RNA–Protein interactions for RNA: YER143W

DDI1, Transcript of DNA damage-inducible v-SNARE binding protein, yeastyeast

Gene DDI1, Length 1,287 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
DDI1YER143W APC9Q12107 265 aa8.89□□□□□ -0.99
DDI1YER143W STB3Q12427 513 aa8.89□□□□□ -0.99
DDI1YER143W YPT6Q99260 215 aa8.89□□□□□ -0.99
DDI1YER143W LEU1P07264 779 aaKnown RBP8.88□□□□□ -0.99
DDI1YER143W MNE1P24720 663 aa8.88□□□□□ -0.99
DDI1YER143W SRP72P38688 640 aaKnown RBP8.88□□□□□ -0.99
DDI1YER143W PAC1P39946 494 aaKnown RBP8.88□□□□□ -0.99
DDI1YER143W HAT2P39984 401 aa8.88□□□□□ -0.99
DDI1YER143W YIR007WP40566 764 aa8.88□□□□□ -0.99
DDI1YER143W MNT2P53059 558 aa8.88□□□□□ -0.99
DDI1YER143W FLC3P53121 802 aa8.88□□□□□ -0.99
DDI1YER143W IST1P53843 298 aaPredicted RBP8.88□□□□□ -0.99
DDI1YER143W TVP15Q03860 143 aa8.88□□□□□ -0.99
DDI1YER143W CSN9Q03981 162 aa8.88□□□□□ -0.99
DDI1YER143W RPN9Q04062 393 aaKnown RBP8.88□□□□□ -0.99
DDI1YER143W NUS1Q12063 375 aa8.88□□□□□ -0.99
DDI1YER143W CHS5Q12114 671 aaKnown RBP8.88□□□□□ -0.99
DDI1YER143W MRH1Q12117 320 aaPredicted RBP8.88□□□□□ -0.99
DDI1YER143W MOD5P07884 428 aa8.87□□□□□ -0.99
DDI1YER143W SEC63P14906 663 aa8.87□□□□□ -0.99
DDI1YER143W PMA2P19657 947 aa8.87□□□□□ -0.99
DDI1YER143W BET2P20133 325 aa8.87□□□□□ -0.99
DDI1YER143W TRX2P22803 104 aaKnown RBP8.87□□□□□ -0.99
DDI1YER143W MRPL9P31334 269 aa8.87□□□□□ -0.99
DDI1YER143W LIP5P32875 414 aa8.87□□□□□ -0.99
DDI1YER143W MUP3P38734 546 aa8.87□□□□□ -0.99
DDI1YER143W YHR131CP38835 850 aa8.87□□□□□ -0.99
DDI1YER143W TIM17P39515 158 aa8.87□□□□□ -0.99
DDI1YER143W ACO2P39533 789 aa8.87□□□□□ -0.99
DDI1YER143W MGS1P40151 587 aa8.87□□□□□ -0.99
DDI1YER143W AIR1P40507 360 aaKnown RBP8.87□□□□□ -0.99
DDI1YER143W ARC1P46672 376 aaKnown RBP8.87□□□□□ -0.99
DDI1YER143W PYK2P52489 506 aaKnown RBP8.87□□□□□ -0.99
DDI1YER143W YNR065CP53751 1116 aa8.87□□□□□ -0.99
DDI1YER143W YMR155WQ03795 547 aa8.87□□□□□ -0.99
DDI1YER143W LCB5Q06147 687 aaKnown RBP8.87□□□□□ -0.99
DDI1YER143W NUT2Q06213 157 aa8.87□□□□□ -0.99
DDI1YER143W ENT4Q07872 247 aa8.87□□□□□ -0.99
DDI1YER143W DAP1Q12091 152 aa8.87□□□□□ -0.99
DDI1YER143W YOL087CQ99247 1116 aa8.87□□□□□ -0.99
DDI1YER143W YOR338WQ99326 363 aa8.87□□□□□ -0.99
DDI1YER143W SPS1P08458 490 aa8.86□□□□□ -0.99
DDI1YER143W FPR1P20081 114 aaKnown RBP8.86□□□□□ -0.99
DDI1YER143W YJU3P28321 313 aa8.86□□□□□ -0.99
DDI1YER143W STE5P32917 917 aa8.86□□□□□ -0.99
DDI1YER143W TFC3P34111 1160 aa8.86□□□□□ -0.99
DDI1YER143W RRN3P36070 627 aa8.86□□□□□ -0.99
DDI1YER143W MAK5P38112 773 aaPredicted RBP8.86□□□□□ -0.99
