RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000262067.4

TSPAN13-201, Transcript of tetraspanin 13, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TSPAN13, Length 2,093 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN13-201ENST00000262067 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP27.39■■□□□ 1.97
TSPAN13-201ENST00000262067 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP27.39■■□□□ 1.97
TSPAN13-201ENST00000262067 A0A087X0B3 334 aa27.38■■□□□ 1.97
TSPAN13-201ENST00000262067 SMCO2A6NFE2 343 aa27.38■■□□□ 1.97
TSPAN13-201ENST00000262067 ZNF543Q08ER8 600 aa27.38■■□□□ 1.97
TSPAN13-201ENST00000262067 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP27.38■■□□□ 1.97
TSPAN13-201ENST00000262067 SARM1Q6SZW1 724 aa27.38■■□□□ 1.97
TSPAN13-201ENST00000262067 C4orf32Q8N8J7 132 aa27.38■■□□□ 1.97
TSPAN13-201ENST00000262067 HOOK1Q9UJC3 728 aaKnown RBP27.38■■□□□ 1.97
TSPAN13-201ENST00000262067 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP27.38■■□□□ 1.97
TSPAN13-201ENST00000262067 PSMD14O00487 310 aa27.37■■□□□ 1.97
TSPAN13-201ENST00000262067 POSTNQ15063 836 aa27.37■■□□□ 1.97
TSPAN13-201ENST00000262067 IL17AQ16552 155 aa27.37■■□□□ 1.97
TSPAN13-201ENST00000262067 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP27.37■■□□□ 1.97
TSPAN13-201ENST00000262067 INF2Q27J81 1249 aa27.37■■□□□ 1.97
TSPAN13-201ENST00000262067 TATDN1Q6P1N9 297 aa27.37■■□□□ 1.97
TSPAN13-201ENST00000262067 TRIM34Q9BYJ4 488 aa27.37■■□□□ 1.97
TSPAN13-201ENST00000262067 C6orf50Q9HD87 102 aa27.37■■□□□ 1.97
TSPAN13-201ENST00000262067 COL4A5P29400 1685 aa27.37■■□□□ 1.97
TSPAN13-201ENST00000262067 ENTPD3O75355 529 aa27.36■■□□□ 1.97
TSPAN13-201ENST00000262067 VIL1P09327 827 aaKnown RBP27.36■■□□□ 1.97
TSPAN13-201ENST00000262067 PRR29P0C7W0 189 aa27.36■■□□□ 1.97
TSPAN13-201ENST00000262067 GRAMD1CQ8IYS0 662 aa27.36■■□□□ 1.97
TSPAN13-201ENST00000262067 ZBTB7AO95365 584 aa27.36■■□□□ 1.97
TSPAN13-201ENST00000262067 DHX58Q96C10 678 aa27.36■■□□□ 1.97
TSPAN13-201ENST00000262067 GMLQ99445 158 aa27.36■■□□□ 1.97
TSPAN13-201ENST00000262067 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP27.36■■□□□ 1.97
TSPAN13-201ENST00000262067 GNA11P29992 359 aa27.35■■□□□ 1.97
TSPAN13-201ENST00000262067 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa27.35■■□□□ 1.97
TSPAN13-201ENST00000262067 SOGA3Q5TF21 947 aa27.35■■□□□ 1.97
TSPAN13-201ENST00000262067 TTBK2Q6IQ55 1244 aa27.35■■□□□ 1.97
TSPAN13-201ENST00000262067 KANK3Q6NY19 840 aa27.35■■□□□ 1.97
TSPAN13-201ENST00000262067 ATRNL1Q5VV63 1379 aa27.34■■□□□ 1.97
TSPAN13-201ENST00000262067 EEF2P13639 858 aaKnown RBP27.34■■□□□ 1.97
TSPAN13-201ENST00000262067 ARL6IP4Q66PJ3 421 aaKnown RBP27.34■■□□□ 1.97
TSPAN13-201ENST00000262067 ARHGAP30Q7Z6I6 1101 aaPredicted RBP27.34■■□□□ 1.97
TSPAN13-201ENST00000262067 JMJD4Q9H9V9 463 aa27.34■■□□□ 1.97
TSPAN13-201ENST00000262067 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP27.34■■□□□ 1.97
TSPAN13-201ENST00000262067 ZNF500O60304 480 aaPredicted RBP27.33■■□□□ 1.97
TSPAN13-201ENST00000262067 ADGRF4Q8IZF3 695 aa27.33■■□□□ 1.97
TSPAN13-201ENST00000262067 KANSL2Q9H9L4 492 aa27.33■■□□□ 1.97
TSPAN13-201ENST00000262067 SPDYE2BA6NHP3 402 aa27.32■■□□□ 1.96
TSPAN13-201ENST00000262067 GOLGA6L6A8MZA4 724 aa27.32■■□□□ 1.96
TSPAN13-201ENST00000262067 hCG_1984214I3L0E3 225 aa27.32■■□□□ 1.96
TSPAN13-201ENST00000262067 SPDYE6P0CI01 402 aa27.32■■□□□ 1.96
TSPAN13-201ENST00000262067 BMP6P22004 513 aa27.32■■□□□ 1.96
TSPAN13-201ENST00000262067 SARSP49591 514 aaKnown RBP27.32■■□□□ 1.96
TSPAN13-201ENST00000262067 CCDC96Q2M329 555 aa27.32■■□□□ 1.96
