RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469694.5

GPC1-208, Transcript of glypican 1, humanhuman

TSL 2

Gene GPC1, Length 2,862 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC1-208ENST00000469694 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP15.7■□□□□ 0.1
GPC1-208ENST00000469694 MSANTD4Q8NCY6 345 aa15.7■□□□□ 0.1
GPC1-208ENST00000469694 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa15.7■□□□□ 0.1
GPC1-208ENST00000469694 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa15.7■□□□□ 0.1
GPC1-208ENST00000469694 USP17L3A6NCW0 530 aa15.69■□□□□ 0.1
GPC1-208ENST00000469694 USP17L4A6NCW7 530 aa15.69■□□□□ 0.1
GPC1-208ENST00000469694 TFAP4Q01664 338 aa15.69■□□□□ 0.1
GPC1-208ENST00000469694 TBX2Q13207 712 aaPredicted RBP15.69■□□□□ 0.1
GPC1-208ENST00000469694 PTPN21Q16825 1174 aa15.69■□□□□ 0.1
GPC1-208ENST00000469694 USP17L1Q7RTZ2 530 aa15.69■□□□□ 0.1
GPC1-208ENST00000469694 TEX11Q8IYF3 940 aa15.69■□□□□ 0.1
GPC1-208ENST00000469694 TMTC2Q8N394 836 aa15.69■□□□□ 0.1
GPC1-208ENST00000469694 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP15.69■□□□□ 0.1
GPC1-208ENST00000469694 ERLIN1O75477 346 aa15.69■□□□□ 0.1
GPC1-208ENST00000469694 YEATS4O95619 227 aa15.69■□□□□ 0.1
GPC1-208ENST00000469694 PDE4BQ07343 736 aa15.69■□□□□ 0.1
GPC1-208ENST00000469694 TROAPQ12815 778 aa15.69■□□□□ 0.1
GPC1-208ENST00000469694 SBK1Q52WX2 424 aa15.69■□□□□ 0.1
GPC1-208ENST00000469694 PNKPQ96T60 521 aa15.69■□□□□ 0.1
GPC1-208ENST00000469694 ABCB6Q9NP58 842 aa15.69■□□□□ 0.1
GPC1-208ENST00000469694 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP15.69■□□□□ 0.1
GPC1-208ENST00000469694 BTBD18B2RXH4 712 aa15.69■□□□□ 0.1
GPC1-208ENST00000469694 SPTLC2O15270 562 aa15.69■□□□□ 0.1
GPC1-208ENST00000469694 ORC4O43929 436 aa15.69■□□□□ 0.1
GPC1-208ENST00000469694 LDHCP07864 332 aa15.69■□□□□ 0.1
GPC1-208ENST00000469694 PPP4CP60510 307 aa15.69■□□□□ 0.1
GPC1-208ENST00000469694 PICALMQ13492 652 aa15.69■□□□□ 0.1
GPC1-208ENST00000469694 SWT1Q5T5J6 900 aaKnown RBP15.69■□□□□ 0.1
GPC1-208ENST00000469694 SHISA4Q96DD7 197 aa15.69■□□□□ 0.1
GPC1-208ENST00000469694 IL17RBQ9NRM6 502 aa15.69■□□□□ 0.1
GPC1-208ENST00000469694 POLR3EQ9NVU0 708 aa15.69■□□□□ 0.1
GPC1-208ENST00000469694 TUBE1Q9UJT0 475 aa15.69■□□□□ 0.1
GPC1-208ENST00000469694 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP15.68■□□□□ 0.1
GPC1-208ENST00000469694 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa15.68■□□□□ 0.1
GPC1-208ENST00000469694 MYO1BO43795 1136 aa15.68■□□□□ 0.1
GPC1-208ENST00000469694 RHBDL3P58872 404 aa15.68■□□□□ 0.1
GPC1-208ENST00000469694 CATIPQ7Z7H3 387 aa15.68■□□□□ 0.1
GPC1-208ENST00000469694 EFCAB13Q8IY85 973 aa15.68■□□□□ 0.1
GPC1-208ENST00000469694 FAM71BQ8TC56 605 aa15.68■□□□□ 0.1
GPC1-208ENST00000469694 SUGCTQ9HAC7 445 aa15.68■□□□□ 0.1
GPC1-208ENST00000469694 MKNK2Q9HBH9 465 aa15.68■□□□□ 0.1
GPC1-208ENST00000469694 INTS13Q9NVM9 706 aa15.68■□□□□ 0.1
GPC1-208ENST00000469694 BAZ2BQ9UIF8 2168 aaKnown RBP15.68■□□□□ 0.1
GPC1-208ENST00000469694 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa15.68■□□□□ 0.1
GPC1-208ENST00000469694 ANKRD65E5RJM6 399 aa15.68■□□□□ 0.1
GPC1-208ENST00000469694 G3V3G9 751 aa15.68■□□□□ 0.1
GPC1-208ENST00000469694 TRIM29Q14134 588 aa15.68■□□□□ 0.1
GPC1-208ENST00000469694 DCAF8Q5TAQ9 597 aa15.68■□□□□ 0.1
GPC1-208ENST00000469694 RCSD1Q6JBY9 416 aa15.68■□□□□ 0.1
GPC1-208ENST00000469694 RASGRP2Q7LDG7 609 aa15.68■□□□□ 0.1