DDI1YER143W CTP1P38152 299 aa8.86□□□□□ -0.99
DDI1YER143W MED6P38782 295 aa8.86□□□□□ -0.99
DDI1YER143W ALG8P40351 577 aa8.86□□□□□ -0.99
DDI1YER143W GTS1P40956 396 aa8.86□□□□□ -0.99
DDI1YER143W GYP8P43570 497 aa8.86□□□□□ -0.99
DDI1YER143W SET2P46995 733 aaKnown RBP8.86□□□□□ -0.99
DDI1YER143W GLG2P47011 380 aa8.86□□□□□ -0.99
DDI1YER143W PET130P47065 347 aa8.86□□□□□ -0.99
DDI1YER143W EMC4P53073 190 aa8.86□□□□□ -0.99
DDI1YER143W YNL143CP53908 130 aa8.86□□□□□ -0.99
DDI1YER143W VAC7P53950 1165 aa8.86□□□□□ -0.99
DDI1YER143W SFB2P53953 876 aa8.86□□□□□ -0.99
DDI1YER143W FMN1Q03778 218 aa8.86□□□□□ -0.99
DDI1YER143W GSF2Q04697 403 aaKnown RBP8.86□□□□□ -0.99
DDI1YER143W UPC2Q12151 913 aa8.86□□□□□ -0.99
DDI1YER143W YPL247CQ12523 523 aa8.86□□□□□ -0.99
DDI1YER143W YPR089WO13585 888 aa8.85□□□□□ -0.99
DDI1YER143W RPS14AP06367 137 aaKnown RBP8.85□□□□□ -0.99
DDI1YER143W RHO2P06781 192 aa8.85□□□□□ -0.99
DDI1YER143W MPH2P0CD99 609 aa8.85□□□□□ -0.99
DDI1YER143W PRP4P20053 465 aaKnown RBP8.85□□□□□ -0.99
DDI1YER143W ARG1P22768 420 aa8.85□□□□□ -0.99
DDI1YER143W CLB1P24868 471 aa8.85□□□□□ -0.99
DDI1YER143W SGF29P25554 259 aa8.85□□□□□ -0.99
DDI1YER143W VAC17P25591 423 aa8.85□□□□□ -0.99
DDI1YER143W PPZ1P26570 692 aa8.85□□□□□ -0.99
DDI1YER143W MVD1P32377 396 aaKnown RBP8.85□□□□□ -0.99
DDI1YER143W MRE11P32829 692 aa8.85□□□□□ -0.99
DDI1YER143W ASK1P35734 292 aa8.85□□□□□ -0.99
DDI1YER143W RFC3P38629 340 aa8.85□□□□□ -0.99
DDI1YER143W NEM1P38757 446 aa8.85□□□□□ -0.99
DDI1YER143W RPS14BP39516 138 aaKnown RBP8.85□□□□□ -0.99
DDI1YER143W TMA22P47089 198 aaPredicted RBP8.85□□□□□ -0.99
DDI1YER143W YJR124CP47159 448 aa8.85□□□□□ -0.99
DDI1YER143W AIF1P52923 378 aa8.85□□□□□ -0.99
DDI1YER143W BOL2P53082 120 aa8.85□□□□□ -0.99
DDI1YER143W FRE4P53746 719 aa8.85□□□□□ -0.99
DDI1YER143W BLS1Q06071 122 aa8.85□□□□□ -0.99
DDI1YER143W HRK1Q08732 759 aaKnown RBP8.85□□□□□ -0.99
DDI1YER143W UBX3Q12229 455 aa8.85□□□□□ -0.99
DDI1YER143W MDY2Q12285 212 aa8.85□□□□□ -0.99
DDI1YER143W HIS5P07172 385 aa8.84□□□□□ -0.99
DDI1YER143W SEC53P07283 254 aaKnown RBP8.84□□□□□ -0.99
DDI1YER143W ABF1P14164 731 aa8.84□□□□□ -0.99
DDI1YER143W IMG2P25642 146 aaPredicted RBP8.84□□□□□ -0.99
DDI1YER143W RPC19P28000 142 aaKnown RBP8.84□□□□□ -0.99
DDI1YER143W MLS1P30952 554 aa8.84□□□□□ -0.99
DDI1YER143W MF(ALPHA)2P32435 120 aa8.84□□□□□ -0.99
DDI1YER143W STE13P33894 931 aa8.84□□□□□ -0.99
DDI1YER143W PXA2P34230 853 aa8.84□□□□□ -0.99
DDI1YER143W ERP5P38819 212 aa8.84□□□□□ -0.99
DDI1YER143W YHB1P39676 399 aaKnown RBP8.84□□□□□ -0.99
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 26.2 ms