RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486840.1

CCZ1B-211, Transcript of CCZ1 homolog B, vacuolar protein trafficking and biogenesis associated, humanhuman

TSL 2

Gene CCZ1B, Length 545 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCZ1B-211ENST00000486840 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP31.58■■■□□ 2.65
CCZ1B-211ENST00000486840 HTTP42858 3142 aa31.57■■■□□ 2.64
CCZ1B-211ENST00000486840 SGPL1O95470 568 aa31.57■■■□□ 2.64
CCZ1B-211ENST00000486840 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP31.57■■■□□ 2.64
CCZ1B-211ENST00000486840 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP31.57■■■□□ 2.64
CCZ1B-211ENST00000486840 DCAF4Q8WV16 495 aa31.57■■■□□ 2.64
CCZ1B-211ENST00000486840 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP31.57■■■□□ 2.64
CCZ1B-211ENST00000486840 CASC1Q6TDU7 716 aa31.56■■■□□ 2.64
CCZ1B-211ENST00000486840 TACC3Q9Y6A5 838 aa31.56■■■□□ 2.64
CCZ1B-211ENST00000486840 DOCK3Q8IZD9 2030 aa31.56■■■□□ 2.64
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CCZ1B-211ENST00000486840 HOXC6P09630 235 aa31.54■■■□□ 2.64
CCZ1B-211ENST00000486840 KCTD1Q719H9 257 aa31.54■■■□□ 2.64
CCZ1B-211ENST00000486840 UBAC1Q9BSL1 405 aa31.54■■■□□ 2.64
CCZ1B-211ENST00000486840 OAZ1P54368 228 aa31.53■■■□□ 2.64
CCZ1B-211ENST00000486840 CCL14Q16627 93 aa31.53■■■□□ 2.64
CCZ1B-211ENST00000486840 DDX11Q96FC9 970 aa31.53■■■□□ 2.64
CCZ1B-211ENST00000486840 NBPF3Q9H094 633 aa31.53■■■□□ 2.64
CCZ1B-211ENST00000486840 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa31.53■■■□□ 2.64
CCZ1B-211ENST00000486840 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP31.53■■■□□ 2.64
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CCZ1B-211ENST00000486840 B4E1Z4 1266 aa31.52■■■□□ 2.64
CCZ1B-211ENST00000486840 SGSM2O43147 1006 aa31.52■■■□□ 2.64
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CCZ1B-211ENST00000486840 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa31.52■■■□□ 2.64
CCZ1B-211ENST00000486840 KAT14Q9H8E8 782 aa31.52■■■□□ 2.64
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CCZ1B-211ENST00000486840 FBXO40Q9UH90 709 aa31.52■■■□□ 2.64
CCZ1B-211ENST00000486840 PLA2G6O60733 806 aa31.51■■■□□ 2.63
CCZ1B-211ENST00000486840 CNGA1P29973 690 aa31.51■■■□□ 2.63
CCZ1B-211ENST00000486840 TRIM32Q13049 653 aa31.51■■■□□ 2.63
CCZ1B-211ENST00000486840 ATP2A1O14983 1001 aa31.5■■■□□ 2.63
CCZ1B-211ENST00000486840 NOVP48745 357 aa31.5■■■□□ 2.63
CCZ1B-211ENST00000486840 CACNB2Q08289 660 aaPredicted RBP31.5■■■□□ 2.63
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CCZ1B-211ENST00000486840 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP31.5■■■□□ 2.63
CCZ1B-211ENST00000486840 REPS2Q8NFH8 660 aa31.49■■■□□ 2.63
CCZ1B-211ENST00000486840 NPLOC4Q8TAT6 608 aa31.49■■■□□ 2.63
CCZ1B-211ENST00000486840 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP31.49■■■□□ 2.63
CCZ1B-211ENST00000486840 CENPFP49454 3210 aa31.48■■■□□ 2.63
CCZ1B-211ENST00000486840 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP31.48■■■□□ 2.63
CCZ1B-211ENST00000486840 OLFML2BQ68BL8 750 aa31.48■■■□□ 2.63
CCZ1B-211ENST00000486840 ANKRD35Q8N283 1001 aa31.48■■■□□ 2.63
CCZ1B-211ENST00000486840 CHST13Q8NET6 341 aa31.48■■■□□ 2.63
CCZ1B-211ENST00000486840 HTATIP2Q9BUP3 242 aa31.48■■■□□ 2.63
CCZ1B-211ENST00000486840 IL25Q9H293 177 aa31.48■■■□□ 2.63
CCZ1B-211ENST00000486840 GPCPD1Q9NPB8 672 aa31.48■■■□□ 2.63
CCZ1B-211ENST00000486840 ZSWIM5Q9P217 1185 aa31.48■■■□□ 2.63
CCZ1B-211ENST00000486840 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP31.48■■■□□ 2.63
CCZ1B-211ENST00000486840 ERICH2A1L162 156 aa31.47■■■□□ 2.63
CCZ1B-211ENST00000486840 PTH1RQ03431 593 aa31.47■■■□□ 2.63
CCZ1B-211ENST00000486840 MAP3K21Q5TCX8 1036 aa31.47■■■□□ 2.63
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CCZ1B-211ENST00000486840 PRR12Q9ULL5 1215 aa31.46■■■□□ 2.63
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CCZ1B-211ENST00000486840 COBLO75128 1261 aa31.45■■■□□ 2.63
CCZ1B-211ENST00000486840 CYP2C19P33261 490 aa31.45■■■□□ 2.63
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CCZ1B-211ENST00000486840 FLRT1Q9NZU1 646 aa31.45■■■□□ 2.63
CCZ1B-211ENST00000486840 PNMA2Q9UL42 364 aa31.45■■■□□ 2.63
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CCZ1B-211ENST00000486840 PNMA1Q8ND90 353 aa31.44■■■□□ 2.62
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CCZ1B-211ENST00000486840 CYP21A2P08686 494 aa31.41■■■□□ 2.62
CCZ1B-211ENST00000486840 RNF146Q9NTX7 359 aa31.41■■■□□ 2.62
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CCZ1B-211ENST00000486840 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP31.41■■■□□ 2.62
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CCZ1B-211ENST00000486840 TTBK2Q6IQ55 1244 aa31.4■■■□□ 2.62
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