RNA–Protein interactions for RNA: YML035C

AMD1, Transcript of AMP deaminase, yeast

Gene AMD1, Length 2,433 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
AMD1	YML035C	STB6	P36085	766 aa		5.71	□□□□□ -1.5
AMD1	YML035C	RIM2	P38127	377 aa		5.71	□□□□□ -1.5
AMD1	YML035C	RFC3	P38629	340 aa		5.71	□□□□□ -1.5
AMD1	YML035C	YHR182W	P38870	785 aa		5.71	□□□□□ -1.5
AMD1	YML035C	ACO2	P39533	789 aa		5.71	□□□□□ -1.5
AMD1	YML035C	TES1	P41903	349 aa	Known RBP	5.71	□□□□□ -1.5
AMD1	YML035C	ARC1	P46672	376 aa	Known RBP	5.71	□□□□□ -1.5
AMD1	YML035C	CSN12	P47130	423 aa		5.71	□□□□□ -1.5
AMD1	YML035C	RSM7	P47150	247 aa		5.71	□□□□□ -1.5
AMD1	YML035C	TAF6	P53040	516 aa		5.71	□□□□□ -1.5
AMD1	YML035C	YNL143C	P53908	130 aa		5.71	□□□□□ -1.5
AMD1	YML035C	UBP2	Q01476	1272 aa		5.71	□□□□□ -1.5
AMD1	YML035C	YMR209C	Q03648	457 aa		5.71	□□□□□ -1.5
AMD1	YML035C	PPN1	Q04119	674 aa		5.71	□□□□□ -1.5
AMD1	YML035C	YPR084W	Q06821	456 aa		5.71	□□□□□ -1.5
AMD1	YML035C	DIA2	Q08496	732 aa	Predicted RBP	5.71	□□□□□ -1.5
AMD1	YML035C	TGL5	Q12043	749 aa		5.71	□□□□□ -1.5
AMD1	YML035C	YMR084W	A2P2R3	262 aa		5.7	□□□□□ -1.5
AMD1	YML035C	LEU1	P07264	779 aa	Known RBP	5.7	□□□□□ -1.5
AMD1	YML035C	MSF1	P08425	469 aa		5.7	□□□□□ -1.5
AMD1	YML035C	GLN4	P13188	809 aa	Known RBP	5.7	□□□□□ -1.5
AMD1	YML035C	SEC63	P14906	663 aa		5.7	□□□□□ -1.5
AMD1	YML035C	NSP1	P14907	823 aa	Known RBP	5.7	□□□□□ -1.5
AMD1	YML035C	MEF1	P25039	761 aa		5.7	□□□□□ -1.5
AMD1	YML035C	NIP1	P32497	812 aa	Known RBP	5.7	□□□□□ -1.5
AMD1	YML035C	YME2	P32843	850 aa		5.7	□□□□□ -1.5
AMD1	YML035C	STE5	P32917	917 aa		5.7	□□□□□ -1.5
AMD1	YML035C	AXL1	P40851	1208 aa		5.7	□□□□□ -1.5
AMD1	YML035C	IME4	P41833	600 aa		5.7	□□□□□ -1.5
AMD1	YML035C	LSB3	P43603	459 aa	Known RBP	5.7	□□□□□ -1.5
AMD1	YML035C	SET2	P46995	733 aa	Known RBP	5.7	□□□□□ -1.5
AMD1	YML035C	USE1	P53146	245 aa		5.7	□□□□□ -1.5
AMD1	YML035C	IST1	P53843	298 aa	Predicted RBP	5.7	□□□□□ -1.5
AMD1	YML035C	IRC10	Q08118	586 aa		5.7	□□□□□ -1.5
AMD1	YML035C	NUS1	Q12063	375 aa		5.7	□□□□□ -1.5
AMD1	YML035C	NOT5	Q12514	560 aa	Predicted RBP	5.7	□□□□□ -1.5
AMD1	YML035C	CET1	O13297	549 aa	Predicted RBP	5.7	□□□□□ -1.5
AMD1	YML035C	ABF1	P14164	731 aa		5.7	□□□□□ -1.5
AMD1	YML035C	AMD1	P15274	810 aa	Known RBP	5.7	□□□□□ -1.5
AMD1	YML035C	HEM3	P28789	327 aa		5.7	□□□□□ -1.5
AMD1	YML035C	BRF1	P29056	596 aa		5.7	□□□□□ -1.5
AMD1	YML035C	MF(ALPHA)2	P32435	120 aa		5.7	□□□□□ -1.5
AMD1	YML035C	GCD11	P32481	527 aa	Known RBP	5.7	□□□□□ -1.5
AMD1	YML035C	PHO89	P38361	574 aa		5.7	□□□□□ -1.5
AMD1	YML035C	ALG8	P40351	577 aa		5.7	□□□□□ -1.5
AMD1	YML035C	HOS4	P40480	1083 aa		5.7	□□□□□ -1.5
AMD1	YML035C	GTS1	P40956	396 aa		5.7	□□□□□ -1.5
AMD1	YML035C	GCD14	P46959	383 aa	Predicted RBP	5.7	□□□□□ -1.5
AMD1	YML035C	STE2	D6VTK4	431 aa		5.69	□□□□□ -1.5
AMD1	YML035C	APA1	P16550	321 aa	Known RBP	5.69	□□□□□ -1.5
