RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000372466.8

NUP62CL-201, Transcript of nucleoporin 62 C-terminal like, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene NUP62CL, Length 1,755 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP62CL-201ENST00000372466 ZMYND12Q9H0C1 365 aa15.81■□□□□ 0.12
NUP62CL-201ENST00000372466 MAN1B1Q9UKM7 699 aa15.81■□□□□ 0.12
NUP62CL-201ENST00000372466 DDTLA6NHG4 134 aaPredicted RBP15.8■□□□□ 0.12
NUP62CL-201ENST00000372466 FAM196BA6NMK8 535 aa15.8■□□□□ 0.12
NUP62CL-201ENST00000372466 SMTNL1A8MU46 457 aa15.8■□□□□ 0.12
NUP62CL-201ENST00000372466 IKBKBO14920 756 aa15.8■□□□□ 0.12
NUP62CL-201ENST00000372466 OFD1O75665 1012 aa15.8■□□□□ 0.12
NUP62CL-201ENST00000372466 INF2Q27J81 1249 aa15.8■□□□□ 0.12
NUP62CL-201ENST00000372466 CCDC144BQ3MJ40 725 aa15.8■□□□□ 0.12
NUP62CL-201ENST00000372466 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa15.8■□□□□ 0.12
NUP62CL-201ENST00000372466 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP15.8■□□□□ 0.12
NUP62CL-201ENST00000372466 RIOX1Q9H6W3 641 aa15.8■□□□□ 0.12
NUP62CL-201ENST00000372466 GPCPD1Q9NPB8 672 aa15.8■□□□□ 0.12
NUP62CL-201ENST00000372466 SARSP49591 514 aaKnown RBP15.8■□□□□ 0.12
NUP62CL-201ENST00000372466 C17orf53Q8N3J3 647 aaPredicted RBP15.8■□□□□ 0.12
NUP62CL-201ENST00000372466 SMARCE1Q969G3 411 aa15.8■□□□□ 0.12
NUP62CL-201ENST00000372466 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP15.8■□□□□ 0.12
NUP62CL-201ENST00000372466 PYCARDQ9ULZ3 195 aa15.8■□□□□ 0.12
NUP62CL-201ENST00000372466 SMCO2A6NFE2 343 aa15.79■□□□□ 0.12
NUP62CL-201ENST00000372466 SLFN14P0C7P3 912 aa15.79■□□□□ 0.12
NUP62CL-201ENST00000372466 BAG6P46379 1132 aa15.79■□□□□ 0.12
NUP62CL-201ENST00000372466 TPM4P67936 248 aa15.79■□□□□ 0.12
NUP62CL-201ENST00000372466 ATP2B2Q01814 1243 aa15.79■□□□□ 0.12
NUP62CL-201ENST00000372466 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP15.79■□□□□ 0.12
NUP62CL-201ENST00000372466 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP15.79■□□□□ 0.12
NUP62CL-201ENST00000372466 ARL6IP4Q66PJ3 421 aaKnown RBP15.79■□□□□ 0.12
NUP62CL-201ENST00000372466 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP15.79■□□□□ 0.12
NUP62CL-201ENST00000372466 TTLL6Q8N841 843 aa15.79■□□□□ 0.12
NUP62CL-201ENST00000372466 HSD3B7Q9H2F3 369 aa15.79■□□□□ 0.12
NUP62CL-201ENST00000372466 C6orf50Q9HD87 102 aa15.79■□□□□ 0.12
NUP62CL-201ENST00000372466 KIF13BQ9NQT8 1826 aa15.79■□□□□ 0.12
NUP62CL-201ENST00000372466 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa15.78■□□□□ 0.12
NUP62CL-201ENST00000372466 AFMP43652 599 aa15.78■□□□□ 0.12
NUP62CL-201ENST00000372466 MYL5Q02045 173 aa15.78■□□□□ 0.12
NUP62CL-201ENST00000372466 ZNF543Q08ER8 600 aa15.78■□□□□ 0.12
NUP62CL-201ENST00000372466 MORC3Q14149 939 aa15.78■□□□□ 0.12
NUP62CL-201ENST00000372466 CFAP100Q494V2 611 aa15.78■□□□□ 0.12
NUP62CL-201ENST00000372466 SOGA3Q5TF21 947 aa15.78■□□□□ 0.12
NUP62CL-201ENST00000372466 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP15.78■□□□□ 0.12
NUP62CL-201ENST00000372466 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa15.78■□□□□ 0.12
NUP62CL-201ENST00000372466 SPATA20Q8TB22 786 aa15.78■□□□□ 0.12
NUP62CL-201ENST00000372466 PAGE5Q96GU1 130 aa15.78■□□□□ 0.12
NUP62CL-201ENST00000372466 CCDC17Q96LX7 622 aa15.78■□□□□ 0.12
NUP62CL-201ENST00000372466 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP15.78■□□□□ 0.12
NUP62CL-201ENST00000372466 PI4KBQ9UBF8 816 aa15.78■□□□□ 0.12
NUP62CL-201ENST00000372466 COL4A5P29400 1685 aa15.78■□□□□ 0.12
NUP62CL-201ENST00000372466 NPM3O75607 178 aaKnown RBP15.77■□□□□ 0.12
NUP62CL-201ENST00000372466 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP15.77■□□□□ 0.12
