RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559861.1

USP3-AS1-204, USP3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene USP3-AS1, Length 620 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP3-AS1-204ENST00000559861 BCL9O00512 1426 aa12.31□□□□□ -0.44
USP3-AS1-204ENST00000559861 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa12.31□□□□□ -0.44
USP3-AS1-204ENST00000559861 TMPRSS2O15393 492 aa12.31□□□□□ -0.44
USP3-AS1-204ENST00000559861 GAS2O43903 313 aaKnown RBP12.31□□□□□ -0.44
USP3-AS1-204ENST00000559861 H2AFB1P0C5Y9 115 aa12.31□□□□□ -0.44
USP3-AS1-204ENST00000559861 H2AFB2P0C5Z0 115 aa12.31□□□□□ -0.44
USP3-AS1-204ENST00000559861 TFE3P19532 575 aaPredicted RBP12.31□□□□□ -0.44
USP3-AS1-204ENST00000559861 NKAPLQ5M9Q1 402 aa12.31□□□□□ -0.44
USP3-AS1-204ENST00000559861 GAL3ST3Q96A11 431 aa12.31□□□□□ -0.44
USP3-AS1-204ENST00000559861 ACSBG1Q96GR2 724 aa12.31□□□□□ -0.44
USP3-AS1-204ENST00000559861 GSX1Q9H4S2 264 aaPredicted RBP12.31□□□□□ -0.44
USP3-AS1-204ENST00000559861 AP4E1Q9UPM8 1137 aa12.31□□□□□ -0.44
USP3-AS1-204ENST00000559861 TLR6Q9Y2C9 796 aa12.31□□□□□ -0.44
USP3-AS1-204ENST00000559861 HIF3AQ9Y2N7 669 aa12.31□□□□□ -0.44
USP3-AS1-204ENST00000559861 COL24A1Q17RW2 1714 aa12.31□□□□□ -0.44
USP3-AS1-204ENST00000559861 DHX15O43143 795 aaKnown RBP12.3□□□□□ -0.44
USP3-AS1-204ENST00000559861 ID3Q02535 119 aa12.3□□□□□ -0.44
USP3-AS1-204ENST00000559861 PWP1Q13610 501 aa12.3□□□□□ -0.44
USP3-AS1-204ENST00000559861 RSPO4Q2I0M5 234 aaPredicted RBP12.3□□□□□ -0.44
USP3-AS1-204ENST00000559861 RELL1Q8IUW5 271 aa12.3□□□□□ -0.44
USP3-AS1-204ENST00000559861 FAM20CQ8IXL6 584 aa12.3□□□□□ -0.44
USP3-AS1-204ENST00000559861 METTL5Q9NRN9 209 aaKnown RBP12.3□□□□□ -0.44
USP3-AS1-204ENST00000559861 CRIM1Q9NZV1 1036 aa12.3□□□□□ -0.44
USP3-AS1-204ENST00000559861 PCDHB5Q9Y5E4 795 aa12.3□□□□□ -0.44
USP3-AS1-204ENST00000559861 ACTL7BQ9Y614 415 aa12.3□□□□□ -0.44
USP3-AS1-204ENST00000559861 RGPD5Q99666 1765 aa12.3□□□□□ -0.44
USP3-AS1-204ENST00000559861 CRB1P82279 1406 aa12.29□□□□□ -0.44
USP3-AS1-204ENST00000559861 CEP350Q5VT06 3117 aa12.29□□□□□ -0.44
USP3-AS1-204ENST00000559861 QSER1Q2KHR3 1735 aa12.29□□□□□ -0.44
USP3-AS1-204ENST00000559861 FANCCQ00597 558 aa12.29□□□□□ -0.44
USP3-AS1-204ENST00000559861 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP12.29□□□□□ -0.44
USP3-AS1-204ENST00000559861 ZC3H12AQ5D1E8 599 aaKnown RBP12.29□□□□□ -0.44
USP3-AS1-204ENST00000559861 HS2ST1Q7LGA3 356 aa12.29□□□□□ -0.44
USP3-AS1-204ENST00000559861 DYMQ7RTS9 669 aa12.29□□□□□ -0.44
USP3-AS1-204ENST00000559861 TMEM74Q96NL1 305 aa12.29□□□□□ -0.44
USP3-AS1-204ENST00000559861 USP54Q70EL1 1684 aa12.29□□□□□ -0.44
USP3-AS1-204ENST00000559861 BMP3P12645 472 aa12.28□□□□□ -0.44
USP3-AS1-204ENST00000559861 LMNB1P20700 586 aa12.28□□□□□ -0.44
USP3-AS1-204ENST00000559861 ZNF76P36508 570 aa12.28□□□□□ -0.44
USP3-AS1-204ENST00000559861 PRR23CQ6ZRP0 262 aa12.28□□□□□ -0.44
USP3-AS1-204ENST00000559861 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP12.28□□□□□ -0.44
USP3-AS1-204ENST00000559861 SPON1Q9HCB6 807 aa12.28□□□□□ -0.44
USP3-AS1-204ENST00000559861 COPRSQ9NQ92 184 aa12.28□□□□□ -0.44
USP3-AS1-204ENST00000559861 GGT7Q9UJ14 662 aa12.28□□□□□ -0.44
USP3-AS1-204ENST00000559861 PCDHA4Q9UN74 947 aa12.28□□□□□ -0.44
USP3-AS1-204ENST00000559861 AATKQ6ZMQ8 1374 aa12.28□□□□□ -0.44
USP3-AS1-204ENST00000559861 ABCC6O95255 1503 aa12.27□□□□□ -0.44
USP3-AS1-204ENST00000559861 F6X3S4 739 aa12.27□□□□□ -0.45
USP3-AS1-204ENST00000559861 SCAMP3O14828 347 aaKnown RBP12.27□□□□□ -0.45
USP3-AS1-204ENST00000559861 KCNQ2O43526 872 aa12.27□□□□□ -0.45
