RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000421019.1

SMIM25-201, Transcript of small integral membrane protein 25, humanhuman

TSL 2

Gene SMIM25, Length 686 nt, Biotype lincRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM25-201ENST00000421019 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP13.09□□□□□ -0.31
SMIM25-201ENST00000421019 SYNGAP1Q96PV0 1343 aa13.09□□□□□ -0.31
SMIM25-201ENST00000421019 A0A0G2JMZ2 1700 aa13.08□□□□□ -0.32
SMIM25-201ENST00000421019 EPHB4P54760 987 aa13.08□□□□□ -0.32
SMIM25-201ENST00000421019 SBK1Q52WX2 424 aa13.08□□□□□ -0.32
SMIM25-201ENST00000421019 MAMDC4Q6UXC1 1216 aa13.08□□□□□ -0.32
SMIM25-201ENST00000421019 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP13.08□□□□□ -0.32
SMIM25-201ENST00000421019 KLHDC9Q8NEP7 349 aa13.08□□□□□ -0.32
SMIM25-201ENST00000421019 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP13.08□□□□□ -0.32
SMIM25-201ENST00000421019 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP13.08□□□□□ -0.32
SMIM25-201ENST00000421019 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP13.08□□□□□ -0.32
SMIM25-201ENST00000421019 MKNK2Q9HBH9 465 aa13.08□□□□□ -0.32
SMIM25-201ENST00000421019 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP13.08□□□□□ -0.32
SMIM25-201ENST00000421019 LTBP2Q14767 1821 aa13.08□□□□□ -0.32
SMIM25-201ENST00000421019 DNAJC25-GNG10A0A024R161 153 aa13.07□□□□□ -0.32
SMIM25-201ENST00000421019 F5H6K3 240 aa13.07□□□□□ -0.32
SMIM25-201ENST00000421019 ATP2A1O14983 1001 aa13.07□□□□□ -0.32
SMIM25-201ENST00000421019 ZBED4O75132 1171 aa13.07□□□□□ -0.32
SMIM25-201ENST00000421019 DUSP11O75319 330 aaKnown RBP13.07□□□□□ -0.32
SMIM25-201ENST00000421019 SNAI1O95863 264 aaPredicted RBP13.07□□□□□ -0.32
SMIM25-201ENST00000421019 TIMP1P01033 207 aa13.07□□□□□ -0.32
SMIM25-201ENST00000421019 KLRC3Q07444 240 aa13.07□□□□□ -0.32
SMIM25-201ENST00000421019 FAAP100Q0VG06 881 aa13.07□□□□□ -0.32
SMIM25-201ENST00000421019 KCNA10Q16322 511 aa13.07□□□□□ -0.32
SMIM25-201ENST00000421019 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP13.07□□□□□ -0.32
SMIM25-201ENST00000421019 GIMAP6Q6P9H5 292 aa13.07□□□□□ -0.32
SMIM25-201ENST00000421019 CCDC174Q6PII3 467 aa13.07□□□□□ -0.32
SMIM25-201ENST00000421019 PCSK9Q8NBP7 692 aaKnown RBP13.07□□□□□ -0.32
SMIM25-201ENST00000421019 GLT1D1Q96MS3 346 aa13.07□□□□□ -0.32
SMIM25-201ENST00000421019 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP13.07□□□□□ -0.32
SMIM25-201ENST00000421019 SPC25Q9HBM1 224 aa13.07□□□□□ -0.32
SMIM25-201ENST00000421019 COG6Q9Y2V7 657 aa13.07□□□□□ -0.32
SMIM25-201ENST00000421019 ELP1O95163 1332 aa13.07□□□□□ -0.32
SMIM25-201ENST00000421019 DNAH12Q6ZR08 3092 aa13.07□□□□□ -0.32
SMIM25-201ENST00000421019 NDUFB10O96000 172 aa13.06□□□□□ -0.32
SMIM25-201ENST00000421019 CHGBP05060 677 aa13.06□□□□□ -0.32
SMIM25-201ENST00000421019 RASA1P20936 1047 aa13.06□□□□□ -0.32
SMIM25-201ENST00000421019 CST5P28325 142 aaPredicted RBP13.06□□□□□ -0.32
SMIM25-201ENST00000421019 CCSAPQ6IQ19 270 aaPredicted RBP13.06□□□□□ -0.32
SMIM25-201ENST00000421019 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP13.06□□□□□ -0.32
SMIM25-201ENST00000421019 LENG1Q96BZ8 264 aaPredicted RBP13.06□□□□□ -0.32
SMIM25-201ENST00000421019 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP13.06□□□□□ -0.32
SMIM25-201ENST00000421019 LRRCC1Q9C099 1032 aa13.06□□□□□ -0.32
SMIM25-201ENST00000421019 ABHD16BQ9H3Z7 469 aa13.06□□□□□ -0.32
SMIM25-201ENST00000421019 ZNF287Q9HBT7 754 aa13.06□□□□□ -0.32
SMIM25-201ENST00000421019 FBXO40Q9UH90 709 aa13.06□□□□□ -0.32
SMIM25-201ENST00000421019 ZHX1Q9UKY1 873 aaPredicted RBP13.06□□□□□ -0.32
SMIM25-201ENST00000421019 RIPK3Q9Y572 518 aa13.06□□□□□ -0.32
