RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000435136.6

SH3BP2-202, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene SH3BP2, Length 2,318 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-202ENST00000435136 PCDHA5Q9Y5H7 936 aa21.24■□□□□ 0.99
SH3BP2-202ENST00000435136 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP21.24■□□□□ 0.99
SH3BP2-202ENST00000435136 LTBP3Q9NS15 1303 aa21.23■□□□□ 0.99
SH3BP2-202ENST00000435136 LAD1O00515 517 aa21.23■□□□□ 0.99
SH3BP2-202ENST00000435136 NCAPHQ15003 741 aa21.23■□□□□ 0.99
SH3BP2-202ENST00000435136 ZNF174Q15697 407 aa21.23■□□□□ 0.99
SH3BP2-202ENST00000435136 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP21.23■□□□□ 0.99
SH3BP2-202ENST00000435136 DBNDD1Q9H9R9 158 aa21.23■□□□□ 0.99
SH3BP2-202ENST00000435136 SCN9AQ15858 1988 aa21.23■□□□□ 0.99
SH3BP2-202ENST00000435136 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa21.23■□□□□ 0.99
SH3BP2-202ENST00000435136 BIN1O00499 593 aa21.23■□□□□ 0.99
SH3BP2-202ENST00000435136 TTLL1O95922 423 aa21.23■□□□□ 0.99
SH3BP2-202ENST00000435136 SLFN14P0C7P3 912 aa21.23■□□□□ 0.99
SH3BP2-202ENST00000435136 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP21.23■□□□□ 0.99
SH3BP2-202ENST00000435136 TERF1P54274 439 aa21.23■□□□□ 0.99
SH3BP2-202ENST00000435136 ORC2Q13416 577 aaPredicted RBP21.23■□□□□ 0.99
SH3BP2-202ENST00000435136 MLKLQ8NB16 471 aa21.23■□□□□ 0.99
SH3BP2-202ENST00000435136 SPTLC3Q9NUV7 552 aa21.23■□□□□ 0.99
SH3BP2-202ENST00000435136 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP21.23■□□□□ 0.99
SH3BP2-202ENST00000435136 SMC2O95347 1197 aa21.22■□□□□ 0.99
SH3BP2-202ENST00000435136 GNA11P29992 359 aa21.22■□□□□ 0.99
SH3BP2-202ENST00000435136 LONP1P36776 959 aaKnown RBP21.22■□□□□ 0.99
SH3BP2-202ENST00000435136 SCNN1DP51172 638 aa21.22■□□□□ 0.99
SH3BP2-202ENST00000435136 SPECC1Q5M775 1068 aa21.22■□□□□ 0.99
SH3BP2-202ENST00000435136 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa21.22■□□□□ 0.99
SH3BP2-202ENST00000435136 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa21.22■□□□□ 0.99
SH3BP2-202ENST00000435136 SMARCE1Q969G3 411 aa21.22■□□□□ 0.99
SH3BP2-202ENST00000435136 KCNF1Q9H3M0 494 aa21.22■□□□□ 0.99
SH3BP2-202ENST00000435136 PCDHA6Q9UN73 950 aa21.22■□□□□ 0.99
SH3BP2-202ENST00000435136 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa21.22■□□□□ 0.99
SH3BP2-202ENST00000435136 SIPA1L1O43166 1804 aa21.22■□□□□ 0.99
SH3BP2-202ENST00000435136 A0A087WWV3 80 aa21.22■□□□□ 0.99
SH3BP2-202ENST00000435136 PDHBP11177 359 aa21.22■□□□□ 0.99
SH3BP2-202ENST00000435136 SHMT1P34896 483 aa21.22■□□□□ 0.99
SH3BP2-202ENST00000435136 MYL5Q02045 173 aa21.22■□□□□ 0.99
SH3BP2-202ENST00000435136 TYW1BQ6NUM6 668 aa21.22■□□□□ 0.99
SH3BP2-202ENST00000435136 KRT25Q7Z3Z0 450 aa21.22■□□□□ 0.99
SH3BP2-202ENST00000435136 FOXP4Q8IVH2 680 aaPredicted RBP21.22■□□□□ 0.99
SH3BP2-202ENST00000435136 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP21.22■□□□□ 0.99
SH3BP2-202ENST00000435136 MXD3Q9BW11 206 aa21.22■□□□□ 0.99
SH3BP2-202ENST00000435136 C6orf50Q9HD87 102 aa21.22■□□□□ 0.99
SH3BP2-202ENST00000435136 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP21.21■□□□□ 0.99
SH3BP2-202ENST00000435136 WNT7AO00755 349 aa21.21■□□□□ 0.99
SH3BP2-202ENST00000435136 AKR1B1P15121 316 aa21.21■□□□□ 0.99
SH3BP2-202ENST00000435136 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP21.21■□□□□ 0.99
SH3BP2-202ENST00000435136 IMPACTQ9P2X3 320 aa21.21■□□□□ 0.99
