RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558954.5

RABGGTA-208, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit alpha, humanhuman

TSL 4

Gene RABGGTA, Length 570 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTA-208ENST00000558954 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
RABGGTA-208ENST00000558954 GNRH1P01148 92 aa22.18■■□□□ 1.14
RABGGTA-208ENST00000558954 BMP3P12645 472 aa22.18■■□□□ 1.14
RABGGTA-208ENST00000558954 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
RABGGTA-208ENST00000558954 FCGRTP55899 365 aa22.18■■□□□ 1.14
RABGGTA-208ENST00000558954 SART3Q15020 963 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
RABGGTA-208ENST00000558954 OTOP1Q7RTM1 612 aa22.18■■□□□ 1.14
RABGGTA-208ENST00000558954 ENAHQ8N8S7 591 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
RABGGTA-208ENST00000558954 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa22.18■■□□□ 1.14
RABGGTA-208ENST00000558954 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa22.18■■□□□ 1.14
RABGGTA-208ENST00000558954 EFCC1Q9HA90 598 aa22.18■■□□□ 1.14
RABGGTA-208ENST00000558954 TXNRD2Q9NNW7 524 aa22.18■■□□□ 1.14
RABGGTA-208ENST00000558954 RBPJLQ9UBG7 517 aa22.18■■□□□ 1.14
RABGGTA-208ENST00000558954 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
RABGGTA-208ENST00000558954 TRIM17Q9Y577 477 aa22.18■■□□□ 1.14
RABGGTA-208ENST00000558954 DSG3P32926 999 aa22.17■■□□□ 1.14
RABGGTA-208ENST00000558954 PSMC4P43686 418 aa22.17■■□□□ 1.14
RABGGTA-208ENST00000558954 ERVK-9P63128 1117 aa22.17■■□□□ 1.14
RABGGTA-208ENST00000558954 ERVK-24P63145 666 aa22.17■■□□□ 1.14
RABGGTA-208ENST00000558954 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
RABGGTA-208ENST00000558954 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
RABGGTA-208ENST00000558954 CYB5R4Q7L1T6 521 aa22.17■■□□□ 1.14
RABGGTA-208ENST00000558954 MB21D2Q8IYB1 491 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
RABGGTA-208ENST00000558954 DCAF4Q8WV16 495 aa22.17■■□□□ 1.14
RABGGTA-208ENST00000558954 SLF1Q9BQI6 1058 aa22.17■■□□□ 1.14
RABGGTA-208ENST00000558954 KAT14Q9H8E8 782 aa22.17■■□□□ 1.14
RABGGTA-208ENST00000558954 FBXO28Q9NVF7 368 aa22.17■■□□□ 1.14
RABGGTA-208ENST00000558954 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa22.17■■□□□ 1.14
RABGGTA-208ENST00000558954 ZNF236Q9UL36 1845 aa22.17■■□□□ 1.14
RABGGTA-208ENST00000558954 ERICH2A1L162 156 aa22.16■■□□□ 1.14
RABGGTA-208ENST00000558954 MCCP23508 829 aa22.16■■□□□ 1.14
RABGGTA-208ENST00000558954 CCNA1P78396 465 aa22.16■■□□□ 1.14
RABGGTA-208ENST00000558954 CCDC96Q2M329 555 aa22.16■■□□□ 1.14
RABGGTA-208ENST00000558954 ANKS1AQ92625 1134 aa22.16■■□□□ 1.14
RABGGTA-208ENST00000558954 ATG4CQ96DT6 458 aa22.16■■□□□ 1.14
RABGGTA-208ENST00000558954 FEM1BQ9UK73 627 aa22.16■■□□□ 1.14
RABGGTA-208ENST00000558954 MTMR7Q9Y216 660 aa22.16■■□□□ 1.14
RABGGTA-208ENST00000558954 PLXNA1Q9UIW2 1896 aa22.15■■□□□ 1.14
RABGGTA-208ENST00000558954 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
RABGGTA-208ENST00000558954 STAT2P52630 851 aa22.15■■□□□ 1.14
RABGGTA-208ENST00000558954 CAP1Q01518 475 aa22.15■■□□□ 1.14
RABGGTA-208ENST00000558954 KRT32Q14532 448 aa22.15■■□□□ 1.14
RABGGTA-208ENST00000558954 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
RABGGTA-208ENST00000558954 POTEEQ6S8J3 1075 aa22.15■■□□□ 1.14
RABGGTA-208ENST00000558954 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
RABGGTA-208ENST00000558954 PNMA1Q8ND90 353 aa22.15■■□□□ 1.14
RABGGTA-208ENST00000558954 TRIM47Q96LD4 638 aa22.15■■□□□ 1.14
RABGGTA-208ENST00000558954 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
