RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000620030.1

PPP1CC-211, Transcript of protein phosphatase 1 catalytic subunit gamma, humanhuman

TSL 2

Gene PPP1CC, Length 582 nt, Biotype non stop decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1CC-211ENST00000620030 PPARAQ07869 468 aa28.08■■■□□ 2.09
PPP1CC-211ENST00000620030 FAM83BQ5T0W9 1011 aa28.08■■■□□ 2.09
PPP1CC-211ENST00000620030 DIS3LQ8TF46 1054 aaKnown RBP28.08■■■□□ 2.09
PPP1CC-211ENST00000620030 MROH8Q9H579 483 aa28.08■■■□□ 2.09
PPP1CC-211ENST00000620030 CLIP2Q9UDT6 1046 aa28.08■■■□□ 2.09
PPP1CC-211ENST00000620030 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa28.08■■■□□ 2.09
PPP1CC-211ENST00000620030 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP28.08■■■□□ 2.09
PPP1CC-211ENST00000620030 PLS1Q14651 629 aa28.07■■■□□ 2.08
PPP1CC-211ENST00000620030 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP28.07■■■□□ 2.08
PPP1CC-211ENST00000620030 MFSD14CQ5VZR4 134 aa28.07■■■□□ 2.08
PPP1CC-211ENST00000620030 LHX8Q68G74 356 aa28.07■■■□□ 2.08
PPP1CC-211ENST00000620030 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP28.07■■■□□ 2.08
PPP1CC-211ENST00000620030 NECAB2Q7Z6G3 386 aa28.07■■■□□ 2.08
PPP1CC-211ENST00000620030 TICAM2Q86XR7 235 aa28.07■■■□□ 2.08
PPP1CC-211ENST00000620030 HELLSQ9NRZ9 838 aa28.07■■■□□ 2.08
PPP1CC-211ENST00000620030 MTMR4Q9NYA4 1195 aa28.07■■■□□ 2.08
PPP1CC-211ENST00000620030 VWA5AO00534 786 aa28.06■■■□□ 2.08
PPP1CC-211ENST00000620030 RAD21O60216 631 aa28.06■■■□□ 2.08
PPP1CC-211ENST00000620030 ADORA2AP29274 412 aa28.06■■■□□ 2.08
PPP1CC-211ENST00000620030 PDE4BQ07343 736 aa28.06■■■□□ 2.08
PPP1CC-211ENST00000620030 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa28.06■■■□□ 2.08
PPP1CC-211ENST00000620030 NEDD1Q8NHV4 660 aa28.06■■■□□ 2.08
PPP1CC-211ENST00000620030 CEP95Q96GE4 821 aa28.06■■■□□ 2.08
PPP1CC-211ENST00000620030 CEP290O15078 2479 aa28.06■■■□□ 2.08
PPP1CC-211ENST00000620030 A0A0G2JMZ2 1700 aa28.05■■■□□ 2.08
PPP1CC-211ENST00000620030 COBLO75128 1261 aa28.05■■■□□ 2.08
PPP1CC-211ENST00000620030 NDUFB10O96000 172 aa28.05■■■□□ 2.08
PPP1CC-211ENST00000620030 VPS53Q5VIR6 699 aa28.05■■■□□ 2.08
PPP1CC-211ENST00000620030 DPP9Q86TI2 863 aa28.05■■■□□ 2.08
PPP1CC-211ENST00000620030 NCAPG2Q86XI2 1143 aa28.05■■■□□ 2.08
PPP1CC-211ENST00000620030 ABRAQ8N0Z2 381 aa28.05■■■□□ 2.08
PPP1CC-211ENST00000620030 REPS2Q8NFH8 660 aa28.05■■■□□ 2.08
PPP1CC-211ENST00000620030 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP28.05■■■□□ 2.08
PPP1CC-211ENST00000620030 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP28.05■■■□□ 2.08
PPP1CC-211ENST00000620030 SLC25A27O95847 323 aa28.04■■■□□ 2.08
PPP1CC-211ENST00000620030 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP28.04■■■□□ 2.08
PPP1CC-211ENST00000620030 NUCB1Q02818 461 aa28.04■■■□□ 2.08
PPP1CC-211ENST00000620030 CHD1LQ86WJ1 897 aa28.04■■■□□ 2.08
PPP1CC-211ENST00000620030 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa28.04■■■□□ 2.08
PPP1CC-211ENST00000620030 CYP2C19P33261 490 aa28.03■■■□□ 2.08
PPP1CC-211ENST00000620030 TFAP4Q01664 338 aa28.03■■■□□ 2.08
PPP1CC-211ENST00000620030 ALX1Q15699 326 aa28.03■■■□□ 2.08
PPP1CC-211ENST00000620030 FAM47AQ5JRC9 791 aa28.03■■■□□ 2.08
PPP1CC-211ENST00000620030 OLFML2BQ68BL8 750 aa28.03■■■□□ 2.08
PPP1CC-211ENST00000620030 RIOX2Q8IUF8 465 aa28.03■■■□□ 2.08
PPP1CC-211ENST00000620030 FAM227BQ96M60 508 aa28.03■■■□□ 2.08
PPP1CC-211ENST00000620030 NBPF3Q9H094 633 aa28.03■■■□□ 2.08
PPP1CC-211ENST00000620030 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP28.03■■■□□ 2.08
