RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000379445.7

CTXN3-201, Transcript of cortexin 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTXN3, Length 1,660 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3-201ENST00000379445 USP17L22D6RA61 530 aa8.42□□□□□ -1.06
CTXN3-201ENST00000379445 USP17L17D6RBQ6 530 aa8.42□□□□□ -1.06
CTXN3-201ENST00000379445 USP17L19D6RCP7 530 aa8.42□□□□□ -1.06
CTXN3-201ENST00000379445 USP17L20D6RJB6 530 aa8.42□□□□□ -1.06
CTXN3-201ENST00000379445 RAB11FIP3O75154 756 aa8.42□□□□□ -1.06
CTXN3-201ENST00000379445 CYP2B6P20813 491 aa8.42□□□□□ -1.06
CTXN3-201ENST00000379445 USP14P54578 494 aa8.42□□□□□ -1.06
CTXN3-201ENST00000379445 USP17L24Q0WX57 530 aa8.42□□□□□ -1.06
CTXN3-201ENST00000379445 RAB3GAP1Q15042 981 aa8.42□□□□□ -1.06
CTXN3-201ENST00000379445 MORN1Q5T089 497 aa8.42□□□□□ -1.06
CTXN3-201ENST00000379445 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa8.42□□□□□ -1.06
CTXN3-201ENST00000379445 LBX2Q6XYB7 198 aa8.42□□□□□ -1.06
CTXN3-201ENST00000379445 GPR142Q7Z601 462 aa8.42□□□□□ -1.06
CTXN3-201ENST00000379445 LCORLQ8N3X6 602 aa8.42□□□□□ -1.06
CTXN3-201ENST00000379445 SDR42E1Q8WUS8 393 aa8.42□□□□□ -1.06
CTXN3-201ENST00000379445 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa8.42□□□□□ -1.06
CTXN3-201ENST00000379445 FEZ1Q99689 392 aa8.42□□□□□ -1.06
CTXN3-201ENST00000379445 NUDT12Q9BQG2 462 aa8.42□□□□□ -1.06
CTXN3-201ENST00000379445 PAGR1Q9BTK6 254 aa8.42□□□□□ -1.06
CTXN3-201ENST00000379445 CRNKL1Q9BZJ0 848 aaKnown RBP8.42□□□□□ -1.06
CTXN3-201ENST00000379445 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP8.42□□□□□ -1.06
CTXN3-201ENST00000379445 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP8.42□□□□□ -1.06
CTXN3-201ENST00000379445 GNEQ9Y223 722 aaKnown RBP8.42□□□□□ -1.06
CTXN3-201ENST00000379445 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa8.42□□□□□ -1.06
CTXN3-201ENST00000379445 NR2E3Q9Y5X4 410 aa8.42□□□□□ -1.06
CTXN3-201ENST00000379445 DOCK3Q8IZD9 2030 aa8.42□□□□□ -1.06
CTXN3-201ENST00000379445 A0A1W2PRG0 241 aa8.41□□□□□ -1.06
CTXN3-201ENST00000379445 ANKRD62A6NC57 917 aa8.41□□□□□ -1.06
CTXN3-201ENST00000379445 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP8.41□□□□□ -1.06
CTXN3-201ENST00000379445 COL9A1P20849 921 aa8.41□□□□□ -1.06
CTXN3-201ENST00000379445 ADD2P35612 726 aa8.41□□□□□ -1.06
CTXN3-201ENST00000379445 SEPT2Q15019 361 aa8.41□□□□□ -1.06
CTXN3-201ENST00000379445 SLFNL1Q499Z3 407 aa8.41□□□□□ -1.06
CTXN3-201ENST00000379445 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa8.41□□□□□ -1.06
CTXN3-201ENST00000379445 NECAB2Q7Z6G3 386 aa8.41□□□□□ -1.06
CTXN3-201ENST00000379445 GIPC2Q8TF65 315 aa8.41□□□□□ -1.06
CTXN3-201ENST00000379445 APBA2Q99767 749 aa8.41□□□□□ -1.06
CTXN3-201ENST00000379445 NPDC1Q9NQX5 325 aaPredicted RBP8.41□□□□□ -1.06
CTXN3-201ENST00000379445 MCM9Q9NXL9 1143 aa8.41□□□□□ -1.06
CTXN3-201ENST00000379445 RCAN3Q9UKA8 241 aa8.41□□□□□ -1.06
CTXN3-201ENST00000379445 OGDHLQ9ULD0 1010 aa8.41□□□□□ -1.06
CTXN3-201ENST00000379445 CHGBP05060 677 aa8.4□□□□□ -1.06
CTXN3-201ENST00000379445 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.06
CTXN3-201ENST00000379445 CYP2D6P10635 497 aa8.4□□□□□ -1.06
CTXN3-201ENST00000379445 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.06
CTXN3-201ENST00000379445 ATP5JP18859 108 aa8.4□□□□□ -1.06
CTXN3-201ENST00000379445 ERCC3P19447 782 aa8.4□□□□□ -1.06
CTXN3-201ENST00000379445 RGS2P41220 211 aa8.4□□□□□ -1.06
