RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550658.1

SYF2P1-201, Transcript of SYF2 pre-mRNA splicing factor pseudogene 1, humanhuman

BASIC

Gene SYF2P1, Length 413 nt, Biotype processed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2P1-201ENST00000550658 SVIPQ8NHG7 77 aa4.4□□□□□ -1.71
SYF2P1-201ENST00000550658 IPO4Q8TEX9 1081 aaKnown RBP4.4□□□□□ -1.71
SYF2P1-201ENST00000550658 CRELD1Q96HD1 420 aa4.4□□□□□ -1.71
SYF2P1-201ENST00000550658 ARPC5LQ9BPX5 153 aa4.4□□□□□ -1.71
SYF2P1-201ENST00000550658 EMILIN2Q9BXX0 1053 aa4.4□□□□□ -1.71
SYF2P1-201ENST00000550658 ARNT2Q9HBZ2 717 aa4.4□□□□□ -1.71
SYF2P1-201ENST00000550658 CBX8Q9HC52 389 aa4.4□□□□□ -1.71
SYF2P1-201ENST00000550658 SSU72Q9NP77 194 aaKnown RBP4.4□□□□□ -1.71
SYF2P1-201ENST00000550658 LZTS1Q9Y250 596 aa4.4□□□□□ -1.71
SYF2P1-201ENST00000550658 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP4.4□□□□□ -1.71
SYF2P1-201ENST00000550658 U3KQE9 123 aa4.4□□□□□ -1.71
SYF2P1-201ENST00000550658 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa4.4□□□□□ -1.71
SYF2P1-201ENST00000550658 GOLIM4O00461 696 aa4.39□□□□□ -1.71
SYF2P1-201ENST00000550658 TBX3O15119 743 aa4.39□□□□□ -1.71
SYF2P1-201ENST00000550658 C8AP07357 584 aa4.39□□□□□ -1.71
SYF2P1-201ENST00000550658 FUT4P22083 530 aa4.39□□□□□ -1.71
SYF2P1-201ENST00000550658 GSTT1P30711 240 aa4.39□□□□□ -1.71
SYF2P1-201ENST00000550658 CD96P40200 585 aa4.39□□□□□ -1.71
SYF2P1-201ENST00000550658 GJA8P48165 433 aa4.39□□□□□ -1.71
SYF2P1-201ENST00000550658 JAG1P78504 1218 aa4.39□□□□□ -1.71
SYF2P1-201ENST00000550658 ZNF252P-AS1Q0IIN9 211 aa4.39□□□□□ -1.71
SYF2P1-201ENST00000550658 KCTD2Q14681 263 aa4.39□□□□□ -1.71
SYF2P1-201ENST00000550658 ZNF394Q53GI3 561 aa4.39□□□□□ -1.71
SYF2P1-201ENST00000550658 TTLL5Q6EMB2 1281 aa4.39□□□□□ -1.71
SYF2P1-201ENST00000550658 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa4.39□□□□□ -1.71
SYF2P1-201ENST00000550658 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP4.39□□□□□ -1.71
SYF2P1-201ENST00000550658 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP4.39□□□□□ -1.71
SYF2P1-201ENST00000550658 TOP6BLQ8N6T0 577 aa4.39□□□□□ -1.71
SYF2P1-201ENST00000550658 C3orf58Q8NDZ4 430 aa4.39□□□□□ -1.71
SYF2P1-201ENST00000550658 GPBAR1Q8TDU6 330 aa4.39□□□□□ -1.71
SYF2P1-201ENST00000550658 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP4.39□□□□□ -1.71
SYF2P1-201ENST00000550658 GPRASP2Q96D09 838 aa4.39□□□□□ -1.71
SYF2P1-201ENST00000550658 ACSBG1Q96GR2 724 aa4.39□□□□□ -1.71
SYF2P1-201ENST00000550658 HRASLS5Q96KN8 279 aa4.39□□□□□ -1.71
SYF2P1-201ENST00000550658 NECAB3Q96P71 396 aaPredicted RBP4.39□□□□□ -1.71
SYF2P1-201ENST00000550658 DEPDC7Q96QD5 511 aa4.39□□□□□ -1.71
SYF2P1-201ENST00000550658 C12orf49Q9H741 205 aa4.39□□□□□ -1.71
SYF2P1-201ENST00000550658 CACNA2D2Q9NY47 1150 aa4.39□□□□□ -1.71
SYF2P1-201ENST00000550658 ZNF69Q9UC07 566 aa4.39□□□□□ -1.71
SYF2P1-201ENST00000550658 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP4.39□□□□□ -1.71
SYF2P1-201ENST00000550658 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP4.39□□□□□ -1.71
SYF2P1-201ENST00000550658 TMEM265A0A087WTH1 108 aa4.38□□□□□ -1.71
SYF2P1-201ENST00000550658 TTC36A6NLP5 189 aa4.38□□□□□ -1.71
SYF2P1-201ENST00000550658 ALG1L2C9J202 215 aa4.38□□□□□ -1.71
SYF2P1-201ENST00000550658 CLGNO14967 610 aa4.38□□□□□ -1.71
SYF2P1-201ENST00000550658 TSPAN6O43657 245 aa4.38□□□□□ -1.71
SYF2P1-201ENST00000550658 BPNT1O95861 308 aa4.38□□□□□ -1.71
SYF2P1-201ENST00000550658 LDHCP07864 332 aa4.38□□□□□ -1.71
SYF2P1-201ENST00000550658 ATF3P18847 181 aa4.38□□□□□ -1.71
