RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592965.2

MBD3-211, Transcript of methyl-CpG binding domain protein 3, humanhuman

TSL 4

Gene MBD3, Length 568 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD3-211ENST00000592965 NYAP2Q9P242 653 aa27.79■■■□□ 2.04
MBD3-211ENST00000592965 STAP2Q9UGK3 403 aa27.79■■■□□ 2.04
MBD3-211ENST00000592965 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa27.78■■■□□ 2.04
MBD3-211ENST00000592965 ADORA2AP29274 412 aa27.78■■■□□ 2.04
MBD3-211ENST00000592965 LHX8Q68G74 356 aa27.78■■■□□ 2.04
MBD3-211ENST00000592965 CHRDL2Q6WN34 429 aa27.78■■■□□ 2.04
MBD3-211ENST00000592965 ABRAQ8N0Z2 381 aa27.78■■■□□ 2.04
MBD3-211ENST00000592965 STK11IPQ8N1F8 1099 aa27.78■■■□□ 2.04
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MBD3-211ENST00000592965 TMEM132BQ14DG7 1078 aa27.77■■■□□ 2.04
MBD3-211ENST00000592965 C11orf49Q9H6J7 331 aa27.77■■■□□ 2.04
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MBD3-211ENST00000592965 OLFML2BQ68BL8 750 aa27.76■■■□□ 2.03
MBD3-211ENST00000592965 DPP9Q86TI2 863 aa27.76■■■□□ 2.03
MBD3-211ENST00000592965 SLC25A27O95847 323 aa27.75■■■□□ 2.03
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MBD3-211ENST00000592965 NAPBQ9H115 298 aa27.75■■■□□ 2.03
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MBD3-211ENST00000592965 PDE1AP54750 535 aa27.74■■■□□ 2.03
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MBD3-211ENST00000592965 PRO3102Q9H379 93 aa27.74■■■□□ 2.03
MBD3-211ENST00000592965 SLC5A4Q9NY91 659 aa27.74■■■□□ 2.03
MBD3-211ENST00000592965 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa27.74■■■□□ 2.03
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MBD3-211ENST00000592965 F5H6K3 240 aa27.73■■■□□ 2.03
MBD3-211ENST00000592965 RAD21O60216 631 aa27.73■■■□□ 2.03
MBD3-211ENST00000592965 MSCO60682 206 aa27.73■■■□□ 2.03
MBD3-211ENST00000592965 COBLO75128 1261 aa27.73■■■□□ 2.03
MBD3-211ENST00000592965 NDUFB10O96000 172 aa27.73■■■□□ 2.03
MBD3-211ENST00000592965 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP27.73■■■□□ 2.03
MBD3-211ENST00000592965 COL6A1P12109 1028 aa27.73■■■□□ 2.03
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MBD3-211ENST00000592965 KLRC3Q07444 240 aa27.73■■■□□ 2.03
MBD3-211ENST00000592965 RIOX2Q8IUF8 465 aa27.73■■■□□ 2.03
MBD3-211ENST00000592965 REPS2Q8NFH8 660 aa27.73■■■□□ 2.03
MBD3-211ENST00000592965 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP27.73■■■□□ 2.03
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MBD3-211ENST00000592965 FOXP2O15409 715 aa27.72■■■□□ 2.03
MBD3-211ENST00000592965 CYBAP13498 195 aa27.72■■■□□ 2.03
MBD3-211ENST00000592965 PPARAQ07869 468 aa27.72■■■□□ 2.03
MBD3-211ENST00000592965 MKL1Q969V6 931 aa27.72■■■□□ 2.03
MBD3-211ENST00000592965 CEP95Q96GE4 821 aa27.72■■■□□ 2.03
MBD3-211ENST00000592965 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP27.72■■■□□ 2.03
MBD3-211ENST00000592965 SLF1Q9BQI6 1058 aa27.72■■■□□ 2.03
MBD3-211ENST00000592965 MTMR4Q9NYA4 1195 aa27.72■■■□□ 2.03
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MBD3-211ENST00000592965 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP27.72■■■□□ 2.03
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MBD3-211ENST00000592965 TICAM2Q86XR7 235 aa27.71■■■□□ 2.03
MBD3-211ENST00000592965 TRPV1Q8NER1 839 aa27.71■■■□□ 2.03
MBD3-211ENST00000592965 NEDD1Q8NHV4 660 aa27.71■■■□□ 2.03
MBD3-211ENST00000592965 PCDH10Q9P2E7 1040 aa27.71■■■□□ 2.03
MBD3-211ENST00000592965 CLIP2Q9UDT6 1046 aa27.71■■■□□ 2.03
MBD3-211ENST00000592965 STAT3P40763 770 aa27.7■■■□□ 2.02
MBD3-211ENST00000592965 TTLL1O95922 423 aa27.69■■■□□ 2.02
MBD3-211ENST00000592965 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa27.69■■■□□ 2.02
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MBD3-211ENST00000592965 C7orf61Q8IZ16 206 aa27.69■■■□□ 2.02
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MBD3-211ENST00000592965 TSPY8P0CW00 308 aa27.68■■■□□ 2.02
MBD3-211ENST00000592965 CNGA1P29973 690 aa27.68■■■□□ 2.02
MBD3-211ENST00000592965 GMCL1P1Q8NEA9 526 aa27.68■■■□□ 2.02
MBD3-211ENST00000592965 MAML3Q96JK9 1138 aa27.68■■■□□ 2.02
MBD3-211ENST00000592965 MMP19Q99542 508 aa27.68■■■□□ 2.02
MBD3-211ENST00000592965 HELLSQ9NRZ9 838 aa27.68■■■□□ 2.02
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MBD3-211ENST00000592965 LNPKQ9C0E8 428 aa27.67■■■□□ 2.02
MBD3-211ENST00000592965 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP27.67■■■□□ 2.02
MBD3-211ENST00000592965 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP27.67■■■□□ 2.025e-6■■□□□ 11.4
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MBD3-211ENST00000592965 KCTD2Q14681 263 aa27.65■■■□□ 2.02
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MBD3-211ENST00000592965 DIS3Q9Y2L1 958 aaKnown RBP27.65■■■□□ 2.02
MBD3-211ENST00000592965 SMCHD1A6NHR9 2005 aa27.64■■■□□ 2.02
MBD3-211ENST00000592965 ATP2A1O14983 1001 aa27.64■■■□□ 2.02
MBD3-211ENST00000592965 SEPT4O43236 478 aa27.64■■■□□ 2.02
MBD3-211ENST00000592965 ALX1Q15699 326 aa27.64■■■□□ 2.02
MBD3-211ENST00000592965 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa27.64■■■□□ 2.02
MBD3-211ENST00000592965 VPS53Q5VIR6 699 aa27.64■■■□□ 2.02
MBD3-211ENST00000592965 NRBP1Q9UHY1 535 aa27.64■■■□□ 2.02
MBD3-211ENST00000592965 FEM1BQ9UK73 627 aa27.64■■■□□ 2.02
MBD3-211ENST00000592965 LAMA3Q16787 3333 aa27.64■■■□□ 2.02
MBD3-211ENST00000592965 DNM1LO00429 736 aa27.63■■■□□ 2.01
MBD3-211ENST00000592965 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP27.63■■■□□ 2.01
MBD3-211ENST00000592965 ZMYND8Q9ULU4 1186 aaPredicted RBP27.63■■■□□ 2.01
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