RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436673.5

UPP1-208, Transcript of uridine phosphorylase 1, human

TSL 5

Gene UPP1, Length 918 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
UPP1-208	ENST00000436673	TTLL1	O95922	423 aa		31.49	■■■□□ 2.63
UPP1-208	ENST00000436673	ZNF865	P0CJ78	1059 aa	Predicted RBP	31.49	■■■□□ 2.63
UPP1-208	ENST00000436673	MX1	P20591	662 aa		31.49	■■■□□ 2.63
UPP1-208	ENST00000436673	TRIM60	Q495X7	471 aa		31.49	■■■□□ 2.63
UPP1-208	ENST00000436673		Q7L0L9	218 aa		31.49	■■■□□ 2.63
UPP1-208	ENST00000436673	GMCL1P1	Q8NEA9	526 aa		31.49	■■■□□ 2.63
UPP1-208	ENST00000436673	FERMT2	Q96AC1	680 aa		31.49	■■■□□ 2.63
UPP1-208	ENST00000436673	ZBED4	O75132	1171 aa		31.48	■■■□□ 2.63
UPP1-208	ENST00000436673	PDE4B	Q07343	736 aa		31.48	■■■□□ 2.63
UPP1-208	ENST00000436673	C1orf53	Q5VUE5	145 aa		31.48	■■■□□ 2.63
UPP1-208	ENST00000436673	LRRC47	Q8N1G4	583 aa	Known RBP	31.48	■■■□□ 2.63
UPP1-208	ENST00000436673	MSL3	Q8N5Y2	521 aa	Known RBP	31.48	■■■□□ 2.63
UPP1-208	ENST00000436673	NEDD1	Q8NHV4	660 aa		31.48	■■■□□ 2.63
UPP1-208	ENST00000436673	KIFC2	Q96AC6	838 aa		31.48	■■■□□ 2.63
UPP1-208	ENST00000436673	NAPB	Q9H115	298 aa		31.48	■■■□□ 2.63
UPP1-208	ENST00000436673	SLC38A10	Q9HBR0	1119 aa		31.48	■■■□□ 2.63
UPP1-208	ENST00000436673	FEM1B	Q9UK73	627 aa		31.48	■■■□□ 2.63
UPP1-208	ENST00000436673	PHF24	Q9UPV7	400 aa		31.48	■■■□□ 2.63
UPP1-208	ENST00000436673	PLXNA1	Q9UIW2	1896 aa		31.47	■■■□□ 2.63
UPP1-208	ENST00000436673	DNAJC25-GNG10	A0A024R161	153 aa		31.47	■■■□□ 2.63
UPP1-208	ENST00000436673	CPXCR1	Q8N123	301 aa		31.47	■■■□□ 2.63
UPP1-208	ENST00000436673	DDX11	Q96FC9	970 aa		31.47	■■■□□ 2.63
UPP1-208	ENST00000436673	CNPY2	Q9Y2B0	182 aa		31.47	■■■□□ 2.63
UPP1-208	ENST00000436673	SALL3	Q9BXA9	1300 aa		31.47	■■■□□ 2.63
UPP1-208	ENST00000436673	PGK1	P00558	417 aa		31.46	■■■□□ 2.63
UPP1-208	ENST00000436673	TSPY3	P0CV98	308 aa		31.46	■■■□□ 2.63
UPP1-208	ENST00000436673	TSPY8	P0CW00	308 aa		31.46	■■■□□ 2.63
UPP1-208	ENST00000436673	AKR1A1	P14550	325 aa		31.46	■■■□□ 2.63
UPP1-208	ENST00000436673	PPARA	Q07869	468 aa		31.46	■■■□□ 2.63
UPP1-208	ENST00000436673	RNF180	Q86T96	592 aa		31.46	■■■□□ 2.63
UPP1-208	ENST00000436673	SMCHD1	A6NHR9	2005 aa		31.45	■■■□□ 2.63
UPP1-208	ENST00000436673	SLC3A2	P08195	630 aa	Known RBP	31.45	■■■□□ 2.63