PPP1CC-211ENST00000620030 NR2E3Q9Y5X4 410 aa28.03■■■□□ 2.08
PPP1CC-211ENST00000620030 TTLL1O95922 423 aa28.02■■■□□ 2.08
PPP1CC-211ENST00000620030 TSPY3P0CV98 308 aa28.02■■■□□ 2.08
PPP1CC-211ENST00000620030 TSPY8P0CW00 308 aa28.02■■■□□ 2.08
PPP1CC-211ENST00000620030 STAT3P40763 770 aa28.02■■■□□ 2.08
PPP1CC-211ENST00000620030 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa28.02■■■□□ 2.08
PPP1CC-211ENST00000620030 SLF1Q9BQI6 1058 aa28.02■■■□□ 2.08
PPP1CC-211ENST00000620030 INCENPQ9NQS7 918 aa28.02■■■□□ 2.08
PPP1CC-211ENST00000620030 ANAPC4Q9UJX5 808 aa28.02■■■□□ 2.08
PPP1CC-211ENST00000620030 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP28.02■■■□□ 2.08
PPP1CC-211ENST00000620030 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP28.02■■■□□ 2.08
PPP1CC-211ENST00000620030 TACC3Q9Y6A5 838 aa28.02■■■□□ 2.08
PPP1CC-211ENST00000620030 PLIN4Q96Q06 1357 aa28.01■■■□□ 2.07
PPP1CC-211ENST00000620030 A0A0D9SFI3 127 aa28.01■■■□□ 2.07
PPP1CC-211ENST00000620030 CTDSPL2Q05D32 466 aa28.01■■■□□ 2.07
PPP1CC-211ENST00000620030 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa28.01■■■□□ 2.07
PPP1CC-211ENST00000620030 TRPV1Q8NER1 839 aa28.01■■■□□ 2.07
PPP1CC-211ENST00000620030 OSBPL3Q9H4L5 887 aa28.01■■■□□ 2.07
PPP1CC-211ENST00000620030 EVI5O60447 810 aa28■■■□□ 2.07
PPP1CC-211ENST00000620030 FCER1AP12319 257 aa28■■■□□ 2.07
PPP1CC-211ENST00000620030 GMCL1P1Q8NEA9 526 aa28■■■□□ 2.07
PPP1CC-211ENST00000620030 C11orf49Q9H6J7 331 aa28■■■□□ 2.07
PPP1CC-211ENST00000620030 PARP14Q460N5 1801 aa27.99■■■□□ 2.07
PPP1CC-211ENST00000620030 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP27.99■■■□□ 2.07
PPP1CC-211ENST00000620030 SLC5A4Q9NY91 659 aa27.99■■■□□ 2.07
PPP1CC-211ENST00000620030 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa27.98■■■□□ 2.07
PPP1CC-211ENST00000620030 FGAP02671 866 aa27.98■■■□□ 2.07
PPP1CC-211ENST00000620030 FGRP09769 529 aa27.98■■■□□ 2.07
PPP1CC-211ENST00000620030 CYBAP13498 195 aa27.98■■■□□ 2.07
PPP1CC-211ENST00000620030 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP27.98■■■□□ 2.07
PPP1CC-211ENST00000620030 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP27.98■■■□□ 2.07
PPP1CC-211ENST00000620030 COL6A1P12109 1028 aa27.97■■■□□ 2.07
PPP1CC-211ENST00000620030 RILPL2Q969X0 211 aa27.97■■■□□ 2.07
PPP1CC-211ENST00000620030 MMP19Q99542 508 aa27.97■■■□□ 2.07
PPP1CC-211ENST00000620030 IL17RBQ9NRM6 502 aa27.97■■■□□ 2.07
PPP1CC-211ENST00000620030 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP27.97■■■□□ 2.07
PPP1CC-211ENST00000620030 ZNF236Q9UL36 1845 aa27.97■■■□□ 2.07
PPP1CC-211ENST00000620030 COPB2P35606 906 aa27.96■■■□□ 2.07
PPP1CC-211ENST00000620030 SLFN13Q68D06 897 aa27.96■■■□□ 2.07
PPP1CC-211ENST00000620030 CHRDL2Q6WN34 429 aa27.96■■■□□ 2.07
PPP1CC-211ENST00000620030 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP27.96■■■□□ 2.07
PPP1CC-211ENST00000620030 MAML3Q96JK9 1138 aa27.96■■■□□ 2.07
PPP1CC-211ENST00000620030 FEM1BQ9UK73 627 aa27.96■■■□□ 2.07
PPP1CC-211ENST00000620030 PFASO15067 1338 aa27.95■■■□□ 2.07
PPP1CC-211ENST00000620030 ATP2A1O14983 1001 aa27.95■■■□□ 2.06
PPP1CC-211ENST00000620030 MSCO60682 206 aa27.95■■■□□ 2.06
PPP1CC-211ENST00000620030 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP27.95■■■□□ 2.06
PPP1CC-211ENST00000620030 SDSP20132 328 aa27.95■■■□□ 2.06
PPP1CC-211ENST00000620030 CNGA1P29973 690 aa27.95■■■□□ 2.06
PPP1CC-211ENST00000620030 TEX13BQ9BXU2 312 aa27.95■■■□□ 2.06
PPP1CC-211ENST00000620030 PRO3102Q9H379 93 aa27.95■■■□□ 2.06
PPP1CC-211ENST00000620030 ORC4O43929 436 aa27.94■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.6 ms