RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476336.5

PRAME-211, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 2

Gene PRAME, Length 589 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-211ENST00000476336 PPP4R2Q9NY27 417 aa15.7■□□□□ 0.1
PRAME-211ENST00000476336 TMEM232C9JQI7 657 aa15.69■□□□□ 0.1
PRAME-211ENST00000476336 NMT2O60551 498 aa15.69■□□□□ 0.1
PRAME-211ENST00000476336 KDM4AO75164 1064 aa15.69■□□□□ 0.1
PRAME-211ENST00000476336 INHAP05111 366 aa15.69■□□□□ 0.1
PRAME-211ENST00000476336 CCL5P13501 91 aa15.69■□□□□ 0.1
PRAME-211ENST00000476336 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP15.69■□□□□ 0.1
PRAME-211ENST00000476336 CYP2B6P20813 491 aa15.69■□□□□ 0.1
PRAME-211ENST00000476336 TMEM132BQ14DG7 1078 aa15.69■□□□□ 0.1
PRAME-211ENST00000476336 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP15.69■□□□□ 0.1
PRAME-211ENST00000476336 DPP9Q86TI2 863 aa15.69■□□□□ 0.1
PRAME-211ENST00000476336 NCAPG2Q86XI2 1143 aa15.69■□□□□ 0.1
PRAME-211ENST00000476336 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP15.69■□□□□ 0.1
PRAME-211ENST00000476336 TMEM47Q9BQJ4 181 aa15.69■□□□□ 0.1
PRAME-211ENST00000476336 UBAC1Q9BSL1 405 aa15.69■□□□□ 0.1
PRAME-211ENST00000476336 RNF208Q9H0X6 261 aa15.69■□□□□ 0.1
PRAME-211ENST00000476336 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa15.69■□□□□ 0.1
PRAME-211ENST00000476336 FBXO28Q9NVF7 368 aa15.69■□□□□ 0.1
PRAME-211ENST00000476336 FBXO40Q9UH90 709 aa15.69■□□□□ 0.1
PRAME-211ENST00000476336 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP15.69■□□□□ 0.1
PRAME-211ENST00000476336 TACC3Q9Y6A5 838 aa15.69■□□□□ 0.1
PRAME-211ENST00000476336 RPTORQ8N122 1335 aa15.68■□□□□ 0.1
PRAME-211ENST00000476336 PEX10O60683 326 aa15.68■□□□□ 0.1
PRAME-211ENST00000476336 ELNP15502 786 aa15.68■□□□□ 0.1
PRAME-211ENST00000476336 MCCP23508 829 aa15.68■□□□□ 0.1
PRAME-211ENST00000476336 IKQ13123 557 aaPredicted RBP15.68■□□□□ 0.1
PRAME-211ENST00000476336 KCTD2Q14681 263 aa15.68■□□□□ 0.1
PRAME-211ENST00000476336 ANKS1AQ92625 1134 aa15.68■□□□□ 0.1
PRAME-211ENST00000476336 KIFC2Q96AC6 838 aa15.68■□□□□ 0.1
PRAME-211ENST00000476336 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa15.68■□□□□ 0.1
PRAME-211ENST00000476336 IL25Q9H293 177 aa15.68■□□□□ 0.1
PRAME-211ENST00000476336 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP15.68■□□□□ 0.1
PRAME-211ENST00000476336 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP15.68■□□□□ 0.1
PRAME-211ENST00000476336 NEDD4P46934 1319 aa15.68■□□□□ 0.1
PRAME-211ENST00000476336 ZNFX1Q9P2E3 1918 aaKnown RBP15.67■□□□□ 0.1
PRAME-211ENST00000476336 B4E1Z4 1266 aa15.67■□□□□ 0.1
PRAME-211ENST00000476336 GJA8P48165 433 aa15.67■□□□□ 0.1
PRAME-211ENST00000476336 SART3Q15020 963 aaKnown RBP15.67■□□□□ 0.1
PRAME-211ENST00000476336 TKFCQ3LXA3 575 aa15.67■□□□□ 0.1
PRAME-211ENST00000476336 GPATCH4Q5T3I0 446 aaKnown RBP15.67■□□□□ 0.1
PRAME-211ENST00000476336 MFSD14CQ5VZR4 134 aa15.67■□□□□ 0.1
PRAME-211ENST00000476336 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP15.67■□□□□ 0.1
PRAME-211ENST00000476336 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP15.67■□□□□ 0.1
PRAME-211ENST00000476336 CHST13Q8NET6 341 aa15.67■□□□□ 0.1
PRAME-211ENST00000476336 REPS2Q8NFH8 660 aa15.67■□□□□ 0.1
PRAME-211ENST00000476336 NCOA7Q8NI08 942 aa15.67■□□□□ 0.1
PRAME-211ENST00000476336 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP15.67■□□□□ 0.1
PRAME-211ENST00000476336 KAT14Q9H8E8 782 aa15.67■□□□□ 0.1
