RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000606714.5

TRAM2-AS1-204, Transcript of TRAM2 antisense RNA 1 (head to head), humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene TRAM2-AS1, Length 2,453 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 SMYD4Q8IYR2 804 aaPredicted RBP24.75■■□□□ 1.55
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 BLIDQ8IZY5 108 aa24.75■■□□□ 1.55
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 TMEM47Q9BQJ4 181 aa24.75■■□□□ 1.55
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 SAMSN1Q9NSI8 373 aaKnown RBP24.75■■□□□ 1.55
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 TOP1P11387 765 aaKnown RBP24.74■■□□□ 1.55
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 DDR1Q08345 913 aa24.74■■□□□ 1.55
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 GRM4Q14833 912 aa24.74■■□□□ 1.55
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP24.74■■□□□ 1.55
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 CCDC112Q8NEF3 446 aa24.74■■□□□ 1.55
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 SPATA20Q8TB22 786 aa24.74■■□□□ 1.55
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 STX17P56962 302 aa24.74■■□□□ 1.55
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa24.74■■□□□ 1.55
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 TRIML1Q8N9V2 468 aa24.74■■□□□ 1.55
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 ENOX1Q8TC92 643 aaKnown RBP24.74■■□□□ 1.55
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 PAXBP1Q9Y5B6 917 aa24.74■■□□□ 1.55
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 ROBO3Q96MS0 1386 aa24.73■■□□□ 1.55
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 CYTH3O43739 400 aa24.73■■□□□ 1.55
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 CDC25AP30304 524 aa24.73■■□□□ 1.55
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 TBC1D16Q8TBP0 767 aa24.73■■□□□ 1.55
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 MORC2Q9Y6X9 1032 aaPredicted RBP24.73■■□□□ 1.55
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP24.73■■□□□ 1.55
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 TRIM37O94972 964 aa24.73■■□□□ 1.55
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 IL1R1P14778 569 aa24.73■■□□□ 1.55
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 CCDC34Q96HJ3 373 aa24.73■■□□□ 1.55
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 BLZF1Q9H2G9 400 aa24.73■■□□□ 1.55
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP24.73■■□□□ 1.55
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 ZBTB22O15209 634 aa24.72■■□□□ 1.55
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 CD44P16070 742 aaKnown RBP24.72■■□□□ 1.55
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 CDK8P49336 464 aa24.72■■□□□ 1.55
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 WWC2Q6AWC2 1192 aa24.72■■□□□ 1.55
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa24.72■■□□□ 1.55
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 ANKS1AQ92625 1134 aa24.72■■□□□ 1.55
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 RIMBP2O15034 1052 aa24.72■■□□□ 1.55
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 CALML3P27482 149 aa24.72■■□□□ 1.55
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 PPP1R13BQ96KQ4 1090 aa24.72■■□□□ 1.55
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 EYA3Q99504 573 aa24.72■■□□□ 1.55
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 PCDHA4Q9UN74 947 aa24.72■■□□□ 1.55
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa24.71■■□□□ 1.55
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 COBLO75128 1261 aa24.71■■□□□ 1.55
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 ZNF18P17022 549 aa24.71■■□□□ 1.55
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 HSPA1LP34931 641 aa24.71■■□□□ 1.55
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 FEZ1Q99689 392 aa24.71■■□□□ 1.55
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 NRDCO43847 1150 aa24.71■■□□□ 1.55
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 TRAPPC10P48553 1259 aa24.71■■□□□ 1.55
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 DPYDQ12882 1025 aa24.71■■□□□ 1.55
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 FLT1P17948 1338 aa24.71■■□□□ 1.55
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 BBOX1O75936 387 aa24.7■■□□□ 1.54
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 NAA30Q147X3 362 aaPredicted RBP24.7■■□□□ 1.54
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 F8W031 263 aaPredicted RBP24.7■■□□□ 1.54
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 MYO1BO43795 1136 aa24.7■■□□□ 1.54
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 GNAQP50148 359 aa24.7■■□□□ 1.54
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa24.7■■□□□ 1.54
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP24.69■■□□□ 1.54
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa24.69■■□□□ 1.54
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP24.69■■□□□ 1.54
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 RHBDL3P58872 404 aa24.69■■□□□ 1.54
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 GTF2IP78347 998 aa24.69■■□□□ 1.54
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 OGFRQ9NZT2 677 aa24.69■■□□□ 1.54
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 INF2Q27J81 1249 aa24.68■■□□□ 1.54
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 CCDC178Q5BJE1 867 aa24.68■■□□□ 1.54
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 C16orf86Q6ZW13 317 aa24.68■■□□□ 1.54
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 HOMER1Q86YM7 354 aa24.68■■□□□ 1.54
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 IQUBQ8NA54 791 aa24.68■■□□□ 1.54
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP24.68■■□□□ 1.54
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 KCND1Q9NSA2 647 aa24.68■■□□□ 1.54
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 PCDHA6Q9UN73 950 aa24.68■■□□□ 1.54
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa24.68■■□□□ 1.54
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 KLRF2D3W0D1 207 aa24.68■■□□□ 1.54
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 E2F4Q16254 413 aa24.68■■□□□ 1.54
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 USP17L2Q6R6M4 530 aa24.68■■□□□ 1.54
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 SH3GLB2Q9NR46 395 aa24.68■■□□□ 1.54
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP24.67■■□□□ 1.54
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 STXBP3O00186 592 aa24.67■■□□□ 1.54
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 ERCC5P28715 1186 aaPredicted RBP24.67■■□□□ 1.54
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 PICALMQ13492 652 aa24.67■■□□□ 1.54
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 C4orf32Q8N8J7 132 aa24.67■■□□□ 1.54
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 MTRQ99707 1265 aa24.67■■□□□ 1.54
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 ZNF287Q9HBT7 754 aa24.67■■□□□ 1.54
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 VAT1LQ9HCJ6 419 aa24.67■■□□□ 1.54
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 SYNRGQ9UMZ2 1314 aa24.67■■□□□ 1.54
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 CUL4BQ13620 913 aa24.67■■□□□ 1.54
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 SNED1Q8TER0 1413 aa24.66■■□□□ 1.54
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 PDXDC2PQ6P474 469 aa24.66■■□□□ 1.54
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 CEP95Q96GE4 821 aa24.66■■□□□ 1.54
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 GSDMAQ96QA5 445 aa24.66■■□□□ 1.54
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 BARHL2Q9NY43 387 aa24.66■■□□□ 1.54
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 PP2D1A8MPX8 630 aa24.66■■□□□ 1.54
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 ADKP55263 362 aaKnown RBP24.66■■□□□ 1.54
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP24.66■■□□□ 1.54
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 KARSQ15046 597 aaKnown RBP24.66■■□□□ 1.54
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 SYCP1Q15431 976 aa24.66■■□□□ 1.54
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 KIF18AQ8NI77 898 aa24.66■■□□□ 1.54
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 TMEM60Q9H2L4 133 aa24.66■■□□□ 1.54
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP24.65■■□□□ 1.54
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 M0R2N6 131 aa24.65■■□□□ 1.54
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP24.65■■□□□ 1.54
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 SYT10Q6XYQ8 523 aa24.65■■□□□ 1.54
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa24.64■■□□□ 1.54
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP24.64■■□□□ 1.54
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 PLCG2P16885 1265 aa24.64■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.5 ms