RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000566905.5

PKD1-232, Transcript of polycystin 1, transient receptor potential channel interacting, humanhuman

TSL 3

Gene PKD1, Length 559 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD1-232ENST00000566905 RNF208Q9H0X6 261 aa22.43■■□□□ 1.18
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PKD1-232ENST00000566905 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP22.43■■□□□ 1.18
PKD1-232ENST00000566905 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP22.43■■□□□ 1.18
PKD1-232ENST00000566905 ZNF236Q9UL36 1845 aa22.43■■□□□ 1.18
PKD1-232ENST00000566905 SLC25A27O95847 323 aa22.42■■□□□ 1.18
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PKD1-232ENST00000566905 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP22.42■■□□□ 1.18
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PKD1-232ENST00000566905 FAM160B2Q86V87 743 aa22.42■■□□□ 1.18
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PKD1-232ENST00000566905 CHURC1Q8WUH1 139 aa22.42■■□□□ 1.18
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PKD1-232ENST00000566905 CASC1Q6TDU7 716 aa22.4■■□□□ 1.18
PKD1-232ENST00000566905 DPP9Q86TI2 863 aa22.4■■□□□ 1.18
PKD1-232ENST00000566905 DGKHQ86XP1 1220 aa22.4■■□□□ 1.18
PKD1-232ENST00000566905 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP22.4■■□□□ 1.18
PKD1-232ENST00000566905 UBAC1Q9BSL1 405 aa22.4■■□□□ 1.18
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PKD1-232ENST00000566905 FCER1AP12319 257 aa22.39■■□□□ 1.17
PKD1-232ENST00000566905 COPB2P35606 906 aa22.39■■□□□ 1.17
PKD1-232ENST00000566905 TTBK2Q6IQ55 1244 aa22.39■■□□□ 1.17
PKD1-232ENST00000566905 ENAHQ8N8S7 591 aaPredicted RBP22.39■■□□□ 1.17
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PKD1-232ENST00000566905 MMP19Q99542 508 aa22.39■■□□□ 1.17
PKD1-232ENST00000566905 KAT14Q9H8E8 782 aa22.39■■□□□ 1.17
PKD1-232ENST00000566905 GPCPD1Q9NPB8 672 aa22.39■■□□□ 1.17
PKD1-232ENST00000566905 E7EWF7 191 aa22.38■■□□□ 1.17
PKD1-232ENST00000566905 PDHBP11177 359 aa22.38■■□□□ 1.17
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PKD1-232ENST00000566905 CYB5R4Q7L1T6 521 aa22.38■■□□□ 1.17
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PKD1-232ENST00000566905 PNMA1Q8ND90 353 aa22.37■■□□□ 1.17
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PKD1-232ENST00000566905 FLRT1Q9NZU1 646 aa22.37■■□□□ 1.17
PKD1-232ENST00000566905 ATP2A1O14983 1001 aa22.36■■□□□ 1.17
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PKD1-232ENST00000566905 DEFB118Q96PH6 123 aa22.36■■□□□ 1.17
PKD1-232ENST00000566905 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP22.36■■□□□ 1.173e-8■■■■■ 46.9
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PKD1-232ENST00000566905 GOLGA8HP0CJ92 632 aa22.34■■□□□ 1.17
PKD1-232ENST00000566905 GJA8P48165 433 aa22.34■■□□□ 1.17
PKD1-232ENST00000566905 MAP3K21Q5TCX8 1036 aa22.34■■□□□ 1.17
PKD1-232ENST00000566905 SHISA4Q96DD7 197 aa22.34■■□□□ 1.17
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PKD1-232ENST00000566905 PAK6Q9NQU5 681 aaPredicted RBP22.34■■□□□ 1.17
PKD1-232ENST00000566905 ZNF536O15090 1300 aa22.33■■□□□ 1.17
PKD1-232ENST00000566905 MYH6P13533 1939 aa22.33■■□□□ 1.17
PKD1-232ENST00000566905 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP22.33■■□□□ 1.17
PKD1-232ENST00000566905 SGPL1O95470 568 aa22.33■■□□□ 1.17
PKD1-232ENST00000566905 SNHG28P0DPA3 235 aa22.33■■□□□ 1.17
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