RNA–Protein interactions for RNA: YHR069C

RRP4, Transcript of Exosome non-catalytic core component, yeast

Gene RRP4, Length 1,080 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RRP4	YHR069C	SIP4	P46954	829 aa		5.75	□□□□□ -1.49
RRP4	YHR069C	SET2	P46995	733 aa	Known RBP	5.75	□□□□□ -1.49
RRP4	YHR069C	NMA2	P53204	395 aa		5.75	□□□□□ -1.49
RRP4	YHR069C	BUD32	P53323	261 aa		5.75	□□□□□ -1.49
RRP4	YHR069C	RNY1	Q02933	434 aa	Known RBP	5.75	□□□□□ -1.49
RRP4	YHR069C	TFB2	Q02939	513 aa		5.75	□□□□□ -1.49
RRP4	YHR069C	MCP2	Q06567	569 aa		5.75	□□□□□ -1.49
RRP4	YHR069C	YOR338W	Q99326	363 aa		5.75	□□□□□ -1.49
RRP4	YHR069C	CET1	O13297	549 aa	Predicted RBP	5.74	□□□□□ -1.49
RRP4	YHR069C	RPS31	P05759	152 aa	Known RBP	5.74	□□□□□ -1.49
RRP4	YHR069C	MPH2	P0CD99	609 aa		5.74	□□□□□ -1.49
RRP4	YHR069C	SSC1	P0CS90	654 aa	Known RBP	5.74	□□□□□ -1.49
RRP4	YHR069C	AMD1	P15274	810 aa	Known RBP	5.74	□□□□□ -1.49
RRP4	YHR069C	SEC14	P24280	304 aa	Known RBP	5.74	□□□□□ -1.49
RRP4	YHR069C	MSH1	P25846	959 aa		5.74	□□□□□ -1.49
RRP4	YHR069C	BEM1	P29366	551 aa		5.74	□□□□□ -1.49
RRP4	YHR069C	MRPL9	P31334	269 aa		5.74	□□□□□ -1.49
RRP4	YHR069C	IMP3	P32899	183 aa	Predicted RBP	5.74	□□□□□ -1.49
RRP4	YHR069C	PMT1	P33775	817 aa		5.74	□□□□□ -1.49
RRP4	YHR069C	PXA2	P34230	853 aa		5.74	□□□□□ -1.49
RRP4	YHR069C	YBR032W	P38223	100 aa		5.74	□□□□□ -1.49
RRP4	YHR069C	HXT5	P38695	592 aa		5.74	□□□□□ -1.49
RRP4	YHR069C	OSH7	P38755	437 aa		5.74	□□□□□ -1.49
RRP4	YHR069C	MNN1	P39106	762 aa		5.74	□□□□□ -1.49
RRP4	YHR069C	RGI2	P40188	164 aa		5.74	□□□□□ -1.49
RRP4	YHR069C	SER33	P40510	469 aa		5.74	□□□□□ -1.49
RRP4	YHR069C	PXA1	P41909	870 aa		5.74	□□□□□ -1.49
RRP4	YHR069C	YJR124C	P47159	448 aa		5.74	□□□□□ -1.49
RRP4	YHR069C	PEX8	P53248	589 aa		5.74	□□□□□ -1.49
RRP4	YHR069C	BIO4	P53630	237 aa		5.74	□□□□□ -1.49
RRP4	YHR069C	BIO5	P53744	561 aa	Known RBP	5.74	□□□□□ -1.49
RRP4	YHR069C	VAC7	P53950	1165 aa		5.74	□□□□□ -1.49
RRP4	YHR069C	PEX13	P80667	386 aa		5.74	□□□□□ -1.49
RRP4	YHR069C	RSC2	Q06488	889 aa		5.74	□□□□□ -1.49
RRP4	YHR069C	YMR030W-A	Q3E760	96 aa		5.74	□□□□□ -1.49
RRP4	YHR069C	MEX67	Q99257	599 aa	Known RBP	5.74	□□□□□ -1.49
RRP4	YHR069C	FRT1	Q99332	602 aa		5.74	□□□□□ -1.49
RRP4	YHR069C	Q0182	Q9ZZW1	134 aa		5.74	□□□□□ -1.49
RRP4	YHR069C	RPS9A	O13516	197 aa	Known RBP	5.73	□□□□□ -1.49
RRP4	YHR069C	SRV2	P17555	526 aa	Known RBP	5.73	□□□□□ -1.49
RRP4	YHR069C	PHO3	P24031	467 aa		5.73	□□□□□ -1.49
RRP4	YHR069C	EMC1	P25574	760 aa		5.73	□□□□□ -1.49
RRP4	YHR069C	BRF1	P29056	596 aa		5.73	□□□□□ -1.49
RRP4	YHR069C	CYM1	P32898	989 aa		5.73	□□□□□ -1.49
RRP4	YHR069C	CTF13	P35203	478 aa		5.73	□□□□□ -1.49
RRP4	YHR069C	LRG1	P35688	1017 aa		5.73	□□□□□ -1.49
RRP4	YHR069C	CIN4	P39110	191 aa		5.73	□□□□□ -1.49
RRP4	YHR069C	TIM17	P39515	158 aa		5.73	□□□□□ -1.49
RRP4	YHR069C	OAF1	P39720	1047 aa	Predicted RBP	5.73	□□□□□ -1.49
