RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000569270.5

CHTF18-218, Transcript of chromosome transmission fidelity factor 18, humanhuman

TSL 5

Gene CHTF18, Length 711 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHTF18-218ENST00000569270 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP22.97■■□□□ 1.27
CHTF18-218ENST00000569270 PDE1AP54750 535 aa22.97■■□□□ 1.27
CHTF18-218ENST00000569270 CHMP4CQ96CF2 233 aa22.97■■□□□ 1.27
CHTF18-218ENST00000569270 DDX11Q96FC9 970 aa22.97■■□□□ 1.27
CHTF18-218ENST00000569270 INCENPQ9NQS7 918 aa22.97■■□□□ 1.27
CHTF18-218ENST00000569270 NRBP1Q9UHY1 535 aa22.97■■□□□ 1.27
CHTF18-218ENST00000569270 MYH7P12883 1935 aa22.96■■□□□ 1.27
CHTF18-218ENST00000569270 BMP3P12645 472 aa22.96■■□□□ 1.27
CHTF18-218ENST00000569270 RTP1P59025 263 aa22.96■■□□□ 1.27
CHTF18-218ENST00000569270 CTDSPL2Q05D32 466 aa22.96■■□□□ 1.27
CHTF18-218ENST00000569270 LRRC41Q15345 812 aa22.96■■□□□ 1.27
CHTF18-218ENST00000569270 VPS53Q5VIR6 699 aa22.96■■□□□ 1.27
CHTF18-218ENST00000569270 TDHQ8IZJ6 230 aa22.96■■□□□ 1.27
CHTF18-218ENST00000569270 ATP11BQ9Y2G3 1177 aa22.96■■□□□ 1.27
CHTF18-218ENST00000569270 PLIN4Q96Q06 1357 aa22.96■■□□□ 1.27
CHTF18-218ENST00000569270 ATP2A1O14983 1001 aa22.95■■□□□ 1.26
CHTF18-218ENST00000569270 RARBP10826 455 aa22.95■■□□□ 1.26
CHTF18-218ENST00000569270 ADCYAP1R1P41586 468 aa22.95■■□□□ 1.26
CHTF18-218ENST00000569270 FERMT2Q96AC1 680 aa22.95■■□□□ 1.26
CHTF18-218ENST00000569270 LBHD1Q9BQE6 289 aaPredicted RBP22.95■■□□□ 1.26
CHTF18-218ENST00000569270 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa22.95■■□□□ 1.26
CHTF18-218ENST00000569270 XPNPEP3Q9NQH7 507 aa22.95■■□□□ 1.26
CHTF18-218ENST00000569270 CNPY2Q9Y2B0 182 aa22.95■■□□□ 1.26
CHTF18-218ENST00000569270 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP22.95■■□□□ 1.26
CHTF18-218ENST00000569270 ALPK3Q96L96 1907 aa22.94■■□□□ 1.26
CHTF18-218ENST00000569270 TSPY2A6NKD2 308 aa22.94■■□□□ 1.26
CHTF18-218ENST00000569270 SLC39A5Q6ZMH5 540 aa22.94■■□□□ 1.26
CHTF18-218ENST00000569270 LNPKQ9C0E8 428 aa22.94■■□□□ 1.26
CHTF18-218ENST00000569270 STX8Q9UNK0 236 aa22.94■■□□□ 1.26
CHTF18-218ENST00000569270 TMEM232C9JQI7 657 aa22.93■■□□□ 1.26
CHTF18-218ENST00000569270 PGK1P00558 417 aa22.93■■□□□ 1.26
CHTF18-218ENST00000569270 ZNF865P0CJ78 1059 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
CHTF18-218ENST00000569270 IKQ13123 557 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
CHTF18-218ENST00000569270 FAM227BQ96M60 508 aa22.93■■□□□ 1.26
CHTF18-218ENST00000569270 HELLSQ9NRZ9 838 aa22.93■■□□□ 1.26
CHTF18-218ENST00000569270 PRKAG2Q9UGJ0 569 aa22.93■■□□□ 1.26
CHTF18-218ENST00000569270 DNAJC25-GNG10A0A024R161 153 aa22.92■■□□□ 1.26
CHTF18-218ENST00000569270 NMT2O60551 498 aa22.92■■□□□ 1.26
CHTF18-218ENST00000569270 MCCP23508 829 aa22.92■■□□□ 1.26
CHTF18-218ENST00000569270 SLC1A4P43007 532 aa22.92■■□□□ 1.26
CHTF18-218ENST00000569270 TRIM60Q495X7 471 aa22.92■■□□□ 1.26
CHTF18-218ENST00000569270 ANKRD35Q8N283 1001 aa22.92■■□□□ 1.26
CHTF18-218ENST00000569270 LENG1Q96BZ8 264 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
CHTF18-218ENST00000569270 GMCL1Q96IK5 515 aa22.92■■□□□ 1.26
CHTF18-218ENST00000569270 MYH8P13535 1937 aa22.92■■□□□ 1.26
CHTF18-218ENST00000569270 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
CHTF18-218ENST00000569270 SZT2Q5T011 3432 aa22.91■■□□□ 1.26
CHTF18-218ENST00000569270 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
CHTF18-218ENST00000569270 AKR1A1P14550 325 aa22.91■■□□□ 1.26
CHTF18-218ENST00000569270 STAT2P52630 851 aa22.91■■□□□ 1.26
