RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000419253.1

TTC28-AS1-203, TTC28 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TTC28-AS1, Length 846 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC28-AS1-203ENST00000419253 RIOX2Q8IUF8 465 aa14.61□□□□□ -0.07
TTC28-AS1-203ENST00000419253 CPXCR1Q8N123 301 aa14.61□□□□□ -0.07
TTC28-AS1-203ENST00000419253 DCAF4Q8WV16 495 aa14.61□□□□□ -0.07
TTC28-AS1-203ENST00000419253 MMP19Q99542 508 aa14.61□□□□□ -0.07
TTC28-AS1-203ENST00000419253 TMEM47Q9BQJ4 181 aa14.61□□□□□ -0.07
TTC28-AS1-203ENST00000419253 UBAC1Q9BSL1 405 aa14.61□□□□□ -0.07
TTC28-AS1-203ENST00000419253 TEX13BQ9BXU2 312 aa14.61□□□□□ -0.07
TTC28-AS1-203ENST00000419253 COL11A1P12107 1806 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
TTC28-AS1-203ENST00000419253 LAMA4Q16363 1823 aa14.61□□□□□ -0.07
TTC28-AS1-203ENST00000419253 PARP14Q460N5 1801 aa14.61□□□□□ -0.07
TTC28-AS1-203ENST00000419253 NEDD4P46934 1319 aa14.61□□□□□ -0.07
TTC28-AS1-203ENST00000419253 PLXNB2O15031 1838 aa14.6□□□□□ -0.07
TTC28-AS1-203ENST00000419253 B4E1Z4 1266 aa14.6□□□□□ -0.07
TTC28-AS1-203ENST00000419253 TFRCP02786 760 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
TTC28-AS1-203ENST00000419253 ADORA2AP29274 412 aa14.6□□□□□ -0.07
TTC28-AS1-203ENST00000419253 GJA8P48165 433 aa14.6□□□□□ -0.07
TTC28-AS1-203ENST00000419253 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
TTC28-AS1-203ENST00000419253 KCTD1Q719H9 257 aa14.6□□□□□ -0.07
TTC28-AS1-203ENST00000419253 ABRAQ8N0Z2 381 aa14.6□□□□□ -0.07
TTC28-AS1-203ENST00000419253 TRIB2Q92519 343 aa14.6□□□□□ -0.07
TTC28-AS1-203ENST00000419253 USP6NLQ92738 828 aa14.6□□□□□ -0.07
TTC28-AS1-203ENST00000419253 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa14.6□□□□□ -0.07
TTC28-AS1-203ENST00000419253 NBPF3Q9H094 633 aa14.6□□□□□ -0.07
TTC28-AS1-203ENST00000419253 IL25Q9H293 177 aa14.6□□□□□ -0.07
TTC28-AS1-203ENST00000419253 A0A0G2JMZ2 1700 aa14.6□□□□□ -0.07
TTC28-AS1-203ENST00000419253 RPTORQ8N122 1335 aa14.6□□□□□ -0.07
TTC28-AS1-203ENST00000419253 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
TTC28-AS1-203ENST00000419253 NOVP48745 357 aa14.59□□□□□ -0.07
TTC28-AS1-203ENST00000419253 OAZ1P54368 228 aa14.59□□□□□ -0.07
TTC28-AS1-203ENST00000419253 PTH1RQ03431 593 aa14.59□□□□□ -0.07
TTC28-AS1-203ENST00000419253 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
TTC28-AS1-203ENST00000419253 DGKHQ86XP1 1220 aa14.59□□□□□ -0.07
TTC28-AS1-203ENST00000419253 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
TTC28-AS1-203ENST00000419253 DEFB118Q96PH6 123 aa14.59□□□□□ -0.07
TTC28-AS1-203ENST00000419253 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP14.59□□□□□ -0.07
TTC28-AS1-203ENST00000419253 KAT14Q9H8E8 782 aa14.59□□□□□ -0.07
TTC28-AS1-203ENST00000419253 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa14.59□□□□□ -0.07
TTC28-AS1-203ENST00000419253 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
TTC28-AS1-203ENST00000419253 ERICH2A1L162 156 aa14.58□□□□□ -0.08
TTC28-AS1-203ENST00000419253 PLA2G6O60733 806 aa14.58□□□□□ -0.08
TTC28-AS1-203ENST00000419253 SGPL1O95470 568 aa14.58□□□□□ -0.08
TTC28-AS1-203ENST00000419253 HOXC6P09630 235 aa14.58□□□□□ -0.08
TTC28-AS1-203ENST00000419253 CCL14Q16627 93 aa14.58□□□□□ -0.08
TTC28-AS1-203ENST00000419253 ERICH6BQ5W0A0 696 aa14.58□□□□□ -0.08
TTC28-AS1-203ENST00000419253 DDX11Q96FC9 970 aa14.58□□□□□ -0.08
TTC28-AS1-203ENST00000419253 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
TTC28-AS1-203ENST00000419253 RAVER2Q9HCJ3 691 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
TTC28-AS1-203ENST00000419253 ZSWIM5Q9P217 1185 aa14.58□□□□□ -0.08
TTC28-AS1-203ENST00000419253 FBXO40Q9UH90 709 aa14.58□□□□□ -0.08