RRP4	YHR069C	MTO1	P53070	669 aa		5.73	□□□□□ -1.49
RRP4	YHR069C	YGL140C	P53120	1219 aa		5.73	□□□□□ -1.49
RRP4	YHR069C	NPY1	P53164	384 aa		5.73	□□□□□ -1.49
RRP4	YHR069C	YDR131C	Q03899	556 aa		5.73	□□□□□ -1.49
RRP4	YHR069C	RPC11	Q04307	110 aa	Predicted RBP	5.73	□□□□□ -1.49
RRP4	YHR069C	FAR8	Q05040	523 aa		5.73	□□□□□ -1.49
RRP4	YHR069C	SYT1	Q06836	1226 aa		5.73	□□□□□ -1.49
RRP4	YHR069C	RUD3	Q12234	484 aa	Known RBP	5.73	□□□□□ -1.49
RRP4	YHR069C	NCA2	Q12374	616 aa		5.73	□□□□□ -1.49
RRP4	YHR069C	STE2	D6VTK4	431 aa		5.72	□□□□□ -1.49
RRP4	YHR069C	NSP1	P14907	823 aa	Known RBP	5.72	□□□□□ -1.49
RRP4	YHR069C	GAL11	P19659	1081 aa		5.72	□□□□□ -1.49
RRP4	YHR069C	YCR099C	P25657	155 aa		5.72	□□□□□ -1.49
RRP4	YHR069C	MSH2	P25847	964 aa		5.72	□□□□□ -1.49
RRP4	YHR069C	HRR25	P29295	494 aa	Known RBP	5.72	□□□□□ -1.49
RRP4	YHR069C	MCM5	P29496	775 aa	Known RBP	5.72	□□□□□ -1.49
RRP4	YHR069C	MLF3	P32047	452 aa		5.72	□□□□□ -1.49
RRP4	YHR069C	RIM1	P32445	135 aa	Known RBP	5.72	□□□□□ -1.49
RRP4	YHR069C	CDC3	P32457	520 aa	Known RBP	5.72	□□□□□ -1.49
RRP4	YHR069C	LDB7	P38210	180 aa		5.72	□□□□□ -1.49
RRP4	YHR069C	YBR197C	P38306	217 aa		5.72	□□□□□ -1.49
RRP4	YHR069C	SSP120	P39931	234 aa	Known RBP	5.72	□□□□□ -1.49
RRP4	YHR069C	RPH1	P39956	796 aa		5.72	□□□□□ -1.49
RRP4	YHR069C	PEP8	P40335	379 aa		5.72	□□□□□ -1.49
RRP4	YHR069C	PFK26	P40433	827 aa	Known RBP	5.72	□□□□□ -1.49
RRP4	YHR069C	GTS1	P40956	396 aa		5.72	□□□□□ -1.49
RRP4	YHR069C	SPC105	P53148	917 aa		5.72	□□□□□ -1.49
RRP4	YHR069C	ART5	P53244	586 aa	Known RBP	5.72	□□□□□ -1.49
RRP4	YHR069C	FRE4	P53746	719 aa		5.72	□□□□□ -1.49
RRP4	YHR069C	YNL143C	P53908	130 aa		5.72	□□□□□ -1.49
RRP4	YHR069C	EFM6	P53970	246 aa		5.72	□□□□□ -1.49
RRP4	YHR069C	NAM8	Q00539	523 aa	Known RBP	5.72	□□□□□ -1.49
RRP4	YHR069C	RNT1	Q02555	471 aa		5.72	□□□□□ -1.49
RRP4	YHR069C	PET117	Q02771	107 aa		5.72	□□□□□ -1.49
RRP4	YHR069C	YMR209C	Q03648	457 aa		5.72	□□□□□ -1.49
RRP4	YHR069C	YLR053C	Q12026	108 aa		5.72	□□□□□ -1.49
RRP4	YHR069C	KCS1	Q12494	1050 aa		5.72	□□□□□ -1.49
RRP4	YHR069C	FMP27	Q06179	2628 aa		5.71	□□□□□ -1.5
RRP4	YHR069C	SPS1	P08458	490 aa		5.71	□□□□□ -1.5
RRP4	YHR069C	GCY1	P14065	312 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.71	□□□□□ -1.5	not detected
RRP4	YHR069C	TOM20	P35180	183 aa		5.71	□□□□□ -1.5
RRP4	YHR069C	SRP72	P38688	640 aa	Known RBP	5.71	□□□□□ -1.5
RRP4	YHR069C	REV7	P38927	245 aa		5.71	□□□□□ -1.5
RRP4	YHR069C	ACO2	P39533	789 aa		5.71	□□□□□ -1.5
RRP4	YHR069C	GDH3	P39708	457 aa		5.71	□□□□□ -1.5
RRP4	YHR069C	ALG8	P40351	577 aa		5.71	□□□□□ -1.5
RRP4	YHR069C	FAA4	P47912	694 aa	Known RBP	5.71	□□□□□ -1.5
RRP4	YHR069C	COG7	P53195	279 aa		5.71	□□□□□ -1.5
RRP4	YHR069C	CWC24	P53769	259 aa		5.71	□□□□□ -1.5
RRP4	YHR069C	AQR1	P53943	586 aa		5.71	□□□□□ -1.5
RRP4	YHR069C	SPP2	Q02521	185 aa		5.71	□□□□□ -1.5

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