SYF2P1-201ENST00000550658 CNGA1P29973 690 aa4.38□□□□□ -1.71
SYF2P1-201ENST00000550658 GNA15P30679 374 aa4.38□□□□□ -1.71
SYF2P1-201ENST00000550658 MASP1P48740 699 aa4.38□□□□□ -1.71
SYF2P1-201ENST00000550658 RACK1P63244 317 aaKnown RBP4.38□□□□□ -1.71
SYF2P1-201ENST00000550658 NFE2Q16621 373 aaPredicted RBP4.38□□□□□ -1.71
SYF2P1-201ENST00000550658 AOC3Q16853 763 aa4.38□□□□□ -1.71
SYF2P1-201ENST00000550658 CCDC70Q6NSX1 233 aa4.38□□□□□ -1.71
SYF2P1-201ENST00000550658 KIAA0907Q7Z7F0 614 aaPredicted RBP4.38□□□□□ -1.71
SYF2P1-201ENST00000550658 ATG4DQ86TL0 474 aaPredicted RBP4.38□□□□□ -1.71
SYF2P1-201ENST00000550658 CREBRFQ8IUR6 639 aa4.38□□□□□ -1.71
SYF2P1-201ENST00000550658 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP4.38□□□□□ -1.71
SYF2P1-201ENST00000550658 CHPFQ8IZ52 775 aa4.38□□□□□ -1.71
SYF2P1-201ENST00000550658 CCDC89Q8N998 374 aa4.38□□□□□ -1.71
SYF2P1-201ENST00000550658 SH3TC2Q8TF17 1288 aa4.38□□□□□ -1.71
SYF2P1-201ENST00000550658 SNRNP27Q8WVK2 155 aaKnown RBP4.38□□□□□ -1.71
SYF2P1-201ENST00000550658 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP4.38□□□□□ -1.71
SYF2P1-201ENST00000550658 SEC16BQ96JE7 1060 aa4.38□□□□□ -1.71
SYF2P1-201ENST00000550658 FEZ1Q99689 392 aa4.38□□□□□ -1.71
SYF2P1-201ENST00000550658 RC3H2Q9HBD1 1191 aaKnown RBP4.38□□□□□ -1.71
SYF2P1-201ENST00000550658 IFT122Q9HBG6 1241 aa4.38□□□□□ -1.71
SYF2P1-201ENST00000550658 ADAMTS6Q9UKP5 1117 aa4.38□□□□□ -1.71
SYF2P1-201ENST00000550658 PLAGL2Q9UPG8 496 aa4.38□□□□□ -1.71
SYF2P1-201ENST00000550658 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP4.38□□□□□ -1.71
SYF2P1-201ENST00000550658 PCDHGB7Q9Y5F8 929 aa4.38□□□□□ -1.71
SYF2P1-201ENST00000550658 ENC1O14682 589 aa4.37□□□□□ -1.71
SYF2P1-201ENST00000550658 RNASE1P07998 156 aaKnown RBP4.37□□□□□ -1.71
SYF2P1-201ENST00000550658 MYL3P08590 195 aa4.37□□□□□ -1.71
SYF2P1-201ENST00000550658 ITIH2P19823 946 aa4.37□□□□□ -1.71
SYF2P1-201ENST00000550658 IFRD2Q12894 506 aaPredicted RBP4.37□□□□□ -1.71
SYF2P1-201ENST00000550658 TMEM95Q3KNT9 176 aa4.37□□□□□ -1.71
SYF2P1-201ENST00000550658 GRAMD1BQ3KR37 738 aa4.37□□□□□ -1.71
SYF2P1-201ENST00000550658 PPM1JQ5JR12 505 aa4.37□□□□□ -1.71
SYF2P1-201ENST00000550658 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa4.37□□□□□ -1.71
SYF2P1-201ENST00000550658 TPTE2Q6XPS3 522 aa4.37□□□□□ -1.71
SYF2P1-201ENST00000550658 C16orf86Q6ZW13 317 aa4.37□□□□□ -1.71
SYF2P1-201ENST00000550658 GET4Q7L5D6 327 aaPredicted RBP4.37□□□□□ -1.71
SYF2P1-201ENST00000550658 KRT26Q7Z3Y9 468 aa4.37□□□□□ -1.71
SYF2P1-201ENST00000550658 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP4.37□□□□□ -1.71
SYF2P1-201ENST00000550658 IFNL3Q8IZI9 196 aa4.37□□□□□ -1.71
SYF2P1-201ENST00000550658 PI4K2BQ8TCG2 481 aa4.37□□□□□ -1.71
SYF2P1-201ENST00000550658 GRIN3AQ8TCU5 1115 aa4.37□□□□□ -1.71
SYF2P1-201ENST00000550658 FBF1Q8TES7 1133 aa4.37□□□□□ -1.71
SYF2P1-201ENST00000550658 FBXO41Q8TF61 875 aa4.37□□□□□ -1.71
SYF2P1-201ENST00000550658 NEUROD6Q96NK8 337 aa4.37□□□□□ -1.71
SYF2P1-201ENST00000550658 TSPAN18Q96SJ8 248 aa4.37□□□□□ -1.71
SYF2P1-201ENST00000550658 CEP44Q9C0F1 390 aa4.37□□□□□ -1.71
SYF2P1-201ENST00000550658 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa4.37□□□□□ -1.71
SYF2P1-201ENST00000550658 MBNL3Q9NUK0 354 aaKnown RBP4.37□□□□□ -1.71
SYF2P1-201ENST00000550658 SNTG2Q9NY99 539 aa4.37□□□□□ -1.71
SYF2P1-201ENST00000550658 GGT7Q9UJ14 662 aa4.37□□□□□ -1.71
SYF2P1-201ENST00000550658 FBXO2Q9UK22 296 aaPredicted RBP4.37□□□□□ -1.71
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.2 ms