RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567434.5

CCNDBP1-211, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

TSL 3

Gene CCNDBP1, Length 713 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-211ENST00000567434 TEX13BQ9BXU2 312 aa20.2■□□□□ 0.82
CCNDBP1-211ENST00000567434 INCENPQ9NQS7 918 aa20.2■□□□□ 0.82
CCNDBP1-211ENST00000567434 TACC3Q9Y6A5 838 aa20.2■□□□□ 0.82
CCNDBP1-211ENST00000567434 PLA2G6O60733 806 aa20.19■□□□□ 0.82
CCNDBP1-211ENST00000567434 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP20.19■□□□□ 0.82
CCNDBP1-211ENST00000567434 SLC1A4P43007 532 aa20.19■□□□□ 0.82
CCNDBP1-211ENST00000567434 HAND2P61296 217 aa20.19■□□□□ 0.82
CCNDBP1-211ENST00000567434 CACNB2Q08289 660 aaPredicted RBP20.19■□□□□ 0.82
CCNDBP1-211ENST00000567434 OLFML2BQ68BL8 750 aa20.19■□□□□ 0.82
CCNDBP1-211ENST00000567434 FAM160B2Q86V87 743 aa20.19■□□□□ 0.82
CCNDBP1-211ENST00000567434 CHURC1Q8WUH1 139 aa20.19■□□□□ 0.82
CCNDBP1-211ENST00000567434 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP20.19■□□□□ 0.82
CCNDBP1-211ENST00000567434 STAT2P52630 851 aa20.18■□□□□ 0.82
CCNDBP1-211ENST00000567434 OAZ1P54368 228 aa20.18■□□□□ 0.82
CCNDBP1-211ENST00000567434 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
CCNDBP1-211ENST00000567434 ESR2Q92731 530 aa20.18■□□□□ 0.82
CCNDBP1-211ENST00000567434 HTATIP2Q9BUP3 242 aa20.18■□□□□ 0.82
CCNDBP1-211ENST00000567434 NBPF3Q9H094 633 aa20.18■□□□□ 0.82
CCNDBP1-211ENST00000567434 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa20.18■□□□□ 0.82
CCNDBP1-211ENST00000567434 CEP290O15078 2479 aa20.17■□□□□ 0.82
CCNDBP1-211ENST00000567434 NMT2O60551 498 aa20.17■□□□□ 0.82
CCNDBP1-211ENST00000567434 IGHA2P01877 340 aa20.17■□□□□ 0.82
CCNDBP1-211ENST00000567434 TOP1P11387 765 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
CCNDBP1-211ENST00000567434 KCTD2Q14681 263 aa20.17■□□□□ 0.82
CCNDBP1-211ENST00000567434 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
CCNDBP1-211ENST00000567434 TBC1D10CQ8IV04 446 aa20.17■□□□□ 0.82
CCNDBP1-211ENST00000567434 NPLOC4Q8TAT6 608 aa20.17■□□□□ 0.82
CCNDBP1-211ENST00000567434 KIFC2Q96AC6 838 aa20.17■□□□□ 0.82
CCNDBP1-211ENST00000567434 TTC14Q96N46 770 aa20.17■□□□□ 0.82
CCNDBP1-211ENST00000567434 MMP19Q99542 508 aa20.17■□□□□ 0.82
CCNDBP1-211ENST00000567434 FLRT1Q9NZU1 646 aa20.17■□□□□ 0.82
CCNDBP1-211ENST00000567434 TMEM232C9JQI7 657 aa20.16■□□□□ 0.82
CCNDBP1-211ENST00000567434 H0YGN5 161 aa20.16■□□□□ 0.82
CCNDBP1-211ENST00000567434 MSCO60682 206 aa20.16■□□□□ 0.82
CCNDBP1-211ENST00000567434 CCDC178Q5BJE1 867 aa20.16■□□□□ 0.82
CCNDBP1-211ENST00000567434 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
CCNDBP1-211ENST00000567434 RCSD1Q6JBY9 416 aa20.16■□□□□ 0.82
CCNDBP1-211ENST00000567434 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP20.16■□□□□ 0.82
CCNDBP1-211ENST00000567434 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
CCNDBP1-211ENST00000567434 DCAF4Q8WV16 495 aa20.16■□□□□ 0.82
CCNDBP1-211ENST00000567434 OGDHLQ9ULD0 1010 aa20.16■□□□□ 0.82
CCNDBP1-211ENST00000567434 DIS3Q9Y2L1 958 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
CCNDBP1-211ENST00000567434 MCCP23508 829 aa20.15■□□□□ 0.82
CCNDBP1-211ENST00000567434 CHMLP26374 656 aa20.15■□□□□ 0.82
CCNDBP1-211ENST00000567434 IKQ13123 557 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
CCNDBP1-211ENST00000567434 FBXO40Q9UH90 709 aa20.15■□□□□ 0.82
CCNDBP1-211ENST00000567434 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
CCNDBP1-211ENST00000567434 COBLO75128 1261 aa20.14■□□□□ 0.81