UPP1-208	ENST00000436673	SLC4A3	P48751	1232 aa		31.45	■■■□□ 2.63
UPP1-208	ENST00000436673	RRP1	P56182	461 aa	Known RBP	31.45	■■■□□ 2.63
UPP1-208	ENST00000436673	TFAP4	Q01664	338 aa		31.45	■■■□□ 2.63
UPP1-208	ENST00000436673	DHX30	Q7L2E3	1194 aa	Known RBP eCLIP	31.45	■■■□□ 2.63
UPP1-208	ENST00000436673	RAVER2	Q9HCJ3	691 aa	Known RBP	31.45	■■■□□ 2.63
UPP1-208	ENST00000436673	PRDM5	Q9NQX1	630 aa	Predicted RBP	31.45	■■■□□ 2.63
UPP1-208	ENST00000436673	MTMR10	Q9NXD2	777 aa		31.45	■■■□□ 2.63
UPP1-208	ENST00000436673	CTDP1	Q9Y5B0	961 aa	Predicted RBP	31.45	■■■□□ 2.63
UPP1-208	ENST00000436673	MYH4	Q9Y623	1939 aa		31.45	■■■□□ 2.62
UPP1-208	ENST00000436673	SYNGAP1	Q96PV0	1343 aa		31.45	■■■□□ 2.62
UPP1-208	ENST00000436673	SLFN13	Q68D06	897 aa		31.44	■■■□□ 2.62
UPP1-208	ENST00000436673	MAMDC4	Q6UXC1	1216 aa		31.44	■■■□□ 2.62
UPP1-208	ENST00000436673	LENG1	Q96BZ8	264 aa	Predicted RBP	31.44	■■■□□ 2.62
UPP1-208	ENST00000436673	PDLIM7	Q9NR12	457 aa		31.44	■■■□□ 2.62
UPP1-208	ENST00000436673	LTBP2	Q14767	1821 aa		31.44	■■■□□ 2.62
UPP1-208	ENST00000436673	FOXP2	O15409	715 aa		31.43	■■■□□ 2.62
UPP1-208	ENST00000436673	SNAI1	O95863	264 aa	Predicted RBP	31.43	■■■□□ 2.62
UPP1-208	ENST00000436673	BMP3	P12645	472 aa		31.43	■■■□□ 2.62
UPP1-208	ENST00000436673	OAZ1	P54368	228 aa		31.42	■■■□□ 2.62
UPP1-208	ENST00000436673	ZNF467	Q7Z7K2	595 aa	Predicted RBP	31.42	■■■□□ 2.62
UPP1-208	ENST00000436673	SLC17A8	Q8NDX2	589 aa		31.42	■■■□□ 2.62
UPP1-208	ENST00000436673		A0A0C4DFX4	3053 aa		31.41	■■■□□ 2.62
UPP1-208	ENST00000436673	ADAMTS4	O75173	837 aa		31.41	■■■□□ 2.62
UPP1-208	ENST00000436673	TLE2	Q04725	743 aa		31.41	■■■□□ 2.62
UPP1-208	ENST00000436673	CCDC129	Q6ZRS4	1044 aa		31.41	■■■□□ 2.62
UPP1-208	ENST00000436673	SH3RF1	Q7Z6J0	888 aa		31.41	■■■□□ 2.62
UPP1-208	ENST00000436673	FBXO40	Q9UH90	709 aa		31.41	■■■□□ 2.62
UPP1-208	ENST00000436673	FAM184B	Q9ULE4	1060 aa		31.41	■■■□□ 2.62
UPP1-208	ENST00000436673	TRIM43B	A6NCK2	446 aa		31.4	■■■□□ 2.62
UPP1-208	ENST00000436673	ANKRD45	Q5TZF3	282 aa		31.4	■■■□□ 2.62
UPP1-208	ENST00000436673	CHST13	Q8NET6	341 aa		31.4	■■■□□ 2.62
UPP1-208	ENST00000436673	BAD	Q92934	168 aa		31.4	■■■□□ 2.62
UPP1-208	ENST00000436673	TRIM43	Q96BQ3	446 aa	Predicted RBP	31.4	■■■□□ 2.62
UPP1-208	ENST00000436673	GMCL1	Q96IK5	515 aa		31.4	■■■□□ 2.62
