RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000524534.5

PTPRK-217, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRK, Length 2,441 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-217ENST00000524534 HDAC6Q9UBN7 1215 aa12.94□□□□□ -0.34
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PTPRK-217ENST00000524534 EHBP1Q8NDI1 1231 aa12.92□□□□□ -0.34
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PTPRK-217ENST00000524534 CKAP4Q07065 602 aaKnown RBP12.91□□□□□ -0.34
PTPRK-217ENST00000524534 TSR1Q2NL82 804 aaKnown RBP12.91□□□□□ -0.34
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PTPRK-217ENST00000524534 GOLGA6L1Q8N7Z2 621 aa12.89□□□□□ -0.35
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PTPRK-217ENST00000524534 ZNF384Q8TF68 577 aa12.89□□□□□ -0.35
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PTPRK-217ENST00000524534 EIF3CQ99613 913 aaKnown RBP12.89□□□□□ -0.35
PTPRK-217ENST00000524534 NUP58Q9BVL2 599 aa12.89□□□□□ -0.35
PTPRK-217ENST00000524534 LACRTQ9GZZ8 138 aa12.89□□□□□ -0.35
PTPRK-217ENST00000524534 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP12.89□□□□□ -0.35
PTPRK-217ENST00000524534 USP17L12C9JPN9 530 aa12.89□□□□□ -0.35
PTPRK-217ENST00000524534 USP17L21D6R901 530 aa12.89□□□□□ -0.35
PTPRK-217ENST00000524534 PPFIA4O75335 1185 aa12.89□□□□□ -0.35
PTPRK-217ENST00000524534 TRHP20396 242 aaPredicted RBP12.89□□□□□ -0.35
PTPRK-217ENST00000524534 MAGEA9P43362 315 aa12.89□□□□□ -0.35
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