RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486268.5

ERGIC3-215, Transcript of ERGIC and golgi 3, human

TSL 2

Gene ERGIC3, Length 584 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ERGIC3-215	ENST00000486268	TBC1D12	O60347	775 aa		13.54	□□□□□ -0.24
ERGIC3-215	ENST00000486268	CUTA	O60888	179 aa		13.54	□□□□□ -0.24
ERGIC3-215	ENST00000486268	PDHB	P11177	359 aa		13.54	□□□□□ -0.24
ERGIC3-215	ENST00000486268	LIG1	P18858	919 aa		13.54	□□□□□ -0.24
ERGIC3-215	ENST00000486268	CMA1	P23946	247 aa		13.54	□□□□□ -0.24
ERGIC3-215	ENST00000486268	NLRP5	P59047	1200 aa		13.54	□□□□□ -0.24
ERGIC3-215	ENST00000486268	TNFAIP1	Q13829	316 aa		13.54	□□□□□ -0.24
ERGIC3-215	ENST00000486268	PTPA	Q15257	358 aa		13.54	□□□□□ -0.24
ERGIC3-215	ENST00000486268	NBPF12	Q5TAG4	269 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
ERGIC3-215	ENST00000486268	TNMD	Q9H2S6	317 aa		13.54	□□□□□ -0.24
ERGIC3-215	ENST00000486268	RIOX1	Q9H6W3	641 aa		13.54	□□□□□ -0.24
ERGIC3-215	ENST00000486268	DNAJC18	Q9H819	358 aa		13.54	□□□□□ -0.24
ERGIC3-215	ENST00000486268	CLIP2	Q9UDT6	1046 aa		13.54	□□□□□ -0.24
ERGIC3-215	ENST00000486268	SEC63	Q9UGP8	760 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
ERGIC3-215	ENST00000486268	PPP2R3B	Q9Y5P8	575 aa		13.54	□□□□□ -0.24
ERGIC3-215	ENST00000486268	MYH6	P13533	1939 aa		13.54	□□□□□ -0.24
ERGIC3-215	ENST00000486268	MYH8	P13535	1937 aa		13.54	□□□□□ -0.24
ERGIC3-215	ENST00000486268	FAM237A	A0A1B0GTK4	181 aa		13.53	□□□□□ -0.24
ERGIC3-215	ENST00000486268	MPHOSPH10	O00566	681 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
ERGIC3-215	ENST00000486268	KIN	O60870	393 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
ERGIC3-215	ENST00000486268	CAVIN2	O95810	425 aa		13.53	□□□□□ -0.24
ERGIC3-215	ENST00000486268	CCDC192	P0DO97	292 aa		13.53	□□□□□ -0.24
ERGIC3-215	ENST00000486268	XRCC6	P12956	609 aa	Known RBP eCLIP	13.53	□□□□□ -0.24
ERGIC3-215	ENST00000486268	TNNI2	P48788	182 aa		13.53	□□□□□ -0.24
ERGIC3-215	ENST00000486268	COL13A1	Q5TAT6	717 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
ERGIC3-215	ENST00000486268	CST9	Q5W186	159 aa		13.53	□□□□□ -0.24
ERGIC3-215	ENST00000486268	FSIP1	Q8NA03	581 aa		13.53	□□□□□ -0.24
ERGIC3-215	ENST00000486268	DCAF4	Q8WV16	495 aa		13.53	□□□□□ -0.24
ERGIC3-215	ENST00000486268	ANP32B	Q92688	251 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
ERGIC3-215	ENST00000486268	TNFRSF25	Q93038	417 aa		13.53	□□□□□ -0.24
ERGIC3-215	ENST00000486268	CSRNP1	Q96S65	589 aa		13.53	□□□□□ -0.24
