RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000416021.5

SH3BP4-204, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP4, Length 593 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-204ENST00000416021 STAT2P52630 851 aa24.83■■□□□ 1.57
SH3BP4-204ENST00000416021 IKQ13123 557 aaPredicted RBP24.83■■□□□ 1.57
SH3BP4-204ENST00000416021 CCL14Q16627 93 aa24.83■■□□□ 1.57
SH3BP4-204ENST00000416021 CPXCR1Q8N123 301 aa24.83■■□□□ 1.57
SH3BP4-204ENST00000416021 DCAF4Q8WV16 495 aa24.83■■□□□ 1.57
SH3BP4-204ENST00000416021 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP24.83■■□□□ 1.57
SH3BP4-204ENST00000416021 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa24.83■■□□□ 1.57
SH3BP4-204ENST00000416021 ADORA2AP29274 412 aa24.82■■□□□ 1.56
SH3BP4-204ENST00000416021 TRIM32Q13049 653 aa24.82■■□□□ 1.56
SH3BP4-204ENST00000416021 TRDNQ13061 729 aa24.82■■□□□ 1.56
SH3BP4-204ENST00000416021 DPP9Q86TI2 863 aa24.82■■□□□ 1.56
SH3BP4-204ENST00000416021 ANKS1AQ92625 1134 aa24.82■■□□□ 1.56
SH3BP4-204ENST00000416021 APBA2Q99767 749 aa24.82■■□□□ 1.56
SH3BP4-204ENST00000416021 LSG1Q9H089 658 aaKnown RBP24.82■■□□□ 1.56
SH3BP4-204ENST00000416021 RAVER2Q9HCJ3 691 aaKnown RBP24.82■■□□□ 1.56
SH3BP4-204ENST00000416021 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP24.82■■□□□ 1.56
SH3BP4-204ENST00000416021 RLFQ13129 1914 aa24.82■■□□□ 1.56
SH3BP4-204ENST00000416021 DOCK3Q8IZD9 2030 aa24.81■■□□□ 1.56
SH3BP4-204ENST00000416021 ATP2A1O14983 1001 aa24.81■■□□□ 1.56
SH3BP4-204ENST00000416021 GJB1P08034 283 aa24.81■■□□□ 1.56
SH3BP4-204ENST00000416021 HOXC6P09630 235 aa24.81■■□□□ 1.56
SH3BP4-204ENST00000416021 FDX1P10109 184 aa24.81■■□□□ 1.56
SH3BP4-204ENST00000416021 FCER1AP12319 257 aa24.81■■□□□ 1.56
SH3BP4-204ENST00000416021 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP24.81■■□□□ 1.56
SH3BP4-204ENST00000416021 SLC4A3P48751 1232 aa24.81■■□□□ 1.56
SH3BP4-204ENST00000416021 CCDC96Q2M329 555 aa24.81■■□□□ 1.56
SH3BP4-204ENST00000416021 RASGRP2Q7LDG7 609 aa24.81■■□□□ 1.56
SH3BP4-204ENST00000416021 ABRAQ8N0Z2 381 aa24.81■■□□□ 1.56
SH3BP4-204ENST00000416021 NPLOC4Q8TAT6 608 aa24.81■■□□□ 1.56
SH3BP4-204ENST00000416021 TEX13BQ9BXU2 312 aa24.81■■□□□ 1.56
SH3BP4-204ENST00000416021 COBLO75128 1261 aa24.8■■□□□ 1.56
SH3BP4-204ENST00000416021 COPB2P35606 906 aa24.8■■□□□ 1.56
SH3BP4-204ENST00000416021 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP24.8■■□□□ 1.56
SH3BP4-204ENST00000416021 TTBK2Q6IQ55 1244 aa24.8■■□□□ 1.56
SH3BP4-204ENST00000416021 RIPK3Q9Y572 518 aa24.8■■□□□ 1.56
SH3BP4-204ENST00000416021 E7EWF7 191 aa24.79■■□□□ 1.56
SH3BP4-204ENST00000416021 PDHBP11177 359 aa24.79■■□□□ 1.56
SH3BP4-204ENST00000416021 CASC1Q6TDU7 716 aa24.79■■□□□ 1.56
SH3BP4-204ENST00000416021 CYB5R4Q7L1T6 521 aa24.79■■□□□ 1.56
SH3BP4-204ENST00000416021 MMP19Q99542 508 aa24.79■■□□□ 1.56
SH3BP4-204ENST00000416021 UBAC1Q9BSL1 405 aa24.79■■□□□ 1.56
SH3BP4-204ENST00000416021 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP24.79■■□□□ 1.56
SH3BP4-204ENST00000416021 GPCPD1Q9NPB8 672 aa24.79■■□□□ 1.56
SH3BP4-204ENST00000416021 FLRT1Q9NZU1 646 aa24.79■■□□□ 1.56
SH3BP4-204ENST00000416021 PRR12Q9ULL5 1215 aa24.79■■□□□ 1.56
SH3BP4-204ENST00000416021 TAF6LQ9Y6J9 622 aa24.79■■□□□ 1.56
SH3BP4-204ENST00000416021 RPTORQ8N122 1335 aa24.79■■□□□ 1.56
SH3BP4-204ENST00000416021 CDC45O75419 566 aa24.78■■□□□ 1.56
SH3BP4-204ENST00000416021 GJA8P48165 433 aa24.78■■□□□ 1.56
SH3BP4-204ENST00000416021 OAZ1P54368 228 aa24.78■■□□□ 1.56
