RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480301.1

ACTB-211, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ACTB, Length 657 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-211ENST00000480301 NCAPG2Q86XI2 1143 aa24.65■■□□□ 1.54
ACTB-211ENST00000480301 TMEM106CQ9BVX2 250 aa24.65■■□□□ 1.54
ACTB-211ENST00000480301 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa24.65■■□□□ 1.54
ACTB-211ENST00000480301 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP24.65■■□□□ 1.54
ACTB-211ENST00000480301 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa24.65■■□□□ 1.54
ACTB-211ENST00000480301 ATP2A1O14983 1001 aa24.64■■□□□ 1.54
ACTB-211ENST00000480301 STRNO43815 780 aa24.64■■□□□ 1.54
ACTB-211ENST00000480301 STAT2P52630 851 aa24.64■■□□□ 1.54
ACTB-211ENST00000480301 STOX1Q6ZVD7 989 aa24.64■■□□□ 1.54
ACTB-211ENST00000480301 CYB5R4Q7L1T6 521 aa24.64■■□□□ 1.54
ACTB-211ENST00000480301 CHURC1Q8WUH1 139 aa24.64■■□□□ 1.54
ACTB-211ENST00000480301 TRIB2Q92519 343 aa24.64■■□□□ 1.54
ACTB-211ENST00000480301 E7EWF7 191 aa24.63■■□□□ 1.53
ACTB-211ENST00000480301 CCL5P13501 91 aa24.63■■□□□ 1.53
ACTB-211ENST00000480301 TRDNQ13061 729 aa24.63■■□□□ 1.53
ACTB-211ENST00000480301 ENAHQ8N8S7 591 aaPredicted RBP24.63■■□□□ 1.53
ACTB-211ENST00000480301 APBA2Q99767 749 aa24.63■■□□□ 1.53
ACTB-211ENST00000480301 ANO2Q9NQ90 1003 aa24.63■■□□□ 1.53
ACTB-211ENST00000480301 HMGCRP04035 888 aa24.62■■□□□ 1.53
ACTB-211ENST00000480301 SNHG28P0DPA3 235 aa24.62■■□□□ 1.53
ACTB-211ENST00000480301 PDHBP11177 359 aa24.62■■□□□ 1.53
ACTB-211ENST00000480301 TRIM32Q13049 653 aa24.62■■□□□ 1.53
ACTB-211ENST00000480301 CCL14Q16627 93 aa24.62■■□□□ 1.53
ACTB-211ENST00000480301 CCDC96Q2M329 555 aa24.62■■□□□ 1.53
ACTB-211ENST00000480301 TTBK2Q6IQ55 1244 aa24.62■■□□□ 1.53
ACTB-211ENST00000480301 TEX13BQ9BXU2 312 aa24.62■■□□□ 1.53
ACTB-211ENST00000480301 UNC93B1Q9H1C4 597 aa24.62■■□□□ 1.53
ACTB-211ENST00000480301 RAVER2Q9HCJ3 691 aaKnown RBP24.62■■□□□ 1.53
ACTB-211ENST00000480301 COL11A1P12107 1806 aaPredicted RBP24.62■■□□□ 1.53
ACTB-211ENST00000480301 TNKSO95271 1327 aa24.61■■□□□ 1.53
ACTB-211ENST00000480301 CENPFP49454 3210 aa24.61■■□□□ 1.53
ACTB-211ENST00000480301 HOXC6P09630 235 aa24.61■■□□□ 1.53
ACTB-211ENST00000480301 FDX1P10109 184 aa24.61■■□□□ 1.53
ACTB-211ENST00000480301 ADORA2AP29274 412 aa24.61■■□□□ 1.53
ACTB-211ENST00000480301 IKQ13123 557 aaPredicted RBP24.61■■□□□ 1.53
ACTB-211ENST00000480301 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP24.61■■□□□ 1.53
ACTB-211ENST00000480301 CASC1Q6TDU7 716 aa24.61■■□□□ 1.53
ACTB-211ENST00000480301 BTNL9Q6UXG8 535 aa24.61■■□□□ 1.53
ACTB-211ENST00000480301 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP24.61■■□□□ 1.53
ACTB-211ENST00000480301 ABRAQ8N0Z2 381 aa24.61■■□□□ 1.53
ACTB-211ENST00000480301 CPXCR1Q8N123 301 aa24.61■■□□□ 1.53
ACTB-211ENST00000480301 NPLOC4Q8TAT6 608 aa24.61■■□□□ 1.53
ACTB-211ENST00000480301 RIPK3Q9Y572 518 aa24.61■■□□□ 1.53
ACTB-211ENST00000480301 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP24.61■■□□□ 1.53
ACTB-211ENST00000480301 COPB2P35606 906 aa24.6■■□□□ 1.53
ACTB-211ENST00000480301 NECTIN1Q15223 517 aa24.6■■□□□ 1.53
ACTB-211ENST00000480301 SEC23AQ15436 765 aa24.6■■□□□ 1.53
ACTB-211ENST00000480301 NCOA7Q8NI08 942 aa24.6■■□□□ 1.53
ACTB-211ENST00000480301 UBAC1Q9BSL1 405 aa24.6■■□□□ 1.53
ACTB-211ENST00000480301 RNF208Q9H0X6 261 aa24.6■■□□□ 1.53
ACTB-211ENST00000480301 KAT14Q9H8E8 782 aa24.6■■□□□ 1.53