RABGGTA-208ENST00000558954 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
RABGGTA-208ENST00000558954 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
RABGGTA-208ENST00000558954 CNMDO75829 334 aa22.14■■□□□ 1.13
RABGGTA-208ENST00000558954 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
RABGGTA-208ENST00000558954 PDHBP11177 359 aa22.14■■□□□ 1.13
RABGGTA-208ENST00000558954 CTGFP29279 349 aa22.14■■□□□ 1.13
RABGGTA-208ENST00000558954 MCM5P33992 734 aa22.14■■□□□ 1.13
RABGGTA-208ENST00000558954 HSPA4P34932 840 aa22.14■■□□□ 1.13
RABGGTA-208ENST00000558954 IKQ13123 557 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
RABGGTA-208ENST00000558954 SEC23AQ15436 765 aa22.14■■□□□ 1.13
RABGGTA-208ENST00000558954 TSGA10IPQ3SY00 556 aa22.14■■□□□ 1.13
RABGGTA-208ENST00000558954 RASGRP2Q7LDG7 609 aa22.14■■□□□ 1.13
RABGGTA-208ENST00000558954 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
RABGGTA-208ENST00000558954 TNS4Q8IZW8 715 aa22.14■■□□□ 1.13
RABGGTA-208ENST00000558954 MCOLN1Q9GZU1 580 aa22.14■■□□□ 1.13
RABGGTA-208ENST00000558954 BTBD7Q9P203 1132 aa22.14■■□□□ 1.13
RABGGTA-208ENST00000558954 ADAMTS5Q9UNA0 930 aa22.14■■□□□ 1.13
RABGGTA-208ENST00000558954 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa22.14■■□□□ 1.13
RABGGTA-208ENST00000558954 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
RABGGTA-208ENST00000558954 TMEM232C9JQI7 657 aa22.13■■□□□ 1.13
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RABGGTA-208ENST00000558954 PEX10O60683 326 aa22.13■■□□□ 1.13
RABGGTA-208ENST00000558954 HOXD10P28358 340 aa22.13■■□□□ 1.13
RABGGTA-208ENST00000558954 MAPK4P31152 587 aa22.13■■□□□ 1.13
RABGGTA-208ENST00000558954 PRMT2P55345 433 aa22.13■■□□□ 1.13
RABGGTA-208ENST00000558954 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
RABGGTA-208ENST00000558954 FAM160B2Q86V87 743 aa22.13■■□□□ 1.13
RABGGTA-208ENST00000558954 CHURC1Q8WUH1 139 aa22.13■■□□□ 1.13
RABGGTA-208ENST00000558954 COA7Q96BR5 231 aa22.13■■□□□ 1.13
RABGGTA-208ENST00000558954 MTA3Q9BTC8 594 aa22.13■■□□□ 1.13
RABGGTA-208ENST00000558954 SMCHD1A6NHR9 2005 aa22.13■■□□□ 1.13
RABGGTA-208ENST00000558954 PRC1O43663 620 aa22.12■■□□□ 1.13
RABGGTA-208ENST00000558954 PLA2G6O60733 806 aa22.12■■□□□ 1.13
RABGGTA-208ENST00000558954 ANTXR2P58335 489 aa22.12■■□□□ 1.13
RABGGTA-208ENST00000558954 TMEM67Q5HYA8 995 aa22.12■■□□□ 1.13
RABGGTA-208ENST00000558954 KCTD1Q719H9 257 aa22.12■■□□□ 1.13
RABGGTA-208ENST00000558954 KIFC2Q96AC6 838 aa22.12■■□□□ 1.13
RABGGTA-208ENST00000558954 CHMP4CQ96CF2 233 aa22.12■■□□□ 1.13
RABGGTA-208ENST00000558954 SNHG28P0DPA3 235 aa22.11■■□□□ 1.13
RABGGTA-208ENST00000558954 PLS1Q14651 629 aa22.11■■□□□ 1.13
RABGGTA-208ENST00000558954 WTAPQ15007 396 aa22.11■■□□□ 1.13
RABGGTA-208ENST00000558954 GPATCH4Q5T3I0 446 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
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RABGGTA-208ENST00000558954 RASEFQ8IZ41 740 aa22.11■■□□□ 1.13
RABGGTA-208ENST00000558954 KCNB2Q92953 911 aa22.11■■□□□ 1.13
RABGGTA-208ENST00000558954 NEK1Q96PY6 1258 aa22.11■■□□□ 1.13
RABGGTA-208ENST00000558954 SPATC1LQ9H0A9 340 aa22.11■■□□□ 1.13
RABGGTA-208ENST00000558954 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
RABGGTA-208ENST00000558954 SRRDQ9UH36 339 aa22.11■■□□□ 1.13
RABGGTA-208ENST00000558954 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
RABGGTA-208ENST00000558954 HTTP42858 3142 aa22.1■■□□□ 1.13
RABGGTA-208ENST00000558954 FDX1P10109 184 aa22.1■■□□□ 1.13
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