RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000021380.9

Trappc6b-201, Transcript of Trafficking protein particle complex subunit 6B, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Trappc6b, Length 1,255 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Ces3bQ8VCU1 571 aa26.52■■□□□ 1.84
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Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Suclg2Q9Z2I8 433 aa26.51■■□□□ 1.83
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Trappc6b-201ENSMUST00000021380 MslnlQ8C160 685 aa26.5■■□□□ 1.83
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Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Fam71e1A1L3C1 212 aa26.49■■□□□ 1.83
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Cst8P32766 142 aa26.49■■□□□ 1.83
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Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Tmtc2Q56A06 836 aa26.49■■□□□ 1.83
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Crhr2Q60748 411 aa26.49■■□□□ 1.83
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Ppip5k2Q6ZQB6 1129 aa26.49■■□□□ 1.83
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Ccp110Q7TSH4 1004 aa26.49■■□□□ 1.83
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Tbc1d10bQ8BHL3 798 aa26.49■■□□□ 1.83
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Supt16hQ920B9 1047 aa26.49■■□□□ 1.83
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Gtf3c5Q8R2T8 520 aa26.48■■□□□ 1.83
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Col26a1Q91VF6 440 aa26.48■■□□□ 1.83
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Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Inpp4aQ9EPW0 939 aa26.48■■□□□ 1.83
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Dnajb2Q9QYI5 324 aa26.48■■□□□ 1.83
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Mdh1bQ5F204 500 aa26.47■■□□□ 1.83
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Clca4aQ6Q473 924 aa26.47■■□□□ 1.83
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Oxnad1Q8VE38 311 aa26.47■■□□□ 1.83
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Xrn2Q9DBR1 951 aaKnown RBP26.47■■□□□ 1.83
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Dnaaf5B9EJR8 853 aa26.46■■□□□ 1.83
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Gm8882E9Q7E4 283 aa26.46■■□□□ 1.83
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Stag2O35638 1231 aa26.46■■□□□ 1.83
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 CatspereP0DP43 985 aa26.46■■□□□ 1.83
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Sgsm2Q80U12 1005 aa26.46■■□□□ 1.83
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Zdhhc15Q8BGJ0 337 aa26.46■■□□□ 1.83
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 U2af1l4Q8BGJ9 220 aa26.46■■□□□ 1.83
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Tfap4Q9JIZ5 338 aa26.46■■□□□ 1.83
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Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Fbxl16A2RT62 479 aa26.45■■□□□ 1.82
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Ankrd35E9Q9D8 996 aa26.45■■□□□ 1.82
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Churc1Q6DG52 112 aa26.45■■□□□ 1.82
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Cyp26b1Q811W2 512 aa26.45■■□□□ 1.82
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Ncaph2Q8BSP2 607 aa26.45■■□□□ 1.82
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Hsdl1Q8BTX9 330 aa26.45■■□□□ 1.82
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Gpcpd1Q8C0L9 675 aa26.45■■□□□ 1.82
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Gpr37l1Q99JG2 481 aa26.45■■□□□ 1.82
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Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Myh8P13542 1937 aa26.45■■□□□ 1.82
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Phldb3E9QAF4 648 aa26.44■■□□□ 1.82
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Fzd1O70421 642 aa26.44■■□□□ 1.82
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Gja8P28236 440 aa26.44■■□□□ 1.82
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 SqleP52019 572 aa26.44■■□□□ 1.82
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Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Ints3Q7TPD0 1041 aaKnown RBP26.44■■□□□ 1.82
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Zswim3Q8CFL8 695 aa26.44■■□□□ 1.82
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Depdc1aQ8CIG0 804 aa26.44■■□□□ 1.82
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Pqbp1Q91VJ5 263 aaKnown RBP26.44■■□□□ 1.82
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Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Calm2P0DP27 149 aaKnown RBP26.43■■□□□ 1.82
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Calm3P0DP28 149 aaKnown RBP26.43■■□□□ 1.82
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Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Fbxo10Q7TQF2 950 aa26.43■■□□□ 1.82
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Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Ces1hD3Z298 562 aa26.42■■□□□ 1.82
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Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Ccdc85aQ5SP85 500 aa26.42■■□□□ 1.82
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Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Pitpnm1O35954 1243 aa26.41■■□□□ 1.82
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Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Tceanc2Q8R2M0 207 aa26.41■■□□□ 1.82
Trappc6b-201ENSMUST00000021380 Usp26Q99MX1 835 aa26.41■■□□□ 1.82
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Trappc6b-201ENSMUST00000021380 GnaqP21279 359 aa26.4■■□□□ 1.82
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