RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492996.6

HERC4-211, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HERC4, Length 3,385 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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HERC4-211ENST00000492996 COL6A1P12109 1028 aa8.05□□□□□ -1.12
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HERC4-211ENST00000492996 CCDC186Q7Z3E2 898 aa8.05□□□□□ -1.12
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HERC4-211ENST00000492996 KCNG4Q8TDN1 519 aa8.05□□□□□ -1.12
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HERC4-211ENST00000492996 SAMD3Q8N6K7 520 aa8.05□□□□□ -1.12
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HERC4-211ENST00000492996 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP8.05□□□□□ -1.12
HERC4-211ENST00000492996 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP8.05□□□□□ -1.12
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HERC4-211ENST00000492996 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP8.04□□□□□ -1.12
HERC4-211ENST00000492996 USP17L12C9JPN9 530 aa8.04□□□□□ -1.12
HERC4-211ENST00000492996 USP17L21D6R901 530 aa8.04□□□□□ -1.12
HERC4-211ENST00000492996 CTAGE5O15320 804 aa8.04□□□□□ -1.12
HERC4-211ENST00000492996 ZNF202O95125 648 aa8.04□□□□□ -1.12
HERC4-211ENST00000492996 YEATS4O95619 227 aa8.04□□□□□ -1.12
HERC4-211ENST00000492996 TNNT3P45378 269 aaPredicted RBP8.04□□□□□ -1.12
HERC4-211ENST00000492996 ZNF75DP51815 510 aa8.04□□□□□ -1.12
HERC4-211ENST00000492996 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP8.04□□□□□ -1.12
HERC4-211ENST00000492996 AOPEPQ8N6M6 819 aa8.04□□□□□ -1.12
HERC4-211ENST00000492996 SLAIN1Q8ND83 568 aa8.04□□□□□ -1.12
HERC4-211ENST00000492996 STAG1Q8WVM7 1258 aa8.04□□□□□ -1.12
HERC4-211ENST00000492996 TNKSO95271 1327 aa8.04□□□□□ -1.12
HERC4-211ENST00000492996 GOLGA6L6A8MZA4 724 aa8.04□□□□□ -1.12
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