ERGIC3-215	ENST00000486268	FTO	Q9C0B1	505 aa	Known RBP eCLIP	13.53	□□□□□ -0.24
ERGIC3-215	ENST00000486268	CABP5	Q9NP86	173 aa		13.53	□□□□□ -0.24
ERGIC3-215	ENST00000486268	BARHL2	Q9NY43	387 aa		13.53	□□□□□ -0.24
ERGIC3-215	ENST00000486268	PCDHA4	Q9UN74	947 aa		13.53	□□□□□ -0.24
ERGIC3-215	ENST00000486268	ESYT2	A0FGR8	921 aa		13.52	□□□□□ -0.25
ERGIC3-215	ENST00000486268	USP17L5	A8MUK1	530 aa		13.52	□□□□□ -0.25
ERGIC3-215	ENST00000486268	SLURP2	P0DP57	97 aa		13.52	□□□□□ -0.25
ERGIC3-215	ENST00000486268	GNA11	P29992	359 aa		13.52	□□□□□ -0.25
ERGIC3-215	ENST00000486268	ZNF543	Q08ER8	600 aa		13.52	□□□□□ -0.25
ERGIC3-215	ENST00000486268	NPY5R	Q15761	445 aa		13.52	□□□□□ -0.25
ERGIC3-215	ENST00000486268	ABCB5	Q2M3G0	1257 aa		13.52	□□□□□ -0.25
ERGIC3-215	ENST00000486268	UVSSA	Q2YD98	709 aa		13.52	□□□□□ -0.25
ERGIC3-215	ENST00000486268	AXDND1	Q5T1B0	1012 aa	Predicted RBP	13.52	□□□□□ -0.25
ERGIC3-215	ENST00000486268	KRI1	Q8N9T8	703 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.25
ERGIC3-215	ENST00000486268	ZNF579	Q8NAF0	562 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.25
ERGIC3-215	ENST00000486268	ENGASE	Q8NFI3	743 aa		13.52	□□□□□ -0.25
ERGIC3-215	ENST00000486268	TIGD1	Q96MW7	591 aa		13.52	□□□□□ -0.25
ERGIC3-215	ENST00000486268	FZD1	Q9UP38	647 aa		13.52	□□□□□ -0.25
ERGIC3-215	ENST00000486268	TRIM75P	A6NK02	468 aa		13.51	□□□□□ -0.25
ERGIC3-215	ENST00000486268	CYTH3	O43739	400 aa		13.51	□□□□□ -0.25
ERGIC3-215	ENST00000486268	NR1I2	O75469	434 aa		13.51	□□□□□ -0.25
ERGIC3-215	ENST00000486268	CELF2	O95319	508 aa	Known RBP	13.51	□□□□□ -0.25
ERGIC3-215	ENST00000486268	TOB1	P50616	345 aa	Predicted RBP	13.51	□□□□□ -0.25
ERGIC3-215	ENST00000486268	NR5A1	Q13285	461 aa		13.51	□□□□□ -0.25
ERGIC3-215	ENST00000486268	SNW1	Q13573	536 aa	Known RBP	13.51	□□□□□ -0.25
ERGIC3-215	ENST00000486268	PPP1R18	Q6NYC8	613 aa		13.51	□□□□□ -0.25
ERGIC3-215	ENST00000486268	USP17L2	Q6R6M4	530 aa		13.51	□□□□□ -0.25
ERGIC3-215	ENST00000486268	ELOA2	Q8IYF1	753 aa	Predicted RBP	13.51	□□□□□ -0.25
ERGIC3-215	ENST00000486268	BLID	Q8IZY5	108 aa		13.51	□□□□□ -0.25
ERGIC3-215	ENST00000486268	GMCL1P1	Q8NEA9	526 aa		13.51	□□□□□ -0.25
ERGIC3-215	ENST00000486268	OXER1	Q8TDS5	423 aa		13.51	□□□□□ -0.25
ERGIC3-215	ENST00000486268	SHISA4	Q96DD7	197 aa		13.51	□□□□□ -0.25
ERGIC3-215	ENST00000486268	ZNF408	Q9H9D4	720 aa		13.51	□□□□□ -0.25
ERGIC3-215	ENST00000486268	XPO5	Q9HAV4	1204 aa	Known RBP eCLIP	13.51	□□□□□ -0.25