GPC1-208ENST00000469694 TRIM22Q8IYM9 498 aa15.68■□□□□ 0.1
GPC1-208ENST00000469694 H0YIN7 160 aa15.67■□□□□ 0.1
GPC1-208ENST00000469694 CMA1P23946 247 aa15.67■□□□□ 0.1
GPC1-208ENST00000469694 NR5A1Q13285 461 aa15.67■□□□□ 0.1
GPC1-208ENST00000469694 CEP112Q8N8E3 955 aa15.67■□□□□ 0.1
GPC1-208ENST00000469694 TC2NQ8N9U0 490 aa15.67■□□□□ 0.1
GPC1-208ENST00000469694 COA1Q9GZY4 146 aa15.67■□□□□ 0.1
GPC1-208ENST00000469694 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP15.67■□□□□ 0.1
GPC1-208ENST00000469694 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa15.67■□□□□ 0.1
GPC1-208ENST00000469694 V9GY48 417 aaPredicted RBP15.67■□□□□ 0.1
GPC1-208ENST00000469694 FLT1P17948 1338 aa15.67■□□□□ 0.1
GPC1-208ENST00000469694 MAST2Q6P0Q8 1798 aa15.67■□□□□ 0.1
GPC1-208ENST00000469694 LTBP1Q14766 1721 aa15.67■□□□□ 0.1
GPC1-208ENST00000469694 SLURP2P0DP57 97 aa15.67■□□□□ 0.1
GPC1-208ENST00000469694 PFKFB1P16118 471 aa15.67■□□□□ 0.1
GPC1-208ENST00000469694 AXDND1Q5T1B0 1012 aaPredicted RBP15.67■□□□□ 0.1
GPC1-208ENST00000469694 WWC2Q6AWC2 1192 aa15.67■□□□□ 0.1
GPC1-208ENST00000469694 MMS22LQ6ZRQ5 1243 aa15.67■□□□□ 0.1
GPC1-208ENST00000469694 TMC4Q7Z404 712 aa15.67■□□□□ 0.1
GPC1-208ENST00000469694 CNNM3Q8NE01 707 aa15.67■□□□□ 0.1
GPC1-208ENST00000469694 OXER1Q8TDS5 423 aa15.67■□□□□ 0.1
GPC1-208ENST00000469694 FANCLQ9NW38 375 aa15.67■□□□□ 0.1
GPC1-208ENST00000469694 STK32BQ9NY57 414 aa15.67■□□□□ 0.1
GPC1-208ENST00000469694 VPS54Q9P1Q0 977 aa15.67■□□□□ 0.1
GPC1-208ENST00000469694 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP15.67■□□□□ 0.1
GPC1-208ENST00000469694 PPFIA4O75335 1185 aa15.66■□□□□ 0.1
GPC1-208ENST00000469694 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP15.66■□□□□ 0.1
GPC1-208ENST00000469694 CASP8Q14790 479 aa15.66■□□□□ 0.1
GPC1-208ENST00000469694 KARSQ15046 597 aaKnown RBP15.66■□□□□ 0.1
GPC1-208ENST00000469694 HSP90B2PQ58FF3 399 aa15.66■□□□□ 0.1
GPC1-208ENST00000469694 IRX2Q9BZI1 471 aaPredicted RBP15.66■□□□□ 0.1
GPC1-208ENST00000469694 CDC23Q9UJX2 597 aa15.66■□□□□ 0.1
GPC1-208ENST00000469694 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP15.66■□□□□ 0.1
GPC1-208ENST00000469694 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP15.66■□□□□ 0.1
GPC1-208ENST00000469694 TUBB4BP68371 445 aa15.66■□□□□ 0.1
GPC1-208ENST00000469694 BRAPQ7Z569 592 aa15.66■□□□□ 0.1
GPC1-208ENST00000469694 PDILTQ8N807 584 aa15.66■□□□□ 0.1
GPC1-208ENST00000469694 GPATCH11Q8N954 259 aa15.66■□□□□ 0.1
GPC1-208ENST00000469694 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa15.66■□□□□ 0.1
GPC1-208ENST00000469694 MTA3Q9BTC8 594 aa15.66■□□□□ 0.1
GPC1-208ENST00000469694 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP15.66■□□□□ 0.1
GPC1-208ENST00000469694 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa15.66■□□□□ 0.1
GPC1-208ENST00000469694 FAM205AQ6ZU69 1335 aa15.66■□□□□ 0.1
GPC1-208ENST00000469694 LRRC37AA6NMS7 1700 aa15.66■□□□□ 0.1
GPC1-208ENST00000469694 NRXN2Q9P2S2 1712 aa15.66■□□□□ 0.1
GPC1-208ENST00000469694 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa15.65■□□□□ 0.1
GPC1-208ENST00000469694 FUT2Q10981 343 aa15.65■□□□□ 0.1
GPC1-208ENST00000469694 E2F4Q16254 413 aa15.65■□□□□ 0.1
GPC1-208ENST00000469694 MCTP2Q6DN12 878 aa15.65■□□□□ 0.1
GPC1-208ENST00000469694 DIS3L2Q8IYB7 885 aaKnown RBP15.65■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 63.5 ms