USP3-AS1-204ENST00000559861 TCP11L2Q8N4U5 519 aa12.27□□□□□ -0.45
USP3-AS1-204ENST00000559861 RHOVQ96L33 236 aa12.27□□□□□ -0.45
USP3-AS1-204ENST00000559861 MIR1-1HGQ9H1L0 117 aa12.27□□□□□ -0.45
USP3-AS1-204ENST00000559861 KBTBD4Q9NVX7 518 aa12.27□□□□□ -0.45
USP3-AS1-204ENST00000559861 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP12.27□□□□□ -0.45
USP3-AS1-204ENST00000559861 GBP2P32456 591 aaPredicted RBP12.26□□□□□ -0.45
USP3-AS1-204ENST00000559861 RBM25P49756 843 aaKnown RBP12.26□□□□□ -0.45
USP3-AS1-204ENST00000559861 USP11P51784 963 aa12.26□□□□□ -0.45
USP3-AS1-204ENST00000559861 LMNB2Q03252 620 aa12.26□□□□□ -0.45
USP3-AS1-204ENST00000559861 SEPT6Q14141 434 aa12.26□□□□□ -0.45
USP3-AS1-204ENST00000559861 SGO2Q562F6 1265 aa12.26□□□□□ -0.45
USP3-AS1-204ENST00000559861 TRIM42Q8IWZ5 723 aa12.26□□□□□ -0.45
USP3-AS1-204ENST00000559861 FANCD2OSQ96PS1 177 aa12.26□□□□□ -0.45
USP3-AS1-204ENST00000559861 ATXN3LQ9H3M9 355 aa12.26□□□□□ -0.45
USP3-AS1-204ENST00000559861 DISC1Q9NRI5 854 aa12.26□□□□□ -0.45
USP3-AS1-204ENST00000559861 FAM105AQ9NUU6 356 aa12.26□□□□□ -0.45
USP3-AS1-204ENST00000559861 FURINP09958 794 aa12.25□□□□□ -0.45
USP3-AS1-204ENST00000559861 ASPAP45381 313 aa12.25□□□□□ -0.45
USP3-AS1-204ENST00000559861 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP12.25□□□□□ -0.45
USP3-AS1-204ENST00000559861 ERVK-24P63145 666 aa12.25□□□□□ -0.45
USP3-AS1-204ENST00000559861 CAMK2GQ13555 558 aaPredicted RBP12.25□□□□□ -0.45
USP3-AS1-204ENST00000559861 NBPF8Q3BBV2 869 aa12.25□□□□□ -0.45
USP3-AS1-204ENST00000559861 CDPF1Q6NVV7 123 aa12.25□□□□□ -0.45
USP3-AS1-204ENST00000559861 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP12.25□□□□□ -0.45
USP3-AS1-204ENST00000559861 USP35Q9P2H5 1018 aa12.25□□□□□ -0.45
USP3-AS1-204ENST00000559861 RAXQ9Y2V3 346 aa12.25□□□□□ -0.45
USP3-AS1-204ENST00000559861 ACEP12821 1306 aa12.25□□□□□ -0.45
USP3-AS1-204ENST00000559861 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa12.25□□□□□ -0.45
USP3-AS1-204ENST00000559861 KIR2DP1A0A0G2JNF4 349 aaPredicted RBP12.24□□□□□ -0.45
USP3-AS1-204ENST00000559861 NFAT5O94916 1531 aa12.24□□□□□ -0.45
USP3-AS1-204ENST00000559861 PF4P02776 101 aa12.24□□□□□ -0.45
USP3-AS1-204ENST00000559861 MAP4P27816 1152 aaKnown RBP12.24□□□□□ -0.45
USP3-AS1-204ENST00000559861 CLEC10AQ8IUN9 316 aa12.24□□□□□ -0.45
USP3-AS1-204ENST00000559861 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa12.24□□□□□ -0.45
USP3-AS1-204ENST00000559861 BTAF1O14981 1849 aa12.23□□□□□ -0.45
USP3-AS1-204ENST00000559861 MON2Q7Z3U7 1717 aa12.23□□□□□ -0.45
USP3-AS1-204ENST00000559861 USP6P35125 1406 aa12.23□□□□□ -0.45
USP3-AS1-204ENST00000559861 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP12.23□□□□□ -0.45
USP3-AS1-204ENST00000559861 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa12.23□□□□□ -0.45
USP3-AS1-204ENST00000559861 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP12.23□□□□□ -0.45
USP3-AS1-204ENST00000559861 MINDY4BA8MYZ0 360 aa12.23□□□□□ -0.45
USP3-AS1-204ENST00000559861 PLSCR1O15162 318 aa12.23□□□□□ -0.45
USP3-AS1-204ENST00000559861 DYRK3O43781 588 aa12.23□□□□□ -0.45
USP3-AS1-204ENST00000559861 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP12.23□□□□□ -0.45
USP3-AS1-204ENST00000559861 BEND4Q6ZU67 534 aa12.23□□□□□ -0.45
USP3-AS1-204ENST00000559861 FBLIM1Q8WUP2 373 aa12.23□□□□□ -0.45
USP3-AS1-204ENST00000559861 EZH1Q92800 747 aaPredicted RBP12.23□□□□□ -0.45
USP3-AS1-204ENST00000559861 RNF34Q969K3 372 aa12.23□□□□□ -0.45
USP3-AS1-204ENST00000559861 FAM83CQ9BQN1 747 aa12.23□□□□□ -0.45
USP3-AS1-204ENST00000559861 YIPF2Q9BWQ6 316 aa12.23□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.7 ms