ACTB-211ENST00000480301 PRR12Q9ULL5 1215 aa24.6■■□□□ 1.53
ACTB-211ENST00000480301 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP24.6■■□□□ 1.53
ACTB-211ENST00000480301 SLC27A2O14975 620 aa24.59■■□□□ 1.53
ACTB-211ENST00000480301 COBLO75128 1261 aa24.59■■□□□ 1.53
ACTB-211ENST00000480301 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP24.59■■□□□ 1.53
ACTB-211ENST00000480301 EN2P19622 333 aaPredicted RBP24.59■■□□□ 1.53
ACTB-211ENST00000480301 OAZ1P54368 228 aa24.59■■□□□ 1.53
ACTB-211ENST00000480301 ZNF543Q08ER8 600 aa24.59■■□□□ 1.53
ACTB-211ENST00000480301 PNMA1Q8ND90 353 aa24.59■■□□□ 1.53
ACTB-211ENST00000480301 GPCPD1Q9NPB8 672 aa24.59■■□□□ 1.53
ACTB-211ENST00000480301 FLRT1Q9NZU1 646 aa24.59■■□□□ 1.53
ACTB-211ENST00000480301 ZNF536O15090 1300 aa24.59■■□□□ 1.53
ACTB-211ENST00000480301 GJB1P08034 283 aa24.58■■□□□ 1.53
ACTB-211ENST00000480301 FCER1AP12319 257 aa24.58■■□□□ 1.53
ACTB-211ENST00000480301 SLC16A2P36021 539 aa24.58■■□□□ 1.53
ACTB-211ENST00000480301 CREB3L3Q68CJ9 461 aa24.58■■□□□ 1.53
ACTB-211ENST00000480301 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP24.58■■□□□ 1.53
ACTB-211ENST00000480301 DPP9Q86TI2 863 aa24.58■■□□□ 1.53
ACTB-211ENST00000480301 IGHA2P01877 340 aa24.57■■□□□ 1.52
ACTB-211ENST00000480301 SNAP25P60880 206 aa24.57■■□□□ 1.52
ACTB-211ENST00000480301 MAP3K21Q5TCX8 1036 aa24.57■■□□□ 1.52
ACTB-211ENST00000480301 MB21D2Q8IYB1 491 aaPredicted RBP24.57■■□□□ 1.52
ACTB-211ENST00000480301 MMP19Q99542 508 aa24.57■■□□□ 1.52
ACTB-211ENST00000480301 SLC4A3P48751 1232 aa24.56■■□□□ 1.52
ACTB-211ENST00000480301 ANTXR2P58335 489 aa24.56■■□□□ 1.52
ACTB-211ENST00000480301 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP24.56■■□□□ 1.52
ACTB-211ENST00000480301 CACNB2Q08289 660 aaPredicted RBP24.56■■□□□ 1.52
ACTB-211ENST00000480301 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP24.56■■□□□ 1.52
ACTB-211ENST00000480301 SYDE2Q5VT97 1194 aa24.56■■□□□ 1.52
ACTB-211ENST00000480301 AGBL1Q96MI9 1066 aa24.56■■□□□ 1.52
ACTB-211ENST00000480301 PAK6Q9NQU5 681 aaPredicted RBP24.56■■□□□ 1.52
ACTB-211ENST00000480301 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP24.56■■□□□ 1.52
ACTB-211ENST00000480301 RPTORQ8N122 1335 aa24.56■■□□□ 1.52
ACTB-211ENST00000480301 GOLGA8HP0CJ92 632 aa24.55■■□□□ 1.52
ACTB-211ENST00000480301 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP24.55■■□□□ 1.52
ACTB-211ENST00000480301 GJA8P48165 433 aa24.55■■□□□ 1.52
ACTB-211ENST00000480301 KCTD2Q14681 263 aa24.55■■□□□ 1.52
ACTB-211ENST00000480301 CCDC174Q6PII3 467 aa24.55■■□□□ 1.52
ACTB-211ENST00000480301 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP24.55■■□□□ 1.526e-19■■□□□ 12.8
ACTB-211ENST00000480301 CHST3Q7LGC8 479 aa24.55■■□□□ 1.52
ACTB-211ENST00000480301 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP24.55■■□□□ 1.52
ACTB-211ENST00000480301 ZNF236Q9UL36 1845 aa24.55■■□□□ 1.52
ACTB-211ENST00000480301 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP24.54■■□□□ 1.52
ACTB-211ENST00000480301 PGK2P07205 417 aa24.54■■□□□ 1.52
ACTB-211ENST00000480301 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP24.54■■□□□ 1.52
ACTB-211ENST00000480301 GPATCH4Q5T3I0 446 aaKnown RBP24.54■■□□□ 1.52
ACTB-211ENST00000480301 CHST13Q8NET6 341 aa24.54■■□□□ 1.52
ACTB-211ENST00000480301 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP24.54■■□□□ 1.52
ACTB-211ENST00000480301 SHISA4Q96DD7 197 aa24.54■■□□□ 1.52
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