SH3BP4-204ENST00000416021 ENAHQ8N8S7 591 aaPredicted RBP24.78■■□□□ 1.56
SH3BP4-204ENST00000416021 KAT14Q9H8E8 782 aa24.78■■□□□ 1.56
SH3BP4-204ENST00000416021 ANO2Q9NQ90 1003 aa24.78■■□□□ 1.56
SH3BP4-204ENST00000416021 SLC5A4Q9NY91 659 aa24.78■■□□□ 1.56
SH3BP4-204ENST00000416021 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP24.78■■□□□ 1.56
SH3BP4-204ENST00000416021 SGPL1O95470 568 aa24.77■■□□□ 1.56
SH3BP4-204ENST00000416021 SLC16A2P36021 539 aa24.77■■□□□ 1.56
SH3BP4-204ENST00000416021 SNAP25P60880 206 aa24.77■■□□□ 1.56
SH3BP4-204ENST00000416021 CACNB2Q08289 660 aaPredicted RBP24.77■■□□□ 1.56
SH3BP4-204ENST00000416021 KCTD2Q14681 263 aa24.77■■□□□ 1.56
SH3BP4-204ENST00000416021 MAP3K21Q5TCX8 1036 aa24.77■■□□□ 1.56
SH3BP4-204ENST00000416021 MFSD14CQ5VZR4 134 aa24.77■■□□□ 1.56
SH3BP4-204ENST00000416021 BTNL9Q6UXG8 535 aa24.77■■□□□ 1.56
SH3BP4-204ENST00000416021 NCOA7Q8NI08 942 aa24.77■■□□□ 1.56
SH3BP4-204ENST00000416021 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP24.77■■□□□ 1.56
SH3BP4-204ENST00000416021 DEFB118Q96PH6 123 aa24.77■■□□□ 1.56
SH3BP4-204ENST00000416021 PAK6Q9NQU5 681 aaPredicted RBP24.77■■□□□ 1.56
SH3BP4-204ENST00000416021 TNKSO95271 1327 aa24.77■■□□□ 1.56
SH3BP4-204ENST00000416021 MYH4Q9Y623 1939 aa24.76■■□□□ 1.55
SH3BP4-204ENST00000416021 SNHG28P0DPA3 235 aa24.76■■□□□ 1.55
SH3BP4-204ENST00000416021 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP24.76■■□□□ 1.55
SH3BP4-204ENST00000416021 ZNF543Q08ER8 600 aa24.76■■□□□ 1.55
SH3BP4-204ENST00000416021 STOX1Q6ZVD7 989 aa24.76■■□□□ 1.55
SH3BP4-204ENST00000416021 PNMA1Q8ND90 353 aa24.76■■□□□ 1.55
SH3BP4-204ENST00000416021 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP24.76■■□□□ 1.551e-6■■■■□ 22.7
SH3BP4-204ENST00000416021 TFRCP02786 760 aaKnown RBP24.75■■□□□ 1.55
SH3BP4-204ENST00000416021 NECTIN1Q15223 517 aa24.75■■□□□ 1.55
SH3BP4-204ENST00000416021 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP24.75■■□□□ 1.55
SH3BP4-204ENST00000416021 AGBL1Q96MI9 1066 aa24.75■■□□□ 1.55
SH3BP4-204ENST00000416021 PLXNB2O15031 1838 aa24.75■■□□□ 1.55
SH3BP4-204ENST00000416021 PGK2P07205 417 aa24.74■■□□□ 1.55
SH3BP4-204ENST00000416021 SEC23AQ15436 765 aa24.74■■□□□ 1.55
SH3BP4-204ENST00000416021 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP24.74■■□□□ 1.55
SH3BP4-204ENST00000416021 SYDE2Q5VT97 1194 aa24.74■■□□□ 1.55
SH3BP4-204ENST00000416021 OLFML2BQ68BL8 750 aa24.74■■□□□ 1.55
SH3BP4-204ENST00000416021 CCDC174Q6PII3 467 aa24.74■■□□□ 1.55
SH3BP4-204ENST00000416021 CHST13Q8NET6 341 aa24.74■■□□□ 1.55
SH3BP4-204ENST00000416021 ZNF536O15090 1300 aa24.74■■□□□ 1.55
SH3BP4-204ENST00000416021 A0A0G2JMZ2 1700 aa24.74■■□□□ 1.55
SH3BP4-204ENST00000416021 SLC27A2O14975 620 aa24.73■■□□□ 1.55
SH3BP4-204ENST00000416021 IGHA2P01877 340 aa24.73■■□□□ 1.55
SH3BP4-204ENST00000416021 CYP2C19P33261 490 aa24.73■■□□□ 1.55
SH3BP4-204ENST00000416021 GPATCH4Q5T3I0 446 aaKnown RBP24.73■■□□□ 1.55
SH3BP4-204ENST00000416021 CREB3L3Q68CJ9 461 aa24.73■■□□□ 1.55
SH3BP4-204ENST00000416021 SHISA4Q96DD7 197 aa24.73■■□□□ 1.55
SH3BP4-204ENST00000416021 DDX11Q96FC9 970 aa24.73■■□□□ 1.55
SH3BP4-204ENST00000416021 FBXO40Q9UH90 709 aa24.73■■□□□ 1.55
SH3BP4-204ENST00000416021 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP24.72■■□□□ 1.55
SH3BP4-204ENST00000416021 GOLGA8HP0CJ92 632 aa24.72■■□□□ 1.55
SH3BP4-204ENST00000416021 ZNF792Q3KQV3 632 aa24.72■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.1 ms