RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555690.5

PPP4R4-204, Transcript of protein phosphatase 4 regulatory subunit 4, human

TSL 3

Gene PPP4R4, Length 680 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PPP4R4-204	ENST00000555690	ZBED4	O75132	1171 aa		29.11	■■■□□ 2.25
PPP4R4-204	ENST00000555690	ZNF865	P0CJ78	1059 aa	Predicted RBP	29.11	■■■□□ 2.25
PPP4R4-204	ENST00000555690	TRIM60	Q495X7	471 aa		29.11	■■■□□ 2.25
PPP4R4-204	ENST00000555690	ZMYM1	Q5SVZ6	1142 aa		29.11	■■■□□ 2.25
PPP4R4-204	ENST00000555690	LRRC47	Q8N1G4	583 aa	Known RBP	29.11	■■■□□ 2.25
PPP4R4-204	ENST00000555690	KIFC2	Q96AC6	838 aa		29.11	■■■□□ 2.25
PPP4R4-204	ENST00000555690	PLXNA1	Q9UIW2	1896 aa		29.1	■■■□□ 2.25
PPP4R4-204	ENST00000555690	TTLL1	O95922	423 aa		29.1	■■■□□ 2.25
PPP4R4-204	ENST00000555690	PGK1	P00558	417 aa		29.1	■■■□□ 2.25
PPP4R4-204	ENST00000555690	MX1	P20591	662 aa		29.1	■■■□□ 2.25
PPP4R4-204	ENST00000555690	SNX17	Q15036	470 aa		29.1	■■■□□ 2.25
PPP4R4-204	ENST00000555690	DDX11	Q96FC9	970 aa		29.1	■■■□□ 2.25
PPP4R4-204	ENST00000555690	NAPB	Q9H115	298 aa		29.1	■■■□□ 2.25
PPP4R4-204	ENST00000555690	RAVER2	Q9HCJ3	691 aa	Known RBP	29.1	■■■□□ 2.25
PPP4R4-204	ENST00000555690	PRDM5	Q9NQX1	630 aa	Predicted RBP	29.1	■■■□□ 2.25
PPP4R4-204	ENST00000555690	CNPY2	Q9Y2B0	182 aa		29.1	■■■□□ 2.25
PPP4R4-204	ENST00000555690	CTDP1	Q9Y5B0	961 aa	Predicted RBP	29.1	■■■□□ 2.25
PPP4R4-204	ENST00000555690	ATP2A1	O14983	1001 aa		29.09	■■■□□ 2.25
PPP4R4-204	ENST00000555690	TSPY3	P0CV98	308 aa		29.09	■■■□□ 2.25
PPP4R4-204	ENST00000555690	TSPY8	P0CW00	308 aa		29.09	■■■□□ 2.25
PPP4R4-204	ENST00000555690	PDE4B	Q07343	736 aa		29.09	■■■□□ 2.25
PPP4R4-204	ENST00000555690	NEDD1	Q8NHV4	660 aa		29.09	■■■□□ 2.25
PPP4R4-204	ENST00000555690	LENG1	Q96BZ8	264 aa	Predicted RBP	29.09	■■■□□ 2.25
PPP4R4-204	ENST00000555690	PHF24	Q9UPV7	400 aa		29.09	■■■□□ 2.25
PPP4R4-204	ENST00000555690	MYH4	Q9Y623	1939 aa		29.09	■■■□□ 2.25
PPP4R4-204	ENST00000555690	PPARA	Q07869	468 aa		29.08	■■■□□ 2.25
PPP4R4-204	ENST00000555690	RNF180	Q86T96	592 aa		29.08	■■■□□ 2.25
PPP4R4-204	ENST00000555690	SLC17A8	Q8NDX2	589 aa		29.08	■■■□□ 2.25
PPP4R4-204	ENST00000555690	SLC38A10	Q9HBR0	1119 aa		29.08	■■■□□ 2.25
PPP4R4-204	ENST00000555690	FEM1B	Q9UK73	627 aa		29.08	■■■□□ 2.25
PPP4R4-204	ENST00000555690	SYNPO2	Q9UMS6	1093 aa		29.08	■■■□□ 2.25
PPP4R4-204	ENST00000555690	SLC3A2	P08195	630 aa	Known RBP	29.07	■■■□□ 2.24
