RNA–Protein interactions for RNA: YMR038C

CCS1, Transcript of Copper chaperone for superoxide dismutase Sod1p, yeast

Gene CCS1, Length 750 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
CCS1	YMR038C	TOF2	Q02208	771 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CCS1	YMR038C	TSR1	Q07381	788 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
CCS1	YMR038C	GPM2	Q12008	311 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CCS1	YMR038C	YPR027C	Q12079	277 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CCS1	YMR038C	ACF2	Q12168	779 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CCS1	YMR038C	RAD3	P06839	778 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CCS1	YMR038C	FRS1	P15624	595 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
CCS1	YMR038C	KIN3	P22209	435 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CCS1	YMR038C	TKL2	P33315	681 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CCS1	YMR038C	REV7	P38927	245 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CCS1	YMR038C	OSW5	P40219	148 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CCS1	YMR038C	YIL161W	P40449	235 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
CCS1	YMR038C	DUG1	P43616	481 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
CCS1	YMR038C	RMD8	P43620	662 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CCS1	YMR038C	NOP15	P53927	220 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
CCS1	YMR038C	TIM8	P57744	87 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CCS1	YMR038C	MUB1	Q03162	620 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CCS1	YMR038C	YMR210W	Q03649	449 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CCS1	YMR038C	MLH2	Q07980	695 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CCS1	YMR038C	TLG2	Q08144	397 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CCS1	YMR038C	TCO89	Q08921	799 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CCS1	YMR038C	SLX4	Q12098	748 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CCS1	YMR038C	TMA17	Q12513	150 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CCS1	YMR038C	YKL033W-A	Q86ZR7	236 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CCS1	YMR038C	RPS17A	P02407	136 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CCS1	YMR038C	RPS17B	P14127	136 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CCS1	YMR038C	RRT12	P25381	491 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CCS1	YMR038C	BMH1	P29311	267 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CCS1	YMR038C	FRE1	P32791	686 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CCS1	YMR038C	PHO11	P35842	467 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CCS1	YMR038C	SRX1	P36077	127 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CCS1	YMR038C	UTH1	P36135	365 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CCS1	YMR038C	PHO12	P38693	467 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CCS1	YMR038C	PCL5	P38794	229 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CCS1	YMR038C	TOS3	P43637	560 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CCS1	YMR038C	BIT61	P47041	543 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CCS1	YMR038C	FHN1	P53279	174 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CCS1	YMR038C	DON1	Q05610	365 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CCS1	YMR038C	STP4	Q07351	490 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CCS1	YMR038C	MCH5	Q08777	521 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CCS1	YMR038C	MLH3	Q12083	715 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CCS1	YMR038C	MSF1	P08425	469 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CCS1	YMR038C	GLN4	P13188	809 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CCS1	YMR038C	FPR1	P20081	114 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CCS1	YMR038C	CBF2	P32504	956 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CCS1	YMR038C	WBP1	P33767	430 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CCS1	YMR038C	BAT1	P38891	393 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CCS1	YMR038C	FTR1	P40088	404 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CCS1	YMR038C	YJR061W	P40355	935 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CCS1	YMR038C	YJR120W	P47157	116 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CCS1	YMR038C	PEX14	P53112	341 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CCS1	YMR038C	YGL036W	P53185	909 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CCS1	YMR038C	CEG1	Q01159	459 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CCS1	YMR038C	MTD1	Q02046	320 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CCS1	YMR038C	HEL2	Q05580	639 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CCS1	YMR038C	ECM22	Q05958	814 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CCS1	YMR038C	YOL075C	Q08234	1294 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CCS1	YMR038C	DIA2	Q08496	732 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CCS1	YMR038C	ABP140	Q08641	628 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CCS1	YMR038C	MED1	Q12321	566 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CCS1	YMR038C	POM34	Q12445	299 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CCS1	YMR038C	ERG20	P08524	352 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CCS1	YMR038C	NAT1	P12945	854 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CCS1	YMR038C	CDC26	P14724	124 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CCS1	YMR038C	EFB1	P32471	206 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CCS1	YMR038C	SWI3	P32591	825 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CCS1	YMR038C	ATG12	P38316	186 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CCS1	YMR038C	YBR225W	P38321	900 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CCS1	YMR038C	BIT2	P38346	545 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CCS1	YMR038C	TIF5	P38431	405 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CCS1	YMR038C	AVT2	P39981	480 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CCS1	YMR038C	KAP123	P40069	1113 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CCS1	YMR038C	GPP2	P40106	250 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CCS1	YMR038C	YPS6	P40583	537 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CCS1	YMR038C	BUD8	P41698	603 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CCS1	YMR038C	SMC3	P47037	1230 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CCS1	YMR038C	YAP1802	P53309	568 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CCS1	YMR038C	CSL4	P53859	292 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CCS1	YMR038C	SSL2	Q00578	843 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CCS1	YMR038C	IWR1	Q07532	353 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CCS1	YMR038C	YOR387C	Q08910	206 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CCS1	YMR038C	ZRT2	Q12436	422 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CCS1	YMR038C	THR1	P17423	357 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CCS1	YMR038C	CDC42	P19073	191 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CCS1	YMR038C	FEN2	P25621	512 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CCS1	YMR038C	XRS2	P33301	854 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CCS1	YMR038C	KDX1	P36005	433 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CCS1	YMR038C	YBR071W	P38243	211 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CCS1	YMR038C	DSE1	P40077	573 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CCS1	YMR038C	RSM25	P40496	264 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CCS1	YMR038C	ERG10	P41338	398 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CCS1	YMR038C	NIT2	P47016	307 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CCS1	YMR038C	IML2	P47031	731 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CCS1	YMR038C	COQ6	P53318	479 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CCS1	YMR038C	VBA4	Q04602	768 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CCS1	YMR038C	HBT1	Q07653	1046 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CCS1	YMR038C	GIS3	Q12418	502 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CCS1	YMR038C	BIK1	P11709	440 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CCS1	YMR038C	SAT4	P25333	603 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CCS1	YMR038C	LRE1	P25579	583 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63

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