RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000553786.1

PRRX1-208, Transcript of paired related homeobox 1, humanhuman

TSL 4

Gene PRRX1, Length 529 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRX1-208ENST00000553786 ZHX1Q9UKY1 873 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
PRRX1-208ENST00000553786 DDX19BQ9UMR2 479 aa20.13■□□□□ 0.81
PRRX1-208ENST00000553786 SYNGAP1Q96PV0 1343 aa20.12■□□□□ 0.81
PRRX1-208ENST00000553786 ANKRD33Q7Z3H0 272 aa20.12■□□□□ 0.81
PRRX1-208ENST00000553786 MSL3Q8N5Y2 521 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
PRRX1-208ENST00000553786 DDX11Q96FC9 970 aa20.12■□□□□ 0.81
PRRX1-208ENST00000553786 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP20.12■□□□□ 0.81
PRRX1-208ENST00000553786 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
PRRX1-208ENST00000553786 FAM184BQ9ULE4 1060 aa20.12■□□□□ 0.81
PRRX1-208ENST00000553786 DNAJB2P25686 324 aa20.11■□□□□ 0.81
PRRX1-208ENST00000553786 FAAP100Q0VG06 881 aa20.11■□□□□ 0.81
PRRX1-208ENST00000553786 TOX2Q96NM4 488 aa20.11■□□□□ 0.81
PRRX1-208ENST00000553786 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa20.11■□□□□ 0.81
PRRX1-208ENST00000553786 COG6Q9Y2V7 657 aa20.11■□□□□ 0.81
PRRX1-208ENST00000553786 PLXNA1Q9UIW2 1896 aa20.11■□□□□ 0.81
PRRX1-208ENST00000553786 SPTBN5Q9NRC6 3674 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
PRRX1-208ENST00000553786 MOXD2PA6NHM9 499 aa20.1■□□□□ 0.81
PRRX1-208ENST00000553786 SLC4A3P48751 1232 aa20.1■□□□□ 0.81
PRRX1-208ENST00000553786 STK11IPQ8N1F8 1099 aa20.1■□□□□ 0.81
PRRX1-208ENST00000553786 MKNK2Q9HBH9 465 aa20.1■□□□□ 0.81
PRRX1-208ENST00000553786 RIPK3Q9Y572 518 aa20.1■□□□□ 0.81
PRRX1-208ENST00000553786 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP20.1■□□□□ 0.81
PRRX1-208ENST00000553786 SMCHD1A6NHR9 2005 aa20.1■□□□□ 0.81
PRRX1-208ENST00000553786 ZNFX1Q9P2E3 1918 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
PRRX1-208ENST00000553786 HSFX4A0A1B0GTS1 333 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
PRRX1-208ENST00000553786 HSFX3A0A1B0GWH4 333 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
PRRX1-208ENST00000553786 SNAI1O95863 264 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
PRRX1-208ENST00000553786 NDUFB10O96000 172 aa20.09■□□□□ 0.81
PRRX1-208ENST00000553786 RASA1P20936 1047 aa20.09■□□□□ 0.81
PRRX1-208ENST00000553786 KCNA10Q16322 511 aa20.09■□□□□ 0.81
PRRX1-208ENST00000553786 CPXCR1Q8N123 301 aa20.09■□□□□ 0.81
PRRX1-208ENST00000553786 KLHDC9Q8NEP7 349 aa20.09■□□□□ 0.81
PRRX1-208ENST00000553786 NYAP2Q9P242 653 aa20.09■□□□□ 0.81
PRRX1-208ENST00000553786 MROH7Q68CQ1 1323 aa20.08■□□□□ 0.81
PRRX1-208ENST00000553786 DNAJC25-GNG10A0A024R161 153 aa20.08■□□□□ 0.81
PRRX1-208ENST00000553786 MYADML2A6NDP7 307 aa20.08■□□□□ 0.81
PRRX1-208ENST00000553786 F5H6K3 240 aa20.08■□□□□ 0.81
PRRX1-208ENST00000553786 DUSP11O75319 330 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.81
PRRX1-208ENST00000553786 C6orf222P0C671 652 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.81
PRRX1-208ENST00000553786 KLRC3Q07444 240 aa20.08■□□□□ 0.81
PRRX1-208ENST00000553786 GRIN2CQ14957 1233 aa20.08■□□□□ 0.81
PRRX1-208ENST00000553786 MAMDC4Q6UXC1 1216 aa20.08■□□□□ 0.81
PRRX1-208ENST00000553786 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.81
PRRX1-208ENST00000553786 GLT1D1Q96MS3 346 aa20.08■□□□□ 0.81
PRRX1-208ENST00000553786 TBX21Q9UL17 535 aa20.08■□□□□ 0.81
PRRX1-208ENST00000553786 ZBED4O75132 1171 aa20.07■□□□□ 0.8
PRRX1-208ENST00000553786 TIMP1P01033 207 aa20.07■□□□□ 0.8
PRRX1-208ENST00000553786 SBK1Q52WX2 424 aa20.07■□□□□ 0.8
PRRX1-208ENST00000553786 CCSAPQ6IQ19 270 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
