RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000296642.4

PGGT1B-201, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene PGGT1B, Length 552 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-201ENST00000296642 SHMT1P34896 483 aa9.52□□□□□ -0.89
PGGT1B-201ENST00000296642 DYNLL1P63167 89 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
PGGT1B-201ENST00000296642 ICA1Q05084 483 aa9.52□□□□□ -0.89
PGGT1B-201ENST00000296642 ADGRE1Q14246 886 aa9.52□□□□□ -0.89
PGGT1B-201ENST00000296642 ZNF792Q3KQV3 632 aa9.52□□□□□ -0.89
PGGT1B-201ENST00000296642 TNNI3KQ59H18 835 aa9.52□□□□□ -0.89
PGGT1B-201ENST00000296642 GNASQ5JWF2 1037 aa9.52□□□□□ -0.89
PGGT1B-201ENST00000296642 MAGEB6Q8N7X4 407 aa9.52□□□□□ -0.89
PGGT1B-201ENST00000296642 MIGA1Q8NAN2 632 aa9.52□□□□□ -0.89
PGGT1B-201ENST00000296642 KLHDC9Q8NEP7 349 aa9.52□□□□□ -0.89
PGGT1B-201ENST00000296642 ARHGAP45Q92619 1136 aa9.52□□□□□ -0.89
PGGT1B-201ENST00000296642 ATG4CQ96DT6 458 aa9.52□□□□□ -0.89
PGGT1B-201ENST00000296642 CCDC17Q96LX7 622 aa9.52□□□□□ -0.89
PGGT1B-201ENST00000296642 ABHD16BQ9H3Z7 469 aa9.52□□□□□ -0.89
PGGT1B-201ENST00000296642 VCPKMTQ9H867 229 aa9.52□□□□□ -0.89
PGGT1B-201ENST00000296642 MCM9Q9NXL9 1143 aa9.52□□□□□ -0.89
PGGT1B-201ENST00000296642 PLXNA1Q9UIW2 1896 aa9.52□□□□□ -0.89
PGGT1B-201ENST00000296642 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa9.52□□□□□ -0.89
PGGT1B-201ENST00000296642 CDH23Q9H251 3354 aa9.52□□□□□ -0.89
PGGT1B-201ENST00000296642 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa9.51□□□□□ -0.89
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PGGT1B-201ENST00000296642 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
PGGT1B-201ENST00000296642 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa9.51□□□□□ -0.89
PGGT1B-201ENST00000296642 TMEM67Q5HYA8 995 aa9.51□□□□□ -0.89
PGGT1B-201ENST00000296642 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
PGGT1B-201ENST00000296642 ADGRA1Q86SQ6 560 aa9.51□□□□□ -0.89
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PGGT1B-201ENST00000296642 HIPK3Q9H422 1215 aa9.51□□□□□ -0.89
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PGGT1B-201ENST00000296642 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa9.51□□□□□ -0.89
PGGT1B-201ENST00000296642 EYSQ5T1H1 3165 aa9.51□□□□□ -0.89
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PGGT1B-201ENST00000296642 SUPT20HL2P0C7V6 817 aa9.5□□□□□ -0.89
PGGT1B-201ENST00000296642 C7P10643 843 aa9.5□□□□□ -0.89
PGGT1B-201ENST00000296642 ATP2A2P16615 1042 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
PGGT1B-201ENST00000296642 POU3F3P20264 500 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
PGGT1B-201ENST00000296642 CDK7P50613 346 aa9.5□□□□□ -0.89
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PGGT1B-201ENST00000296642 TMEM132BQ14DG7 1078 aa9.5□□□□□ -0.89
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PGGT1B-201ENST00000296642 C16orf59Q7L2K0 433 aa9.5□□□□□ -0.89
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PGGT1B-201ENST00000296642 NECAB3Q96P71 396 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
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PGGT1B-201ENST00000296642 ANKRD35Q8N283 1001 aa9.49□□□□□ -0.89
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PGGT1B-201ENST00000296642 KCNH6Q9H252 994 aa9.49□□□□□ -0.89
PGGT1B-201ENST00000296642 EPHX3Q9H6B9 360 aa9.49□□□□□ -0.89
PGGT1B-201ENST00000296642 KANSL2Q9H9L4 492 aa9.49□□□□□ -0.89
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PGGT1B-201ENST00000296642 PRR33A8MZF0 331 aa9.48□□□□□ -0.89
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PGGT1B-201ENST00000296642 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
PGGT1B-201ENST00000296642 CYP2C18P33260 490 aa9.48□□□□□ -0.89
PGGT1B-201ENST00000296642 GUCY1A2P33402 732 aa9.48□□□□□ -0.89
PGGT1B-201ENST00000296642 TFF2Q03403 129 aa9.48□□□□□ -0.89
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PGGT1B-201ENST00000296642 UPF3AQ9H1J1 476 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
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PGGT1B-201ENST00000296642 TCF20Q9UGU0 1960 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
PGGT1B-201ENST00000296642 ASB14A6NK59 587 aa9.47□□□□□ -0.89
PGGT1B-201ENST00000296642 CD4P01730 458 aa9.47□□□□□ -0.89
PGGT1B-201ENST00000296642 ITGA7Q13683 1181 aa9.47□□□□□ -0.89
PGGT1B-201ENST00000296642 CCDC144BQ3MJ40 725 aa9.47□□□□□ -0.89
PGGT1B-201ENST00000296642 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
PGGT1B-201ENST00000296642 ERC1Q8IUD2 1116 aa9.47□□□□□ -0.89
PGGT1B-201ENST00000296642 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
PGGT1B-201ENST00000296642 CHST13Q8NET6 341 aa9.47□□□□□ -0.89
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