RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628306.2

CAPNS1-216, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,389 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-216ENST00000628306 SEPT4O43236 478 aa28.86■■■□□ 2.21
CAPNS1-216ENST00000628306 PRAMEF19Q5SWL8 479 aa28.86■■■□□ 2.21
CAPNS1-216ENST00000628306 TMEM179Q6ZVK1 233 aa28.86■■■□□ 2.21
CAPNS1-216ENST00000628306 APBB1O00213 710 aa28.85■■■□□ 2.21
CAPNS1-216ENST00000628306 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP28.85■■■□□ 2.21
CAPNS1-216ENST00000628306 AKR1B1P15121 316 aa28.85■■■□□ 2.21
CAPNS1-216ENST00000628306 PDE1AP54750 535 aa28.85■■■□□ 2.21
CAPNS1-216ENST00000628306 TTC22Q5TAA0 569 aa28.85■■■□□ 2.21
CAPNS1-216ENST00000628306 ATG4CQ96DT6 458 aa28.85■■■□□ 2.21
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CAPNS1-216ENST00000628306 ATP11BQ9Y2G3 1177 aa28.84■■■□□ 2.21
CAPNS1-216ENST00000628306 TMX2Q9Y320 296 aa28.84■■■□□ 2.21
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CAPNS1-216ENST00000628306 ARMT1Q9H993 441 aa28.83■■■□□ 2.21
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CAPNS1-216ENST00000628306 MAML3Q96JK9 1138 aa28.82■■■□□ 2.2
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CAPNS1-216ENST00000628306 MROH8Q9H579 483 aa28.82■■■□□ 2.2
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CAPNS1-216ENST00000628306 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa28.81■■■□□ 2.2
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CAPNS1-216ENST00000628306 TRIM43BA6NCK2 446 aa28.8■■■□□ 2.2
CAPNS1-216ENST00000628306 FLOT1O75955 427 aa28.8■■■□□ 2.2
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CAPNS1-216ENST00000628306 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa28.79■■■□□ 2.2
CAPNS1-216ENST00000628306 KBTBD13C9JR72 458 aa28.79■■■□□ 2.2
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CAPNS1-216ENST00000628306 ICA1Q05084 483 aa28.79■■■□□ 2.2
CAPNS1-216ENST00000628306 NCAPG2Q86XI2 1143 aa28.79■■■□□ 2.2
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CAPNS1-216ENST00000628306 C16orf86Q6ZW13 317 aa28.75■■■□□ 2.19
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CAPNS1-216ENST00000628306 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa28.75■■■□□ 2.19
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CAPNS1-216ENST00000628306 TTYH1Q9H313 450 aaPredicted RBP28.75■■■□□ 2.19
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CAPNS1-216ENST00000628306 USP17L21D6R901 530 aa28.74■■■□□ 2.19
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CAPNS1-216ENST00000628306 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP28.74■■■□□ 2.19
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CAPNS1-216ENST00000628306 PLXNA1Q9UIW2 1896 aa28.73■■■□□ 2.19
CAPNS1-216ENST00000628306 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP28.73■■■□□ 2.19
CAPNS1-216ENST00000628306 SLC25A27O95847 323 aa28.73■■■□□ 2.19
CAPNS1-216ENST00000628306 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP28.73■■■□□ 2.19
CAPNS1-216ENST00000628306 BOLA2Q9H3K6 86 aa28.73■■■□□ 2.19
CAPNS1-216ENST00000628306 SH2D4AQ9H788 454 aa28.73■■■□□ 2.19
CAPNS1-216ENST00000628306 CDC45O75419 566 aa28.72■■■□□ 2.19
CAPNS1-216ENST00000628306 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP28.72■■■□□ 2.19
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