RNA–Protein interactions for RNA: YHR148W

IMP3, Transcript of Component of the SSU processome, yeast

Gene IMP3, Length 552 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
IMP3	YHR148W	INA17	Q02888	182 aa		4.62	□□□□□ -1.67
IMP3	YHR148W	RAD30	Q04049	632 aa		4.62	□□□□□ -1.67
IMP3	YHR148W	CAC2	Q04199	468 aa		4.62	□□□□□ -1.67
IMP3	YHR148W	ATX2	Q12067	313 aa		4.62	□□□□□ -1.67
IMP3	YHR148W	NKP1	Q12493	238 aa		4.62	□□□□□ -1.67
IMP3	YHR148W	CDC16	P09798	840 aa		4.61	□□□□□ -1.67
IMP3	YHR148W	RPL19A	P0CX82	189 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
IMP3	YHR148W	RPL19B	P0CX83	189 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
IMP3	YHR148W	ASK1	P35734	292 aa		4.61	□□□□□ -1.67
IMP3	YHR148W	SCW4	P53334	386 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
IMP3	YHR148W	IST1	P53843	298 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
IMP3	YHR148W	YLR112W	Q12130	139 aa		4.61	□□□□□ -1.67
IMP3	YHR148W	HXK2	P04807	486 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
IMP3	YHR148W	CDC24	P11433	854 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
IMP3	YHR148W	RAP1	P11938	827 aa		4.6	□□□□□ -1.67
IMP3	YHR148W	CLB2	P24869	491 aa		4.6	□□□□□ -1.67
IMP3	YHR148W	CHS3	P29465	1165 aa		4.6	□□□□□ -1.67
IMP3	YHR148W	SAC1	P32368	623 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
IMP3	YHR148W	TMT1	P32643	299 aa		4.6	□□□□□ -1.67
IMP3	YHR148W	SCO2	P38072	301 aa		4.6	□□□□□ -1.67
IMP3	YHR148W	LEU5	P38702	357 aa		4.6	□□□□□ -1.67
IMP3	YHR148W	PKP1	P40530	394 aa		4.6	□□□□□ -1.67
IMP3	YHR148W	LYS4	P49367	693 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
IMP3	YHR148W	MAK10	Q02197	733 aa		4.6	□□□□□ -1.67
IMP3	YHR148W	SKM1	Q12469	655 aa		4.6	□□□□□ -1.67
IMP3	YHR148W	RPL42A	P0CX27	106 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
IMP3	YHR148W	RPL42B	P0CX28	106 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
IMP3	YHR148W	PAH1	P32567	862 aa		4.59	□□□□□ -1.67
IMP3	YHR148W	DPB11	P47027	764 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
IMP3	YHR148W	RPS7B	P48164	190 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
IMP3	YHR148W	GSH2	Q08220	491 aa		4.59	□□□□□ -1.67
IMP3	YHR148W	ICT1	Q12385	394 aa		4.59	□□□□□ -1.67
IMP3	YHR148W	KRS1	P15180	591 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
IMP3	YHR148W	PWP1	P21304	576 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
IMP3	YHR148W	MGM1	P32266	881 aa		4.58	□□□□□ -1.68
IMP3	YHR148W	PDB1	P32473	366 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
IMP3	YHR148W	SNU114	P36048	1008 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
IMP3	YHR148W	MNN2	P38069	597 aa		4.58	□□□□□ -1.68
IMP3	YHR148W	ARP1	P38696	384 aa		4.58	□□□□□ -1.68
IMP3	YHR148W	SPC97	P38863	823 aa		4.58	□□□□□ -1.68
IMP3	YHR148W	BUR6	P40096	142 aa		4.58	□□□□□ -1.68
IMP3	YHR148W	HXT9	P40885	567 aa		4.58	□□□□□ -1.68
IMP3	YHR148W	MDV1	P47025	714 aa		4.58	□□□□□ -1.68
IMP3	YHR148W	VPS25	P47142	202 aa		4.58	□□□□□ -1.68
IMP3	YHR148W	LYS20	P48570	428 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
IMP3	YHR148W	NNF2	P53253	936 aa		4.58	□□□□□ -1.68
IMP3	YHR148W	MRPL1	Q04599	285 aa		4.58	□□□□□ -1.68
IMP3	YHR148W	POS5	Q06892	414 aa		4.58	□□□□□ -1.68
