□□□ -0.22
GGA3-204	ENST00000578208	TMEM47	Q9BQJ4	181 aa		13.67	□□□□□ -0.22
GGA3-204	ENST00000578208	XRN2	Q9H0D6	950 aa	Known RBP eCLIP	13.67	□□□□□ -0.22
GGA3-204	ENST00000578208	HMX1	Q9NP08	348 aa	Predicted RBP	13.67	□□□□□ -0.22
GGA3-204	ENST00000578208	HOXC6	P09630	235 aa		13.66	□□□□□ -0.22
GGA3-204	ENST00000578208	PRKAR2A	P13861	404 aa	Known RBP	13.66	□□□□□ -0.22
GGA3-204	ENST00000578208	GJA8	P48165	433 aa		13.66	□□□□□ -0.22
GGA3-204	ENST00000578208	PTH1R	Q03431	593 aa		13.66	□□□□□ -0.22
GGA3-204	ENST00000578208	KCTD2	Q14681	263 aa		13.66	□□□□□ -0.22
GGA3-204	ENST00000578208	RALYL	Q86SE5	291 aa	Known RBP	13.66	□□□□□ -0.22
GGA3-204	ENST00000578208	REPS2	Q8NFH8	660 aa		13.66	□□□□□ -0.22
GGA3-204	ENST00000578208	DEFB118	Q96PH6	123 aa		13.66	□□□□□ -0.22
GGA3-204	ENST00000578208	ZKSCAN3	Q9BRR0	538 aa		13.66	□□□□□ -0.22
GGA3-204	ENST00000578208	UBAC1	Q9BSL1	405 aa		13.66	□□□□□ -0.22
GGA3-204	ENST00000578208	KAT14	Q9H8E8	782 aa		13.66	□□□□□ -0.22
GGA3-204	ENST00000578208	SLC38A10	Q9HBR0	1119 aa		13.66	□□□□□ -0.22
GGA3-204	ENST00000578208	ZNF214	Q9UL59	606 aa	Predicted RBP	13.66	□□□□□ -0.22
GGA3-204	ENST00000578208	COL11A1	P12107	1806 aa	Predicted RBP	13.66	□□□□□ -0.22
GGA3-204	ENST00000578208	DOCK3	Q8IZD9	2030 aa		13.65	□□□□□ -0.22
GGA3-204	ENST00000578208	ATP2A1	O14983	1001 aa		13.65	□□□□□ -0.22
GGA3-204	ENST00000578208	PLA2G6	O60733	806 aa		13.65	□□□□□ -0.22
GGA3-204	ENST00000578208	OAZ1	P54368	228 aa		13.65	□□□□□ -0.22
GGA3-204	ENST00000578208	CCL14	Q16627	93 aa		13.65	□□□□□ -0.22
GGA3-204	ENST00000578208	DGKH	Q86XP1	1220 aa		13.65	□□□□□ -0.22
GGA3-204	ENST00000578208	ZSCAN10	Q96SZ4	725 aa	Predicted RBP	13.65	□□□□□ -0.22
GGA3-204	ENST00000578208	RAVER2	Q9HCJ3	691 aa	Known RBP	13.65	□□□□□ -0.22
GGA3-204	ENST00000578208	FBXO40	Q9UH90	709 aa		13.65	□□□□□ -0.22
GGA3-204	ENST00000578208	SGPL1	O95470	568 aa		13.64	□□□□□ -0.23
GGA3-204	ENST00000578208	TFRC	P02786	760 aa	Known RBP	13.64	□□□□□ -0.23
GGA3-204	ENST00000578208	CACNB2	Q08289	660 aa	Predicted RBP	13.64	□□□□□ -0.23
GGA3-204	ENST00000578208	TRIM32	Q13049	653 aa		13.64	□□□□□ -0.23
GGA3-204	ENST00000578208	ERICH6B	Q5W0A0	696 aa		13.64	□□□□□ -0.23
GGA3-204	ENST00000578208	SKAP1	Q86WV1	359 aa		13.64	□□□□□ -0.23
GGA3-204	ENST00000578208	NPLOC4	Q8TAT6	608 aa		13.64	□□□□□ -0.23
GGA3-204	ENST00000578208	ESYT1	Q9BSJ8	1104 aa		13.64	□□□□□ -0.23
GGA3-204	ENST00000578208	PAK6	Q9NQU5	681 aa	Predicted RBP	13.64	□□□□□ -0.23
GGA3-204	ENST00000578208	RBM8A	Q9Y5S9	174 aa	Known RBP	13.64	□□□□□ -0.23
GGA3-204	ENST00000578208	TNKS	O95271	1327 aa		13.64	□□□□□ -0.23
GGA3-204	ENST00000578208	ERICH2	A1L162	156 aa		13.63	□□□□□ -0.23
GGA3-204	ENST00000578208	CDC45	O75419	566 aa		13.63	□□□□□ -0.23
GGA3-204	ENST00000578208	CYP21A2	P08686	494 aa		13.63	□□□□□ -0.23
GGA3-204	ENST00000578208	PDHB	P11177	359 aa		13.63	□□□□□ -0.23
