RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000381514.7

MRPL23-201, Transcript of mitochondrial ribosomal protein L23, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene MRPL23, Length 919 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL23-201ENST00000381514 VCAM1P19320 739 aa20.36■□□□□ 0.85
MRPL23-201ENST00000381514 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
MRPL23-201ENST00000381514 GJA5P36382 358 aa20.36■□□□□ 0.85
MRPL23-201ENST00000381514 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
MRPL23-201ENST00000381514 EVCP57679 992 aa20.36■□□□□ 0.85
MRPL23-201ENST00000381514 TROAPQ12815 778 aa20.36■□□□□ 0.85
MRPL23-201ENST00000381514 STK3Q13188 491 aa20.36■□□□□ 0.85
MRPL23-201ENST00000381514 FAM83BQ5T0W9 1011 aa20.36■□□□□ 0.85
MRPL23-201ENST00000381514 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
MRPL23-201ENST00000381514 FAM160B2Q86V87 743 aa20.36■□□□□ 0.85
MRPL23-201ENST00000381514 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa20.36■□□□□ 0.85
MRPL23-201ENST00000381514 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
MRPL23-201ENST00000381514 SENP2Q9HC62 589 aa20.36■□□□□ 0.85
MRPL23-201ENST00000381514 HOXC10Q9NYD6 342 aa20.36■□□□□ 0.85
MRPL23-201ENST00000381514 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
MRPL23-201ENST00000381514 BRPF3Q9ULD4 1205 aa20.36■□□□□ 0.85
MRPL23-201ENST00000381514 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa20.36■□□□□ 0.85
MRPL23-201ENST00000381514 ATAD5Q96QE3 1844 aa20.36■□□□□ 0.85
MRPL23-201ENST00000381514 FLOT1O75955 427 aa20.35■□□□□ 0.85
MRPL23-201ENST00000381514 CDKL5O76039 1030 aa20.35■□□□□ 0.85
MRPL23-201ENST00000381514 STAT2P52630 851 aa20.35■□□□□ 0.85
MRPL23-201ENST00000381514 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
MRPL23-201ENST00000381514 SP3Q02447 781 aa20.35■□□□□ 0.85
MRPL23-201ENST00000381514 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
MRPL23-201ENST00000381514 GRM4Q14833 912 aa20.35■□□□□ 0.85
MRPL23-201ENST00000381514 KCTD1Q719H9 257 aa20.35■□□□□ 0.85
MRPL23-201ENST00000381514 MYL10Q9BUA6 226 aa20.35■□□□□ 0.85
MRPL23-201ENST00000381514 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
MRPL23-201ENST00000381514 CENPFP49454 3210 aa20.34■□□□□ 0.85
MRPL23-201ENST00000381514 KLRF2D3W0D1 207 aa20.34■□□□□ 0.85
MRPL23-201ENST00000381514 ZNF543Q08ER8 600 aa20.34■□□□□ 0.85
MRPL23-201ENST00000381514 COG2Q14746 738 aa20.34■□□□□ 0.85
MRPL23-201ENST00000381514 ANKRD23Q86SG2 305 aa20.34■□□□□ 0.85
MRPL23-201ENST00000381514 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
MRPL23-201ENST00000381514 MS4A4AQ96JQ5 239 aa20.34■□□□□ 0.85
MRPL23-201ENST00000381514 TPCN1Q9ULQ1 816 aa20.34■□□□□ 0.85
MRPL23-201ENST00000381514 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa20.34■□□□□ 0.85
MRPL23-201ENST00000381514 PFKFB2O60825 505 aa20.33■□□□□ 0.85
MRPL23-201ENST00000381514 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.85
MRPL23-201ENST00000381514 GOLGA8HP0CJ92 632 aa20.33■□□□□ 0.85
MRPL23-201ENST00000381514 SNHG28P0DPA3 235 aa20.33■□□□□ 0.85
MRPL23-201ENST00000381514 FDX1P10109 184 aa20.33■□□□□ 0.85
MRPL23-201ENST00000381514 EN2P19622 333 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.85
MRPL23-201ENST00000381514 RXRAP19793 462 aa20.33■□□□□ 0.85
MRPL23-201ENST00000381514 CCT2P78371 535 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.85
MRPL23-201ENST00000381514 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa20.33■□□□□ 0.85
MRPL23-201ENST00000381514 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.85
MRPL23-201ENST00000381514 SLF1Q9BQI6 1058 aa20.33■□□□□ 0.85
MRPL23-201ENST00000381514 OTOFQ9HC10 1997 aa20.33■□□□□ 0.84
