RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561112.1

RASGRF1-208, Transcript of Ras protein specific guanine nucleotide releasing factor 1, human

TSL 2

Gene RASGRF1, Length 265 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RASGRF1-208	ENST00000561112	ADCY3	O60266	1144 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RASGRF1-208	ENST00000561112	IRF5	Q13568	498 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RASGRF1-208	ENST00000561112	TMEM132B	Q14DG7	1078 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RASGRF1-208	ENST00000561112	MORN1	Q5T089	497 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RASGRF1-208	ENST00000561112	RCSD1	Q6JBY9	416 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RASGRF1-208	ENST00000561112	SAMD1	Q6SPF0	538 aa	Predicted RBP	13.76	□□□□□ -0.21
RASGRF1-208	ENST00000561112	MFSD6	Q6ZSS7	791 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RASGRF1-208	ENST00000561112	GMCL1P1	Q8NEA9	526 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RASGRF1-208	ENST00000561112	REPS2	Q8NFH8	660 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RASGRF1-208	ENST00000561112	CHMP4C	Q96CF2	233 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RASGRF1-208	ENST00000561112	MOV10L1	Q9BXT6	1211 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
RASGRF1-208	ENST00000561112	TOMM22	Q9NS69	142 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RASGRF1-208	ENST00000561112	TCP11L1	Q9NUJ3	509 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RASGRF1-208	ENST00000561112	PPP1R9A	Q9ULJ8	1098 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RASGRF1-208	ENST00000561112	TAF6L	Q9Y6J9	622 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RASGRF1-208	ENST00000561112	RAD50	Q92878	1312 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RASGRF1-208	ENST00000561112	MAPK4	P31152	587 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RASGRF1-208	ENST00000561112	TRIM32	Q13049	653 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RASGRF1-208	ENST00000561112	SLFN13	Q68D06	897 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RASGRF1-208	ENST00000561112	PLEKHH3	Q7Z736	793 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RASGRF1-208	ENST00000561112	NBPF11	Q86T75	865 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RASGRF1-208	ENST00000561112	PXYLP1	Q8TE99	480 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RASGRF1-208	ENST00000561112	SPATC1L	Q9H0A9	340 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RASGRF1-208	ENST00000561112	SYNPO2	Q9UMS6	1093 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RASGRF1-208	ENST00000561112	STX8	Q9UNK0	236 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RASGRF1-208	ENST00000561112	COL11A1	P12107	1806 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
RASGRF1-208	ENST00000561112	LAMA4	Q16363	1823 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RASGRF1-208	ENST00000561112	VWA5A	O00534	786 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RASGRF1-208	ENST00000561112	CYP2B6	P20813	491 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RASGRF1-208	ENST00000561112	PTPRE	P23469	700 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RASGRF1-208	ENST00000561112	MCC	P23508	829 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RASGRF1-208	ENST00000561112	BMP2KL	Q5H9B9	411 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RASGRF1-208	ENST00000561112	SLAIN1	Q8ND83	568 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RASGRF1-208	ENST00000561112	RUFY2	Q8WXA3	655 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RASGRF1-208	ENST00000561112	TMEM47	Q9BQJ4	181 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RASGRF1-208	ENST00000561112	ZKSCAN3	Q9BRR0	538 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RASGRF1-208	ENST00000561112	TNRC18	O15417	2968 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
RASGRF1-208	ENST00000561112		B4E1Z4	1266 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RASGRF1-208	ENST00000561112	CYP21A2	P08686	494 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RASGRF1-208	ENST00000561112	PC	P11498	1178 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
RASGRF1-208	ENST00000561112	BMP3	P12645	472 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RASGRF1-208	ENST00000561112	ERCC3	P19447	782 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RASGRF1-208	ENST00000561112	EN2	P19622	333 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
RASGRF1-208	ENST00000561112	CCL14	Q16627	93 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RASGRF1-208	ENST00000561112	IMMT	Q16891	758 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
RASGRF1-208	ENST00000561112	MB21D1	Q8N884	522 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RASGRF1-208	ENST00000561112	MAP4K1	Q92918	833 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RASGRF1-208	ENST00000561112	NUDT12	Q9BQG2	462 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RASGRF1-208	ENST00000561112	SLF1	Q9BQI6	1058 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RASGRF1-208	ENST00000561112	RNF41	Q9H4P4	317 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
