RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000296026.4

CXCL3-201, Transcript of C-X-C motif chemokine ligand 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CXCL3, Length 1,075 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL3-201ENST00000296026 MX1P20591 662 aa23.36■■□□□ 1.33
CXCL3-201ENST00000296026 PDE4BQ07343 736 aa23.36■■□□□ 1.33
CXCL3-201ENST00000296026 SNX17Q15036 470 aa23.36■■□□□ 1.33
CXCL3-201ENST00000296026 TRIM60Q495X7 471 aa23.36■■□□□ 1.33
CXCL3-201ENST00000296026 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP23.36■■□□□ 1.33
CXCL3-201ENST00000296026 KIFC2Q96AC6 838 aa23.36■■□□□ 1.33
CXCL3-201ENST00000296026 DDX11Q96FC9 970 aa23.36■■□□□ 1.33
CXCL3-201ENST00000296026 NAPBQ9H115 298 aa23.36■■□□□ 1.33
CXCL3-201ENST00000296026 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa23.36■■□□□ 1.33
CXCL3-201ENST00000296026 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP23.36■■□□□ 1.33
CXCL3-201ENST00000296026 SMCHD1A6NHR9 2005 aa23.36■■□□□ 1.33
CXCL3-201ENST00000296026 ATP2A1O14983 1001 aa23.35■■□□□ 1.33
CXCL3-201ENST00000296026 ZNF865P0CJ78 1059 aaPredicted RBP23.35■■□□□ 1.33
CXCL3-201ENST00000296026 TSPY3P0CV98 308 aa23.35■■□□□ 1.33
CXCL3-201ENST00000296026 TSPY8P0CW00 308 aa23.35■■□□□ 1.33
CXCL3-201ENST00000296026 PPARAQ07869 468 aa23.35■■□□□ 1.33
CXCL3-201ENST00000296026 NEDD1Q8NHV4 660 aa23.35■■□□□ 1.33
CXCL3-201ENST00000296026 CNPY2Q9Y2B0 182 aa23.35■■□□□ 1.33
CXCL3-201ENST00000296026 LTBP2Q14767 1821 aa23.35■■□□□ 1.33
CXCL3-201ENST00000296026 LAMA3Q16787 3333 aa23.34■■□□□ 1.33
CXCL3-201ENST00000296026 PGK1P00558 417 aa23.34■■□□□ 1.33
CXCL3-201ENST00000296026 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP23.34■■□□□ 1.33
CXCL3-201ENST00000296026 AKR1A1P14550 325 aa23.34■■□□□ 1.33
CXCL3-201ENST00000296026 GMCL1P1Q8NEA9 526 aa23.34■■□□□ 1.33
CXCL3-201ENST00000296026 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa23.34■■□□□ 1.33
CXCL3-201ENST00000296026 RAVER2Q9HCJ3 691 aaKnown RBP23.34■■□□□ 1.33
CXCL3-201ENST00000296026 PRDM5Q9NQX1 630 aaPredicted RBP23.34■■□□□ 1.33
CXCL3-201ENST00000296026 FEM1BQ9UK73 627 aa23.34■■□□□ 1.33
CXCL3-201ENST00000296026 PHF24Q9UPV7 400 aa23.34■■□□□ 1.33
CXCL3-201ENST00000296026 PLIN4Q96Q06 1357 aa23.34■■□□□ 1.33
CXCL3-201ENST00000296026 DNAJC25-GNG10A0A024R161 153 aa23.33■■□□□ 1.33
CXCL3-201ENST00000296026 RRP1P56182 461 aaKnown RBP23.33■■□□□ 1.33
CXCL3-201ENST00000296026 TFAP4Q01664 338 aa23.33■■□□□ 1.33
CXCL3-201ENST00000296026 C1orf53Q5VUE5 145 aa23.33■■□□□ 1.33
CXCL3-201ENST00000296026 SLFN13Q68D06 897 aa23.33■■□□□ 1.33
CXCL3-201ENST00000296026 RNF180Q86T96 592 aa23.33■■□□□ 1.33
CXCL3-201ENST00000296026 MSL3Q8N5Y2 521 aaKnown RBP23.33■■□□□ 1.33
CXCL3-201ENST00000296026 DNAH12Q6ZR08 3092 aa23.33■■□□□ 1.32
CXCL3-201ENST00000296026 BMP3P12645 472 aa23.32■■□□□ 1.32
CXCL3-201ENST00000296026 SLC17A8Q8NDX2 589 aa23.32■■□□□ 1.32
CXCL3-201ENST00000296026 LENG1Q96BZ8 264 aaPredicted RBP23.32■■□□□ 1.32
CXCL3-201ENST00000296026 PDLIM7Q9NR12 457 aa23.32■■□□□ 1.32
CXCL3-201ENST00000296026 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP23.32■■□□□ 1.32
CXCL3-201ENST00000296026 SYNGAP1Q96PV0 1343 aa23.32■■□□□ 1.32
CXCL3-201ENST00000296026 SALL3Q9BXA9 1300 aa23.32■■□□□ 1.32
CXCL3-201ENST00000296026 SNAI1O95863 264 aaPredicted RBP23.31■■□□□ 1.32
CXCL3-201ENST00000296026 MAMDC4Q6UXC1 1216 aa23.31■■□□□ 1.32
CXCL3-201ENST00000296026 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa23.31■■□□□ 1.32