MRPL23-201ENST00000381514 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
MRPL23-201ENST00000381514 PDHXO00330 501 aa20.32■□□□□ 0.84
MRPL23-201ENST00000381514 ZBED4O75132 1171 aa20.32■□□□□ 0.84
MRPL23-201ENST00000381514 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
MRPL23-201ENST00000381514 TRAF1Q13077 416 aa20.32■□□□□ 0.84
MRPL23-201ENST00000381514 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa20.32■□□□□ 0.84
MRPL23-201ENST00000381514 TRIM22Q8IYM9 498 aa20.32■□□□□ 0.84
MRPL23-201ENST00000381514 CD99L2Q8TCZ2 262 aa20.32■□□□□ 0.84
MRPL23-201ENST00000381514 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
MRPL23-201ENST00000381514 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
MRPL23-201ENST00000381514 BRI3BPQ8WY22 251 aa20.32■□□□□ 0.84
MRPL23-201ENST00000381514 SNX21Q969T3 373 aa20.32■□□□□ 0.84
MRPL23-201ENST00000381514 KIFC2Q96AC6 838 aa20.32■□□□□ 0.84
MRPL23-201ENST00000381514 PARK7Q99497 189 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
MRPL23-201ENST00000381514 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
MRPL23-201ENST00000381514 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
MRPL23-201ENST00000381514 TRIOBPQ9H2D6 2365 aa20.31■□□□□ 0.84
MRPL23-201ENST00000381514 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
MRPL23-201ENST00000381514 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
MRPL23-201ENST00000381514 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP20.31■□□□□ 0.84
MRPL23-201ENST00000381514 PLA2G6O60733 806 aa20.31■□□□□ 0.84
MRPL23-201ENST00000381514 SMARCA1P28370 1054 aa20.31■□□□□ 0.84
MRPL23-201ENST00000381514 CRHR2Q13324 411 aa20.31■□□□□ 0.84
MRPL23-201ENST00000381514 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa20.31■□□□□ 0.84
MRPL23-201ENST00000381514 ZNF333Q96JL9 665 aa20.31■□□□□ 0.84
MRPL23-201ENST00000381514 VAT1LQ9HCJ6 419 aa20.31■□□□□ 0.84
MRPL23-201ENST00000381514 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
MRPL23-201ENST00000381514 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
MRPL23-201ENST00000381514 MAD2L2Q9UI95 211 aa20.31■□□□□ 0.84
MRPL23-201ENST00000381514 PNMA2Q9UL42 364 aa20.31■□□□□ 0.84
MRPL23-201ENST00000381514 BTBD19C9JJ37 291 aa20.3■□□□□ 0.84
MRPL23-201ENST00000381514 ME3Q16798 604 aa20.3■□□□□ 0.84
MRPL23-201ENST00000381514 TREML2Q5T2D2 321 aa20.3■□□□□ 0.84
MRPL23-201ENST00000381514 SYDE2Q5VT97 1194 aa20.3■□□□□ 0.84
MRPL23-201ENST00000381514 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
MRPL23-201ENST00000381514 MYH4Q9Y623 1939 aa20.29■□□□□ 0.84
MRPL23-201ENST00000381514 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP20.29■□□□□ 0.84
MRPL23-201ENST00000381514 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
MRPL23-201ENST00000381514 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa20.29■□□□□ 0.84
MRPL23-201ENST00000381514 CCDC82Q8N4S0 544 aa20.29■□□□□ 0.84
MRPL23-201ENST00000381514 TMX3Q96JJ7 454 aa20.29■□□□□ 0.84
MRPL23-201ENST00000381514 UBA5Q9GZZ9 404 aa20.29■□□□□ 0.84
MRPL23-201ENST00000381514 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa20.29■□□□□ 0.84
MRPL23-201ENST00000381514 KIF3AQ9Y496 699 aa20.29■□□□□ 0.84
MRPL23-201ENST00000381514 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP20.29■□□□□ 0.84
MRPL23-201ENST00000381514 BRCA2P51587 3418 aa20.28■□□□□ 0.84
MRPL23-201ENST00000381514 MYPNQ86TC9 1320 aa20.28■□□□□ 0.84
MRPL23-201ENST00000381514 DSG3P32926 999 aa20.28■□□□□ 0.84
MRPL23-201ENST00000381514 ADD1P35611 737 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
MRPL23-201ENST00000381514 SLC16A2P36021 539 aa20.28■□□□□ 0.84
MRPL23-201ENST00000381514 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.5 ms