RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558086.1

TMC3-AS1-201, TMC3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2

Gene TMC3-AS1, Length 658 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMC3-AS1-201ENST00000558086 MS4A1P11836 297 aa16.16■□□□□ 0.18
TMC3-AS1-201ENST00000558086 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP16.16■□□□□ 0.18
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TMC3-AS1-201ENST00000558086 SBK1Q52WX2 424 aa16.16■□□□□ 0.18
TMC3-AS1-201ENST00000558086 FAM83BQ5T0W9 1011 aa16.16■□□□□ 0.18
TMC3-AS1-201ENST00000558086 BOLA2Q9H3K6 86 aa16.16■□□□□ 0.18
TMC3-AS1-201ENST00000558086 NYAP2Q9P242 653 aa16.16■□□□□ 0.18
TMC3-AS1-201ENST00000558086 TBX21Q9UL17 535 aa16.16■□□□□ 0.18
TMC3-AS1-201ENST00000558086 DDX19BQ9UMR2 479 aa16.16■□□□□ 0.18
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TMC3-AS1-201ENST00000558086 ACLYP53396 1101 aa16.15■□□□□ 0.18
TMC3-AS1-201ENST00000558086 NKX3-2P78367 333 aa16.15■□□□□ 0.18
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TMC3-AS1-201ENST00000558086 GIMAP6Q6P9H5 292 aa16.15■□□□□ 0.18
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TMC3-AS1-201ENST00000558086 ELP1O95163 1332 aa16.15■□□□□ 0.18
TMC3-AS1-201ENST00000558086 PRUNE2Q8WUY3 3088 aa16.15■□□□□ 0.18
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TMC3-AS1-201ENST00000558086 FOSL2P15408 326 aa16.14■□□□□ 0.17
TMC3-AS1-201ENST00000558086 CDK7P50613 346 aa16.14■□□□□ 0.17
TMC3-AS1-201ENST00000558086 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa16.14■□□□□ 0.17
TMC3-AS1-201ENST00000558086 NUP133Q8WUM0 1156 aa16.14■□□□□ 0.17
TMC3-AS1-201ENST00000558086 FGD4Q96M96 766 aa16.14■□□□□ 0.17
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TMC3-AS1-201ENST00000558086 STARD7Q9NQZ5 370 aa16.14■□□□□ 0.17
TMC3-AS1-201ENST00000558086 FAM184BQ9ULE4 1060 aa16.14■□□□□ 0.17
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TMC3-AS1-201ENST00000558086 HSFX3A0A1B0GWH4 333 aaPredicted RBP16.13■□□□□ 0.17
TMC3-AS1-201ENST00000558086 DCDC2CA8MYV0 355 aa16.13■□□□□ 0.17
TMC3-AS1-201ENST00000558086 PQBP1O60828 265 aaKnown RBP16.13■□□□□ 0.17
TMC3-AS1-201ENST00000558086 TIMP1P01033 207 aa16.13■□□□□ 0.17
TMC3-AS1-201ENST00000558086 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP16.13■□□□□ 0.17
TMC3-AS1-201ENST00000558086 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP16.13■□□□□ 0.17
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TMC3-AS1-201ENST00000558086 TMEM39AQ9NV64 488 aa16.13■□□□□ 0.17
TMC3-AS1-201ENST00000558086 RIPK3Q9Y572 518 aa16.13■□□□□ 0.17
TMC3-AS1-201ENST00000558086 MROH7Q68CQ1 1323 aa16.13■□□□□ 0.17
TMC3-AS1-201ENST00000558086 GSG1L2A8MUP6 293 aa16.12■□□□□ 0.17
TMC3-AS1-201ENST00000558086 F5H6K3 240 aa16.12■□□□□ 0.17
TMC3-AS1-201ENST00000558086 APBB1O00213 710 aa16.12■□□□□ 0.17