PPP4R4-204	ENST00000555690	AKR1A1	P14550	325 aa		29.07	■■■□□ 2.24
PPP4R4-204	ENST00000555690	TFAP4	Q01664	338 aa		29.07	■■■□□ 2.24
PPP4R4-204	ENST00000555690	SLFN13	Q68D06	897 aa		29.07	■■■□□ 2.24
PPP4R4-204	ENST00000555690	GMCL1P1	Q8NEA9	526 aa		29.07	■■■□□ 2.24
PPP4R4-204	ENST00000555690	MTMR10	Q9NXD2	777 aa		29.07	■■■□□ 2.24
PPP4R4-204	ENST00000555690		A0A0C4DFX4	3053 aa		29.07	■■■□□ 2.24
PPP4R4-204	ENST00000555690	PLIN4	Q96Q06	1357 aa		29.06	■■■□□ 2.24
PPP4R4-204	ENST00000555690	DNAJC25-GNG10	A0A024R161	153 aa		29.06	■■■□□ 2.24
PPP4R4-204	ENST00000555690	SNAI1	O95863	264 aa	Predicted RBP	29.06	■■■□□ 2.24
PPP4R4-204	ENST00000555690	C1orf53	Q5VUE5	145 aa		29.06	■■■□□ 2.24
PPP4R4-204	ENST00000555690	SH3RF1	Q7Z6J0	888 aa		29.06	■■■□□ 2.24
PPP4R4-204	ENST00000555690	MSL3	Q8N5Y2	521 aa	Known RBP	29.06	■■■□□ 2.24
PPP4R4-204	ENST00000555690	PDLIM7	Q9NR12	457 aa		29.06	■■■□□ 2.24
PPP4R4-204	ENST00000555690	BMP3	P12645	472 aa		29.05	■■■□□ 2.24
PPP4R4-204	ENST00000555690	RRP1	P56182	461 aa	Known RBP	29.05	■■■□□ 2.24
PPP4R4-204	ENST00000555690	TLE2	Q04725	743 aa		29.05	■■■□□ 2.24
PPP4R4-204	ENST00000555690	CCDC129	Q6ZRS4	1044 aa		29.05	■■■□□ 2.24
PPP4R4-204	ENST00000555690	BAD	Q92934	168 aa		29.05	■■■□□ 2.24
PPP4R4-204	ENST00000555690	SYNGAP1	Q96PV0	1343 aa		29.04	■■■□□ 2.24
PPP4R4-204	ENST00000555690	SALL3	Q9BXA9	1300 aa		29.04	■■■□□ 2.24
PPP4R4-204	ENST00000555690	TRIM43B	A6NCK2	446 aa		29.04	■■■□□ 2.24
PPP4R4-204	ENST00000555690	MAMDC4	Q6UXC1	1216 aa		29.04	■■■□□ 2.24
PPP4R4-204	ENST00000555690	ANKRD35	Q8N283	1001 aa		29.04	■■■□□ 2.24
PPP4R4-204	ENST00000555690	TRIM43	Q96BQ3	446 aa	Predicted RBP	29.04	■■■□□ 2.24
PPP4R4-204	ENST00000555690	CHMP4C	Q96CF2	233 aa		29.04	■■■□□ 2.24
PPP4R4-204	ENST00000555690	ISY1	Q9ULR0	285 aa	Known RBP	29.04	■■■□□ 2.24
PPP4R4-204	ENST00000555690	TMEM232	C9JQI7	657 aa		29.03	■■■□□ 2.24
PPP4R4-204	ENST00000555690	FOXP2	O15409	715 aa		29.03	■■■□□ 2.24
PPP4R4-204	ENST00000555690	CTDSPL2	Q05D32	466 aa		29.03	■■■□□ 2.24
PPP4R4-204	ENST00000555690	ANKRD45	Q5TZF3	282 aa		29.03	■■■□□ 2.24
PPP4R4-204	ENST00000555690	INCENP	Q9NQS7	918 aa		29.03	■■■□□ 2.24
PPP4R4-204	ENST00000555690	ZBTB47	Q9UFB7	747 aa	Predicted RBP	29.03	■■■□□ 2.24
PPP4R4-204	ENST00000555690	ZHX1	Q9UKY1	873 aa	Predicted RBP	29.03	■■■□□ 2.24
PPP4R4-204	ENST00000555690	FAM184B	Q9ULE4	1060 aa		29.03	■■■□□ 2.24