NUP62CL-201ENST00000372466 GNA11P29992 359 aa15.77■□□□□ 0.12
NUP62CL-201ENST00000372466 LRMPQ12912 555 aa15.77■□□□□ 0.12
NUP62CL-201ENST00000372466 E2F4Q16254 413 aa15.77■□□□□ 0.12
NUP62CL-201ENST00000372466 CCDC93Q567U6 631 aa15.77■□□□□ 0.12
NUP62CL-201ENST00000372466 TMEM60Q9H2L4 133 aa15.77■□□□□ 0.12
NUP62CL-201ENST00000372466 CASP1P29466 404 aa15.77■□□□□ 0.11
NUP62CL-201ENST00000372466 LONP1P36776 959 aaKnown RBP15.77■□□□□ 0.11
NUP62CL-201ENST00000372466 TTBK2Q6IQ55 1244 aa15.77■□□□□ 0.11
NUP62CL-201ENST00000372466 KRT25Q7Z3Z0 450 aa15.77■□□□□ 0.11
NUP62CL-201ENST00000372466 TRIML1Q8N9V2 468 aa15.77■□□□□ 0.11
NUP62CL-201ENST00000372466 KIAA1524Q8TCG1 905 aa15.77■□□□□ 0.11
NUP62CL-201ENST00000372466 CCDC34Q96HJ3 373 aa15.77■□□□□ 0.11
NUP62CL-201ENST00000372466 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP15.77■□□□□ 0.11
NUP62CL-201ENST00000372466 TRIM34Q9BYJ4 488 aa15.77■□□□□ 0.11
NUP62CL-201ENST00000372466 XPO4Q9C0E2 1151 aaKnown RBP15.77■□□□□ 0.11
NUP62CL-201ENST00000372466 IFNKQ9P0W0 207 aa15.77■□□□□ 0.11
NUP62CL-201ENST00000372466 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP15.76■□□□□ 0.11
NUP62CL-201ENST00000372466 ESYT2A0FGR8 921 aa15.76■□□□□ 0.11
NUP62CL-201ENST00000372466 hCG_1984214I3L0E3 225 aa15.76■□□□□ 0.11
NUP62CL-201ENST00000372466 SMC2O95347 1197 aa15.76■□□□□ 0.11
NUP62CL-201ENST00000372466 ATP1A3P13637 1013 aa15.76■□□□□ 0.11
NUP62CL-201ENST00000372466 DPEP1P16444 411 aa15.76■□□□□ 0.11
NUP62CL-201ENST00000372466 KCNA3P22001 575 aa15.76■□□□□ 0.11
NUP62CL-201ENST00000372466 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP15.76■□□□□ 0.11
NUP62CL-201ENST00000372466 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP15.76■□□□□ 0.11
NUP62CL-201ENST00000372466 CCDC96Q2M329 555 aa15.76■□□□□ 0.11
NUP62CL-201ENST00000372466 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP15.76■□□□□ 0.11
NUP62CL-201ENST00000372466 ADGRF4Q8IZF3 695 aa15.76■□□□□ 0.11
NUP62CL-201ENST00000372466 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP15.76■□□□□ 0.11
NUP62CL-201ENST00000372466 CACTINQ8WUQ7 758 aaKnown RBP15.76■□□□□ 0.11
NUP62CL-201ENST00000372466 COA7Q96BR5 231 aa15.76■□□□□ 0.11
NUP62CL-201ENST00000372466 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP15.76■□□□□ 0.11
NUP62CL-201ENST00000372466 JMJD4Q9H9V9 463 aa15.76■□□□□ 0.11
NUP62CL-201ENST00000372466 DPYDQ12882 1025 aa15.75■□□□□ 0.11
NUP62CL-201ENST00000372466 GRIPAP1Q4V328 841 aa15.75■□□□□ 0.11
NUP62CL-201ENST00000372466 TATDN1Q6P1N9 297 aa15.75■□□□□ 0.11
NUP62CL-201ENST00000372466 DTHD1Q6ZMT9 781 aa15.75■□□□□ 0.11
NUP62CL-201ENST00000372466 KCTD1Q719H9 257 aa15.75■□□□□ 0.11
NUP62CL-201ENST00000372466 RTKN2Q8IZC4 609 aa15.75■□□□□ 0.11
NUP62CL-201ENST00000372466 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP15.75■□□□□ 0.11
NUP62CL-201ENST00000372466 IQUBQ8NA54 791 aa15.75■□□□□ 0.11
NUP62CL-201ENST00000372466 MLKLQ8NB16 471 aa15.75■□□□□ 0.11
NUP62CL-201ENST00000372466 PSMD1Q99460 953 aa15.75■□□□□ 0.11
NUP62CL-201ENST00000372466 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP15.75■□□□□ 0.11
NUP62CL-201ENST00000372466 TMEM260Q9NX78 707 aa15.75■□□□□ 0.11
NUP62CL-201ENST00000372466 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP15.75■□□□□ 0.11
NUP62CL-201ENST00000372466 ATRNL1Q5VV63 1379 aa15.75■□□□□ 0.11
NUP62CL-201ENST00000372466 EEF2P13639 858 aaKnown RBP15.75■□□□□ 0.11
NUP62CL-201ENST00000372466 CDC25AP30304 524 aa15.75■□□□□ 0.11
NUP62CL-201ENST00000372466 SLC16A2P36021 539 aa15.75■□□□□ 0.11
NUP62CL-201ENST00000372466 FANCCQ00597 558 aa15.75■□□□□ 0.11
NUP62CL-201ENST00000372466 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.9 ms