CXCL3-201ENST00000296026 MTMR10Q9NXD2 777 aa23.31■■□□□ 1.32
CXCL3-201ENST00000296026 OAZ1P54368 228 aa23.3■■□□□ 1.32
CXCL3-201ENST00000296026 TLE2Q04725 743 aa23.3■■□□□ 1.32
CXCL3-201ENST00000296026 ANKRD45Q5TZF3 282 aa23.3■■□□□ 1.32
CXCL3-201ENST00000296026 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP23.3■■□□□ 1.32
CXCL3-201ENST00000296026 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa23.3■■□□□ 1.32
CXCL3-201ENST00000296026 ANKRD35Q8N283 1001 aa23.3■■□□□ 1.32
CXCL3-201ENST00000296026 BADQ92934 168 aa23.3■■□□□ 1.32
CXCL3-201ENST00000296026 FBXO40Q9UH90 709 aa23.3■■□□□ 1.32
CXCL3-201ENST00000296026 ZHX1Q9UKY1 873 aaPredicted RBP23.3■■□□□ 1.32
CXCL3-201ENST00000296026 FAM184BQ9ULE4 1060 aa23.3■■□□□ 1.32
CXCL3-201ENST00000296026 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP23.3■■□□□ 1.32
CXCL3-201ENST00000296026 A0A1W2PQ45 241 aaPredicted RBP23.29■■□□□ 1.32
CXCL3-201ENST00000296026 A0A1W2PQY0 241 aa23.29■■□□□ 1.32
CXCL3-201ENST00000296026 TMEM232C9JQI7 657 aa23.29■■□□□ 1.32
CXCL3-201ENST00000296026 FOXP2O15409 715 aa23.29■■□□□ 1.32
CXCL3-201ENST00000296026 ADAMTS4O75173 837 aa23.29■■□□□ 1.32
CXCL3-201ENST00000296026 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP23.29■■□□□ 1.32
CXCL3-201ENST00000296026 CHST13Q8NET6 341 aa23.29■■□□□ 1.32
CXCL3-201ENST00000296026 CRBNQ96SW2 442 aa23.29■■□□□ 1.32
CXCL3-201ENST00000296026 TRIM43BA6NCK2 446 aa23.28■■□□□ 1.32
CXCL3-201ENST00000296026 FDX1P10109 184 aa23.28■■□□□ 1.32
CXCL3-201ENST00000296026 STAT2P52630 851 aa23.28■■□□□ 1.32
CXCL3-201ENST00000296026 CTDSPL2Q05D32 466 aa23.28■■□□□ 1.32
CXCL3-201ENST00000296026 TRIM43Q96BQ3 446 aaPredicted RBP23.28■■□□□ 1.32
CXCL3-201ENST00000296026 CHMP4CQ96CF2 233 aa23.28■■□□□ 1.32
CXCL3-201ENST00000296026 INCENPQ9NQS7 918 aa23.28■■□□□ 1.32
CXCL3-201ENST00000296026 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP23.28■■□□□ 1.32
CXCL3-201ENST00000296026 SYNRGQ9UMZ2 1314 aa23.28■■□□□ 1.32
CXCL3-201ENST00000296026 TSPY2A6NKD2 308 aa23.27■■□□□ 1.32
CXCL3-201ENST00000296026 SLC1A4P43007 532 aa23.27■■□□□ 1.32
CXCL3-201ENST00000296026 SHHQ15465 462 aa23.27■■□□□ 1.32
CXCL3-201ENST00000296026 CHURC1Q8WUH1 139 aa23.27■■□□□ 1.32
CXCL3-201ENST00000296026 EVI5LQ96CN4 794 aa23.27■■□□□ 1.32
CXCL3-201ENST00000296026 GMCL1Q96IK5 515 aa23.27■■□□□ 1.32
CXCL3-201ENST00000296026 FGD4Q96M96 766 aa23.27■■□□□ 1.32
CXCL3-201ENST00000296026 TSEN34Q9BSV6 310 aaKnown RBP23.27■■□□□ 1.32
CXCL3-201ENST00000296026 HOMER2Q9NSB8 354 aa23.27■■□□□ 1.32
CXCL3-201ENST00000296026 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP23.27■■□□□ 1.32
CXCL3-201ENST00000296026 STX8Q9UNK0 236 aa23.27■■□□□ 1.32
CXCL3-201ENST00000296026 STXBP5LQ9Y2K9 1186 aa23.27■■□□□ 1.32
CXCL3-201ENST00000296026 TACC3Q9Y6A5 838 aa23.27■■□□□ 1.32
CXCL3-201ENST00000296026 POTEB2H3BUK9 544 aa23.26■■□□□ 1.31
CXCL3-201ENST00000296026 MCCP23508 829 aa23.26■■□□□ 1.31
CXCL3-201ENST00000296026 ACLYP53396 1101 aa23.26■■□□□ 1.31
CXCL3-201ENST00000296026 IKQ13123 557 aaPredicted RBP23.26■■□□□ 1.31
CXCL3-201ENST00000296026 ACVR2BQ13705 512 aa23.26■■□□□ 1.31
CXCL3-201ENST00000296026 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa23.26■■□□□ 1.31
CXCL3-201ENST00000296026 C9orf50Q5SZB4 431 aa23.26■■□□□ 1.31
CXCL3-201ENST00000296026 VPS53Q5VIR6 699 aa23.26■■□□□ 1.31
CXCL3-201ENST00000296026 FAM160B2Q86V87 743 aa23.26■■□□□ 1.31
CXCL3-201ENST00000296026 STAG1Q8WVM7 1258 aa23.26■■□□□ 1.31
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