GGA3-204	ENST00000578208	GPATCH4	Q5T3I0	446 aa	Known RBP	13.63	□□□□□ -0.23
GGA3-204	ENST00000578208	MAP3K21	Q5TCX8	1036 aa		13.63	□□□□□ -0.23
GGA3-204	ENST00000578208	SYDE2	Q5VT97	1194 aa		13.63	□□□□□ -0.23
GGA3-204	ENST00000578208	OLFML2B	Q68BL8	750 aa		13.63	□□□□□ -0.23
GGA3-204	ENST00000578208	RASGRP2	Q7LDG7	609 aa		13.63	□□□□□ -0.23
GGA3-204	ENST00000578208	PNMA1	Q8ND90	353 aa		13.63	□□□□□ -0.23
GGA3-204	ENST00000578208	CHST13	Q8NET6	341 aa		13.63	□□□□□ -0.23
GGA3-204	ENST00000578208	NCOA7	Q8NI08	942 aa		13.63	□□□□□ -0.23
GGA3-204	ENST00000578208	SHISA4	Q96DD7	197 aa		13.63	□□□□□ -0.23
GGA3-204	ENST00000578208	DDX11	Q96FC9	970 aa		13.63	□□□□□ -0.23
GGA3-204	ENST00000578208	GPCPD1	Q9NPB8	672 aa		13.63	□□□□□ -0.23
GGA3-204	ENST00000578208	ANO2	Q9NQ90	1003 aa		13.63	□□□□□ -0.23
GGA3-204	ENST00000578208	ZSWIM5	Q9P217	1185 aa		13.63	□□□□□ -0.23
GGA3-204	ENST00000578208	PRR12	Q9ULL5	1215 aa		13.63	□□□□□ -0.23
GGA3-204	ENST00000578208	FRMPD2	Q68DX3	1309 aa	Predicted RBP	13.63	□□□□□ -0.23
GGA3-204	ENST00000578208	COBL	O75128	1261 aa		13.62	□□□□□ -0.23
GGA3-204	ENST00000578208	FARP2	O94887	1054 aa	Predicted RBP	13.62	□□□□□ -0.23
GGA3-204	ENST00000578208	CNGA1	P29973	690 aa		13.62	□□□□□ -0.23
GGA3-204	ENST00000578208	ZNF543	Q08ER8	600 aa		13.62	□□□□□ -0.23
GGA3-204	ENST00000578208	SART3	Q15020	963 aa	Known RBP	13.62	□□□□□ -0.23
GGA3-204	ENST00000578208	TKFC	Q3LXA3	575 aa		13.62	□□□□□ -0.23
GGA3-204	ENST00000578208	IFIT1B	Q5T764	474 aa	Known RBP	13.62	□□□□□ -0.23
GGA3-204	ENST00000578208	CCDC174	Q6PII3	467 aa		13.62	□□□□□ -0.23
GGA3-204	ENST00000578208	ANKRD35	Q8N283	1001 aa		13.62	□□□□□ -0.23
GGA3-204	ENST00000578208	MAP4K1	Q92918	833 aa		13.62	□□□□□ -0.23
GGA3-204	ENST00000578208	ACAD9	Q9H845	621 aa		13.62	□□□□□ -0.23
GGA3-204	ENST00000578208	PPP4R2	Q9NY27	417 aa		13.62	□□□□□ -0.23
GGA3-204	ENST00000578208	FLRT1	Q9NZU1	646 aa		13.62	□□□□□ -0.23
GGA3-204	ENST00000578208	PNMA2	Q9UL42	364 aa		13.62	□□□□□ -0.23
GGA3-204	ENST00000578208		E7EWF7	191 aa		13.61	□□□□□ -0.23
GGA3-204	ENST00000578208	MSC	O60682	206 aa		13.61	□□□□□ -0.23
GGA3-204	ENST00000578208	PGK2	P07205	417 aa		13.61	□□□□□ -0.23
GGA3-204	ENST00000578208	CYP2C19	P33261	490 aa		13.61	□□□□□ -0.23
GGA3-204	ENST00000578208	SLC16A2	P36021	539 aa		13.61	□□□□□ -0.23
GGA3-204	ENST00000578208	TTBK2	Q6IQ55	1244 aa		13.61	□□□□□ -0.23
GGA3-204	ENST00000578208	BTNL9	Q6UXG8	535 aa		13.61	□□□□□ -0.23
GGA3-204	ENST00000578208	ENAH	Q8N8S7	591 aa	Predicted RBP	13.61	□□□□□ -0.23
GGA3-204	ENST00000578208	ANKLE1	Q8NAG6	615 aa		13.61	□□□□□ -0.23
GGA3-204	ENST00000578208	ANKS1A	Q92625	1134 aa		13.61	□□□□□ -0.23
GGA3-204	ENST00000578208	MAML3	Q96JK9	1138 aa		13.61	□□□□□ -0.23
GGA3-204	ENST00000578208	HOMER2	Q9NSB8	354 aa		13.61	□□□□□ -0.23

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