RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476231.1

SYF2-204, Transcript of SYF2 pre-mRNA splicing factor, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SYF2, Length 1,962 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2-204ENST00000476231 BCS1LQ9Y276 419 aa21.78■■□□□ 1.08
SYF2-204ENST00000476231 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP21.77■■□□□ 1.08
SYF2-204ENST00000476231 TNIP1Q15025 636 aa21.77■■□□□ 1.08
SYF2-204ENST00000476231 RESP18Q5W5W9 173 aa21.77■■□□□ 1.08
SYF2-204ENST00000476231 RASGRP2Q7LDG7 609 aa21.77■■□□□ 1.08
SYF2-204ENST00000476231 CLEC10AQ8IUN9 316 aa21.77■■□□□ 1.08
SYF2-204ENST00000476231 FAM151AQ8WW52 585 aa21.77■■□□□ 1.08
SYF2-204ENST00000476231 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP21.77■■□□□ 1.08
SYF2-204ENST00000476231 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP21.77■■□□□ 1.08
SYF2-204ENST00000476231 KANSL2Q9H9L4 492 aa21.77■■□□□ 1.08
SYF2-204ENST00000476231 TUBE1Q9UJT0 475 aa21.77■■□□□ 1.08
SYF2-204ENST00000476231 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa21.77■■□□□ 1.08
SYF2-204ENST00000476231 BAZ2BQ9UIF8 2168 aaKnown RBP21.77■■□□□ 1.08
SYF2-204ENST00000476231 MYH4Q9Y623 1939 aa21.76■■□□□ 1.07
SYF2-204ENST00000476231 TRIM75PA6NK02 468 aa21.76■■□□□ 1.07
SYF2-204ENST00000476231 FAM196BA6NMK8 535 aa21.76■■□□□ 1.07
SYF2-204ENST00000476231 SLURP2P0DP57 97 aa21.76■■□□□ 1.07
SYF2-204ENST00000476231 SYKP43405 635 aa21.76■■□□□ 1.07
SYF2-204ENST00000476231 WWC2Q6AWC2 1192 aa21.76■■□□□ 1.07
SYF2-204ENST00000476231 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP21.76■■□□□ 1.07
SYF2-204ENST00000476231 MKL1Q969V6 931 aa21.76■■□□□ 1.07
SYF2-204ENST00000476231 MAP7D2Q96T17 732 aa21.76■■□□□ 1.07
SYF2-204ENST00000476231 RIOX1Q9H6W3 641 aa21.76■■□□□ 1.07
SYF2-204ENST00000476231 NYAP2Q9P242 653 aa21.76■■□□□ 1.07
SYF2-204ENST00000476231 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP21.76■■□□□ 1.07
SYF2-204ENST00000476231 PCDHA4Q9UN74 947 aa21.76■■□□□ 1.07
SYF2-204ENST00000476231 SMTNL1A8MU46 457 aa21.76■■□□□ 1.07
SYF2-204ENST00000476231 BMP15O95972 392 aa21.76■■□□□ 1.07
SYF2-204ENST00000476231 EARS2Q5JPH6 523 aaKnown RBP21.76■■□□□ 1.07
SYF2-204ENST00000476231 TMEM179Q6ZVK1 233 aa21.76■■□□□ 1.07
SYF2-204ENST00000476231 BLIDQ8IZY5 108 aa21.76■■□□□ 1.07
SYF2-204ENST00000476231 DAGLBQ8NCG7 672 aa21.76■■□□□ 1.07
SYF2-204ENST00000476231 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP21.76■■□□□ 1.07
SYF2-204ENST00000476231 CSRNP1Q96S65 589 aa21.76■■□□□ 1.07
SYF2-204ENST00000476231 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP21.76■■□□□ 1.07
SYF2-204ENST00000476231 CLRN2A0PK11 232 aa21.75■■□□□ 1.07
SYF2-204ENST00000476231 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP21.75■■□□□ 1.07
SYF2-204ENST00000476231 TCP10L2B9ZVM9 353 aa21.75■■□□□ 1.07
SYF2-204ENST00000476231 STXBP3O00186 592 aa21.75■■□□□ 1.07
SYF2-204ENST00000476231 TRAPPC10P48553 1259 aa21.75■■□□□ 1.07
SYF2-204ENST00000476231 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa21.75■■□□□ 1.07
SYF2-204ENST00000476231 FAM205CA6NFA0 338 aa21.74■■□□□ 1.07
SYF2-204ENST00000476231 TPM4P67936 248 aa21.74■■□□□ 1.07
SYF2-204ENST00000476231 ZNF543Q08ER8 600 aa21.74■■□□□ 1.07
