RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000569019.5

CENPT-231, Transcript of centromere protein T, human

TSL 4

Gene CENPT, Length 535 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CENPT-231	ENST00000569019	CYTH3	O43739	400 aa		14.65	□□□□□ -0.06
CENPT-231	ENST00000569019	RAD21	O60216	631 aa		14.65	□□□□□ -0.06
CENPT-231	ENST00000569019	CTNND1	O60716	968 aa	Known RBP	14.65	□□□□□ -0.06
CENPT-231	ENST00000569019	MMP1	P03956	469 aa		14.65	□□□□□ -0.06
CENPT-231	ENST00000569019	EPHX2	P34913	555 aa		14.65	□□□□□ -0.06
CENPT-231	ENST00000569019	KRT85	P78386	507 aa		14.65	□□□□□ -0.06
CENPT-231	ENST00000569019	KIF23	Q02241	960 aa	Predicted RBP	14.65	□□□□□ -0.06
CENPT-231	ENST00000569019	GNL2	Q13823	731 aa	Known RBP	14.65	□□□□□ -0.06
CENPT-231	ENST00000569019	SAFB	Q15424	915 aa	Known RBP eCLIP	14.65	□□□□□ -0.06
CENPT-231	ENST00000569019	SUPT20HL1	Q3ZLR7	823 aa		14.65	□□□□□ -0.06
CENPT-231	ENST00000569019	FAM173B	Q6P4H8	233 aa		14.65	□□□□□ -0.06
CENPT-231	ENST00000569019	BRAP	Q7Z569	592 aa		14.65	□□□□□ -0.06
CENPT-231	ENST00000569019	UBA5	Q9GZZ9	404 aa		14.65	□□□□□ -0.06
CENPT-231	ENST00000569019	VPS54	Q9P1Q0	977 aa		14.65	□□□□□ -0.06
CENPT-231	ENST00000569019	KCNJ14	Q9UNX9	436 aa		14.65	□□□□□ -0.06
CENPT-231	ENST00000569019		A0A1W2PRG0	241 aa		14.64	□□□□□ -0.07
CENPT-231	ENST00000569019	IQCA1L	A6NCM1	817 aa		14.64	□□□□□ -0.07
CENPT-231	ENST00000569019		F5H6K3	240 aa		14.64	□□□□□ -0.07
CENPT-231	ENST00000569019	PRPF40A	O75400	957 aa	Known RBP	14.64	□□□□□ -0.07
CENPT-231	ENST00000569019	SLC1A4	P43007	532 aa		14.64	□□□□□ -0.07
CENPT-231	ENST00000569019	KLRC3	Q07444	240 aa		14.64	□□□□□ -0.07
CENPT-231	ENST00000569019	CSPP1	Q1MSJ5	1256 aa		14.64	□□□□□ -0.07
CENPT-231	ENST00000569019	SLC35G1	Q2M3R5	365 aa		14.64	□□□□□ -0.07
CENPT-231	ENST00000569019	PRAMEF18	Q5VWM3	479 aa		14.64	□□□□□ -0.07
CENPT-231	ENST00000569019	SULF1	Q8IWU6	871 aa		14.64	□□□□□ -0.07
CENPT-231	ENST00000569019	RRP36	Q96EU6	259 aa	Known RBP	14.64	□□□□□ -0.07
CENPT-231	ENST00000569019	CPVL	Q9H3G5	476 aa		14.64	□□□□□ -0.07
CENPT-231	ENST00000569019	SH2D4A	Q9H788	454 aa		14.64	□□□□□ -0.07
CENPT-231	ENST00000569019	GOPC	Q9HD26	462 aa		14.64	□□□□□ -0.07
CENPT-231	ENST00000569019	LMBRD1	Q9NUN5	540 aa		14.64	□□□□□ -0.07
CENPT-231	ENST00000569019	ISY1	Q9ULR0	285 aa	Known RBP	14.64	□□□□□ -0.07
CENPT-231	ENST00000569019	PHIP	Q8WWQ0	1821 aa		14.64	□□□□□ -0.07