CHTF18-218ENST00000569270 OAZ1P54368 228 aa22.91■■□□□ 1.26
CHTF18-218ENST00000569270 LRIT3Q3SXY7 679 aa22.91■■□□□ 1.26
CHTF18-218ENST00000569270 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa22.91■■□□□ 1.26
CHTF18-218ENST00000569270 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa22.91■■□□□ 1.26
CHTF18-218ENST00000569270 RNF180Q86T96 592 aa22.91■■□□□ 1.26
CHTF18-218ENST00000569270 MSL3Q8N5Y2 521 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
CHTF18-218ENST00000569270 PRDM5Q9NQX1 630 aaPredicted RBP22.91■■□□□ 1.26
CHTF18-218ENST00000569270 IL17RBQ9NRM6 502 aa22.91■■□□□ 1.26
CHTF18-218ENST00000569270 HOMER2Q9NSB8 354 aa22.91■■□□□ 1.26
CHTF18-218ENST00000569270 FBXO40Q9UH90 709 aa22.91■■□□□ 1.26
CHTF18-218ENST00000569270 ANAPC4Q9UJX5 808 aa22.91■■□□□ 1.26
CHTF18-218ENST00000569270 ZHX1Q9UKY1 873 aaPredicted RBP22.91■■□□□ 1.26
CHTF18-218ENST00000569270 TACC3Q9Y6A5 838 aa22.91■■□□□ 1.26
CHTF18-218ENST00000569270 SYNGAP1Q96PV0 1343 aa22.9■■□□□ 1.26
CHTF18-218ENST00000569270 A0A0D9SFI3 127 aa22.9■■□□□ 1.26
CHTF18-218ENST00000569270 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa22.9■■□□□ 1.26
CHTF18-218ENST00000569270 SNAI1O95863 264 aaPredicted RBP22.9■■□□□ 1.26
CHTF18-218ENST00000569270 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa22.9■■□□□ 1.26
CHTF18-218ENST00000569270 FAM160B2Q86V87 743 aa22.9■■□□□ 1.26
CHTF18-218ENST00000569270 CHST13Q8NET6 341 aa22.9■■□□□ 1.26
CHTF18-218ENST00000569270 CHURC1Q8WUH1 139 aa22.9■■□□□ 1.26
CHTF18-218ENST00000569270 STAG1Q8WVM7 1258 aa22.9■■□□□ 1.26
CHTF18-218ENST00000569270 TOMM22Q9NS69 142 aa22.9■■□□□ 1.26
CHTF18-218ENST00000569270 PHF24Q9UPV7 400 aa22.9■■□□□ 1.26
CHTF18-218ENST00000569270 MTMR7Q9Y216 660 aa22.9■■□□□ 1.26
CHTF18-218ENST00000569270 ALX1Q15699 326 aa22.89■■□□□ 1.25
CHTF18-218ENST00000569270 MAMDC4Q6UXC1 1216 aa22.89■■□□□ 1.25
CHTF18-218ENST00000569270 KCTD1Q719H9 257 aa22.89■■□□□ 1.25
CHTF18-218ENST00000569270 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP22.89■■□□□ 1.25
CHTF18-218ENST00000569270 FAM184BQ9ULE4 1060 aa22.89■■□□□ 1.25
CHTF18-218ENST00000569270 FGAP02671 866 aa22.88■■□□□ 1.25
CHTF18-218ENST00000569270 FDX1P10109 184 aa22.88■■□□□ 1.25
CHTF18-218ENST00000569270 SNAP25P60880 206 aa22.88■■□□□ 1.25
CHTF18-218ENST00000569270 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP22.88■■□□□ 1.25
CHTF18-218ENST00000569270 AAMPQ13685 434 aa22.88■■□□□ 1.25
CHTF18-218ENST00000569270 SNX17Q15036 470 aa22.88■■□□□ 1.25
CHTF18-218ENST00000569270 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP22.88■■□□□ 1.25
CHTF18-218ENST00000569270 RASGRP2Q7LDG7 609 aa22.88■■□□□ 1.25
CHTF18-218ENST00000569270 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP22.88■■□□□ 1.25
CHTF18-218ENST00000569270 RILPL2Q969X0 211 aa22.88■■□□□ 1.25
CHTF18-218ENST00000569270 AGBL1Q96MI9 1066 aa22.88■■□□□ 1.25
CHTF18-218ENST00000569270 ORC4O43929 436 aa22.87■■□□□ 1.25
CHTF18-218ENST00000569270 RCSD1Q6JBY9 416 aa22.87■■□□□ 1.25
CHTF18-218ENST00000569270 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP22.87■■□□□ 1.25
CHTF18-218ENST00000569270 SMC5Q8IY18 1101 aa22.87■■□□□ 1.25
CHTF18-218ENST00000569270 FGD4Q96M96 766 aa22.87■■□□□ 1.25
CHTF18-218ENST00000569270 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP22.87■■□□□ 1.25
CHTF18-218ENST00000569270 LAMA3Q16787 3333 aa22.87■■□□□ 1.25
CHTF18-218ENST00000569270 ACVR2BQ13705 512 aa22.86■■□□□ 1.25
CHTF18-218ENST00000569270 CCDC174Q6PII3 467 aa22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.4 ms