RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000228515.5

CSRNP2-201, Transcript of cysteine and serine rich nuclear protein 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CSRNP2, Length 4,471 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRNP2-201ENST00000228515 NEK8Q86SG6 692 aa16.27■□□□□ 0.19
CSRNP2-201ENST00000228515 TUBGCP2Q9BSJ2 902 aa16.27■□□□□ 0.19
CSRNP2-201ENST00000228515 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP16.27■□□□□ 0.19
CSRNP2-201ENST00000228515 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP16.27■□□□□ 0.19
CSRNP2-201ENST00000228515 CLNS1AP54105 237 aaKnown RBP16.27■□□□□ 0.19
CSRNP2-201ENST00000228515 UBE3CQ15386 1083 aa16.27■□□□□ 0.19
CSRNP2-201ENST00000228515 MCUR1Q96AQ8 359 aa16.27■□□□□ 0.19
CSRNP2-201ENST00000228515 GSDMAQ96QA5 445 aa16.27■□□□□ 0.19
CSRNP2-201ENST00000228515 ERVV-2B6SEH9 535 aa16.26■□□□□ 0.19
CSRNP2-201ENST00000228515 PPM1FP49593 454 aaPredicted RBP16.26■□□□□ 0.19
CSRNP2-201ENST00000228515 PRR16Q569H4 304 aa16.26■□□□□ 0.19
CSRNP2-201ENST00000228515 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP16.26■□□□□ 0.19
CSRNP2-201ENST00000228515 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa16.26■□□□□ 0.19
CSRNP2-201ENST00000228515 OSBP2Q969R2 916 aa16.26■□□□□ 0.19
CSRNP2-201ENST00000228515 TACO1Q9BSH4 297 aaKnown RBP16.26■□□□□ 0.19
CSRNP2-201ENST00000228515 GJB4Q9NTQ9 266 aa16.26■□□□□ 0.19
CSRNP2-201ENST00000228515 GAS8O95995 478 aa16.26■□□□□ 0.19
CSRNP2-201ENST00000228515 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP16.26■□□□□ 0.19
CSRNP2-201ENST00000228515 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP16.26■□□□□ 0.19
CSRNP2-201ENST00000228515 GUCY2DQ02846 1103 aa16.26■□□□□ 0.19
CSRNP2-201ENST00000228515 MTMR3Q13615 1198 aa16.26■□□□□ 0.19
CSRNP2-201ENST00000228515 FAM26FQ5R3K3 315 aa16.26■□□□□ 0.19
CSRNP2-201ENST00000228515 FYB2Q5VWT5 728 aa16.26■□□□□ 0.19
CSRNP2-201ENST00000228515 SAMSN1Q9NSI8 373 aaKnown RBP16.26■□□□□ 0.19
CSRNP2-201ENST00000228515 CYP4A11Q02928 519 aa16.25■□□□□ 0.19
CSRNP2-201ENST00000228515 STRN3Q13033 797 aa16.25■□□□□ 0.19
CSRNP2-201ENST00000228515 PSTPIP2Q9H939 334 aa16.25■□□□□ 0.19
CSRNP2-201ENST00000228515 SASH1O94885 1247 aa16.25■□□□□ 0.19
CSRNP2-201ENST00000228515 H2AFZP0C0S5 128 aa16.25■□□□□ 0.19
CSRNP2-201ENST00000228515 NECTIN1Q15223 517 aa16.25■□□□□ 0.19
CSRNP2-201ENST00000228515 H2AFVQ71UI9 128 aa16.25■□□□□ 0.19
CSRNP2-201ENST00000228515 SDCCAG8Q86SQ7 713 aaPredicted RBP16.25■□□□□ 0.19
CSRNP2-201ENST00000228515 SMC1BQ8NDV3 1235 aa16.25■□□□□ 0.19
CSRNP2-201ENST00000228515 RAB17Q9H0T7 212 aa16.25■□□□□ 0.19
CSRNP2-201ENST00000228515 EXOC7Q9UPT5 735 aa16.25■□□□□ 0.19
CSRNP2-201ENST00000228515 GJA10Q969M2 543 aa16.25■□□□□ 0.19
CSRNP2-201ENST00000228515 CAPS2Q9BXY5 557 aa16.25■□□□□ 0.19
CSRNP2-201ENST00000228515 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa16.25■□□□□ 0.19
CSRNP2-201ENST00000228515 GAS7O60861 476 aa16.25■□□□□ 0.19
CSRNP2-201ENST00000228515 TBC1D8O95759 1140 aa16.25■□□□□ 0.19
CSRNP2-201ENST00000228515 TNNI1P19237 187 aa16.25■□□□□ 0.19
CSRNP2-201ENST00000228515 ADAM9Q13443 819 aa16.25■□□□□ 0.19
CSRNP2-201ENST00000228515 GKAP1Q5VSY0 366 aaPredicted RBP16.25■□□□□ 0.19
CSRNP2-201ENST00000228515 CROCCP2Q86T23 111 aa16.25■□□□□ 0.19
CSRNP2-201ENST00000228515 STK38LQ9Y2H1 464 aa16.25■□□□□ 0.19
CSRNP2-201ENST00000228515 ERBB4Q15303 1308 aa16.24■□□□□ 0.19
CSRNP2-201ENST00000228515 RASSF7Q02833 373 aa16.24■□□□□ 0.19
