RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551525.5

PTPRB-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 5,291 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-210ENST00000551525 SNRNP27Q8WVK2 155 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
PTPRB-210ENST00000551525 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
PTPRB-210ENST00000551525 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa6.98□□□□□ -1.29
PTPRB-210ENST00000551525 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa6.98□□□□□ -1.29
PTPRB-210ENST00000551525 ALKQ9UM73 1620 aa6.98□□□□□ -1.29
PTPRB-210ENST00000551525 STK25O00506 426 aa6.98□□□□□ -1.29
PTPRB-210ENST00000551525 CCDC159P0C7I6 412 aa6.98□□□□□ -1.29
PTPRB-210ENST00000551525 GRAPQ13588 217 aa6.98□□□□□ -1.29
PTPRB-210ENST00000551525 LRSAM1Q6UWE0 723 aa6.98□□□□□ -1.29
PTPRB-210ENST00000551525 BBOF1Q8ND07 529 aa6.98□□□□□ -1.29
PTPRB-210ENST00000551525 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
PTPRB-210ENST00000551525 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
PTPRB-210ENST00000551525 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
PTPRB-210ENST00000551525 RGL1Q9NZL6 768 aa6.98□□□□□ -1.29
PTPRB-210ENST00000551525 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
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PTPRB-210ENST00000551525 CCDC160A6NGH7 325 aa6.97□□□□□ -1.29
PTPRB-210ENST00000551525 TSPAN9O75954 239 aa6.97□□□□□ -1.29
PTPRB-210ENST00000551525 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
PTPRB-210ENST00000551525 CCDC192P0DO97 292 aa6.97□□□□□ -1.29
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PTPRB-210ENST00000551525 DNM2P50570 870 aa6.97□□□□□ -1.29
PTPRB-210ENST00000551525 TAF12Q16514 161 aa6.97□□□□□ -1.29
PTPRB-210ENST00000551525 SRLQ86TD4 932 aa6.97□□□□□ -1.29
PTPRB-210ENST00000551525 SDR16C5Q8N3Y7 309 aa6.97□□□□□ -1.29
PTPRB-210ENST00000551525 GOLGA1Q92805 767 aa6.97□□□□□ -1.29
PTPRB-210ENST00000551525 EXOC4Q96A65 974 aa6.97□□□□□ -1.29
PTPRB-210ENST00000551525 RPGRIP1Q96KN7 1286 aa6.97□□□□□ -1.29
PTPRB-210ENST00000551525 FAF1Q9UNN5 650 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
PTPRB-210ENST00000551525 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
PTPRB-210ENST00000551525 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
PTPRB-210ENST00000551525 RBM47A0AV96 593 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
PTPRB-210ENST00000551525 RFC1P35251 1148 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
PTPRB-210ENST00000551525 KANK3Q6NY19 840 aa6.97□□□□□ -1.29
PTPRB-210ENST00000551525 VPS36Q86VN1 386 aa6.97□□□□□ -1.29
PTPRB-210ENST00000551525 BRIP1Q9BX63 1249 aa6.97□□□□□ -1.29
PTPRB-210ENST00000551525 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
PTPRB-210ENST00000551525 CHL1O00533 1208 aa6.97□□□□□ -1.29
PTPRB-210ENST00000551525 VIL1P09327 827 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
PTPRB-210ENST00000551525 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
PTPRB-210ENST00000551525 ATP11AP98196 1134 aa6.97□□□□□ -1.29
PTPRB-210ENST00000551525 POU5F1Q01860 360 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
PTPRB-210ENST00000551525 FAPQ12884 760 aa6.97□□□□□ -1.29
PTPRB-210ENST00000551525 MAATS1Q7Z4T9 603 aa6.97□□□□□ -1.29
PTPRB-210ENST00000551525 CACNA2D3Q8IZS8 1091 aa6.97□□□□□ -1.29
PTPRB-210ENST00000551525 AFAP1L1Q8TED9 768 aa6.97□□□□□ -1.29
PTPRB-210ENST00000551525 AZI2Q9H6S1 392 aa6.97□□□□□ -1.29
PTPRB-210ENST00000551525 HEG1Q9ULI3 1381 aa6.97□□□□□ -1.29
PTPRB-210ENST00000551525 USP17L3A6NCW0 530 aa6.97□□□□□ -1.29
PTPRB-210ENST00000551525 USP17L4A6NCW7 530 aa6.97□□□□□ -1.29
PTPRB-210ENST00000551525 EIF3CLB5ME19 914 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
PTPRB-210ENST00000551525 NOP56O00567 594 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
PTPRB-210ENST00000551525 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
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PTPRB-210ENST00000551525 USP17L1Q7RTZ2 530 aa6.97□□□□□ -1.29
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PTPRB-210ENST00000551525 CCDC6Q16204 474 aa6.96□□□□□ -1.29
PTPRB-210ENST00000551525 MFSD14BQ5SR56 506 aa6.96□□□□□ -1.29
PTPRB-210ENST00000551525 TMEM110Q86TL2 294 aa6.96□□□□□ -1.29
PTPRB-210ENST00000551525 RASEFQ8IZ41 740 aa6.96□□□□□ -1.29
PTPRB-210ENST00000551525 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.29
PTPRB-210ENST00000551525 C8orf76Q96K31 380 aa6.96□□□□□ -1.29
PTPRB-210ENST00000551525 YIPF3Q9GZM5 350 aa6.96□□□□□ -1.29
PTPRB-210ENST00000551525 AP5M1Q9H0R1 490 aa6.96□□□□□ -1.29
PTPRB-210ENST00000551525 KDRP35968 1356 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRB-210ENST00000551525 AOX1Q06278 1338 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRB-210ENST00000551525 CCDC189A1A4V9 331 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRB-210ENST00000551525 PECAM1P16284 738 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
PTPRB-210ENST00000551525 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP6.96□□□□□ -1.3
PTPRB-210ENST00000551525 CCDC184Q52MB2 194 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRB-210ENST00000551525 TTLL7Q6ZT98 887 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRB-210ENST00000551525 MFN1Q8IWA4 741 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRB-210ENST00000551525 ARHGAP18Q8N392 663 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRB-210ENST00000551525 CASP10Q92851 521 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRB-210ENST00000551525 EFHD2Q96C19 240 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
PTPRB-210ENST00000551525 SYT17Q9BSW7 474 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRB-210ENST00000551525 TNMDQ9H2S6 317 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRB-210ENST00000551525 USP40Q9NVE5 1235 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRB-210ENST00000551525 ADD3Q9UEY8 706 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
PTPRB-210ENST00000551525 TLR3O15455 904 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
PTPRB-210ENST00000551525 SERPINC1P01008 464 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRB-210ENST00000551525 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
PTPRB-210ENST00000551525 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
PTPRB-210ENST00000551525 CASTP20810 708 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
PTPRB-210ENST00000551525 RPS12P25398 132 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
PTPRB-210ENST00000551525 PDE1CQ14123 709 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
PTPRB-210ENST00000551525 KCTD2Q14681 263 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRB-210ENST00000551525 NLRP9Q7RTR0 991 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRB-210ENST00000551525 LDHDQ86WU2 507 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRB-210ENST00000551525 ANKRD44Q8N8A2 993 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRB-210ENST00000551525 FAM81AQ8TBF8 368 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRB-210ENST00000551525 KCNG4Q8TDN1 519 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRB-210ENST00000551525 FAM89AQ96GI7 184 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRB-210ENST00000551525 CCDC113Q9H0I3 377 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRB-210ENST00000551525 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
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