SH3BP2-202ENST00000435136 MORC3Q14149 939 aa21.21■□□□□ 0.99
SH3BP2-202ENST00000435136 CCDC186Q7Z3E2 898 aa21.21■□□□□ 0.99
SH3BP2-202ENST00000435136 C4orf32Q8N8J7 132 aa21.21■□□□□ 0.99
SH3BP2-202ENST00000435136 KIAA1524Q8TCG1 905 aa21.21■□□□□ 0.99
SH3BP2-202ENST00000435136 PSMD1Q99460 953 aa21.21■□□□□ 0.99
SH3BP2-202ENST00000435136 MAN1B1Q9UKM7 699 aa21.21■□□□□ 0.99
SH3BP2-202ENST00000435136 PPP1R18Q6NYC8 613 aa21.2■□□□□ 0.98
SH3BP2-202ENST00000435136 BAZ2BQ9UIF8 2168 aaKnown RBP21.2■□□□□ 0.98
SH3BP2-202ENST00000435136 PTGS1P23219 599 aa21.2■□□□□ 0.98
SH3BP2-202ENST00000435136 PRPHP41219 470 aa21.2■□□□□ 0.98
SH3BP2-202ENST00000435136 USP17L2Q6R6M4 530 aa21.2■□□□□ 0.98
SH3BP2-202ENST00000435136 ZNF830Q96NB3 372 aaPredicted RBP21.2■□□□□ 0.98
SH3BP2-202ENST00000435136 NAPAP54920 295 aa21.19■□□□□ 0.98
SH3BP2-202ENST00000435136 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP21.19■□□□□ 0.98
SH3BP2-202ENST00000435136 USP49Q70CQ1 688 aa21.19■□□□□ 0.98
SH3BP2-202ENST00000435136 GOLGA8HP0CJ92 632 aa21.18■□□□□ 0.98
SH3BP2-202ENST00000435136 IQUBQ8NA54 791 aa21.18■□□□□ 0.98
SH3BP2-202ENST00000435136 EPSTI1Q96J88 318 aa21.18■□□□□ 0.98
SH3BP2-202ENST00000435136 VWA3AA6NCI4 1184 aa21.18■□□□□ 0.98
SH3BP2-202ENST00000435136 USP17L5A8MUK1 530 aa21.18■□□□□ 0.98
SH3BP2-202ENST00000435136 MCM7P33993 719 aa21.18■□□□□ 0.98
SH3BP2-202ENST00000435136 GSDMDP57764 484 aa21.18■□□□□ 0.98
SH3BP2-202ENST00000435136 GPATCH4Q5T3I0 446 aaKnown RBP21.18■□□□□ 0.98
SH3BP2-202ENST00000435136 PI4KBQ9UBF8 816 aa21.18■□□□□ 0.98
SH3BP2-202ENST00000435136 MYH4Q9Y623 1939 aa21.18■□□□□ 0.98
SH3BP2-202ENST00000435136 ATRNL1Q5VV63 1379 aa21.17■□□□□ 0.98
SH3BP2-202ENST00000435136 TXLNAP40222 546 aa21.17■□□□□ 0.98
SH3BP2-202ENST00000435136 DHX58Q96C10 678 aa21.17■□□□□ 0.98
SH3BP2-202ENST00000435136 GSDMAQ96QA5 445 aa21.17■□□□□ 0.98
SH3BP2-202ENST00000435136 FOXN1O15353 648 aa21.17■□□□□ 0.98
SH3BP2-202ENST00000435136 CBFA2T2O43439 604 aa21.17■□□□□ 0.98
SH3BP2-202ENST00000435136 ZNF543Q08ER8 600 aa21.17■□□□□ 0.98
SH3BP2-202ENST00000435136 E2F4Q16254 413 aa21.17■□□□□ 0.98
SH3BP2-202ENST00000435136 KIAA0825Q8IV33 1275 aa21.17■□□□□ 0.98
SH3BP2-202ENST00000435136 PAGE5Q96GU1 130 aa21.17■□□□□ 0.98
SH3BP2-202ENST00000435136 VPS33BQ9H267 617 aa21.17■□□□□ 0.98
SH3BP2-202ENST00000435136 A0A087X0B3 334 aa21.16■□□□□ 0.98
SH3BP2-202ENST00000435136 ADAMTS3O15072 1205 aa21.16■□□□□ 0.98
SH3BP2-202ENST00000435136 ENTPD3O75355 529 aa21.16■□□□□ 0.98
SH3BP2-202ENST00000435136 PRR29P0C7W0 189 aa21.16■□□□□ 0.98
SH3BP2-202ENST00000435136 ERCC5P28715 1186 aaPredicted RBP21.16■□□□□ 0.98
SH3BP2-202ENST00000435136 NFIAQ12857 509 aa21.16■□□□□ 0.98
SH3BP2-202ENST00000435136 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP21.16■□□□□ 0.98
SH3BP2-202ENST00000435136 PDILTQ8N807 584 aa21.16■□□□□ 0.98
SH3BP2-202ENST00000435136 SMCO2A6NFE2 343 aa21.16■□□□□ 0.98
SH3BP2-202ENST00000435136 SEMA3FQ13275 785 aa21.16■□□□□ 0.98
SH3BP2-202ENST00000435136 AOC3Q16853 763 aa21.16■□□□□ 0.98
SH3BP2-202ENST00000435136 ENOX1Q8TC92 643 aaKnown RBP21.16■□□□□ 0.98
SH3BP2-202ENST00000435136 MKL1Q969V6 931 aa21.16■□□□□ 0.98
SH3BP2-202ENST00000435136 HSD3B7Q9H2F3 369 aa21.16■□□□□ 0.98
SH3BP2-202ENST00000435136 KCNQ5Q9NR82 932 aa21.16■□□□□ 0.98
SH3BP2-202ENST00000435136 MTMR7Q9Y216 660 aa21.16■□□□□ 0.98
SH3BP2-202ENST00000435136 BMP6P22004 513 aa21.15■□□□□ 0.98
SH3BP2-202ENST00000435136 PIGSQ96S52 555 aa21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21 ms