CSRNP2-201ENST00000228515 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP16.24■□□□□ 0.19
CSRNP2-201ENST00000228515 MAST1Q9Y2H9 1570 aa16.24■□□□□ 0.19
CSRNP2-201ENST00000228515 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa16.24■□□□□ 0.19
CSRNP2-201ENST00000228515 PPFIA4O75335 1185 aa16.24■□□□□ 0.19
CSRNP2-201ENST00000228515 STX2P32856 288 aa16.24■□□□□ 0.19
CSRNP2-201ENST00000228515 CCT5P48643 541 aa16.24■□□□□ 0.19
CSRNP2-201ENST00000228515 RBL2Q08999 1139 aa16.24■□□□□ 0.19
CSRNP2-201ENST00000228515 USP40Q9NVE5 1235 aa16.24■□□□□ 0.19
CSRNP2-201ENST00000228515 CHRNDQ07001 517 aa16.24■□□□□ 0.19
CSRNP2-201ENST00000228515 PSMD6Q15008 389 aa16.24■□□□□ 0.19
CSRNP2-201ENST00000228515 CCDC14Q49A88 953 aa16.24■□□□□ 0.19
CSRNP2-201ENST00000228515 ANKRD20A3Q5VUR7 823 aa16.24■□□□□ 0.19
CSRNP2-201ENST00000228515 VPS52Q8N1B4 723 aa16.24■□□□□ 0.19
CSRNP2-201ENST00000228515 CCDC110Q8TBZ0 833 aa16.24■□□□□ 0.19
CSRNP2-201ENST00000228515 VPS37BQ9H9H4 285 aa16.24■□□□□ 0.19
CSRNP2-201ENST00000228515 IKBKBO14920 756 aa16.23■□□□□ 0.19
CSRNP2-201ENST00000228515 GRM1Q13255 1194 aa16.23■□□□□ 0.19
CSRNP2-201ENST00000228515 GEN1Q17RS7 908 aa16.23■□□□□ 0.19
CSRNP2-201ENST00000228515 CCDC170Q8IYT3 715 aa16.23■□□□□ 0.19
CSRNP2-201ENST00000228515 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP16.23■□□□□ 0.19
CSRNP2-201ENST00000228515 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP16.23■□□□□ 0.19
CSRNP2-201ENST00000228515 PRKAB2O43741 272 aa16.23■□□□□ 0.19
CSRNP2-201ENST00000228515 CAPN12Q6ZSI9 719 aa16.23■□□□□ 0.19
CSRNP2-201ENST00000228515 CCDC127Q96BQ5 260 aa16.23■□□□□ 0.19
CSRNP2-201ENST00000228515 MED4Q9NPJ6 270 aa16.23■□□□□ 0.19
CSRNP2-201ENST00000228515 MYOM2P54296 1465 aa16.23■□□□□ 0.19
CSRNP2-201ENST00000228515 PPP6R2O75170 966 aa16.23■□□□□ 0.19
CSRNP2-201ENST00000228515 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP16.23■□□□□ 0.19
CSRNP2-201ENST00000228515 LLGL1Q15334 1064 aa16.23■□□□□ 0.19
CSRNP2-201ENST00000228515 CERS3Q8IU89 383 aa16.23■□□□□ 0.19
CSRNP2-201ENST00000228515 CACNA2D3Q8IZS8 1091 aa16.23■□□□□ 0.19
CSRNP2-201ENST00000228515 CNOT6LQ96LI5 555 aaKnown RBP16.23■□□□□ 0.19
CSRNP2-201ENST00000228515 ANAPC4Q9UJX5 808 aa16.23■□□□□ 0.19
CSRNP2-201ENST00000228515 ASAP1Q9ULH1 1129 aa16.23■□□□□ 0.19
CSRNP2-201ENST00000228515 GNA14O95837 355 aa16.23■□□□□ 0.19
CSRNP2-201ENST00000228515 CTAGE3PQ8IX95 158 aa16.23■□□□□ 0.19
CSRNP2-201ENST00000228515 ACRBPQ8NEB7 543 aa16.23■□□□□ 0.19
CSRNP2-201ENST00000228515 PI4K2BQ8TCG2 481 aa16.23■□□□□ 0.19
CSRNP2-201ENST00000228515 IQCDQ96DY2 449 aa16.23■□□□□ 0.19
CSRNP2-201ENST00000228515 PANK4Q9NVE7 773 aa16.23■□□□□ 0.19
CSRNP2-201ENST00000228515 FEZ2Q9UHY8 353 aaPredicted RBP16.23■□□□□ 0.19
CSRNP2-201ENST00000228515 ERVK-7P63135 1459 aa16.23■□□□□ 0.19
CSRNP2-201ENST00000228515 PPAN-P2RY11A0A0B4J1V8 794 aaPredicted RBP16.22■□□□□ 0.19
CSRNP2-201ENST00000228515 M0R2C6 588 aa16.22■□□□□ 0.19
CSRNP2-201ENST00000228515 CIB2O75838 187 aa16.22■□□□□ 0.19
CSRNP2-201ENST00000228515 KRT19P08727 400 aa16.22■□□□□ 0.19
CSRNP2-201ENST00000228515 CXCR5P32302 372 aa16.22■□□□□ 0.19
CSRNP2-201ENST00000228515 CASC4Q6P4E1 433 aa16.22■□□□□ 0.19
CSRNP2-201ENST00000228515 FOXP1Q9H334 677 aaPredicted RBP16.22■□□□□ 0.19
CSRNP2-201ENST00000228515 MED23Q9ULK4 1368 aa16.22■□□□□ 0.19
CSRNP2-201ENST00000228515 RNF40O75150 1001 aa16.22■□□□□ 0.19
CSRNP2-201ENST00000228515 RESTQ13127 1097 aa16.22■□□□□ 0.19
CSRNP2-201ENST00000228515 FAM178BQ8IXR5 827 aa16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.1 ms