CENPT-231	ENST00000569019	KIF28P	B7ZC32	967 aa		14.63	□□□□□ -0.07
CENPT-231	ENST00000569019	FIBP	O43427	364 aa		14.63	□□□□□ -0.07
CENPT-231	ENST00000569019	NDUFB10	O96000	172 aa		14.63	□□□□□ -0.07
CENPT-231	ENST00000569019	ECE1	P42892	770 aa		14.63	□□□□□ -0.07
CENPT-231	ENST00000569019	ATL3	Q6DD88	541 aa		14.63	□□□□□ -0.07
CENPT-231	ENST00000569019	KCTD1	Q719H9	257 aa		14.63	□□□□□ -0.07
CENPT-231	ENST00000569019	USP48	Q86UV5	1035 aa		14.63	□□□□□ -0.07
CENPT-231	ENST00000569019	TMEM87A	Q8NBN3	555 aa		14.63	□□□□□ -0.07
CENPT-231	ENST00000569019	ACER1	Q8TDN7	264 aa		14.63	□□□□□ -0.07
CENPT-231	ENST00000569019	ZC3H15	Q8WU90	426 aa	Known RBP	14.63	□□□□□ -0.07
CENPT-231	ENST00000569019	GMCL1	Q96IK5	515 aa		14.63	□□□□□ -0.07
CENPT-231	ENST00000569019	ZNF396	Q96N95	335 aa	Predicted RBP	14.63	□□□□□ -0.07
CENPT-231	ENST00000569019	ANP32E	Q9BTT0	268 aa		14.63	□□□□□ -0.07
CENPT-231	ENST00000569019	PHF20	Q9BVI0	1012 aa		14.63	□□□□□ -0.07
CENPT-231	ENST00000569019	RIOX1	Q9H6W3	641 aa		14.63	□□□□□ -0.07
CENPT-231	ENST00000569019	GDPD2	Q9HCC8	539 aa		14.63	□□□□□ -0.07
CENPT-231	ENST00000569019	VAT1L	Q9HCJ6	419 aa		14.63	□□□□□ -0.07
CENPT-231	ENST00000569019	SH3GLB2	Q9NR46	395 aa		14.63	□□□□□ -0.07
CENPT-231	ENST00000569019	FRMD4A	Q9P2Q2	1039 aa	Predicted RBP	14.63	□□□□□ -0.07
CENPT-231	ENST00000569019	SEC63	Q9UGP8	760 aa	Known RBP	14.63	□□□□□ -0.07
CENPT-231	ENST00000569019	ZNF112	Q9UJU3	913 aa		14.63	□□□□□ -0.07
CENPT-231	ENST00000569019	CFAP45	Q9UL16	551 aa		14.63	□□□□□ -0.07
CENPT-231	ENST00000569019	TMX2	Q9Y320	296 aa		14.63	□□□□□ -0.07
CENPT-231	ENST00000569019	OTOF	Q9HC10	1997 aa		14.62	□□□□□ -0.07
CENPT-231	ENST00000569019	SSC5D	A1L4H1	1573 aa		14.62	□□□□□ -0.07
CENPT-231	ENST00000569019	U2AF2	P26368	475 aa	Known RBP eCLIP	14.62	□□□□□ -0.07
CENPT-231	ENST00000569019	INPP5B	P32019	993 aa		14.62	□□□□□ -0.07
CENPT-231	ENST00000569019	NLRP5	P59047	1200 aa		14.62	□□□□□ -0.07
CENPT-231	ENST00000569019	SKOR2	Q2VWA4	1001 aa	Predicted RBP	14.62	□□□□□ -0.07
CENPT-231	ENST00000569019	TTBK2	Q6IQ55	1244 aa		14.62	□□□□□ -0.07
CENPT-231	ENST00000569019	HOMER1	Q86YM7	354 aa		14.62	□□□□□ -0.07
CENPT-231	ENST00000569019	DIS3L2	Q8IYB7	885 aa	Known RBP	14.62	□□□□□ -0.07
CENPT-231	ENST00000569019	SHISA4	Q96DD7	197 aa		14.62	□□□□□ -0.07
CENPT-231	ENST00000569019	PIGS	Q96S52	555 aa		14.62	□□□□□ -0.07
CENPT-231	ENST00000569019	SCAND2P	Q9GZW5	306 aa	Predicted RBP	14.62	□□□□□ -0.07