IMP3	YHR148W	PUF2	Q12221	1075 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.58	□□□□□ -1.68	not detected
IMP3	YHR148W	INP53	Q12271	1107 aa		4.58	□□□□□ -1.68
IMP3	YHR148W	YOR111W	Q99210	232 aa		4.58	□□□□□ -1.68
IMP3	YHR148W	KAR3	P17119	729 aa		4.57	□□□□□ -1.68
IMP3	YHR148W	SAN1	P22470	610 aa		4.57	□□□□□ -1.68
IMP3	YHR148W	MAL33	P38157	468 aa		4.57	□□□□□ -1.68
IMP3	YHR148W	RFC1	P38630	861 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
IMP3	YHR148W	DIA4	P38705	446 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
IMP3	YHR148W	YNG2	P38806	282 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
IMP3	YHR148W	UPF3	P48412	387 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
IMP3	YHR148W	IZH1	Q03419	316 aa		4.57	□□□□□ -1.68
IMP3	YHR148W	PSR1	Q07800	427 aa		4.57	□□□□□ -1.68
IMP3	YHR148W	AAC3	P18238	307 aa		4.56	□□□□□ -1.68
IMP3	YHR148W	SWE1	P32944	819 aa		4.56	□□□□□ -1.68
IMP3	YHR148W	RTS1	P38903	757 aa		4.56	□□□□□ -1.68
IMP3	YHR148W	UIP3	P39547	235 aa		4.56	□□□□□ -1.68
IMP3	YHR148W	YIR016W	P40572	265 aa		4.56	□□□□□ -1.68
IMP3	YHR148W	SGF73	P53165	657 aa		4.56	□□□□□ -1.68
IMP3	YHR148W	DUO1	P53168	247 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
IMP3	YHR148W	ZDS2	P54786	942 aa		4.56	□□□□□ -1.68
IMP3	YHR148W	YMR178W	Q03219	274 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
IMP3	YHR148W	YAP7	Q08182	245 aa		4.56	□□□□□ -1.68
IMP3	YHR148W	CIR2	Q08822	631 aa		4.56	□□□□□ -1.68
IMP3	YHR148W	YCK1	P23291	538 aa		4.55	□□□□□ -1.68
IMP3	YHR148W	GFD2	P25370	566 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
IMP3	YHR148W	NOP16	P40007	231 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
IMP3	YHR148W	YIL152W	P40455	235 aa		4.55	□□□□□ -1.68
IMP3	YHR148W	YIL060W	P40519	144 aa		4.55	□□□□□ -1.68
IMP3	YHR148W	SMC3	P47037	1230 aa		4.55	□□□□□ -1.68
IMP3	YHR148W	STR3	P53101	465 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
IMP3	YHR148W	MPS1	P54199	764 aa		4.55	□□□□□ -1.68
IMP3	YHR148W	YPL068C	Q02749	293 aa		4.55	□□□□□ -1.68
IMP3	YHR148W	ADE13	Q05911	482 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
IMP3	YHR148W	RTT109	Q07794	436 aa		4.55	□□□□□ -1.68
IMP3	YHR148W	TCO89	Q08921	799 aa		4.55	□□□□□ -1.68
IMP3	YHR148W	YPL272C	Q08984	517 aa		4.55	□□□□□ -1.68
IMP3	YHR148W	SPE4	Q12455	300 aa		4.55	□□□□□ -1.68
IMP3	YHR148W	PRE8	P23639	250 aa		4.54	□□□□□ -1.68
IMP3	YHR148W	PGS1	P25578	521 aa		4.54	□□□□□ -1.68
IMP3	YHR148W	ATO2	P32907	282 aa		4.54	□□□□□ -1.68
IMP3	YHR148W	YKL050C	P35736	922 aa		4.54	□□□□□ -1.68
IMP3	YHR148W	VRG4	P40107	337 aa		4.54	□□□□□ -1.68
IMP3	YHR148W	NGL3	Q03210	505 aa		4.54	□□□□□ -1.68
IMP3	YHR148W	ARP10	Q04549	284 aa		4.54	□□□□□ -1.68
IMP3	YHR148W	ARP9	Q05123	467 aa		4.54	□□□□□ -1.68
IMP3	YHR148W	UTP21	Q06078	939 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
IMP3	YHR148W	MCP2	Q06567	569 aa		4.54	□□□□□ -1.68
IMP3	YHR148W	MLH2	Q07980	695 aa		4.54	□□□□□ -1.68
IMP3	YHR148W	UBX3	Q12229	455 aa		4.54	□□□□□ -1.68
IMP3	YHR148W	YBR126W-A	Q8TGU7	68 aa		4.54	□□□□□ -1.68
IMP3	YHR148W	EDE1	P34216	1381 aa		4.53	□□□□□ -1.68
IMP3	YHR148W	SEM1	O94742	89 aa		4.53	□□□□□ -1.68

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