ERGIC3-215	ENST00000486268	C6orf50	Q9HD87	102 aa		13.51	□□□□□ -0.25
ERGIC3-215	ENST00000486268	GINM1	Q9NU53	330 aa		13.51	□□□□□ -0.25
ERGIC3-215	ENST00000486268	hCG_1642624	A0A1W2PR95	340 aa		13.5	□□□□□ -0.25
ERGIC3-215	ENST00000486268	STXBP3	O00186	592 aa		13.5	□□□□□ -0.25
ERGIC3-215	ENST00000486268	PTPRE	P23469	700 aa		13.5	□□□□□ -0.25
ERGIC3-215	ENST00000486268	HTRA3	P83110	453 aa		13.5	□□□□□ -0.25
ERGIC3-215	ENST00000486268	MAP3K10	Q02779	954 aa		13.5	□□□□□ -0.25
ERGIC3-215	ENST00000486268	ICA1	Q05084	483 aa		13.5	□□□□□ -0.25
ERGIC3-215	ENST00000486268	WWC2	Q6AWC2	1192 aa		13.5	□□□□□ -0.25
ERGIC3-215	ENST00000486268	MOB2	Q70IA6	237 aa		13.5	□□□□□ -0.25
ERGIC3-215	ENST00000486268	FMR1NB	Q8N0W7	255 aa	Predicted RBP	13.5	□□□□□ -0.25
ERGIC3-215	ENST00000486268	LRRC47	Q8N1G4	583 aa	Known RBP	13.5	□□□□□ -0.25
ERGIC3-215	ENST00000486268	FERMT2	Q96AC1	680 aa		13.5	□□□□□ -0.25
ERGIC3-215	ENST00000486268	FUCA2	Q9BTY2	467 aa		13.5	□□□□□ -0.25
ERGIC3-215	ENST00000486268	ZMYND12	Q9H0C1	365 aa		13.5	□□□□□ -0.25
ERGIC3-215	ENST00000486268	GLT8D2	Q9H1C3	349 aa		13.5	□□□□□ -0.25
ERGIC3-215	ENST00000486268	SRPRB	Q9Y5M8	271 aa	Known RBP	13.5	□□□□□ -0.25
ERGIC3-215	ENST00000486268	ATAD5	Q96QE3	1844 aa		13.49	□□□□□ -0.25
ERGIC3-215	ENST00000486268	PNMA6F	A0A0J9YX94	578 aa		13.49	□□□□□ -0.25
ERGIC3-215	ENST00000486268	GOLGA8H	P0CJ92	632 aa		13.49	□□□□□ -0.25
ERGIC3-215	ENST00000486268	EEF2	P13639	858 aa	Known RBP	13.49	□□□□□ -0.25
ERGIC3-215	ENST00000486268	ORC2	Q13416	577 aa	Predicted RBP	13.49	□□□□□ -0.25
ERGIC3-215	ENST00000486268	SLC35G1	Q2M3R5	365 aa		13.49	□□□□□ -0.25
ERGIC3-215	ENST00000486268	RESP18	Q5W5W9	173 aa		13.49	□□□□□ -0.25
ERGIC3-215	ENST00000486268	HEATR3	Q7Z4Q2	680 aa		13.49	□□□□□ -0.25
ERGIC3-215	ENST00000486268	TEX2	Q8IWB9	1127 aa		13.49	□□□□□ -0.25
ERGIC3-215	ENST00000486268	GMCL1	Q96IK5	515 aa		13.49	□□□□□ -0.25
ERGIC3-215	ENST00000486268	RBSN	Q9H1K0	784 aa		13.49	□□□□□ -0.25
ERGIC3-215	ENST00000486268	GOLPH3L	Q9H4A5	285 aa		13.49	□□□□□ -0.25
ERGIC3-215	ENST00000486268	FAM13B	Q9NYF5	915 aa		13.49	□□□□□ -0.25
ERGIC3-215	ENST00000486268	CCDC194	A0A1B0GVG4	234 aa		13.48	□□□□□ -0.25
ERGIC3-215	ENST00000486268		M0R2N6	131 aa		13.48	□□□□□ -0.25
ERGIC3-215	ENST00000486268	MARCKS	P29966	332 aa	Predicted RBP	13.48	□□□□□ -0.25
ERGIC3-215	ENST00000486268	NAPA	P54920	295 aa		13.48	□□□□□ -0.25
ERGIC3-215	ENST00000486268	SEPT2	Q15019	361 aa		13.48	□□□□□ -0.25

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