RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000541667.5

CLSTN3-211, Transcript of calsyntenin 3, humanhuman

TSL 4

Gene CLSTN3, Length 671 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN3-211ENST00000541667 RAD21O60216 631 aa14.06□□□□□ -0.16
CLSTN3-211ENST00000541667 CTDSPL2Q05D32 466 aa14.06□□□□□ -0.16
CLSTN3-211ENST00000541667 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP14.06□□□□□ -0.16
CLSTN3-211ENST00000541667 FAM227BQ96M60 508 aa14.06□□□□□ -0.16
CLSTN3-211ENST00000541667 FGD4Q96M96 766 aa14.06□□□□□ -0.16
CLSTN3-211ENST00000541667 TINF2Q9BSI4 451 aa14.06□□□□□ -0.16
CLSTN3-211ENST00000541667 TEX13BQ9BXU2 312 aa14.06□□□□□ -0.16
CLSTN3-211ENST00000541667 ZNF287Q9HBT7 754 aa14.06□□□□□ -0.16
CLSTN3-211ENST00000541667 HELLSQ9NRZ9 838 aa14.06□□□□□ -0.16
CLSTN3-211ENST00000541667 SLC5A4Q9NY91 659 aa14.06□□□□□ -0.16
CLSTN3-211ENST00000541667 MYH4Q9Y623 1939 aa14.05□□□□□ -0.16
CLSTN3-211ENST00000541667 A0A0D9SFI3 127 aa14.05□□□□□ -0.16
CLSTN3-211ENST00000541667 NMT2O60551 498 aa14.05□□□□□ -0.16
CLSTN3-211ENST00000541667 SNAI1O95863 264 aaPredicted RBP14.05□□□□□ -0.16
CLSTN3-211ENST00000541667 PDE4BQ07343 736 aa14.05□□□□□ -0.16
CLSTN3-211ENST00000541667 SLFN13Q68D06 897 aa14.05□□□□□ -0.16
CLSTN3-211ENST00000541667 TICAM2Q86XR7 235 aa14.05□□□□□ -0.16
CLSTN3-211ENST00000541667 LRCH3Q96II8 777 aa14.05□□□□□ -0.16
CLSTN3-211ENST00000541667 LNPKQ9C0E8 428 aa14.05□□□□□ -0.16
CLSTN3-211ENST00000541667 RAVER2Q9HCJ3 691 aaKnown RBP14.05□□□□□ -0.16
CLSTN3-211ENST00000541667 NRBP1Q9UHY1 535 aa14.05□□□□□ -0.16
CLSTN3-211ENST00000541667 FEM1BQ9UK73 627 aa14.05□□□□□ -0.16
CLSTN3-211ENST00000541667 ZNF536O15090 1300 aa14.05□□□□□ -0.16
CLSTN3-211ENST00000541667 FGAP02671 866 aa14.04□□□□□ -0.16
CLSTN3-211ENST00000541667 TSPY3P0CV98 308 aa14.04□□□□□ -0.16
CLSTN3-211ENST00000541667 TSPY8P0CW00 308 aa14.04□□□□□ -0.16
CLSTN3-211ENST00000541667 BMP3P12645 472 aa14.04□□□□□ -0.16
CLSTN3-211ENST00000541667 COPB2P35606 906 aa14.04□□□□□ -0.16
CLSTN3-211ENST00000541667 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP14.04□□□□□ -0.16
CLSTN3-211ENST00000541667 AAMPQ13685 434 aa14.04□□□□□ -0.16
CLSTN3-211ENST00000541667 KCTD2Q14681 263 aa14.04□□□□□ -0.16
CLSTN3-211ENST00000541667 SNX17Q15036 470 aa14.04□□□□□ -0.16
CLSTN3-211ENST00000541667 LRRC41Q15345 812 aa14.04□□□□□ -0.16
CLSTN3-211ENST00000541667 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP14.04□□□□□ -0.16
CLSTN3-211ENST00000541667 MAMDC4Q6UXC1 1216 aa14.04□□□□□ -0.16
CLSTN3-211ENST00000541667 SLC39A5Q6ZMH5 540 aa14.04□□□□□ -0.16
CLSTN3-211ENST00000541667 CPXCR1Q8N123 301 aa14.04□□□□□ -0.16
CLSTN3-211ENST00000541667 ARRDC4Q8NCT1 418 aa14.04□□□□□ -0.16
CLSTN3-211ENST00000541667 KIFC2Q96AC6 838 aa14.04□□□□□ -0.16
CLSTN3-211ENST00000541667 GMCL1Q96IK5 515 aa14.04□□□□□ -0.16
CLSTN3-211ENST00000541667 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP14.04□□□□□ -0.16
CLSTN3-211ENST00000541667 PLXNA1Q9UIW2 1896 aa14.04□□□□□ -0.16
CLSTN3-211ENST00000541667 ORC4O43929 436 aa14.03□□□□□ -0.16
CLSTN3-211ENST00000541667 PLA2G6O60733 806 aa14.03□□□□□ -0.16
CLSTN3-211ENST00000541667 ZBED4O75132 1171 aa14.03□□□□□ -0.16
CLSTN3-211ENST00000541667 MCCP23508 829 aa14.03□□□□□ -0.16
CLSTN3-211ENST00000541667 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa14.03□□□□□ -0.16
CLSTN3-211ENST00000541667 RASGRP2Q7LDG7 609 aa14.03□□□□□ -0.16
CLSTN3-211ENST00000541667 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP14.03□□□□□ -0.16
CLSTN3-211ENST00000541667 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa14.03□□□□□ -0.16
