RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555562.1

FOXN3-AS1-201, FOXN3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene FOXN3-AS1, Length 1,077 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TMEM132BQ14DG7 1078 aa23.27■■□□□ 1.32
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 LBHD1Q9BQE6 289 aaPredicted RBP23.27■■□□□ 1.32
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP23.27■■□□□ 1.32
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 DCTPP1Q9H773 170 aa23.27■■□□□ 1.32
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 RLFQ13129 1914 aa23.27■■□□□ 1.32
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 GJC2Q5T442 439 aaPredicted RBP23.26■■□□□ 1.31
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP23.26■■□□□ 1.31
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 GOPCQ9HD26 462 aa23.26■■□□□ 1.31
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ZNF236Q9UL36 1845 aa23.26■■□□□ 1.31
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 LAMA2P24043 3122 aaKnown RBP23.25■■□□□ 1.31
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP23.25■■□□□ 1.31
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 MAML3Q96JK9 1138 aa23.25■■□□□ 1.31
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP23.25■■□□□ 1.31
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ECHDC1Q9NTX5 307 aa23.25■■□□□ 1.31
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP23.25■■□□□ 1.31
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PRKAG2Q9UGJ0 569 aa23.25■■□□□ 1.31
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 KBTBD13C9JR72 458 aa23.24■■□□□ 1.31
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 RTP1P59025 263 aa23.24■■□□□ 1.31
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PRAMEF19Q5SWL8 479 aa23.24■■□□□ 1.31
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 RIOX2Q8IUF8 465 aa23.24■■□□□ 1.31
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 NRBP1Q9UHY1 535 aa23.24■■□□□ 1.31
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 A0A0G2JMZ2 1700 aa23.24■■□□□ 1.31
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 BAZ2AQ9UIF9 1905 aaKnown RBP23.23■■□□□ 1.31
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 STAT3P40763 770 aa23.23■■□□□ 1.31
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SBK1Q52WX2 424 aa23.23■■□□□ 1.31
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ANO1Q5XXA6 986 aa23.23■■□□□ 1.31
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 GIMAP6Q6P9H5 292 aa23.23■■□□□ 1.31
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SLC39A5Q6ZMH5 540 aa23.23■■□□□ 1.31
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 Q7L0L9 218 aa23.23■■□□□ 1.31
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 MMP19Q99542 508 aa23.23■■□□□ 1.31
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 FBXO28Q9NVF7 368 aa23.23■■□□□ 1.31
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa23.23■■□□□ 1.31
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 FRMPD3Q5JV73 1810 aa23.23■■□□□ 1.31
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 VWA5AO00534 786 aa23.22■■□□□ 1.31
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP23.22■■□□□ 1.31
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP23.22■■□□□ 1.31
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 MTMR10Q9NXD2 777 aa23.22■■□□□ 1.31
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 DIS3Q9Y2L1 958 aaKnown RBP23.22■■□□□ 1.31
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 MYH8P13535 1937 aa23.21■■□□□ 1.31
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 COPB2P35606 906 aa23.21■■□□□ 1.31
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 KCTD2Q14681 263 aa23.21■■□□□ 1.31
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 KBTBD3Q8NAB2 608 aa23.21■■□□□ 1.31
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 MKNK2Q9HBH9 465 aa23.21■■□□□ 1.31
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ATP11BQ9Y2G3 1177 aa23.21■■□□□ 1.31
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 STXBP5LQ9Y2K9 1186 aa23.21■■□□□ 1.31
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 GSG1L2A8MUP6 293 aa23.2■■□□□ 1.3
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 RAD21O60216 631 aa23.2■■□□□ 1.3
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP23.2■■□□□ 1.3
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP23.2■■□□□ 1.3
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 LRRC41Q15345 812 aa23.2■■□□□ 1.3
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 FAM83BQ5T0W9 1011 aa23.2■■□□□ 1.3
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TINF2Q9BSI4 451 aa23.2■■□□□ 1.3
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP23.2■■□□□ 1.3
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 RASA1P20936 1047 aa23.19■■□□□ 1.3
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ADCYAP1R1P41586 468 aa23.19■■□□□ 1.3
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SNX17Q15036 470 aa23.19■■□□□ 1.3
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ZNF792Q3KQV3 632 aa23.19■■□□□ 1.3
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 REPS2Q8NFH8 660 aa23.19■■□□□ 1.3
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 NYAP2Q9P242 653 aa23.19■■□□□ 1.3
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 MINDY4BA8MYZ0 360 aa23.18■■□□□ 1.3
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP23.18■■□□□ 1.3
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PGK2P07205 417 aa23.18■■□□□ 1.3
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP23.18■■□□□ 1.3
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 C1orf53Q5VUE5 145 aa23.18■■□□□ 1.3
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 FAM109BQ6ICB4 259 aaPredicted RBP23.18■■□□□ 1.3
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 APPBP2Q92624 585 aa23.18■■□□□ 1.3
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 OSBP2Q969R2 916 aa23.18■■□□□ 1.3
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 F5H6K3 240 aa23.17■■□□□ 1.3
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 POTEB2H3BUK9 544 aa23.17■■□□□ 1.3
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 DLL1O00548 723 aa23.17■■□□□ 1.3
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 RARBP10826 455 aa23.17■■□□□ 1.3
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 KLRC3Q07444 240 aa23.17■■□□□ 1.3
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 FAM47AQ5JRC9 791 aa23.17■■□□□ 1.3
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SLF1Q9BQI6 1058 aa23.17■■□□□ 1.3
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 MYH7P12883 1935 aa23.16■■□□□ 1.3
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 GNAT2P19087 354 aa23.16■■□□□ 1.3
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TRIM60Q495X7 471 aa23.16■■□□□ 1.3
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP23.16■■□□□ 1.3
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 FERMT2Q96AC1 680 aa23.16■■□□□ 1.3
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TEX13BQ9BXU2 312 aa23.16■■□□□ 1.3
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP23.16■■□□□ 1.3
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ZNF287Q9HBT7 754 aa23.16■■□□□ 1.3
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 XPNPEP3Q9NQH7 507 aa23.16■■□□□ 1.3
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 RNF180Q86T96 592 aa23.15■■□□□ 1.3
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP23.15■■□□□ 1.3
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 STK11IPQ8N1F8 1099 aa23.15■■□□□ 1.3
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP23.15■■□□□ 1.3
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CLIP2Q9UDT6 1046 aa23.15■■□□□ 1.3
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PHF24Q9UPV7 400 aa23.15■■□□□ 1.3
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ZNFX1Q9P2E3 1918 aaKnown RBP23.15■■□□□ 1.3
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PARP14Q460N5 1801 aa23.15■■□□□ 1.3
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ROBO3Q96MS0 1386 aa23.14■■□□□ 1.3
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ERC2O15083 957 aa23.14■■□□□ 1.29
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 GPAA1O43292 621 aa23.14■■□□□ 1.29
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 NDUFB10O96000 172 aa23.14■■□□□ 1.29
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ZNF865P0CJ78 1059 aaPredicted RBP23.14■■□□□ 1.29
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP23.14■■□□□ 1.29
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 MSL3Q8N5Y2 521 aaKnown RBP23.14■■□□□ 1.29
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 MKL1Q969V6 931 aa23.14■■□□□ 1.29
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PRDM5Q9NQX1 630 aaPredicted RBP23.14■■□□□ 1.29
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