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TMC3-AS1-201ENST00000558086 DNAJB2P25686 324 aa16.12■□□□□ 0.17
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TMC3-AS1-201ENST00000558086 MKL1Q969V6 931 aa16.12■□□□□ 0.17
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TMC3-AS1-201ENST00000558086 MCM3APO60318 1980 aa16.11■□□□□ 0.17
TMC3-AS1-201ENST00000558086 MYADML2A6NDP7 307 aa16.11■□□□□ 0.17
TMC3-AS1-201ENST00000558086 CTAGE5O15320 804 aa16.11■□□□□ 0.17
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TMC3-AS1-201ENST00000558086 GJA9P57773 515 aa16.11■□□□□ 0.17
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TMC3-AS1-201ENST00000558086 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP16.11■□□□□ 0.17
TMC3-AS1-201ENST00000558086 ABHD16BQ9H3Z7 469 aa16.11■□□□□ 0.17
TMC3-AS1-201ENST00000558086 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa16.11■□□□□ 0.17
TMC3-AS1-201ENST00000558086 KCNA4P22459 653 aa16.1■□□□□ 0.17
TMC3-AS1-201ENST00000558086 ACVR2BQ13705 512 aa16.1■□□□□ 0.17
TMC3-AS1-201ENST00000558086 PCSK9Q8NBP7 692 aaKnown RBP16.1■□□□□ 0.17
TMC3-AS1-201ENST00000558086 CHST13Q8NET6 341 aa16.1■□□□□ 0.17
TMC3-AS1-201ENST00000558086 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP16.1■□□□□ 0.17
TMC3-AS1-201ENST00000558086 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP16.1■□□□□ 0.17
TMC3-AS1-201ENST00000558086 PRDM6Q9NQX0 595 aa16.1■□□□□ 0.17
TMC3-AS1-201ENST00000558086 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP16.1■□□□□ 0.17
TMC3-AS1-201ENST00000558086 FBXO40Q9UH90 709 aa16.1■□□□□ 0.17
TMC3-AS1-201ENST00000558086 LRRC37A2A6NM11 1700 aa16.1■□□□□ 0.17
TMC3-AS1-201ENST00000558086 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP16.09■□□□□ 0.17
TMC3-AS1-201ENST00000558086 TMEM240Q5SV17 173 aa16.09■□□□□ 0.17
TMC3-AS1-201ENST00000558086 FAM126BQ8IXS8 530 aa16.09■□□□□ 0.17
TMC3-AS1-201ENST00000558086 KBTBD3Q8NAB2 608 aa16.09■□□□□ 0.17
TMC3-AS1-201ENST00000558086 USP38Q8NB14 1042 aa16.09■□□□□ 0.17
TMC3-AS1-201ENST00000558086 SLC43A3Q8NBI5 491 aa16.09■□□□□ 0.17
TMC3-AS1-201ENST00000558086 GMCL1P1Q8NEA9 526 aa16.09■□□□□ 0.17
TMC3-AS1-201ENST00000558086 DDX11Q96FC9 970 aa16.09■□□□□ 0.17
TMC3-AS1-201ENST00000558086 GLT1D1Q96MS3 346 aa16.09■□□□□ 0.17
TMC3-AS1-201ENST00000558086 LRRCC1Q9C099 1032 aa16.09■□□□□ 0.17
TMC3-AS1-201ENST00000558086 ZNF576Q9H609 170 aa16.09■□□□□ 0.17
TMC3-AS1-201ENST00000558086 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP16.09■□□□□ 0.17
TMC3-AS1-201ENST00000558086 COG6Q9Y2V7 657 aa16.09■□□□□ 0.17
TMC3-AS1-201ENST00000558086 MUC3AQ02505 3323 aa16.09■□□□□ 0.17
TMC3-AS1-201ENST00000558086 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.16
TMC3-AS1-201ENST00000558086 ARVCFO00192 962 aa16.08■□□□□ 0.16
TMC3-AS1-201ENST00000558086 CD4P01730 458 aa16.08■□□□□ 0.16
TMC3-AS1-201ENST00000558086 ASGR1P07306 291 aa16.08■□□□□ 0.16
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