CTXN3-201ENST00000379445 PDE3AQ14432 1141 aa8.4□□□□□ -1.06
CTXN3-201ENST00000379445 CCL14Q16627 93 aa8.4□□□□□ -1.06
CTXN3-201ENST00000379445 C20orf194Q5TEA3 1177 aa8.4□□□□□ -1.06
CTXN3-201ENST00000379445 TYW1BQ6NUM6 668 aa8.4□□□□□ -1.06
CTXN3-201ENST00000379445 PLEKHH3Q7Z736 793 aa8.4□□□□□ -1.06
CTXN3-201ENST00000379445 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.06
CTXN3-201ENST00000379445 SLC44A5Q8NCS7 719 aa8.4□□□□□ -1.06
CTXN3-201ENST00000379445 ADAMTS19Q8TE59 1207 aa8.4□□□□□ -1.06
CTXN3-201ENST00000379445 HAUS7Q99871 368 aa8.4□□□□□ -1.06
CTXN3-201ENST00000379445 BOLA2Q9H3K6 86 aa8.4□□□□□ -1.06
CTXN3-201ENST00000379445 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.06
CTXN3-201ENST00000379445 ARMT1Q9H993 441 aa8.4□□□□□ -1.06
CTXN3-201ENST00000379445 CABP5Q9NP86 173 aa8.4□□□□□ -1.06
CTXN3-201ENST00000379445 PAG1Q9NWQ8 432 aa8.4□□□□□ -1.06
CTXN3-201ENST00000379445 BTBD7Q9P203 1132 aa8.4□□□□□ -1.06
CTXN3-201ENST00000379445 RABGEF1Q9UJ41 708 aa8.4□□□□□ -1.06
CTXN3-201ENST00000379445 NAV1Q8NEY1 1877 aa8.4□□□□□ -1.06
CTXN3-201ENST00000379445 MYH1P12882 1939 aa8.4□□□□□ -1.06
CTXN3-201ENST00000379445 PRKAB2O43741 272 aa8.4□□□□□ -1.07
CTXN3-201ENST00000379445 KDM4AO75164 1064 aa8.4□□□□□ -1.07
CTXN3-201ENST00000379445 MBD4O95243 580 aa8.4□□□□□ -1.07
CTXN3-201ENST00000379445 CACNB2Q08289 660 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.07
CTXN3-201ENST00000379445 CDHR5Q9HBB8 845 aa8.4□□□□□ -1.07
CTXN3-201ENST00000379445 PFASO15067 1338 aa8.39□□□□□ -1.07
CTXN3-201ENST00000379445 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
CTXN3-201ENST00000379445 SMIM22K7EJ46 135 aa8.39□□□□□ -1.07
CTXN3-201ENST00000379445 IGHA2P01877 340 aa8.39□□□□□ -1.07
CTXN3-201ENST00000379445 HOXC6P09630 235 aa8.39□□□□□ -1.07
CTXN3-201ENST00000379445 COL6A1P12109 1028 aa8.39□□□□□ -1.07
CTXN3-201ENST00000379445 CCND3P30281 292 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
CTXN3-201ENST00000379445 CCNA1P78396 465 aa8.39□□□□□ -1.07
CTXN3-201ENST00000379445 GRB14Q14449 540 aa8.39□□□□□ -1.07
CTXN3-201ENST00000379445 UBE3CQ15386 1083 aa8.39□□□□□ -1.07
CTXN3-201ENST00000379445 PROX2Q3B8N5 592 aa8.39□□□□□ -1.07
CTXN3-201ENST00000379445 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa8.39□□□□□ -1.07
CTXN3-201ENST00000379445 TMEM179Q6ZVK1 233 aa8.39□□□□□ -1.07
CTXN3-201ENST00000379445 CLEC10AQ8IUN9 316 aa8.39□□□□□ -1.07
CTXN3-201ENST00000379445 SIAH1Q8IUQ4 282 aa8.39□□□□□ -1.07
CTXN3-201ENST00000379445 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
CTXN3-201ENST00000379445 DYNLL2Q96FJ2 89 aa8.39□□□□□ -1.07
CTXN3-201ENST00000379445 EPAS1Q99814 870 aa8.39□□□□□ -1.07
CTXN3-201ENST00000379445 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
CTXN3-201ENST00000379445 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa8.39□□□□□ -1.07
CTXN3-201ENST00000379445 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
CTXN3-201ENST00000379445 FLRT1Q9NZU1 646 aa8.39□□□□□ -1.07
CTXN3-201ENST00000379445 SWAP70Q9UH65 585 aa8.39□□□□□ -1.07
CTXN3-201ENST00000379445 A0A1W2PPC1 479 aa8.38□□□□□ -1.07
CTXN3-201ENST00000379445 SLC15A5A6NIM6 579 aa8.38□□□□□ -1.07
CTXN3-201ENST00000379445 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
CTXN3-201ENST00000379445 AKR1B1P15121 316 aa8.38□□□□□ -1.07
CTXN3-201ENST00000379445 C12orf60Q5U649 245 aa8.38□□□□□ -1.07
CTXN3-201ENST00000379445 UBXN4Q92575 508 aa8.38□□□□□ -1.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 58.6 ms