SYF2-204ENST00000476231 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP21.74■■□□□ 1.07
SYF2-204ENST00000476231 GPATCH4Q5T3I0 446 aaKnown RBP21.74■■□□□ 1.07
SYF2-204ENST00000476231 SHC4Q6S5L8 630 aa21.74■■□□□ 1.07
SYF2-204ENST00000476231 AOPEPQ8N6M6 819 aa21.74■■□□□ 1.07
SYF2-204ENST00000476231 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP21.74■■□□□ 1.07
SYF2-204ENST00000476231 IMPACTQ9P2X3 320 aa21.74■■□□□ 1.07
SYF2-204ENST00000476231 NRBP1Q9UHY1 535 aa21.74■■□□□ 1.07
SYF2-204ENST00000476231 hCG_1984214I3L0E3 225 aa21.74■■□□□ 1.07
SYF2-204ENST00000476231 IKBKBO14920 756 aa21.74■■□□□ 1.07
SYF2-204ENST00000476231 MYO1BO43795 1136 aa21.74■■□□□ 1.07
SYF2-204ENST00000476231 PTPREP23469 700 aa21.74■■□□□ 1.07
SYF2-204ENST00000476231 ABCB5Q2M3G0 1257 aa21.74■■□□□ 1.07
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SYF2-204ENST00000476231 C17orf53Q8N3J3 647 aaPredicted RBP21.74■■□□□ 1.07
SYF2-204ENST00000476231 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP21.74■■□□□ 1.07
SYF2-204ENST00000476231 CPVLQ9H3G5 476 aa21.74■■□□□ 1.07
SYF2-204ENST00000476231 ATP2B1P20020 1258 aa21.73■■□□□ 1.07
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SYF2-204ENST00000476231 CNTNAP1P78357 1384 aa21.73■■□□□ 1.07
SYF2-204ENST00000476231 ATP2B2Q01814 1243 aa21.73■■□□□ 1.07
SYF2-204ENST00000476231 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP21.73■■□□□ 1.07
SYF2-204ENST00000476231 FBXO2Q9UK22 296 aaPredicted RBP21.73■■□□□ 1.07
SYF2-204ENST00000476231 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa21.73■■□□□ 1.07
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SYF2-204ENST00000476231 GSDMDP57764 484 aa21.72■■□□□ 1.07
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SYF2-204ENST00000476231 LRRC8AQ8IWT6 810 aa21.72■■□□□ 1.07
SYF2-204ENST00000476231 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP21.72■■□□□ 1.07
SYF2-204ENST00000476231 UBA5Q9GZZ9 404 aa21.72■■□□□ 1.07
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SYF2-204ENST00000476231 TTC38Q5R3I4 469 aa21.72■■□□□ 1.07
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SYF2-204ENST00000476231 HOMER1Q86YM7 354 aa21.72■■□□□ 1.07
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SYF2-204ENST00000476231 PIGSQ96S52 555 aa21.72■■□□□ 1.07
SYF2-204ENST00000476231 ZMYND12Q9H0C1 365 aa21.72■■□□□ 1.07
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SYF2-204ENST00000476231 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP21.72■■□□□ 1.07
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SYF2-204ENST00000476231 SEPT2Q15019 361 aa21.71■■□□□ 1.07
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SYF2-204ENST00000476231 VEZTQ9HBM0 779 aa21.71■■□□□ 1.07
SYF2-204ENST00000476231 VAT1LQ9HCJ6 419 aa21.71■■□□□ 1.07
SYF2-204ENST00000476231 GPCPD1Q9NPB8 672 aa21.71■■□□□ 1.07
SYF2-204ENST00000476231 MYOZ2Q9NPC6 264 aa21.71■■□□□ 1.07
SYF2-204ENST00000476231 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP21.7■■□□□ 1.07
SYF2-204ENST00000476231 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP21.7■■□□□ 1.07
SYF2-204ENST00000476231 DCAF4Q8WV16 495 aa21.7■■□□□ 1.07
SYF2-204ENST00000476231 KCND1Q9NSA2 647 aa21.7■■□□□ 1.07
SYF2-204ENST00000476231 HOOK1Q9UJC3 728 aaKnown RBP21.7■■□□□ 1.07
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