TSPAN13-201ENST00000262067 NT5DC1Q5TFE4 455 aa27.32■■□□□ 1.96
TSPAN13-201ENST00000262067 KCTD1Q719H9 257 aa27.32■■□□□ 1.96
TSPAN13-201ENST00000262067 KRT25Q7Z3Z0 450 aa27.32■■□□□ 1.96
TSPAN13-201ENST00000262067 DRC7Q8IY82 874 aa27.32■■□□□ 1.96
TSPAN13-201ENST00000262067 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP27.32■■□□□ 1.96
TSPAN13-201ENST00000262067 MKL1Q969V6 931 aa27.32■■□□□ 1.96
TSPAN13-201ENST00000262067 COA7Q96BR5 231 aa27.32■■□□□ 1.96
TSPAN13-201ENST00000262067 NYAP2Q9P242 653 aa27.32■■□□□ 1.96
TSPAN13-201ENST00000262067 MAN1B1Q9UKM7 699 aa27.32■■□□□ 1.96
TSPAN13-201ENST00000262067 PSME4Q14997 1843 aa27.32■■□□□ 1.96
TSPAN13-201ENST00000262067 ESYT2A0FGR8 921 aa27.32■■□□□ 1.96
TSPAN13-201ENST00000262067 SLFN14P0C7P3 912 aa27.32■■□□□ 1.96
TSPAN13-201ENST00000262067 NCAPHQ15003 741 aa27.32■■□□□ 1.96
TSPAN13-201ENST00000262067 SEPT2Q15019 361 aa27.32■■□□□ 1.96
TSPAN13-201ENST00000262067 GPATCH4Q5T3I0 446 aaKnown RBP27.32■■□□□ 1.96
TSPAN13-201ENST00000262067 SIAH1Q8IUQ4 282 aa27.32■■□□□ 1.96
TSPAN13-201ENST00000262067 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP27.32■■□□□ 1.96
TSPAN13-201ENST00000262067 SLC16A2P36021 539 aa27.31■■□□□ 1.96
TSPAN13-201ENST00000262067 VPS33BQ9H267 617 aa27.31■■□□□ 1.96
TSPAN13-201ENST00000262067 PIM2Q9P1W9 311 aa27.31■■□□□ 1.96
TSPAN13-201ENST00000262067 GDF11O95390 407 aa27.31■■□□□ 1.96
TSPAN13-201ENST00000262067 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP27.31■■□□□ 1.96
TSPAN13-201ENST00000262067 SMARCE1Q969G3 411 aa27.31■■□□□ 1.96
TSPAN13-201ENST00000262067 TMEM60Q9H2L4 133 aa27.31■■□□□ 1.96
TSPAN13-201ENST00000262067 HDAC9Q9UKV0 1011 aa27.31■■□□□ 1.96
TSPAN13-201ENST00000262067 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa27.3■■□□□ 1.96
TSPAN13-201ENST00000262067 CLRN2A0PK11 232 aa27.3■■□□□ 1.96
TSPAN13-201ENST00000262067 SMTNL1A8MU46 457 aa27.3■■□□□ 1.96
TSPAN13-201ENST00000262067 TCP10L2B9ZVM9 353 aa27.3■■□□□ 1.96
TSPAN13-201ENST00000262067 CDC25BP30305 580 aa27.3■■□□□ 1.96
TSPAN13-201ENST00000262067 TGFB2P61812 414 aa27.3■■□□□ 1.96
TSPAN13-201ENST00000262067 DLGAP5Q15398 846 aa27.3■■□□□ 1.96
TSPAN13-201ENST00000262067 MRFAP1L1Q96HT8 127 aa27.3■■□□□ 1.96
TSPAN13-201ENST00000262067 CSRNP1Q96S65 589 aa27.3■■□□□ 1.96
TSPAN13-201ENST00000262067 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP27.3■■□□□ 1.96
TSPAN13-201ENST00000262067 ZNRF3Q9ULT6 936 aa27.3■■□□□ 1.96
TSPAN13-201ENST00000262067 KIF13BQ9NQT8 1826 aa27.3■■□□□ 1.96
TSPAN13-201ENST00000262067 IKBKBO14920 756 aa27.29■■□□□ 1.96
TSPAN13-201ENST00000262067 ABCB5Q2M3G0 1257 aa27.29■■□□□ 1.96
TSPAN13-201ENST00000262067 TMEM179Q6ZVK1 233 aa27.29■■□□□ 1.96
TSPAN13-201ENST00000262067 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa27.29■■□□□ 1.96
TSPAN13-201ENST00000262067 PAGE5Q96GU1 130 aa27.29■■□□□ 1.96
TSPAN13-201ENST00000262067 TMOD2Q9NZR1 351 aa27.29■■□□□ 1.96
TSPAN13-201ENST00000262067 NRBP1Q9UHY1 535 aa27.29■■□□□ 1.96
TSPAN13-201ENST00000262067 TPM3P06753 285 aa27.29■■□□□ 1.96
TSPAN13-201ENST00000262067 LONP1P36776 959 aaKnown RBP27.29■■□□□ 1.96
TSPAN13-201ENST00000262067 AFMP43652 599 aa27.29■■□□□ 1.96
TSPAN13-201ENST00000262067 JAG1P78504 1218 aa27.29■■□□□ 1.96
TSPAN13-201ENST00000262067 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa27.29■■□□□ 1.96
TSPAN13-201ENST00000262067 NIM1KQ8IY84 436 aa27.29■■□□□ 1.96
TSPAN13-201ENST00000262067 OGFOD1Q8N543 542 aa27.29■■□□□ 1.96
TSPAN13-201ENST00000262067 SPATA20Q8TB22 786 aa27.29■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.1 ms