CCNDBP1-211ENST00000567434 IQCA1Q86XH1 822 aa20.14■□□□□ 0.81
CCNDBP1-211ENST00000567434 CHST13Q8NET6 341 aa20.14■□□□□ 0.81
CCNDBP1-211ENST00000567434 MAML3Q96JK9 1138 aa20.14■□□□□ 0.81
CCNDBP1-211ENST00000567434 CNNM2Q9H8M5 875 aa20.14■□□□□ 0.81
CCNDBP1-211ENST00000567434 NRBP1Q9UHY1 535 aa20.14■□□□□ 0.81
CCNDBP1-211ENST00000567434 NEDD4P46934 1319 aa20.13■□□□□ 0.81
CCNDBP1-211ENST00000567434 CCND3P30281 292 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
CCNDBP1-211ENST00000567434 CYP2C19P33261 490 aa20.13■□□□□ 0.81
CCNDBP1-211ENST00000567434 NECAB2Q7Z6G3 386 aa20.13■□□□□ 0.81
CCNDBP1-211ENST00000567434 DGKHQ86XP1 1220 aa20.13■□□□□ 0.81
CCNDBP1-211ENST00000567434 TMEM47Q9BQJ4 181 aa20.13■□□□□ 0.81
CCNDBP1-211ENST00000567434 CYBAP13498 195 aa20.12■□□□□ 0.81
CCNDBP1-211ENST00000567434 LHX8Q68G74 356 aa20.12■□□□□ 0.81
CCNDBP1-211ENST00000567434 KCTD1Q719H9 257 aa20.12■□□□□ 0.81
CCNDBP1-211ENST00000567434 CPXCR1Q8N123 301 aa20.12■□□□□ 0.81
CCNDBP1-211ENST00000567434 DPF3Q92784 378 aa20.12■□□□□ 0.81
CCNDBP1-211ENST00000567434 KRT23Q9C075 422 aa20.12■□□□□ 0.81
CCNDBP1-211ENST00000567434 RAVER2Q9HCJ3 691 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
CCNDBP1-211ENST00000567434 ZNFX1Q9P2E3 1918 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
CCNDBP1-211ENST00000567434 CCDC96Q2M329 555 aa20.11■□□□□ 0.81
CCNDBP1-211ENST00000567434 ZNF792Q3KQV3 632 aa20.11■□□□□ 0.81
CCNDBP1-211ENST00000567434 TKFCQ3LXA3 575 aa20.11■□□□□ 0.81
CCNDBP1-211ENST00000567434 BTNL9Q6UXG8 535 aa20.11■□□□□ 0.81
CCNDBP1-211ENST00000567434 MSL3Q8N5Y2 521 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
CCNDBP1-211ENST00000567434 IL25Q9H293 177 aa20.11■□□□□ 0.81
CCNDBP1-211ENST00000567434 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
CCNDBP1-211ENST00000567434 RIPK3Q9Y572 518 aa20.11■□□□□ 0.81
CCNDBP1-211ENST00000567434 SGSM2O43147 1006 aa20.1■□□□□ 0.81
CCNDBP1-211ENST00000567434 KDM4AO75164 1064 aa20.1■□□□□ 0.81
CCNDBP1-211ENST00000567434 DDX11Q96FC9 970 aa20.1■□□□□ 0.81
CCNDBP1-211ENST00000567434 PAWRQ96IZ0 340 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
CCNDBP1-211ENST00000567434 PRR12Q9ULL5 1215 aa20.1■□□□□ 0.81
CCNDBP1-211ENST00000567434 RANBP2P49792 3224 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
CCNDBP1-211ENST00000567434 SZT2Q5T011 3432 aa20.09■□□□□ 0.81
CCNDBP1-211ENST00000567434 TRIOBPQ9H2D6 2365 aa20.09■□□□□ 0.81
CCNDBP1-211ENST00000567434 DNAJC25-GNG10A0A024R161 153 aa20.09■□□□□ 0.81
CCNDBP1-211ENST00000567434 PGK2P07205 417 aa20.09■□□□□ 0.81
CCNDBP1-211ENST00000567434 CNGA1P29973 690 aa20.09■□□□□ 0.81
CCNDBP1-211ENST00000567434 CHRDL2Q6WN34 429 aa20.09■□□□□ 0.81
CCNDBP1-211ENST00000567434 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
CCNDBP1-211ENST00000567434 ANKS1AQ92625 1134 aa20.09■□□□□ 0.81
CCNDBP1-211ENST00000567434 TINF2Q9BSI4 451 aa20.09■□□□□ 0.81
CCNDBP1-211ENST00000567434 ACAD9Q9H845 621 aa20.09■□□□□ 0.81
CCNDBP1-211ENST00000567434 PNMA2Q9UL42 364 aa20.09■□□□□ 0.81
CCNDBP1-211ENST00000567434 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
CCNDBP1-211ENST00000567434 PLXNA1Q9UIW2 1896 aa20.09■□□□□ 0.81
CCNDBP1-211ENST00000567434 ZNF536O15090 1300 aa20.08■□□□□ 0.81
CCNDBP1-211ENST00000567434 B4E1Z4 1266 aa20.08■□□□□ 0.81
CCNDBP1-211ENST00000567434 SEPT4O43236 478 aa20.08■□□□□ 0.81
CCNDBP1-211ENST00000567434 SNHG28P0DPA3 235 aa20.08■□□□□ 0.81
CCNDBP1-211ENST00000567434 PDHBP11177 359 aa20.08■□□□□ 0.81
CCNDBP1-211ENST00000567434 GPATCH4Q5T3I0 446 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.3 ms