TTC28-AS1-203ENST00000419253 ZNFX1Q9P2E3 1918 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
TTC28-AS1-203ENST00000419253 ATP2A1O14983 1001 aa14.57□□□□□ -0.08
TTC28-AS1-203ENST00000419253 CNGA1P29973 690 aa14.57□□□□□ -0.08
TTC28-AS1-203ENST00000419253 TRIM32Q13049 653 aa14.57□□□□□ -0.08
TTC28-AS1-203ENST00000419253 SART3Q15020 963 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
TTC28-AS1-203ENST00000419253 SKAP1Q86WV1 359 aa14.57□□□□□ -0.08
TTC28-AS1-203ENST00000419253 REPS2Q8NFH8 660 aa14.57□□□□□ -0.08
TTC28-AS1-203ENST00000419253 NCOA7Q8NI08 942 aa14.57□□□□□ -0.08
TTC28-AS1-203ENST00000419253 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa14.57□□□□□ -0.08
TTC28-AS1-203ENST00000419253 GPCPD1Q9NPB8 672 aa14.57□□□□□ -0.08
TTC28-AS1-203ENST00000419253 ANO2Q9NQ90 1003 aa14.57□□□□□ -0.08
TTC28-AS1-203ENST00000419253 PAK6Q9NQU5 681 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
TTC28-AS1-203ENST00000419253 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
TTC28-AS1-203ENST00000419253 CDC45O75419 566 aa14.56□□□□□ -0.08
TTC28-AS1-203ENST00000419253 CYP21A2P08686 494 aa14.56□□□□□ -0.08
TTC28-AS1-203ENST00000419253 CACNB2Q08289 660 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
TTC28-AS1-203ENST00000419253 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
TTC28-AS1-203ENST00000419253 CCDC174Q6PII3 467 aa14.56□□□□□ -0.08
TTC28-AS1-203ENST00000419253 ANKRD35Q8N283 1001 aa14.56□□□□□ -0.08
TTC28-AS1-203ENST00000419253 PNMA1Q8ND90 353 aa14.56□□□□□ -0.08
TTC28-AS1-203ENST00000419253 CHST13Q8NET6 341 aa14.56□□□□□ -0.08
TTC28-AS1-203ENST00000419253 NPLOC4Q8TAT6 608 aa14.56□□□□□ -0.08
TTC28-AS1-203ENST00000419253 MAP4K1Q92918 833 aa14.56□□□□□ -0.08
TTC28-AS1-203ENST00000419253 PPP4R2Q9NY27 417 aa14.56□□□□□ -0.08
TTC28-AS1-203ENST00000419253 PRR12Q9ULL5 1215 aa14.56□□□□□ -0.08
TTC28-AS1-203ENST00000419253 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
TTC28-AS1-203ENST00000419253 TNKSO95271 1327 aa14.56□□□□□ -0.08
TTC28-AS1-203ENST00000419253 PDHBP11177 359 aa14.55□□□□□ -0.08
TTC28-AS1-203ENST00000419253 TKFCQ3LXA3 575 aa14.55□□□□□ -0.08
TTC28-AS1-203ENST00000419253 GPATCH4Q5T3I0 446 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
TTC28-AS1-203ENST00000419253 MAP3K21Q5TCX8 1036 aa14.55□□□□□ -0.08
TTC28-AS1-203ENST00000419253 SYDE2Q5VT97 1194 aa14.55□□□□□ -0.08
TTC28-AS1-203ENST00000419253 OLFML2BQ68BL8 750 aa14.55□□□□□ -0.08
TTC28-AS1-203ENST00000419253 HOMER2Q9NSB8 354 aa14.55□□□□□ -0.08
TTC28-AS1-203ENST00000419253 PNMA2Q9UL42 364 aa14.55□□□□□ -0.08
TTC28-AS1-203ENST00000419253 ZNF236Q9UL36 1845 aa14.55□□□□□ -0.08
TTC28-AS1-203ENST00000419253 BRCA2P51587 3418 aa14.54□□□□□ -0.08
TTC28-AS1-203ENST00000419253 E7EWF7 191 aa14.54□□□□□ -0.08
TTC28-AS1-203ENST00000419253 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
TTC28-AS1-203ENST00000419253 COBLO75128 1261 aa14.54□□□□□ -0.08
TTC28-AS1-203ENST00000419253 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
TTC28-AS1-203ENST00000419253 PGK2P07205 417 aa14.54□□□□□ -0.08
TTC28-AS1-203ENST00000419253 ALAS1P13196 640 aa14.54□□□□□ -0.08
TTC28-AS1-203ENST00000419253 CYP2C19P33261 490 aa14.54□□□□□ -0.08
TTC28-AS1-203ENST00000419253 SLC16A2P36021 539 aa14.54□□□□□ -0.08
TTC28-AS1-203ENST00000419253 ZNF543Q08ER8 600 aa14.54□□□□□ -0.08
TTC28-AS1-203ENST00000419253 RNF20Q5VTR2 975 aa14.54□□□□□ -0.08
TTC28-AS1-203ENST00000419253 TTBK2Q6IQ55 1244 aa14.54□□□□□ -0.08
TTC28-AS1-203ENST00000419253 ENAHQ8N8S7 591 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
TTC28-AS1-203ENST00000419253 ANKS1AQ92625 1134 aa14.54□□□□□ -0.08
TTC28-AS1-203ENST00000419253 MAML3Q96JK9 1138 aa14.54□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.4 ms