RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000029180.13

Rprd1b-201, Transcript of Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, mousemouse

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Rprd1b, Length 4,283 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Lrrc36Q3V0M2 755 aa10□□□□□ -0.81
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Ubxn4Q8VCH8 506 aa10□□□□□ -0.81
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Ribc1Q9D0B8 379 aa10□□□□□ -0.81
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Akap8Q9DBR0 687 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 FliiQ9JJ28 1271 aa10□□□□□ -0.81
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Myoz2Q9JJW5 264 aa10□□□□□ -0.81
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Skor2A7M7C7 1008 aa9.99□□□□□ -0.81
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Tsen34Q8BMZ5 316 aa9.99□□□□□ -0.81
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 MyripQ8K3I4 856 aa9.99□□□□□ -0.81
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Lztr1Q9CQ33 837 aa9.99□□□□□ -0.81
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Trim42Q9D2H5 723 aa9.99□□□□□ -0.81
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Rmi1Q9D4G9 616 aa9.99□□□□□ -0.81
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 MyocO70624 490 aa9.99□□□□□ -0.81
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Cnnm2Q3TWN3 875 aa9.99□□□□□ -0.81
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Prom2Q3UUY6 835 aa9.99□□□□□ -0.81
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Ces3aQ63880 571 aa9.99□□□□□ -0.81
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Ces3bQ8VCU1 571 aa9.99□□□□□ -0.81
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Arl8aQ8VEH3 186 aa9.99□□□□□ -0.81
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Tex13c2A0A0G2JGA3 530 aa9.99□□□□□ -0.81
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Ankrd63A2ARS0 390 aa9.99□□□□□ -0.81
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Pls1Q3V0K9 630 aa9.99□□□□□ -0.81
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Cfap52Q5F201 620 aa9.99□□□□□ -0.81
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Tmem179Q8BHH9 233 aa9.99□□□□□ -0.81
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 SyncQ9EPM5 470 aa9.99□□□□□ -0.81
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Cxcl11Q9JHH5 100 aa9.99□□□□□ -0.81
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Krt85Q9Z2T6 507 aa9.99□□□□□ -0.81
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Stat5bP42232 786 aa9.99□□□□□ -0.81
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Syt1P46096 421 aa9.99□□□□□ -0.81
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Nedd4P46935 887 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 ZyxQ62523 564 aa9.99□□□□□ -0.81
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 KhnynQ80U38 671 aa9.99□□□□□ -0.81
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Sept9Q80UG5 583 aa9.99□□□□□ -0.81
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Acnat2Q8BGG9 420 aa9.99□□□□□ -0.81
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Gbp7Q91Z40 638 aa9.99□□□□□ -0.81
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Gnl2Q99LH1 728 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Pold4Q9CWP8 107 aa9.99□□□□□ -0.81
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Stag1Q9D3E6 1258 aa9.99□□□□□ -0.81
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Mdh1P14152 334 aa9.98□□□□□ -0.81
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Usp53P15975 1069 aa9.98□□□□□ -0.81
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Rhbdl3P58873 404 aa9.98□□□□□ -0.81
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Nlrp4cQ3TKR3 982 aa9.98□□□□□ -0.81
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Tbc1d2bQ3U0J8 965 aa9.98□□□□□ -0.81
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 TxlnaQ6PAM1 554 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Kiaa1024Q8K3V7 917 aa9.98□□□□□ -0.81
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Ankrd49Q8VE42 238 aa9.98□□□□□ -0.81
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 PigoQ9JJI6 1093 aa9.98□□□□□ -0.81
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Epb41l3Q9WV92 929 aa9.98□□□□□ -0.81
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Mtmr2Q9Z2D1 643 aa9.98□□□□□ -0.81
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Col11a2Q64739 1736 aa9.98□□□□□ -0.81
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Prl7a2O54831 253 aa9.98□□□□□ -0.81
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 RcvrnP34057 202 aa9.98□□□□□ -0.81
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Ubxn2bQ0KL01 331 aa9.98□□□□□ -0.81
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Rnf40Q3U319 1001 aa9.98□□□□□ -0.81
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 GnptabQ69ZN6 1235 aa9.98□□□□□ -0.81
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Rbm15bQ6PHZ5 887 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Atf7Q8R0S1 413 aa9.98□□□□□ -0.81
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 PdclQ9DBX2 301 aa9.98□□□□□ -0.81
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Hip1rQ9JKY5 1068 aa9.98□□□□□ -0.81
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Cdc45Q9Z1X9 566 aa9.98□□□□□ -0.81
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Zfp804bA0A0G2JGH6 1343 aa9.98□□□□□ -0.81
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 VirmaA2AIV2 1811 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Prr16A3KMN5 304 aa9.98□□□□□ -0.81
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 1700018F24RikB2RW27 314 aa9.98□□□□□ -0.81
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Nrg3O35181 713 aa9.98□□□□□ -0.81
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Gja5Q01231 358 aa9.98□□□□□ -0.81
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Tex11Q14AT2 947 aa9.98□□□□□ -0.81
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Fhdc1Q3ULZ2 1149 aa9.98□□□□□ -0.81
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Cacna2d4Q5RJF7 1116 aa9.98□□□□□ -0.81
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Utp18Q5SSI6 552 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 MmeQ61391 750 aa9.98□□□□□ -0.81
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Gpt2Q8BGT5 522 aa9.98□□□□□ -0.81
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Map10Q8BJS7 891 aa9.98□□□□□ -0.81
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Tor1aip2Q8BYU6 502 aa9.98□□□□□ -0.81
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Ccdc12Q8R344 166 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 StrbpQ91WM1 672 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Sh3bp5lQ99LH9 392 aa9.98□□□□□ -0.81
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Cyp26c1B2RXA7 518 aa9.97□□□□□ -0.81
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Mb21d2Q8C525 428 aa9.97□□□□□ -0.81
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Pitpnm2Q6ZPQ6 1335 aa9.97□□□□□ -0.81
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Nup188Q6ZQH8 1759 aa9.97□□□□□ -0.81
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Tdo2P48776 406 aa9.97□□□□□ -0.81
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Dynll1P63168 89 aa9.97□□□□□ -0.81
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Tfcp2l1Q3UNW5 479 aa9.97□□□□□ -0.81
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Bbof1Q3V079 533 aa9.97□□□□□ -0.81
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 EsrrbQ61539 433 aa9.97□□□□□ -0.81
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Cep120Q7TSG1 988 aa9.97□□□□□ -0.81
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Sept14Q9DA97 430 aa9.97□□□□□ -0.81
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Fam43bA2AM80 330 aa9.97□□□□□ -0.81
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Pdzrn4E9PUZ9 1014 aa9.97□□□□□ -0.81
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Gm38392E9Q2A2 434 aa9.97□□□□□ -0.81
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Dnajc21E9Q8D0 531 aa9.97□□□□□ -0.81
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Pde4aO89084 844 aa9.97□□□□□ -0.81
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Gbp4Q61107 620 aa9.97□□□□□ -0.81
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Nell2Q61220 819 aa9.97□□□□□ -0.81
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Fam163bQ8BUM6 167 aa9.97□□□□□ -0.81
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 PreplQ8C167 725 aa9.97□□□□□ -0.81
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Stx1aO35526 288 aa9.96□□□□□ -0.81
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 G3bp2P97379 482 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.81
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 NogP97466 232 aa9.96□□□□□ -0.81
Rprd1b-201ENSMUST00000029180 Gngt1Q61012 74 aa9.96□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 17.6 ms