SMIM25-201ENST00000421019 MROH7Q68CQ1 1323 aa13.06□□□□□ -0.32
SMIM25-201ENST00000421019 SYNRGQ9UMZ2 1314 aa13.06□□□□□ -0.32
SMIM25-201ENST00000421019 ZNFX1Q9P2E3 1918 aaKnown RBP13.05□□□□□ -0.32
SMIM25-201ENST00000421019 GSG1L2A8MUP6 293 aa13.05□□□□□ -0.32
SMIM25-201ENST00000421019 DNAJB2P25686 324 aa13.05□□□□□ -0.32
SMIM25-201ENST00000421019 SLC4A3P48751 1232 aa13.05□□□□□ -0.32
SMIM25-201ENST00000421019 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP13.05□□□□□ -0.32
SMIM25-201ENST00000421019 ACVR2BQ13705 512 aa13.05□□□□□ -0.32
SMIM25-201ENST00000421019 MFSD5Q6N075 450 aa13.05□□□□□ -0.32
SMIM25-201ENST00000421019 CPXCR1Q8N123 301 aa13.05□□□□□ -0.32
SMIM25-201ENST00000421019 CHST13Q8NET6 341 aa13.05□□□□□ -0.32
SMIM25-201ENST00000421019 VTI1AQ96AJ9 217 aa13.05□□□□□ -0.32
SMIM25-201ENST00000421019 CLIP2Q9UDT6 1046 aa13.05□□□□□ -0.32
SMIM25-201ENST00000421019 FEM1BQ9UK73 627 aa13.05□□□□□ -0.32
SMIM25-201ENST00000421019 TBX21Q9UL17 535 aa13.05□□□□□ -0.32
SMIM25-201ENST00000421019 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa13.05□□□□□ -0.32
SMIM25-201ENST00000421019 MINDY4BA8MYZ0 360 aa13.04□□□□□ -0.32
SMIM25-201ENST00000421019 C6orf222P0C671 652 aaPredicted RBP13.04□□□□□ -0.32
SMIM25-201ENST00000421019 FDX1P10109 184 aa13.04□□□□□ -0.32
SMIM25-201ENST00000421019 CDK7P50613 346 aa13.04□□□□□ -0.32
SMIM25-201ENST00000421019 GRIN2CQ14957 1233 aa13.04□□□□□ -0.32
SMIM25-201ENST00000421019 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP13.04□□□□□ -0.32
SMIM25-201ENST00000421019 ANKRD35Q8N283 1001 aa13.04□□□□□ -0.32
SMIM25-201ENST00000421019 MKL1Q969V6 931 aa13.04□□□□□ -0.32
SMIM25-201ENST00000421019 KIFC2Q96AC6 838 aa13.04□□□□□ -0.32
SMIM25-201ENST00000421019 TIFAQ96CG3 184 aa13.04□□□□□ -0.32
SMIM25-201ENST00000421019 ZNF576Q9H609 170 aa13.04□□□□□ -0.32
SMIM25-201ENST00000421019 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa13.04□□□□□ -0.32
SMIM25-201ENST00000421019 RAVER2Q9HCJ3 691 aaKnown RBP13.04□□□□□ -0.32
SMIM25-201ENST00000421019 ECHDC1Q9NTX5 307 aa13.04□□□□□ -0.32
SMIM25-201ENST00000421019 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP13.04□□□□□ -0.32
SMIM25-201ENST00000421019 MYO9BQ13459 2157 aa13.04□□□□□ -0.32
SMIM25-201ENST00000421019 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP13.03□□□□□ -0.32
SMIM25-201ENST00000421019 ARVCFO00192 962 aa13.03□□□□□ -0.32
SMIM25-201ENST00000421019 TLR3O15455 904 aaKnown RBP13.03□□□□□ -0.32
SMIM25-201ENST00000421019 ASGR1P07306 291 aa13.03□□□□□ -0.32
SMIM25-201ENST00000421019 GNAT2P19087 354 aa13.03□□□□□ -0.32
SMIM25-201ENST00000421019 OAZ1P54368 228 aa13.03□□□□□ -0.32
SMIM25-201ENST00000421019 GJA9P57773 515 aa13.03□□□□□ -0.32
SMIM25-201ENST00000421019 CCDC144BQ3MJ40 725 aa13.03□□□□□ -0.32
SMIM25-201ENST00000421019 GNASQ5JWF2 1037 aa13.03□□□□□ -0.32
SMIM25-201ENST00000421019 STK11IPQ8N1F8 1099 aa13.03□□□□□ -0.32
SMIM25-201ENST00000421019 TMEM199Q8N511 208 aa13.03□□□□□ -0.32
SMIM25-201ENST00000421019 KBTBD3Q8NAB2 608 aa13.03□□□□□ -0.32
SMIM25-201ENST00000421019 APPBP2Q92624 585 aa13.03□□□□□ -0.32
SMIM25-201ENST00000421019 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP13.03□□□□□ -0.32
SMIM25-201ENST00000421019 UPF3AQ9H1J1 476 aaKnown RBP13.03□□□□□ -0.32
SMIM25-201ENST00000421019 PRDM6Q9NQX0 595 aa13.03□□□□□ -0.32
SMIM25-201ENST00000421019 MTMR4Q9NYA4 1195 aa13.03□□□□□ -0.32
SMIM25-201ENST00000421019 BAZ2AQ9UIF9 1905 aaKnown RBP13.03□□□□□ -0.32
SMIM25-201ENST00000421019 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa13.02□□□□□ -0.33
SMIM25-201ENST00000421019 MYADML2A6NDP7 307 aa13.02□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.4 ms