RASGRF1-208	ENST00000561112	ZSWIM5	Q9P217	1185 aa		13.73	□□□□□ -0.21
RASGRF1-208	ENST00000561112	ZNF214	Q9UL59	606 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
RASGRF1-208	ENST00000561112	TMEM232	C9JQI7	657 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RASGRF1-208	ENST00000561112	KDM4A	O75164	1064 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RASGRF1-208	ENST00000561112	INHA	P05111	366 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RASGRF1-208	ENST00000561112	NEFL	P07196	543 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RASGRF1-208	ENST00000561112	CCL5	P13501	91 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RASGRF1-208	ENST00000561112	CCNA1	P78396	465 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RASGRF1-208	ENST00000561112	GRB14	Q14449	540 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RASGRF1-208	ENST00000561112	PLS1	Q14651	629 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RASGRF1-208	ENST00000561112	KCTD1	Q719H9	257 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RASGRF1-208	ENST00000561112	PRPF38A	Q8NAV1	312 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
RASGRF1-208	ENST00000561112	TRIB2	Q92519	343 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RASGRF1-208	ENST00000561112	GMCL1	Q96IK5	515 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RASGRF1-208	ENST00000561112	ESYT1	Q9BSJ8	1104 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RASGRF1-208	ENST00000561112	LSG1	Q9H089	658 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
RASGRF1-208	ENST00000561112	UNC93B1	Q9H1C4	597 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RASGRF1-208	ENST00000561112	FLRT1	Q9NZU1	646 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RASGRF1-208	ENST00000561112	CTNNA3	Q9UI47	895 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RASGRF1-208	ENST00000561112	RIPK3	Q9Y572	518 aa		13.72	□□□□□ -0.21
RASGRF1-208	ENST00000561112	KIAA0100	Q14667	2235 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
RASGRF1-208	ENST00000561112	XRCC5	P13010	732 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
RASGRF1-208	ENST00000561112	MAP2K5	Q13163	448 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RASGRF1-208	ENST00000561112	COL9A3	Q14050	684 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.21
RASGRF1-208	ENST00000561112	WDR78	Q5VTH9	848 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RASGRF1-208	ENST00000561112	TTBK2	Q6IQ55	1244 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RASGRF1-208	ENST00000561112	STOX1	Q6ZVD7	989 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RASGRF1-208	ENST00000561112	CYB5R4	Q7L1T6	521 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RASGRF1-208	ENST00000561112	RIOX2	Q8IUF8	465 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RASGRF1-208	ENST00000561112	CCAR1	Q8IX12	1150 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
RASGRF1-208	ENST00000561112	SHCBP1	Q8NEM2	672 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RASGRF1-208	ENST00000561112	NPLOC4	Q8TAT6	608 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RASGRF1-208	ENST00000561112	ESR2	Q92731	530 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RASGRF1-208	ENST00000561112	KIFC2	Q96AC6	838 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RASGRF1-208	ENST00000561112	TTC14	Q96N46	770 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RASGRF1-208	ENST00000561112	BIN2	Q9UBW5	565 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.21
RASGRF1-208	ENST00000561112	FEM1B	Q9UK73	627 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RASGRF1-208	ENST00000561112	MTMR7	Q9Y216	660 aa		13.71	□□□□□ -0.21
RASGRF1-208	ENST00000561112	SLC15A5	A6NIM6	579 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RASGRF1-208	ENST00000561112	COBL	O75128	1261 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RASGRF1-208	ENST00000561112	IGHA2	P01877	340 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RASGRF1-208	ENST00000561112	CENPB	P07199	599 aa	Predicted RBP	13.7	□□□□□ -0.22
RASGRF1-208	ENST00000561112	TOP1	P11387	765 aa	Known RBP	13.7	□□□□□ -0.22
RASGRF1-208	ENST00000561112	STAT3	P40763	770 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RASGRF1-208	ENST00000561112	SLC1A4	P43007	532 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RASGRF1-208	ENST00000561112	PPP4R3B	Q5MIZ7	849 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RASGRF1-208	ENST00000561112	NCAPG2	Q86XI2	1143 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RASGRF1-208	ENST00000561112	SOCS4	Q8WXH5	440 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RASGRF1-208	ENST00000561112	ANKS1A	Q92625	1134 aa		13.7	□□□□□ -0.22
RASGRF1-208	ENST00000561112	SHISA4	Q96DD7	197 aa		13.7	□□□□□ -0.22

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