AMD1	YML035C	TRX2	P22803	104 aa	Known RBP	5.69	□□□□□ -1.5
AMD1	YML035C	YCR099C	P25657	155 aa		5.69	□□□□□ -1.5
AMD1	YML035C	TOA1	P32773	286 aa		5.69	□□□□□ -1.5
AMD1	YML035C	MRE11	P32829	692 aa		5.69	□□□□□ -1.5
AMD1	YML035C	DCW1	P36091	449 aa		5.69	□□□□□ -1.5
AMD1	YML035C	RIO2	P40160	425 aa	Known RBP	5.69	□□□□□ -1.5
AMD1	YML035C	FAR3	P46671	204 aa		5.69	□□□□□ -1.5
AMD1	YML035C	YNR014W	P53719	212 aa		5.69	□□□□□ -1.5
AMD1	YML035C	YNR061C	P53747	219 aa		5.69	□□□□□ -1.5
AMD1	YML035C	TDA7	P53882	636 aa	Predicted RBP	5.69	□□□□□ -1.5
AMD1	YML035C	YMR178W	Q03219	274 aa	Known RBP	5.69	□□□□□ -1.5
AMD1	YML035C	BLS1	Q06071	122 aa		5.69	□□□□□ -1.5
AMD1	YML035C	GCD2	P12754	651 aa	Predicted RBP	5.69	□□□□□ -1.5
AMD1	YML035C	UBA1	P22515	1024 aa	Known RBP	5.69	□□□□□ -1.5
AMD1	YML035C	GFD2	P25370	566 aa	Known RBP	5.69	□□□□□ -1.5
AMD1	YML035C	SPS22	P25380	463 aa		5.69	□□□□□ -1.5
AMD1	YML035C	SPS19	P32573	292 aa	Known RBP	5.69	□□□□□ -1.5
AMD1	YML035C	CBF5	P33322	483 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.69	□□□□□ -1.5	not detected
AMD1	YML035C	PMT1	P33775	817 aa		5.69	□□□□□ -1.5
AMD1	YML035C	TFC3	P34111	1160 aa		5.69	□□□□□ -1.5
AMD1	YML035C	IRS4	P36115	615 aa	Known RBP	5.69	□□□□□ -1.5
AMD1	YML035C	YHL008C	P38750	627 aa		5.69	□□□□□ -1.5
AMD1	YML035C	TRM5	P38793	499 aa		5.69	□□□□□ -1.5
AMD1	YML035C	REF2	P42073	533 aa	Predicted RBP	5.69	□□□□□ -1.5
AMD1	YML035C	BOL2	P53082	120 aa		5.69	□□□□□ -1.5
AMD1	YML035C	NMA2	P53204	395 aa		5.69	□□□□□ -1.5
AMD1	YML035C	TVP15	Q03860	143 aa		5.69	□□□□□ -1.5
AMD1	YML035C	YDR131C	Q03899	556 aa		5.69	□□□□□ -1.5
AMD1	YML035C	HPT1	Q04178	221 aa	Known RBP	5.69	□□□□□ -1.5
AMD1	YML035C	CIA1	Q05583	330 aa		5.69	□□□□□ -1.5
AMD1	YML035C	HRK1	Q08732	759 aa	Known RBP	5.69	□□□□□ -1.5
AMD1	YML035C	GTT2	Q12390	233 aa		5.69	□□□□□ -1.5
AMD1	YML035C	RAD51	P25454	400 aa		5.68	□□□□□ -1.5
AMD1	YML035C	BUD14	P27637	709 aa		5.68	□□□□□ -1.5
AMD1	YML035C	MUP3	P38734	546 aa		5.68	□□□□□ -1.5
AMD1	YML035C	YHB1	P39676	399 aa	Known RBP	5.68	□□□□□ -1.5
AMD1	YML035C	TEL2	P53038	688 aa		5.68	□□□□□ -1.5
AMD1	YML035C	EMC4	P53073	190 aa		5.68	□□□□□ -1.5
AMD1	YML035C	NPL3	Q01560	414 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.68	□□□□□ -1.5	not detected
AMD1	YML035C	OSH6	Q02201	448 aa		5.68	□□□□□ -1.5
AMD1	YML035C	YDR476C	Q03362	224 aa		5.68	□□□□□ -1.5
AMD1	YML035C	ACL4	Q03771	387 aa		5.68	□□□□□ -1.5
AMD1	YML035C	GTB1	Q04924	702 aa		5.68	□□□□□ -1.5
AMD1	YML035C	HBT1	Q07653	1046 aa	Known RBP	5.68	□□□□□ -1.5
AMD1	YML035C	YOL019W	Q08157	551 aa		5.68	□□□□□ -1.5
AMD1	YML035C	APC9	Q12107	265 aa		5.68	□□□□□ -1.5
AMD1	YML035C	PHO3	P24031	467 aa		5.68	□□□□□ -1.5
AMD1	YML035C	MRPL9	P31334	269 aa		5.68	□□□□□ -1.5
AMD1	YML035C	DGR2	P32330	852 aa		5.68	□□□□□ -1.5
AMD1	YML035C	ZUO1	P32527	433 aa	Known RBP	5.68	□□□□□ -1.5

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