PRAME-211ENST00000476336 ZSWIM5Q9P217 1185 aa15.67■□□□□ 0.1
PRAME-211ENST00000476336 DIS3Q9Y2L1 958 aaKnown RBP15.67■□□□□ 0.1
PRAME-211ENST00000476336 CEP290O15078 2479 aa15.66■□□□□ 0.1
PRAME-211ENST00000476336 ERICH2A1L162 156 aa15.66■□□□□ 0.1
PRAME-211ENST00000476336 CDC45O75419 566 aa15.66■□□□□ 0.1
PRAME-211ENST00000476336 CYP21A2P08686 494 aa15.66■□□□□ 0.1
PRAME-211ENST00000476336 ADORA2AP29274 412 aa15.66■□□□□ 0.1
PRAME-211ENST00000476336 PTH1RQ03431 593 aa15.66■□□□□ 0.1
PRAME-211ENST00000476336 CCDC96Q2M329 555 aa15.66■□□□□ 0.1
PRAME-211ENST00000476336 RNF20Q5VTR2 975 aa15.66■□□□□ 0.1
PRAME-211ENST00000476336 OLFML2BQ68BL8 750 aa15.66■□□□□ 0.1
PRAME-211ENST00000476336 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP15.66■□□□□ 0.1
PRAME-211ENST00000476336 BTNL9Q6UXG8 535 aa15.66■□□□□ 0.1
PRAME-211ENST00000476336 TRIB2Q92519 343 aa15.66■□□□□ 0.1
PRAME-211ENST00000476336 SHISA4Q96DD7 197 aa15.66■□□□□ 0.1
PRAME-211ENST00000476336 MTA3Q9BTC8 594 aa15.66■□□□□ 0.1
PRAME-211ENST00000476336 PAK6Q9NQU5 681 aaPredicted RBP15.66■□□□□ 0.1
PRAME-211ENST00000476336 SGPL1O95470 568 aa15.65■□□□□ 0.1
PRAME-211ENST00000476336 SNHG28P0DPA3 235 aa15.65■□□□□ 0.1
PRAME-211ENST00000476336 PDHBP11177 359 aa15.65■□□□□ 0.1
PRAME-211ENST00000476336 MAP3K21Q5TCX8 1036 aa15.65■□□□□ 0.1
PRAME-211ENST00000476336 MMP19Q99542 508 aa15.65■□□□□ 0.1
PRAME-211ENST00000476336 TNKSO95271 1327 aa15.65■□□□□ 0.1
PRAME-211ENST00000476336 MSCO60682 206 aa15.64■□□□□ 0.09
PRAME-211ENST00000476336 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP15.64■□□□□ 0.09
PRAME-211ENST00000476336 KCTD1Q719H9 257 aa15.64■□□□□ 0.09
PRAME-211ENST00000476336 CPXCR1Q8N123 301 aa15.64■□□□□ 0.09
PRAME-211ENST00000476336 MSL3Q8N5Y2 521 aaKnown RBP15.64■□□□□ 0.09
PRAME-211ENST00000476336 PNMA1Q8ND90 353 aa15.64■□□□□ 0.09
PRAME-211ENST00000476336 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP15.64■□□□□ 0.09
PRAME-211ENST00000476336 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP15.64■□□□□ 0.09
PRAME-211ENST00000476336 UNC93B1Q9H1C4 597 aa15.64■□□□□ 0.09
PRAME-211ENST00000476336 ANO2Q9NQ90 1003 aa15.64■□□□□ 0.09
PRAME-211ENST00000476336 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP15.64■□□□□ 0.09
PRAME-211ENST00000476336 E7EWF7 191 aa15.63■□□□□ 0.09
PRAME-211ENST00000476336 H0YGN5 161 aa15.63■□□□□ 0.09
PRAME-211ENST00000476336 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP15.63■□□□□ 0.09
PRAME-211ENST00000476336 ZNF543Q08ER8 600 aa15.63■□□□□ 0.09
PRAME-211ENST00000476336 ASPRV1Q53RT3 343 aa15.63■□□□□ 0.09
PRAME-211ENST00000476336 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa15.63■□□□□ 0.09
PRAME-211ENST00000476336 ENAHQ8N8S7 591 aaPredicted RBP15.63■□□□□ 0.09
PRAME-211ENST00000476336 ANKLE1Q8NAG6 615 aa15.63■□□□□ 0.09
PRAME-211ENST00000476336 DDX11Q96FC9 970 aa15.63■□□□□ 0.09
PRAME-211ENST00000476336 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa15.63■□□□□ 0.09
PRAME-211ENST00000476336 MAF1Q9H063 256 aa15.63■□□□□ 0.09
PRAME-211ENST00000476336 LSG1Q9H089 658 aaKnown RBP15.63■□□□□ 0.09
PRAME-211ENST00000476336 NRBP1Q9UHY1 535 aa15.63■□□□□ 0.09
PRAME-211ENST00000476336 PRR12Q9ULL5 1215 aa15.63■□□□□ 0.09
PRAME-211ENST00000476336 PLXNA1Q9UIW2 1896 aa15.63■□□□□ 0.09
PRAME-211ENST00000476336 CACNB2Q08289 660 aaPredicted RBP15.62■□□□□ 0.09
PRAME-211ENST00000476336 SYDE2Q5VT97 1194 aa15.62■□□□□ 0.09
PRAME-211ENST00000476336 TMTC2Q8N394 836 aa15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27 ms