PRRX1-208ENST00000553786 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
PRRX1-208ENST00000553786 KIFC2Q96AC6 838 aa20.07■□□□□ 0.8
PRRX1-208ENST00000553786 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
PRRX1-208ENST00000553786 LRRCC1Q9C099 1032 aa20.07■□□□□ 0.8
PRRX1-208ENST00000553786 SPC25Q9HBM1 224 aa20.07■□□□□ 0.8
PRRX1-208ENST00000553786 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
PRRX1-208ENST00000553786 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
PRRX1-208ENST00000553786 ELP1O95163 1332 aa20.06■□□□□ 0.8
PRRX1-208ENST00000553786 MYH7P12883 1935 aa20.06■□□□□ 0.8
PRRX1-208ENST00000553786 MINDY4BA8MYZ0 360 aa20.06■□□□□ 0.8
PRRX1-208ENST00000553786 ATP2A1O14983 1001 aa20.06■□□□□ 0.8
PRRX1-208ENST00000553786 CST5P28325 142 aaPredicted RBP20.06■□□□□ 0.8
PRRX1-208ENST00000553786 ACVR2BQ13705 512 aa20.06■□□□□ 0.8
PRRX1-208ENST00000553786 CCDC174Q6PII3 467 aa20.06■□□□□ 0.8
PRRX1-208ENST00000553786 ANKRD35Q8N283 1001 aa20.06■□□□□ 0.8
PRRX1-208ENST00000553786 PCSK9Q8NBP7 692 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
PRRX1-208ENST00000553786 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
PRRX1-208ENST00000553786 VTI1AQ96AJ9 217 aa20.06■□□□□ 0.8
PRRX1-208ENST00000553786 TIFAQ96CG3 184 aa20.06■□□□□ 0.8
PRRX1-208ENST00000553786 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP20.06■□□□□ 0.8
PRRX1-208ENST00000553786 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
PRRX1-208ENST00000553786 ZNF576Q9H609 170 aa20.06■□□□□ 0.8
PRRX1-208ENST00000553786 RAVER2Q9HCJ3 691 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
PRRX1-208ENST00000553786 CLIP2Q9UDT6 1046 aa20.06■□□□□ 0.8
PRRX1-208ENST00000553786 GSG1L2A8MUP6 293 aa20.05■□□□□ 0.8
PRRX1-208ENST00000553786 ASGR1P07306 291 aa20.05■□□□□ 0.8
PRRX1-208ENST00000553786 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP20.05■□□□□ 0.8
PRRX1-208ENST00000553786 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP20.05■□□□□ 0.8
PRRX1-208ENST00000553786 CCDC144BQ3MJ40 725 aa20.05■□□□□ 0.8
PRRX1-208ENST00000553786 MFSD5Q6N075 450 aa20.05■□□□□ 0.8
PRRX1-208ENST00000553786 GIMAP6Q6P9H5 292 aa20.05■□□□□ 0.8
PRRX1-208ENST00000553786 ABHD16BQ9H3Z7 469 aa20.05■□□□□ 0.8
PRRX1-208ENST00000553786 FBXO40Q9UH90 709 aa20.05■□□□□ 0.8
PRRX1-208ENST00000553786 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP20.04■□□□□ 0.8
PRRX1-208ENST00000553786 ADCY6O43306 1168 aa20.04■□□□□ 0.8
PRRX1-208ENST00000553786 USP38Q8NB14 1042 aa20.04■□□□□ 0.8
PRRX1-208ENST00000553786 UPF3AQ9H1J1 476 aaKnown RBP20.04■□□□□ 0.8
PRRX1-208ENST00000553786 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa20.04■□□□□ 0.8
PRRX1-208ENST00000553786 PRDM6Q9NQX0 595 aa20.04■□□□□ 0.8
PRRX1-208ENST00000553786 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP20.03■□□□□ 0.8
PRRX1-208ENST00000553786 TDO2P48775 406 aa20.03■□□□□ 0.8
PRRX1-208ENST00000553786 GNASQ5JWF2 1037 aa20.03■□□□□ 0.8
PRRX1-208ENST00000553786 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa20.03■□□□□ 0.8
PRRX1-208ENST00000553786 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP20.03■□□□□ 0.8
PRRX1-208ENST00000553786 ARMCX2Q7L311 632 aa20.03■□□□□ 0.8
PRRX1-208ENST00000553786 APPBP2Q92624 585 aa20.03■□□□□ 0.8
PRRX1-208ENST00000553786 FGD4Q96M96 766 aa20.03■□□□□ 0.8
PRRX1-208ENST00000553786 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa20.03■□□□□ 0.8
PRRX1-208ENST00000553786 ZNF287Q9HBT7 754 aa20.03■□□□□ 0.8
PRRX1-208ENST00000553786 HOMER2Q9NSB8 354 aa20.03■□□□□ 0.8
PRRX1-208ENST00000553786 ECHDC1Q9NTX5 307 aa20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.4 ms