UPP1-208	ENST00000436673	STXBP5L	Q9Y2K9	1186 aa		31.4	■■■□□ 2.62
UPP1-208	ENST00000436673	DDX52	Q9Y2R4	599 aa	Known RBP eCLIP	31.4	■■■□□ 2.62
UPP1-208	ENST00000436673		A0A1W2PQ45	241 aa	Predicted RBP	31.39	■■■□□ 2.62
UPP1-208	ENST00000436673		A0A1W2PQY0	241 aa		31.39	■■■□□ 2.62
UPP1-208	ENST00000436673	FDX1	P10109	184 aa		31.39	■■■□□ 2.62
UPP1-208	ENST00000436673	ANKRD35	Q8N283	1001 aa		31.39	■■■□□ 2.62
UPP1-208	ENST00000436673	FGD4	Q96M96	766 aa		31.39	■■■□□ 2.62
UPP1-208	ENST00000436673	ZHX1	Q9UKY1	873 aa	Predicted RBP	31.39	■■■□□ 2.62
UPP1-208	ENST00000436673	TMEM232	C9JQI7	657 aa		31.38	■■■□□ 2.61
UPP1-208	ENST00000436673	POTEB2	H3BUK9	544 aa		31.38	■■■□□ 2.61
UPP1-208	ENST00000436673	CRBN	Q96SW2	442 aa		31.38	■■■□□ 2.61
UPP1-208	ENST00000436673	TSEN34	Q9BSV6	310 aa	Known RBP	31.38	■■■□□ 2.61
UPP1-208	ENST00000436673	ZBTB47	Q9UFB7	747 aa	Predicted RBP	31.38	■■■□□ 2.61
UPP1-208	ENST00000436673	SYNRG	Q9UMZ2	1314 aa		31.38	■■■□□ 2.61
UPP1-208	ENST00000436673	STAT2	P52630	851 aa		31.37	■■■□□ 2.61
UPP1-208	ENST00000436673	CTDSPL2	Q05D32	466 aa		31.37	■■■□□ 2.61
UPP1-208	ENST00000436673	SHH	Q15465	462 aa		31.37	■■■□□ 2.61
UPP1-208	ENST00000436673	PPP4R3B	Q5MIZ7	849 aa		31.37	■■■□□ 2.61
UPP1-208	ENST00000436673	FAM109B	Q6ICB4	259 aa	Predicted RBP	31.37	■■■□□ 2.61
UPP1-208	ENST00000436673	KLHDC9	Q8NEP7	349 aa		31.37	■■■□□ 2.61
UPP1-208	ENST00000436673	EVI5L	Q96CN4	794 aa		31.37	■■■□□ 2.61
UPP1-208	ENST00000436673	INCENP	Q9NQS7	918 aa		31.37	■■■□□ 2.61
UPP1-208	ENST00000436673	CDKN2AIP	Q9NXV6	580 aa	Predicted RBP	31.37	■■■□□ 2.61
UPP1-208	ENST00000436673	TACC3	Q9Y6A5	838 aa		31.37	■■■□□ 2.61
UPP1-208	ENST00000436673	SLC1A4	P43007	532 aa		31.36	■■■□□ 2.61
UPP1-208	ENST00000436673	ACVR2B	Q13705	512 aa		31.36	■■■□□ 2.61
UPP1-208	ENST00000436673	FAM160B2	Q86V87	743 aa		31.36	■■■□□ 2.61
UPP1-208	ENST00000436673	CHURC1	Q8WUH1	139 aa		31.36	■■■□□ 2.61
UPP1-208	ENST00000436673	STAG1	Q8WVM7	1258 aa		31.36	■■■□□ 2.61
UPP1-208	ENST00000436673	ISY1	Q9ULR0	285 aa	Known RBP	31.36	■■■□□ 2.61
UPP1-208	ENST00000436673	TSPY2	A6NKD2	308 aa		31.35	■■■□□ 2.61
UPP1-208	ENST00000436673	DUSP11	O75319	330 aa	Known RBP	31.35	■■■□□ 2.61
UPP1-208	ENST00000436673	CLTB	P09497	229 aa		31.35	■■■□□ 2.61
UPP1-208	ENST00000436673	MCC	P23508	829 aa		31.35	■■■□□ 2.61

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.1 ms