CENPT-231	ENST00000569019	FOXP1	Q9H334	677 aa	Predicted RBP	14.62	□□□□□ -0.07
CENPT-231	ENST00000569019	BRMS1	Q9HCU9	246 aa		14.62	□□□□□ -0.07
CENPT-231	ENST00000569019	TFIP11	Q9UBB9	837 aa	Known RBP	14.62	□□□□□ -0.07
CENPT-231	ENST00000569019	BTBD18	B2RXH4	712 aa		14.61	□□□□□ -0.07
CENPT-231	ENST00000569019	ADM5	C9JUS6	153 aa		14.61	□□□□□ -0.07
CENPT-231	ENST00000569019	TRAK2	O60296	914 aa		14.61	□□□□□ -0.07
CENPT-231	ENST00000569019	BMP3	P12645	472 aa		14.61	□□□□□ -0.07
CENPT-231	ENST00000569019	KRT2	P35908	639 aa		14.61	□□□□□ -0.07
CENPT-231	ENST00000569019	MYSM1	Q5VVJ2	828 aa		14.61	□□□□□ -0.07
CENPT-231	ENST00000569019	WWC2	Q6AWC2	1192 aa		14.61	□□□□□ -0.07
CENPT-231	ENST00000569019	KRT26	Q7Z3Y9	468 aa		14.61	□□□□□ -0.07
CENPT-231	ENST00000569019	HEATR3	Q7Z4Q2	680 aa		14.61	□□□□□ -0.07
CENPT-231	ENST00000569019	SCYL3	Q8IZE3	742 aa		14.61	□□□□□ -0.07
CENPT-231	ENST00000569019	ADGRF4	Q8IZF3	695 aa		14.61	□□□□□ -0.07
CENPT-231	ENST00000569019	FAM177A1	Q8N128	213 aa	Predicted RBP	14.61	□□□□□ -0.07
CENPT-231	ENST00000569019	CCDC148	Q8NFR7	591 aa		14.61	□□□□□ -0.07
CENPT-231	ENST00000569019	GPKOW	Q92917	476 aa	Predicted RBP eCLIP	14.61	□□□□□ -0.07
CENPT-231	ENST00000569019	WRNIP1	Q96S55	665 aa		14.61	□□□□□ -0.07
CENPT-231	ENST00000569019	FEZ1	Q99689	392 aa		14.61	□□□□□ -0.07
CENPT-231	ENST00000569019	TAF1D	Q9H5J8	278 aa	Predicted RBP	14.61	□□□□□ -0.07
CENPT-231	ENST00000569019	VCPKMT	Q9H867	229 aa		14.61	□□□□□ -0.07
CENPT-231	ENST00000569019	PAPPA2	Q9BXP8	1791 aa		14.6	□□□□□ -0.07
CENPT-231	ENST00000569019	hCG_1984214	I3L0E3	225 aa		14.6	□□□□□ -0.07
CENPT-231	ENST00000569019	VEGFA	P15692	232 aa	Predicted RBP	14.6	□□□□□ -0.07
CENPT-231	ENST00000569019	CALML3	P27482	149 aa		14.6	□□□□□ -0.07
CENPT-231	ENST00000569019	SLC16A2	P36021	539 aa		14.6	□□□□□ -0.07
CENPT-231	ENST00000569019	EAPP	Q56P03	285 aa	Predicted RBP	14.6	□□□□□ -0.07
CENPT-231	ENST00000569019	CCDC84	Q86UT8	332 aa	Predicted RBP	14.6	□□□□□ -0.07
CENPT-231	ENST00000569019	PNMA8A	Q86V59	439 aa	Predicted RBP	14.6	□□□□□ -0.07
CENPT-231	ENST00000569019	NOSTRIN	Q8IVI9	506 aa		14.6	□□□□□ -0.07
CENPT-231	ENST00000569019	ZNF713	Q8N859	430 aa	Predicted RBP	14.6	□□□□□ -0.07
CENPT-231	ENST00000569019	CCDC12	Q8WUD4	166 aa	Predicted RBP	14.6	□□□□□ -0.07
CENPT-231	ENST00000569019	KLRG1	Q96E93	195 aa		14.6	□□□□□ -0.07

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