CLSTN3-211ENST00000541667 EXOC6Q8TAG9 804 aa14.03□□□□□ -0.16
CLSTN3-211ENST00000541667 STAG1Q8WVM7 1258 aa14.03□□□□□ -0.16
CLSTN3-211ENST00000541667 OSBPL3Q9H4L5 887 aa14.03□□□□□ -0.16
CLSTN3-211ENST00000541667 TMEM232C9JQI7 657 aa14.02□□□□□ -0.17
CLSTN3-211ENST00000541667 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP14.02□□□□□ -0.17
CLSTN3-211ENST00000541667 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP14.02□□□□□ -0.17
CLSTN3-211ENST00000541667 ADCYAP1R1P41586 468 aa14.02□□□□□ -0.17
CLSTN3-211ENST00000541667 OAZ1P54368 228 aa14.02□□□□□ -0.17
CLSTN3-211ENST00000541667 RTP1P59025 263 aa14.02□□□□□ -0.17
CLSTN3-211ENST00000541667 NUCB1Q02818 461 aa14.02□□□□□ -0.17
CLSTN3-211ENST00000541667 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP14.02□□□□□ -0.17
CLSTN3-211ENST00000541667 LRIT3Q3SXY7 679 aa14.02□□□□□ -0.17
CLSTN3-211ENST00000541667 C1orf53Q5VUE5 145 aa14.02□□□□□ -0.17
CLSTN3-211ENST00000541667 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa14.02□□□□□ -0.17
CLSTN3-211ENST00000541667 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP14.02□□□□□ -0.17
CLSTN3-211ENST00000541667 MSL3Q8N5Y2 521 aaKnown RBP14.02□□□□□ -0.17
CLSTN3-211ENST00000541667 ADAMTS4O75173 837 aa14.01□□□□□ -0.17
CLSTN3-211ENST00000541667 PGK1P00558 417 aa14.01□□□□□ -0.17
CLSTN3-211ENST00000541667 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP14.01□□□□□ -0.17
CLSTN3-211ENST00000541667 CCSAPQ6IQ19 270 aaPredicted RBP14.01□□□□□ -0.17
CLSTN3-211ENST00000541667 RCSD1Q6JBY9 416 aa14.01□□□□□ -0.17
CLSTN3-211ENST00000541667 CHD1LQ86WJ1 897 aa14.01□□□□□ -0.17
CLSTN3-211ENST00000541667 KLHDC9Q8NEP7 349 aa14.01□□□□□ -0.17
CLSTN3-211ENST00000541667 CHST13Q8NET6 341 aa14.01□□□□□ -0.17
CLSTN3-211ENST00000541667 LENG1Q96BZ8 264 aaPredicted RBP14.01□□□□□ -0.17
CLSTN3-211ENST00000541667 CHMP4CQ96CF2 233 aa14.01□□□□□ -0.17
CLSTN3-211ENST00000541667 AGBL1Q96MI9 1066 aa14.01□□□□□ -0.17
CLSTN3-211ENST00000541667 KATNBL1Q9H079 304 aa14.01□□□□□ -0.17
CLSTN3-211ENST00000541667 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP14.01□□□□□ -0.17
CLSTN3-211ENST00000541667 PHF24Q9UPV7 400 aa14.01□□□□□ -0.17
CLSTN3-211ENST00000541667 SYNGAP1Q96PV0 1343 aa14□□□□□ -0.17
CLSTN3-211ENST00000541667 TSPY2A6NKD2 308 aa14□□□□□ -0.17
CLSTN3-211ENST00000541667 ADCY6O43306 1168 aa14□□□□□ -0.17
CLSTN3-211ENST00000541667 FDX1P10109 184 aa14□□□□□ -0.17
CLSTN3-211ENST00000541667 SDSP20132 328 aa14□□□□□ -0.17
CLSTN3-211ENST00000541667 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP14□□□□□ -0.17
CLSTN3-211ENST00000541667 KCTD1Q719H9 257 aa14□□□□□ -0.17
CLSTN3-211ENST00000541667 TDHQ8IZJ6 230 aa14□□□□□ -0.17
CLSTN3-211ENST00000541667 FAM133AQ8N9E0 248 aa14□□□□□ -0.17
CLSTN3-211ENST00000541667 FERMT2Q96AC1 680 aa14□□□□□ -0.17
CLSTN3-211ENST00000541667 DDX11Q96FC9 970 aa14□□□□□ -0.17
CLSTN3-211ENST00000541667 UBE2OQ9C0C9 1292 aaKnown RBP14□□□□□ -0.17
CLSTN3-211ENST00000541667 XPNPEP3Q9NQH7 507 aa14□□□□□ -0.17
CLSTN3-211ENST00000541667 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa14□□□□□ -0.17
CLSTN3-211ENST00000541667 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP14□□□□□ -0.17
CLSTN3-211ENST00000541667 ASTN1O14525 1302 aa13.99□□□□□ -0.17
CLSTN3-211ENST00000541667 SOWAHBA6NEL2 793 aa13.99□□□□□ -0.17
CLSTN3-211ENST00000541667 KBTBD13C9JR72 458 aa13.99□□□□□ -0.17
CLSTN3-211ENST00000541667 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP13.99□□□□□ -0.17
CLSTN3-211ENST00000541667 RARBP10826 455 aa13.99□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.7 ms