PPP4R4-204	ENST00000555690	LTBP2	Q14767	1821 aa		29.03	■■■□□ 2.24
PPP4R4-204	ENST00000555690		A0A1W2PQ45	241 aa	Predicted RBP	29.02	■■■□□ 2.24
PPP4R4-204	ENST00000555690		A0A1W2PQY0	241 aa		29.02	■■■□□ 2.24
PPP4R4-204	ENST00000555690	ADAMTS4	O75173	837 aa		29.02	■■■□□ 2.24
PPP4R4-204	ENST00000555690	SHH	Q15465	462 aa		29.02	■■■□□ 2.24
PPP4R4-204	ENST00000555690	DHX30	Q7L2E3	1194 aa	Known RBP eCLIP	29.02	■■■□□ 2.24
PPP4R4-204	ENST00000555690	CHST13	Q8NET6	341 aa		29.02	■■■□□ 2.24
PPP4R4-204	ENST00000555690	FBXO40	Q9UH90	709 aa		29.02	■■■□□ 2.24
PPP4R4-204	ENST00000555690	OAZ1	P54368	228 aa		29.01	■■■□□ 2.23
PPP4R4-204	ENST00000555690	ZNF467	Q7Z7K2	595 aa	Predicted RBP	29.01	■■■□□ 2.23
PPP4R4-204	ENST00000555690	CRBN	Q96SW2	442 aa		29.01	■■■□□ 2.23
PPP4R4-204	ENST00000555690	HOMER2	Q9NSB8	354 aa		29.01	■■■□□ 2.23
PPP4R4-204	ENST00000555690	STXBP5L	Q9Y2K9	1186 aa		29.01	■■■□□ 2.23
PPP4R4-204	ENST00000555690	SYNRG	Q9UMZ2	1314 aa		29	■■■□□ 2.23
PPP4R4-204	ENST00000555690	POTEB2	H3BUK9	544 aa		29	■■■□□ 2.23
PPP4R4-204	ENST00000555690	MCC	P23508	829 aa		29	■■■□□ 2.23
PPP4R4-204	ENST00000555690	C9orf50	Q5SZB4	431 aa		29	■■■□□ 2.23
PPP4R4-204	ENST00000555690	FGD4	Q96M96	766 aa		29	■■■□□ 2.23
PPP4R4-204	ENST00000555690	DDX52	Q9Y2R4	599 aa	Known RBP eCLIP	29	■■■□□ 2.23
PPP4R4-204	ENST00000555690	SLC1A4	P43007	532 aa		28.99	■■■□□ 2.23
PPP4R4-204	ENST00000555690	STAT2	P52630	851 aa		28.99	■■■□□ 2.23
PPP4R4-204	ENST00000555690	IK	Q13123	557 aa	Predicted RBP	28.99	■■■□□ 2.23
PPP4R4-204	ENST00000555690	ACVR2B	Q13705	512 aa		28.99	■■■□□ 2.23
PPP4R4-204	ENST00000555690	VPS53	Q5VIR6	699 aa		28.99	■■■□□ 2.23
PPP4R4-204	ENST00000555690	GMCL1	Q96IK5	515 aa		28.99	■■■□□ 2.23
PPP4R4-204	ENST00000555690	TSEN34	Q9BSV6	310 aa	Known RBP	28.99	■■■□□ 2.23
PPP4R4-204	ENST00000555690	CDKN2AIP	Q9NXV6	580 aa	Predicted RBP	28.99	■■■□□ 2.23
PPP4R4-204	ENST00000555690	STX8	Q9UNK0	236 aa		28.99	■■■□□ 2.23
PPP4R4-204	ENST00000555690	TACC3	Q9Y6A5	838 aa		28.99	■■■□□ 2.23
PPP4R4-204	ENST00000555690	TSPY2	A6NKD2	308 aa		28.98	■■■□□ 2.23
PPP4R4-204	ENST00000555690	NMT2	O60551	498 aa		28.98	■■■□□ 2.23
PPP4R4-204	ENST00000555690	PQBP1	O60828	265 aa	Known RBP	28.98	■■■□□ 2.23
PPP4R4-204	ENST00000555690	CLTB	P09497	229 aa		28.98	■■■□□ 2.23
PPP4R4-204	ENST00000555690	FDX1	P10109	184 aa		28.98	■■■□□ 2.23

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